Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14570
- Subject:
- NM_001313982.2
- Aligned Length:
- 2382
- Identities:
- 2276
- Gaps:
- 75
Alignment
Query 1 ATGGGTGATGAAAAGGACTCTTGGAAAGTGAAAACTTTAGATGAAATTCTTCAGGAAAAGAAACGAAGGAAGGA 74
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Sbjct 1 ATGGGTGATGAAAAGGACTCTTGGAAAGTGAAAACTTTAGATGAAATTCTTCAGGAAAAGAAACGAAGGAAGGA 74
Query 75 ACAAGAGGAGAAAGCAGAGATAAAACGCTTAAAAAATTCTGATGACCGGGATTCCAAGCGGGATTCCCTTGAGG 148
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Sbjct 75 ACAAGAGGAGAAAGCAGAGATAAAACGCTTAAAAAATTCTGATGACCGGGATTCCAAGCGGGATTCCCTTGAGG 148
Query 149 AGGGGGAGCTGAGAGATCACCGCATGGAGATCACAATAAGGAACTCCCCGTATAGAAGAGAAGACTCTATGGAA 222
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Sbjct 149 AGGGGGAGCTGAGAGATCACTGCATGGAGATCACAATAAGGAACTCCCCGTATAGAAGAGAAGACTCAATGGAA 222
Query 223 GACAGAGGAGAAGAAGATGATTCTTTGGCCATCAAACCACCCCAGCAAATGTCTCGGAAAGAAAAAGCTCATCA 296
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Sbjct 223 GACAGAGGAGAAGAAGATGATTCTTTGGCCATCAAACCACCCCAGCAAATGTCTCGGAAAGAAAAAGTTCATCA 296
Query 297 CAGAAAAGATGAAAAGAGAAAAGAGAAACGTAGGCATCGTAGCCATTCAGCAGAAGGGGGGAAGCATGCTAGAG 370
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Sbjct 297 CAGAAAAGATGAAAAGAGAAAAGAAAAA------------------------------TGGAAGCATGCTAGAG 340
Query 371 TGAAAGAAAAAGAAAGAGAGCACGAACGTCGGAAACGGCATCGAGAAGAACAGGATAAAGCTCGCCGGGAATGG 444
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Sbjct 341 TG------AAAGAAAGAGAGCACGAACGTCGGAAACGACATCGAGAAGAACAGGATAAAGCTCGCCGGGAATGG 408
Query 445 GAAAGACAGAAGAGAAGGGAGATGGCAAGGGAGCATTCCAGGAGAGAA-------------------------- 492
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Sbjct 409 GAAAGACAGAAGAGAAGGGAAATGGCAAGGGAGCATTCCAGGAGAGAAAGGGGGAATGATGGCGTGTGCCTCTT 482
Query 493 -AGGGACCGCTTGGAGCAGTTAGAAAGGAAGCGGGAGCGGGAGCGCAAGATGCGGGAGCAGCAGAAGGAGCAGC 565
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Sbjct 483 CAGGGACCGCTTGGAGCAGTTAGAAAGGAAGCGGGAGCGGGAGCGCAAGATGCGGGAGCAGCAGAAGGAGCAGC 556
Query 566 GGGAGCAGAAGGAGCGCGAGCGGCGGGCGGAGGAGCGGCGCAAGGAGCGGGAGGCCCGCAGGGAAGTGTCTGCA 639
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Sbjct 557 GGGAGCAGAAGGAGCGCGAGCGGCGGGCGGAGGAGCGGCGCAAGGAGCGGGAGGCCCGCAGGGAAGTGTCTGCA 630
Query 640 CATCACCGAACGATGAGAGAGGACTACAGCGACAAAGTGAAAGCCAGCCACTGGAGTCGCAGCCCGCCTCGGCC 713
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Sbjct 631 CATCACCGAACGATGAGAGAGGACTACAGCGACAAAGTGAAAGCCAGCCACTGGAGTCGCAGCCCGCCTCGGCC 704
Query 714 GCCGCGGGAGCGGTTCGAGTTGGGAGACGGCCGGGAAGCCAGTAAAAG-AGAGAAAATGGAAGAAAGGGACCTG 786
