Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14570
• Subject: XM_006711065.4
• Aligned Length: 2393
• Identities: 2305
• Gaps: 79

Alignment

Query    1  ATGGGTGATGAAAAGGACTCTTGGAAAGTGAAAACTTTAGATGAAATTCTTCAGGAAAAGAAACGAAGGAAGGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGTGATGAAAAGGACTCTTGGAAAGTGAAAACTTTAGATGAAATTCTTCAGGAAAAGAAACGAAGGAAGGA  74

Query   75  ACAAGAGGAGAAAGCAGAGATAAAACGCTTAAAAAATTCTGATGACCGGGATTCCAAGCGGGATTCCCTTGAGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ACAAGAGGAGAAAGCAGAGATAAAACGCTTAAAAAATTCTGATGACCGGGATTCCAAGCGGGATTCCCTTGAGG  148

Query  149  AGGGGGAGCTGAGAGATCACCGCATGGAGATCACAATAAGGAACTCCCCGTATAGAAGAGAAGACTCTATGGAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGGGGGAGCTGAGAGATCACCGCATGGAGATCACAATAAGGAACTCCCCGTATAGAAGAGAAGACTCTATGGAA  222

Query  223  GACAGAGGAGAAGAAGATGATTCTTTGGCCATCAAACCACCCCAGCAAATGTCTCGGAAAGAAAAAGCTCATCA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GACAGAGGAGAAGAAGATGATTCTTTGGCCATCAAACCACCCCAGCAAATGTCTCGGAAAGAAAAAGCTCATCA  296

Query  297  CAGAAAAGATGAAAAGAGAAAAGAGAAACGTAGGCATCGTAGCCATTCAGCAGAAGGGGGGAAGCATGCTAGAG  370
            |||||||||||||||||||||||||||||                              |||||||||||||||
Sbjct  297  CAGAAAAGATGAAAAGAGAAAAGAGAAAC------------------------------GGAAGCATGCTAGAG  340

Query  371  TGAAAGAAAAAGAAAGAGAGCACGAACGTCGGAAACGGCATCGAGAAGAACAGGATAAAGCTCGCCGGGAATGG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  341  TGAAAGAAAAAGAAAGAGAGCACGAACGTCGGAAACGGCATCGAGAAGAACAGGATAAAGCTCGCCGGGAATGG  414

Query  445  GAAAGACAGAAGAGAAGGGAGATGGCAAGGGAGCATTCCAGGAGAGAAAGGGACCGCTTGGAGCAGTTAGAAAG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  415  GAAAGACAGAAGAGAAGGGAGATGGCAAGGGAGCATTCCAGGAGAGAAAGGGACCGCTTGGAGCAGTTAGAAAG  488

Query  519  GAAGCGGGAGCGGGAGCGCAAGATGCGGGAGCAGCAGAAGGAGCAGCGGGAGCAGAAGGAGCGCGAGCGGCGGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  489  GAAGCGGGAGCGGGAGCGCAAGATGCGGGAGCAGCAGAAGGAGCAGCGGGAGCAGAAGGAGCGCGAGCGGCGGG  562

Query  593  CGGAGGAGCGGCGCAAGGAGCGGGAGGCCCGCAGGGAAGTGTCTGCACATCACCGAACGATGAGAGAGGACTAC  666
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  563  CAGAGGAGCGGCGCAAGGAGCGGGAGGCCCGCAGGGAAGTGTCTGCACATCACCGAACGATGAGAGAGGACTAC  636

Query  667  AGCGACAAAGTGAAAGCCAGCCACTGGAGTCGCAGCCCGCCTCGGCCGCCGCGGGAGCGGTTCGAGTTGGGAGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  637  AGCGACAAAGTGAAAGCCAGCCACTGGAGTCGCAGCCCGCCTCGGCCGCCGCGGGAGCGGTTCGAGTTGGGAGA  710

Query  741  CGGCCGG--------------------------------GAAGCCAG------TAAAAG-AGAGAAAATGGAAG  775
            |||||||                                ||||||||      |||||| ||||||||||||||
Sbjct  711  CGGCCGGAAGCCAGGTGAGGCCAGGCCGGCGCCTGCGCAGAAGCCAGCACAGTTAAAAGAAGAGAAAATGGAAG  784

