Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14570
- Subject:
- NM_033486.3
- Aligned Length:
- 2355
- Identities:
- 2334
- Gaps:
- 12
Alignment
Query 1 ATGGGTGATGAAAAGGACTCTTGGAAAGTGAAAACTTTAGATGAAATTCTTCAGGAAAAGAAACGAAGGAAGGA 74
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Sbjct 1 ATGGGTGATGAAAAGGACTCTTGGAAAGTGAAAACTTTAGATGAAATTCTTCAGGAAAAGAAACGAAGGAAGGA 74
Query 75 ACAAGAGGAGAAAGCAGAGATAAAACGCTTAAAAAATTCTGATGACCGGGATTCCAAGCGGGATTCCCTTGAGG 148
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Sbjct 75 ACAAGAGGAGAAAGCAGAGATAAAACGCTTAAAAAATTCTGATGACCGGGATTCCAAGCGGGATTCCCTTGAGG 148
Query 149 AGGGGGAGCTGAGAGATCACCGCATGGAGATCACAATAAGGAACTCCCCGTATAGAAGAGAAGACTCTATGGAA 222
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Sbjct 149 AGGGGGAGCTGAGAGATCACCGCATGGAGATCACAATAAGGAACTCCCCGTATAGAAGAGAAGACTCTATGGAA 222
Query 223 GACAGAGGAGAAGAAGATGATTCTTTGGCCATCAAACCACCCCAGCAAATGTCTCGGAAAGAAAAAGCTCATCA 296
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Sbjct 223 GACAGAGGAGAAGAAGATGATTCTTTGGCCATCAAACCACCCCAGCAAATGTCTCGGAAAGAAAAAGCTCATCA 296
Query 297 CAGAAAAGATGAAAAGAGAAAAGAGAAACGTAGGCATCGTAGCCATTCAGCAGAAGGGGGGAAGCATGCTAGAG 370
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Sbjct 297 CAGAAAAGATGAAAAGAGAAAAGAGAAACGTAGGCATCGTAGCCATTCAGCAGAAGGGGGGAAGCATGCTAGAG 370
Query 371 TGAAAGAAAAAGAAAGAGAGCACGAACGTCGGAAACGGCATCGAGAAGAACAGGATAAAGCTCGCCGGGAATGG 444
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Sbjct 371 TGAAAGAAAAAGAAAGAGAGCACGAACGTCGGAAACGGCATCGAGAAGAACAGGATAAAGCTCGCCGGGAATGG 444
Query 445 GAAAGACAGAAGAGAAGGGAGATGGCAAGGGAGCATTCCAGGAGAGAAAGGGACCGCTTGGAGCAGTTAGAAAG 518
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Sbjct 445 GAAAGACAGAAGAGAAGGGAGATGGCAAGGGAGCATTCCAGGAGAGAAAGGGACCGCTTGGAGCAGTTAGAAAG 518
Query 519 GAAGCGGGAGCGGGAGCGCAAGATGCGGGAGCAGCAGAAGGAGCAGCGGGAGCAGAAGGAGCGCGAGCGGCGGG 592
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Sbjct 519 GAAGCGGGAGCGGGAGCGCAAGATGCGGGAGCAGCAGAAGGAGCAGCGGGAGCAGAAGGAGCGCGAGCGGCGGG 592
Query 593 CGGAGGAGCGGCGCAAGGAGCGGGAGGCCCGCAGGGAAGTGTCTGCACATCACCGAACGATGAGAGAGGACTAC 666
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Sbjct 593 CAGAGGAGCGGCGCAAGGAGCGGGAGGCCCGCAGGGAAGTGTCTGCACATCACCGAACGATGAGAGAGGACTAC 666
Query 667 AGCGACAAAGTGAAAGCCAGCCACTGGAGTCGCAGCCCGCCTCGGCCGCCGCGGGAGCGGTTCGAGTTGGGAGA 740
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Sbjct 667 AGCGACAAAGTGAAAGCCAGCCACTGGAGTCGCAGCCCGCCTCGGCCGCCGCGGGAGCGGTTCGAGTTGGGAGA 740
Query 741 CGGCCGGGAAGCCAGTAAAAG-AGAGAAAATGGAAGAAAGGGACCTGCTGTCCGACTTACAGGACATCAGCGAC 813