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Sbjct 705 GCCGCGGGAGCGGTTCGAGTTGGGAGACGGCC-GGAAGCCAGTAAAAGAAGAGAAAATGGAAGAAAGGGACCTG 777
Query 787 CTGTCCGACTTACAGGACATCAGCGACAGCGAGAGGAAGACCAGCTCGGCCGAGTCCTCGTCAGCAGAATCAGG 860
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Sbjct 778 CTGTCCGACTTACAGGACATCAGCGACAGCGAGAGGAAGACCAGCTCGGCCGAGTCCTCGTCAGCGGAATCAGG 851
Query 861 CTCAGGTTCTGAGGAAGAAGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAAGGGAGCACCAGTGAAGAATCAGAGG 934
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Sbjct 852 CTCAGGTTCTGAGGAAGAAGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAAGGGAGCACCAGTGAAGAATCAGAGG 925
Query 935 AGGAGGAGGAGGAAGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAGACCGGCAGCAACTCTGAGGAGGCATCAGAGCAGTCTGCC 1008
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Sbjct 926 AGGAGGAGGAGGAAGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAGACCGGCAGCAACTCTGAGGAGGCATCAGAGCAGTCTGCC 999
Query 1009 GAAGAAGTAAGTGAGGAAGAAATGAGTGAAGATGAAGAACGAGAAAATGAAAACCACCTCTTGGTTGTTCCAGA 1082
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Sbjct 1000 GAAGAAGTAAGTGAGGAAGAAATGAGTGAAGATGAAGAACGAGAAAATGAAAACCACCTCTTGGTTGTTCCAGA 1073
Query 1083 GTCACGGTTCGACCGAGATTCCGGGGAGAGTGAAGAAGCAGAGGAAGAAGTGGGTGAGGGAACGCCGCAGAGCA 1156
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Sbjct 1074 GTCACGGTTCGACCGAGATTCCGGGGAGAGTGAAGAAGCAGAGGAAGAAGTGGGTGAGGGAACGCCGCAGAGCA 1147
Query 1157 GCGCCCTGACAGAGGGCGACTATGTGCCCGACTCCCCTGCCCTGTCGCCCATCGAGCTCAAGCAGGAGCTGCCC 1230
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Sbjct 1148 GCGCCCTGACAGAGGGCGACTATGTGCCCGACTCCCCTGCCCTGTTGCCCATCGAGCTCAAGCAGGAGCTGCCC 1221
Query 1231 AAGTACCTGCCGGCCCTGCAGGGCTGCCGGAGCGTCGAGGAGTTCCAGTGCCTGAACAGGATCGAGGAGGGCAC 1304
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Sbjct 1222 AAGTACCTGCCGGCCCTGCAGGGCTGCCGGAGCGTCGAGGAGTTCCAGTGCCTGAACAGGATCGAGGAGGGCAC 1295
Query 1305 CTATGGAGTGGTCTACAGAGCAAAAGACAAGAAAACAGATGAAATTGTGGCTCTAAAGCGGCTGAAGATGGAGA 1378
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Sbjct 1296 CTATGGAGTGGTCTACAGAGCAAAAGACAAGAAAACAGATGAAATTGTGGCTCTAAAGCGGCTGAAGATGGAGA 1369
Query 1379 AGGAGAAGGAGGGCTTCCCGATCACGTCGCTGAGGGAGATCAACACCATCCTCAAGGCCCAGCATCCCAACATC 1452
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Sbjct 1370 AGGAGAAGGAGGGCTTCCCGATCACGTCCCTGAGGGAGATCAACACCATCCTCAAGGCCCAGCATCCCAACATT 1443
Query 1453 GTCACCGTTAGAGAGATTGTGGTGGGCAGCAACATGGACAAGATCTACATCGTGATGAACTATGTGGAGCACGA 1526
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Sbjct 1444 GTCACCGTTAGAGAGATTGTGGTGGGCAGCAACATGGACAAGATCTACATCGTGATGAACTACGTGGAGCACGA 1517
Query 1527 CCTCAAGAGCCTGATGGAGACCAGAAAACAGCCCCTTCCTGCCAAGGGGAGGTGAAGACCCCTGAGAATCCAGG 1600
