Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14570
- Subject:
- XM_017002927.2
- Aligned Length:
- 2423
- Identities:
- 2229
- Gaps:
- 184
Alignment
Query 1 ATGGGTGATGAAAAGGACTCTTGGAAAGTGAAAACTTTAGATGAAATTCTTCAGGAAAAGAAACGAAGGAAGGA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 ACAAGAGGAGAAAGCAGAGATAAAA---CGCTTAAAAAATTCTGATGACCGGGATTCCAAGCGGGATTCCCTTG 145
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Sbjct 1 ------------------------ATGTCGC-------AGTCTGATGACCGGGATTCCAAGCGGGATTCCCTTG 43
Query 146 AGGAGGGGGAGCTGAGAGATCACCGCATGGAGATCACAATAAGGAACTCCCCGTATAGAAGAGAAGACTCTATG 219
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Sbjct 44 AGGAGGGGGAGCTGAGAGATCACCGCATGGAGATCACAATAAGGAACTCCCCGTATAGAAGAGAAGACTCTATG 117
Query 220 GAAGACAGAGGAGAAGAAGATGATTCTTTGGCCATCAAACCACCCCAGCAAATGTCTCGGAAAGAAAAAGCTCA 293
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Sbjct 118 GAAGACAGAGGAGAAGAAGATGATTCTTTGGCCATCAAACCACCCCAGCAAATGTCTCGGAAAGAAAAAGCTCA 191
Query 294 TCACAGAAAAGATGAAAAGAGAAAAGAGAAACGTAGGCATCGTAGCCATTCAGCAGAAGGGGGGAAGCATGCTA 367
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Sbjct 192 TCACAGAAAAGATGAAAAGAGAAAAGAGAAACGTAGGCATCGTAGCCATTCAGCAGAAGGGGGGAAGCATGCTA 265
Query 368 GAGTGAAAGAAAAAGAAAGAGAGCACGAACGTCGGAAACGGCATCGAGAAGAACAGGATAAAGCTCGCCGGGAA 441
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Sbjct 266 GAGTGAAAGAAAAAGAAAGAGAGCACGAACGTCGGAAACGGCATCGAGAAGAACAGGATAAAGCTCGCCGGGAA 339
Query 442 TGGGAAAGACAGAAGAGAAGGGAGATGGCAAGGGAGCATTCCAGGAGAGAA----------------------- 492
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Sbjct 340 TGGGAAAGACAGAAGAGAAGGGAGATGGCAAGGGAGCATTCCAGGAGAGAAAGGGGGAATGATGGCGTGTGCCT 413
Query 493 ----AGGGACCGCTTGGAGCAGTTAGAAAGGAAGCGGGAGCGGGAGCGCAAGATGCGGGAGCAGCAGAAGGAGC 562
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Sbjct 414 CTTCAGGGACCGCTTGGAGCAGTTAGAAAGGAAGCGGGAGCGGGAGCGCAAGATGCGGGAGCAGCAGAAGGAGC 487
Query 563 AGCGGGAGCAGAAGGAGCGCGAGCGGCGGGCGGAGGAGCGGCGCAAGGAGCGGGAGGCCCGCAGGGAAGTGTCT 636
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Sbjct 488 AGCGGGAGCAGAAGGAGCGCGAGCGGCGGGCAGAGGAGCGGCGCAAGGAGCGGGAGGCCCGCAGGGAAGTGTCT 561
Query 637 GCACATCACCGAACGATGAGAGAGGACTACAGCGACAAAGTGAAAGCCAGCCACTGGAGTCGCAGCCCGCCTCG 710
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Sbjct 562 GCACATCACCGAACGATGAGAGAGGACTACAGCGACAAAGTGAAAGCCAGCCACTGGAGTCGCAGCCCGCCTCG 635
Query 711 GCCGCCGCGGGAGCGGTTCGAGTTGGGAGACGGCCGG--------------------------------GAAGC 752
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Sbjct 636 GCCGCCGCGGGAGCGGTTCGAGTTGGGAGACGGCCGGAAGCCAGGTGAGGCCAGGCCGGCGCCTGCGCAGAAGC 709