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Sbjct 741 CGGCC-GGAAGCCAGTAAAAGAAGAGAAAATGGAAGAAAGGGACCTGCTGTCCGACTTACAGGACATCAGCGAC 813
Query 814 AGCGAGAGGAAGACCAGCTCGGCCGAGTCCTCGTCAGCAGAATCAGGCTCAGGTTCTGAGGAAGAAGAGGAGGA 887
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Sbjct 814 AGCGAGAGGAAGACCAGCTCGGCCGAGTCCTCGTCAGCGGAATCAGGCTCAGGTTCTGAGGAAGAAGAGGAGGA 887
Query 888 GGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAAGGGAGCACCAGTGAAGAATCAGAGGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAAGAGGAGG 961
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Sbjct 888 GGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAAGGGAGCACCAGTGAAGAATCAGAGGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAAGAGGAGG 961
Query 962 AGGAGGAGACCGGCAGCAACTCTGAGGAGGCATCAGAGCAGTCTGCCGAAGAAGTAAGTGAGGAAGAAATGAGT 1035
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Sbjct 962 AGGAGGAGACCGGCAGCAACTCTGAGGAGGCATCAGAGCAGTCTGCCGAAGAAGTAAGTGAGGAAGAAATGAGT 1035
Query 1036 GAAGATGAAGAACGAGAAAATGAAAACCACCTCTTGGTTGTTCCAGAGTCACGGTTCGACCGAGATTCCGGGGA 1109
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Sbjct 1036 GAAGATGAAGAACGAGAAAATGAAAACCACCTCTTGGTTGTTCCAGAGTCACGGTTCGACCGAGATTCCGGGGA 1109
Query 1110 GAGTGAAGAAGCAGAGGAAGAAGTGGGTGAGGGAACGCCGCAGAGCAGCGCCCTGACAGAGGGCGACTATGTGC 1183
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Sbjct 1110 GAGTGAAGAAGCAGAGGAAGAAGTGGGTGAGGGAACGCCGCAGAGCAGCGCCCTGACAGAGGGCGACTATGTGC 1183
Query 1184 CCGACTCCCCTGCCCTGTCGCCCATCGAGCTCAAGCAGGAGCTGCCCAAGTACCTGCCGGCCCTGCAGGGCTGC 1257
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Sbjct 1184 CCGACTCCCCTGCCCTGTCGCCCATCGAGCTCAAGCAGGAGCTGCCCAAGTACCTGCCGGCCCTGCAGGGCTGC 1257
Query 1258 CGGAGCGTCGAGGAGTTCCAGTGCCTGAACAGGATCGAGGAGGGCACCTATGGAGTGGTCTACAGAGCAAAAGA 1331
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Sbjct 1258 CGGAGCGTCGAGGAGTTCCAGTGCCTGAACAGGATCGAGGAGGGCACCTATGGAGTGGTCTACAGAGCAAAAGA 1331
Query 1332 CAAGAAAACAGATGAAATTGTGGCTCTAAAGCGGCTGAAGATGGAGAAGGAGAAGGAGGGCTTCCCGATCACGT 1405
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Sbjct 1332 CAAGAAAACAGATGAAATTGTGGCTCTAAAGCGGCTGAAGATGGAGAAGGAGAAGGAGGGCTTCCCGATCACGT 1405
Query 1406 CGCTGAGGGAGATCAACACCATCCTCAAGGCCCAGCATCCCAACATCGTCACCGTTAGAGAGATTGTGGTGGGC 1479
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Sbjct 1406 CGCTGAGGGAGATCAACACCATCCTCAAGGCCCAGCATCCCAACATCGTCACCGTTAGAGAGATTGTGGTGGGC 1479
Query 1480 AGCAACATGGACAAGATCTACATCGTGATGAACTATGTGGAGCACGACCTCAAGAGCCTGATGGAGACCAGAAA 1553
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Sbjct 1480 AGCAACATGGACAAGATCTACATCGTGATGAACTATGTGGAGCACGACCTCAAGAGCCTGATGGAGACCATGAA 1553