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Sbjct 1518 CCTCAAGAGCCTGATGGAGACCATGAAACAG-CCCTTCCTGCC-AGGGGAGGTGAAGA-CCCTGATGATCCA-G 1587
Query 1601 TTGGTGCGTGGGGGTGAAACACCTCCACGACAAACT-GATCCCTGCACCGTGACCTCAAGACGTCC-ACCTGGC 1672
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Sbjct 1588 CTGCTGCG-GGGGGTGAAACACCTGCACGAC-AACTGGAT-CCTGCACCGTGACCTCAAGACGTCCAACCT-GC 1657
Query 1673 TGCTGAGCCACGCCGGCATCCTCAAGGTGGGTGACTTCGGGCTGGCGCGGGAGTACGGATCCCCTCTGAAGGCC 1746
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Sbjct 1658 TGCTGAGCCACGCCGGCATCCTCAAGGTGGGTGATTTTGGGCTGGCGCGGGAGTACGGATCCCCTCTGAAGGCC 1731
Query 1747 TACACCCCGGTCGTGGTGACCCTGTGGTACCGCGCCCCAGAGCTGCTGCTTGGTGCCAAGGAATACTCCACGGC 1820
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Sbjct 1732 TACACCCCGGTCGTGGTGACCCAGTGGTACCGCGCCCCAGAGCTGCTGCTTGGTGCCAAGGAATACTCCACGGC 1805
Query 1821 CGTGGACATGTGGTCAGTGGGTTGCATCTTCGGGGAGCTGCTGACTCAGAAGCCTCTGTTCCCCGGGAAGTCAG 1894
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Sbjct 1806 CGTGGACATGTGGTCAGTGGGCTGCATCTTCGGGGAGCTGCTGACTCAGAAGCCTCTGTTCCCCGGGAATTCGG 1879
Query 1895 AAATCGATCAGATCAACAAGGTGTTCAAGGATCTGGGGACCCCTAGTGAGAAAATCTGGCCCGGCTACAGCGAG 1968
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Sbjct 1880 AAATCGATCAGATCAACAAAGTGTTCAAGGAGCTGGGGACCCCCAGTGAGAAAATCTGGCCCGGCTACAGTGAG 1953
Query 1969 CTCCCAGCAGTCAAGAAGATGACCTTCAGCGAGCACCCCTACAACAACCTCCGCAAGCGCTTCGGGGCTCTGCT 2042
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Sbjct 1954 CTCCCAGTAGTCAAAAAGATGACCTTCAGCGAGCACCCCTACAACAACCTCCGCAAGCGCTTCGGGGCTCTGCT 2027
Query 2043 CTCAGACCAGGGCTTCGACCTCATGAACAAGTTCCTGACCTACTTCCCCGGGAGGAGGATCAGCGCTGAGGACG 2116
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Sbjct 2028 CTCAGACCAGGGCTTCGACCTCATGAACAAGTTCCTGACCTACTTCCCCGGGAGGAGGATCAGCGCTGAGGACG 2101
Query 2117 GCCTCAAGCATGAGTATTTCCGCGAGACCCCCCTCCCCATCGACCCCTCCATGTTCCCCACGTGGCCCGCCAAG 2190
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Sbjct 2102 GCCTCAAGCATGAGTATTTCCGCGAGACCCCCCTCCCCATCGACCCCTCCATGTTCCCCACGTGGCCCGCCAAG 2175
Query 2191 AGCGAGCAGCAGCGTGTGAAGCGGGGCACCAGCCCGAGGCCCCCTGAGGGAGGCCTGGGCTACAGCCAGCTGGG 2264
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Sbjct 2176 AGCGAGCAGCAGCGTGTGAAGCGGGGCACCAGCCCGAGGCCCCCTGAGGGAGGCCTGGGCTACAGCCAGCTGGG 2249
Query 2265 TGACGACGACCTGAAGGAGACGGGCTTCCACCTTACCACCACGAACCAGGGGGCCTCTGCCGCGGGCCCCGGCT 2338
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Sbjct 2250 TGACGACGACCTGAAGGAGACGGGCTTCCACCTTACCACCACGAACCAGGGGGCCTCTGCCGCGGGCCCCGGCT 2323
Query 2339 TCAGCCTCAAGTTC 2352
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Sbjct 2324 TCAGCCTCAAGTTC 2337