Query 753 CAG------TAAAAG-AGAGAAAATGGAAGAAAGGGACCTGCTGTCCGACTTACAGGACATCAGCGACAGCGAG 819
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Sbjct 710 CAGCACAGTTAAAAGAAGAGAAAATGGAAGAAAGGGACCTGCTGTCCGACTTACAGGACATCAGCGACAGCGAG 783
Query 820 AGGAAGACCAGCTCGGCCGAGTCCTCGTCAGCAGAATCAGGCTCAGGTTCTGAGGAAGAAGAGGAGGAGGAGGA 893
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Sbjct 784 AGGAAGACCAGCTCGGCCGAGTCCTCGTCAGCGGAATCAGGCTCAGGTTCTGAGGAAGAAGAGGAGGAGGAGGA 857
Query 894 AGAGGAGGAGGAGGAAGGGAGCACCAGTGAAGAATCAGAGGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAAGAGGAGGAGGAGG 967
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Sbjct 858 AGAGGAGGAGGAGGAAGGGAGCACCAGTGAAGAATCAGAGGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAAGAGGAGGAGGAGG 931
Query 968 AGACCGGCAGCAACTCTGAGGAGGCATCAGAGCAGTCTGCCGAAGAAGTAAGTGAGGAAGAAATGAGTGAAGAT 1041
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Sbjct 932 AGACCGGCAGCAACTCTGAGGAGGCATCAGAGCAGTCTGCCGAAGAAGTAAGTGAGGAAGAAATGAGTGAAGAT 1005
Query 1042 GAAGAACGAGAAAATGAAAACCACCTCTTGGTTGTTCCAGAGTCACGGTTCGACCGAGATTCCGGGGAGAGTGA 1115
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Sbjct 1006 GAAGAACGAGAAAATGAAAACCACCTCTTGGTTGTTCCAGAGTCACGGTTCGACCGAGATTCCGGGGAGAGTGA 1079
Query 1116 AGAAGCAGAGGAAGAAGTGGGTGAGGGAACGCCGCAGAGCAGCGCCCTGACAGAGGGCGACTATGTGCCCGACT 1189
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Sbjct 1080 AGAAGCAGAGGAAGAAGTGGGTGAGGGAACGCCGCAGAGCAGCGCCCTGACAGAGGGCGACTATGTGCCCGACT 1153
Query 1190 CCCCTGCCCTGTCGCCCATCGAGCTCAAGCAGGAGCTGCCCAAGTACCTGCCGGCCCTGCAGGGCTGCCGGAGC 1263
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Sbjct 1154 CCCCTGCCCTGTCGCCCATCGAGCTCAAGCAGGAGCTGCCCAAGTACCTGCCGGCCCTGCAGGGCTGCCGGAGC 1227
Query 1264 GTCGAGGAGTTCCAGTGCCTGAACAGGATCGAGGAGGGCACCTATGGAGTGGTCTACAGAGCAAAAGACAAGAA 1337
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Sbjct 1228 GTCGAGGAGTTCCAGTGCCTGAACAGGATCGAGGAGGGCACCTATGGAGTGGTCTACAGAGCAAAAGACAAGAA 1301
Query 1338 AACAGATGAAATTGTGGCTCTAAAGCGGCTGAAGATGGAGAAGGAGAAGGAGGGCTTCCCGATCACGTCGCTGA 1411
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Sbjct 1302 AACAGATGAAATTGTGGCTCTAAAGCGGCTGAAGATGGAGAAGGAGAAGGAGGGCTTCCCGATCACGTCGCTGA 1375
Query 1412 GGGAGATCAACACCATCCTCAAGGCCCAGCATCCCAACATCGTCACCGTTAGAGAGATTGTGGTGGGCAGCAAC 1485
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Sbjct 1376 GGGAGATCAACACCATCCTCAAGGCCCAGCATCCCAACATCGTCACCGTTAGAGAGATTGTGGTGGGCAGCAAC 1449
Query 1486 ATGGACAAGATCTACATCGTGATGAACTATGTGGAGCACGACCTCAAGAGCCTGATGGAGACCAGAAAACAGCC 1559