Query  776  AAAGGGACCTGCTGTCCGACTTACAGGACATCAGCGACAGCGAGAGGAAGACCAGCTCGGCCGAGTCCTCGTCA  849
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  785  AAAGGGACCTGCTGTCCGACTTACAGGACATCAGCGACAGCGAGAGGAAGACCAGCTCGGCCGAGTCCTCGTCA  858

Query  850  GCAGAATCAGGCTCAGGTTCTGAGGAAGAAGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAAGGGAGCACCAGTGA  923
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  859  GCGGAATCAGGCTCAGGTTCTGAGGAAGAAGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAAGGGAGCACCAGTGA  932

Query  924  AGAATCAGAGGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAGACCGGCAGCAACTCTGAGGAGGCATCAG  997
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  933  AGAATCAGAGGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAGACCGGCAGCAACTCTGAGGAGGCATCAG  1006

Query  998  AGCAGTCTGCCGAAGAAGTAAGTGAGGAAGAAATGAGTGAAGATGAAGAACGAGAAAATGAAAACCACCTCTTG  1071
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1007  AGCAGTCTGCCGAAGAAGTAAGTGAGGAAGAAATGAGTGAAGATGAAGAACGAGAAAATGAAAACCACCTCTTG  1080

Query 1072  GTTGTTCCAGAGTCACGGTTCGACCGAGATTCCGGGGAGAGTGAAGAAGCAGAGGAAGAAGTGGGTGAGGGAAC  1145
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1081  GTTGTTCCAGAGTCACGGTTCGACCGAGATTCCGGGGAGAGTGAAGAAGCAGAGGAAGAAGTGGGTGAGGGAAC  1154

Query 1146  GCCGCAGAGCAGCGCCCTGACAGAGGGCGACTATGTGCCCGACTCCCCTGCCCTGTCGCCCATCGAGCTCAAGC  1219
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1155  GCCGCAGAGCAGCGCCCTGACAGAGGGCGACTATGTGCCCGACTCCCCTGCCCTGTCGCCCATCGAGCTCAAGC  1228

Query 1220  AGGAGCTGCCCAAGTACCTGCCGGCCCTGCAGGGCTGCCGGAGCGTCGAGGAGTTCCAGTGCCTGAACAGGATC  1293
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1229  AGGAGCTGCCCAAGTACCTGCCGGCCCTGCAGGGCTGCCGGAGCGTCGAGGAGTTCCAGTGCCTGAACAGGATC  1302

Query 1294  GAGGAGGGCACCTATGGAGTGGTCTACAGAGCAAAAGACAAGAAAACAGATGAAATTGTGGCTCTAAAGCGGCT  1367
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1303  GAGGAGGGCACCTATGGAGTGGTCTACAGAGCAAAAGACAAGAAAACAGATGAAATTGTGGCTCTAAAGCGGCT  1376

Query 1368  GAAGATGGAGAAGGAGAAGGAGGGCTTCCCGATCACGTCGCTGAGGGAGATCAACACCATCCTCAAGGCCCAGC  1441
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1377  GAAGATGGAGAAGGAGAAGGAGGGCTTCCCGATCACGTCGCTGAGGGAGATCAACACCATCCTCAAGGCCCAGC  1450

Query 1442  ATCCCAACATCGTCACCGTTAGAGAGATTGTGGTGGGCAGCAACATGGACAAGATCTACATCGTGATGAACTAT  1515
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1451  ATCCCAACATCGTCACCGTTAGAGAGATTGTGGTGGGCAGCAACATGGACAAGATCTACATCGTGATGAACTAT  1524

Query 1516  GTGGAGCACGACCTCAAGAGCCTGATGGAGACCAGAAAACAGCCCCTTCCTGCCAAGGGGAGGTGAAGACCCCT  1589
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||
Sbjct 1525  GTGGAGCACGACCTCAAGAGCCTGATGGAGACCATGAAACAG-CCCTTCCTGCC-AGGGGAGGTGAAGA-CCCT  1595