Query 1554 ACAGCCCCTTCCTGCCAAGGGGAGGTGAAGACCCCTGAGAATCCAGGTTGGTGCGTGGGGGTGAAACACCTCCA 1627
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Sbjct 1554 ACAG-CCCTTCCTGCC-AGGGGAGGTGAAGA-CCCTGATGATCCA-GCTGCTGCGT-GGGGTGAAACACCTGCA 1622
Query 1628 CGACAAACT-GATCCCTGCACCGTGACCTCAAGACGTCC-ACCTGGCTGCTGAGCCACGCCGGCATCCTCAAGG 1699
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Sbjct 1623 CGAC-AACTGGAT-CCTGCACCGTGACCTCAAGACGTCCAACCT-GCTGCTGAGCCACGCCGGCATCCTCAAGG 1693
Query 1700 TGGGTGACTTCGGGCTGGCGCGGGAGTACGGATCCCCTCTGAAGGCCTACACCCCGGTCGTGGTGACCCTGTGG 1773
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Sbjct 1694 TGGGTGACTTCGGGCTGGCGCGGGAGTACGGATCCCCTCTGAAGGCCTACACCCCGGTCGTGGTGACCCTGTGG 1767
Query 1774 TACCGCGCCCCAGAGCTGCTGCTTGGTGCCAAGGAATACTCCACGGCCGTGGACATGTGGTCAGTGGGTTGCAT 1847
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Sbjct 1768 TACCGCGCCCCAGAGCTGCTGCTTGGTGCCAAGGAATACTCCACGGCCGTGGACATGTGGTCAGTGGGTTGCAT 1841
Query 1848 CTTCGGGGAGCTGCTGACTCAGAAGCCTCTGTTCCCCGGGAAGTCAGAAATCGATCAGATCAACAAGGTGTTCA 1921
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Sbjct 1842 CTTCGGGGAGCTGCTGACTCAGAAGCCTCTGTTCCCCGGGAAGTCAGAAATCGATCAGATCAACAAGGTGTTCA 1915
Query 1922 AGGATCTGGGGACCCCTAGTGAGAAAATCTGGCCCGGCTACAGCGAGCTCCCAGCAGTCAAGAAGATGACCTTC 1995
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Sbjct 1916 AGGATCTGGGGACCCCTAGTGAGAAAATCTGGCCCGGCTACAGCGAGCTCCCAGCAGTCAAGAAGATGACCTTC 1989
Query 1996 AGCGAGCACCCCTACAACAACCTCCGCAAGCGCTTCGGGGCTCTGCTCTCAGACCAGGGCTTCGACCTCATGAA 2069
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Sbjct 1990 AGCGAGCACCCCTACAACAACCTCCGCAAGCGCTTCGGGGCTCTGCTCTCAGACCAGGGCTTCGACCTCATGAA 2063
Query 2070 CAAGTTCCTGACCTACTTCCCCGGGAGGAGGATCAGCGCTGAGGACGGCCTCAAGCATGAGTATTTCCGCGAGA 2143
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Sbjct 2064 CAAGTTCCTGACCTACTTCCCCGGGAGGAGGATCAGCGCTGAGGACGGCCTCAAGCATGAGTATTTCCGCGAGA 2137
Query 2144 CCCCCCTCCCCATCGACCCCTCCATGTTCCCCACGTGGCCCGCCAAGAGCGAGCAGCAGCGTGTGAAGCGGGGC 2217
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Sbjct 2138 CCCCCCTCCCCATCGACCCCTCCATGTTCCCCACGTGGCCCGCCAAGAGCGAGCAGCAGCGTGTGAAGCGGGGC 2211
Query 2218 ACCAGCCCGAGGCCCCCTGAGGGAGGCCTGGGCTACAGCCAGCTGGGTGACGACGACCTGAAGGAGACGGGCTT 2291
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Sbjct 2212 ACCAGCCCGAGGCCCCCTGAGGGAGGCCTGGGCTACAGCCAGCTGGGTGACGACGACCTGAAGGAGACGGGCTT 2285
Query 2292 CCACCTTACCACCACGAACCAGGGGGCCTCTGCCGCGGGCCCCGGCTTCAGCCTCAAGTTC 2352
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Sbjct 2286 CCACCTTACCACCACGAACCAGGGGGCCTCTGCCGCGGGCCCCGGCTTCAGCCTCAAGTTC 2346