Query 1590  GAGAATCCAGGTTGGTGCGTGGGGGTGAAACACCTCCACGACAAACT-GATCCCTGCACCGTGACCTCAAGACG  1662
            ||..||||| |.||.||||| ||||||||||||||.|||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1596  GATGATCCA-GCTGCTGCGT-GGGGTGAAACACCTGCACGAC-AACTGGAT-CCTGCACCGTGACCTCAAGACG  1665

Query 1663  TCC-ACCTGGCTGCTGAGCCACGCCGGCATCCTCAAGGTGGGTGACTTCGGGCTGGCGCGGGAGTACGGATCCC  1735
            ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1666  TCCAACCT-GCTGCTGAGCCACGCCGGCATCCTCAAGGTGGGTGACTTCGGGCTGGCGCGGGAGTACGGATCCC  1738

Query 1736  CTCTGAAGGCCTACACCCCGGTCGTGGTGACCCTGTGGTACCGCGCCCCAGAGCTGCTGCTTGGTGCCAAGGAA  1809
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1739  CTCTGAAGGCCTACACCCCGGTCGTGGTGACCCTGTGGTACCGCGCCCCAGAGCTGCTGCTTGGTGCCAAGGAA  1812

Query 1810  TACTCCACGGCCGTGGACATGTGGTCAGTGGGTTGCATCTTCGGGGAGCTGCTGACTCAGAAGCCTCTGTTCCC  1883
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1813  TACTCCACGGCCGTGGACATGTGGTCAGTGGGTTGCATCTTCGGGGAGCTGCTGACTCAGAAGCCTCTGTTCCC  1886

Query 1884  CGGGAAGTCAGAAATCGATCAGATCAACAAGGTGTTCAAGGATCTGGGGACCCCTAGTGAGAAAATCTGGCCCG  1957
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Sbjct 1887  CGGGAAGTCAGAAATCGATCAGATCAACAAGGTGTTCAAGGATCTGGGGACCCCTAGTGAGAAAATCTGGCCCG  1960

Query 1958  GCTACAGCGAGCTCCCAGCAGTCAAGAAGATGACCTTCAGCGAGCACCCCTACAACAACCTCCGCAAGCGCTTC  2031
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Sbjct 1961  GCTACAGCGAGCTCCCAGCAGTCAAGAAGATGACCTTCAGCGAGCACCCCTACAACAACCTCCGCAAGCGCTTC  2034

Query 2032  GGGGCTCTGCTCTCAGACCAGGGCTTCGACCTCATGAACAAGTTCCTGACCTACTTCCCCGGGAGGAGGATCAG  2105
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2035  GGGGCTCTGCTCTCAGACCAGGGCTTCGACCTCATGAACAAGTTCCTGACCTACTTCCCCGGGAGGAGGATCAG  2108

Query 2106  CGCTGAGGACGGCCTCAAGCATGAGTATTTCCGCGAGACCCCCCTCCCCATCGACCCCTCCATGTTCCCCACGT  2179
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2109  CGCTGAGGACGGCCTCAAGCATGAGTATTTCCGCGAGACCCCCCTCCCCATCGACCCCTCCATGTTCCCCACGT  2182

Query 2180  GGCCCGCCAAGAGCGAGCAGCAGCGTGTGAAGCGGGGCACCAGCCCGAGGCCCCCTGAGGGAGGCCTGGGCTAC  2253
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Sbjct 2183  GGCCCGCCAAGAGCGAGCAGCAGCGTGTGAAGCGGGGCACCAGCCCGAGGCCCCCTGAGGGAGGCCTGGGCTAC  2256

Query 2254  AGCCAGCTGGGTGACGACGACCTGAAGGAGACGGGCTTCCACCTTACCACCACGAACCAGGGGGCCTCTGCCGC  2327
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Sbjct 2257  AGCCAGCTGGGTGACGACGACCTGAAGGAGACGGGCTTCCACCTTACCACCACGAACCAGGGGGCCTCTGCCGC  2330

Query 2328  GGGCCCCGGCTTCAGCCTCAAGTTC  2352
            |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2331  GGGCCCCGGCTTCAGCCTCAAGTTC  2355