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Sbjct 1450 ATGGACAAGATCTACATCGTGATGAACTATGTGGAGCACGACCTCAAGAGCCTGATGGAGACCATGAAACAG-C 1522
Query 1560 CCTTCCTGCCAAGGGGAGGTGAAGACCCCTGAGAATCCAGGTTGGTGCGTGGGGGTGAAACACCTCCACGACAA 1633
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Sbjct 1523 CCTTCCTGCC-AGGGGAGGTGAAGA-CCCTGATGATCCA-GCTGCTGCGT-GGGGTGAAACACCTGCACGAC-A 1591
Query 1634 ACT-GATCCCTGCACCGTGACCTCAAGACGTCC-ACCTGGCTGCTGAGCCACGCCGGCATCCTCAAGGTGGGTG 1705
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Sbjct 1592 ACTGGAT-CCTGCACCGTGACCTCAAGACGTCCAACCT-GCTGCTGAGCCACGCCGGCATCCTCAAGGTGGGTG 1663
Query 1706 ACTTCGGGCTGGCGCGGGAGTACGGATCCCCTCTGAAGGCCTACACCCCGGTCGTGGTGACCCTGTGGTACCGC 1779
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Sbjct 1664 ACTTCGGGCTGGCGCGGGAGTACGGATCCCCTCTGAAGGCCTACACCCCGGTCGTGGTGACCCTGTGGTACCGC 1737
Query 1780 GCCCCAGAGCTGCTGCTTGGTGCCAAGGAATACTCCACGGCCGTGGACATGTGGTCAGTGGGTTGCATCTTCGG 1853
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Sbjct 1738 GCCCCAGAGCTGCTGCTTGGTGCCAAGGAATACTCCACGGCCGTGGACATGTGGTCAGTGGGTTGCATCTTCGG 1811
Query 1854 GGAGCTGCTGACTCAGAAGCCTCTGTTCCCCGGGAAGTCAGAAATCGATCAGATCAACAAGGTGTTCAAGGATC 1927
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Sbjct 1812 GGAGCTGCTGACTCAGAAGCCTCTGTTCCCCGGGAAGTCAGAAATCGATCAGATCAACAAGGTGTTCAAGGATC 1885
Query 1928 TGGGGACCCCTAGTGAGAAAATCTGGCCCGGCTACAGCGAGCTCCCAGCAGTCAAGAAGATGACCTTCAGCGAG 2001
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Sbjct 1886 TGGGGACCCCTAGTGAGAAAATCTGGCCCGGCTACAGCGAGCTCCCAGCAGTCAAGAAGATGACCTTCAGCGAG 1959
Query 2002 CACCCCTACAACAACCTCCGCAAGCGCTTCGGGGCTCTGCTCTCAGACCAGGGCTTCGACCTCATGAACAAGTT 2075
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Sbjct 1960 CACCCCTACAACAACCTCCGCAAGCGCTTCGGGGCTCTGCTCTCAGACCAGGGCTTCGACCTCATGAACAAGTT 2033
Query 2076 CCTGACCTACTTCCCCGGGAGGAGGATCAGCGCTGAGGACGGCCTCAAGCATGAGTATTTCCGCGAGACCCCCC 2149
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Sbjct 2034 CCTGACCTACTTCCCCGGGAGGAGGATCAGCGCTGAGGACGGCCTCAAGCATGAGTATTTCCGCGAGACCCCCC 2107
Query 2150 TCCCCATCGACCCCTCCATGTTCCCCACGTGGCCCGCCAAGAGCGAGCAGCAGCGTGTGAAGCGGGGCACCAGC 2223
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Sbjct 2108 TCCCCATCGACCCCTCCATGTTCCCCACGTGGCCCGCCAAGAGCGAGCAGCAGCGTGTGAAGCGGGGCACCAGC 2181
Query 2224 CCGAGGCCCCCTGAGGGAGGCCTGGGCTACAGCCAGCTGGGTGACGACGACCTGAAGGAGACGGGCTTCCACCT 2297
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Sbjct 2182 CCGAGGCCCCCTGAGGGAGGCCTGGGCTACAGCCAGCTGGGTGACGACGACCTGAAGGAGACGGGCTTCCACCT 2255
Query 2298 TACCACCACGAACCAGGGGGCCTCTGCCGCGGGCCCCGGCTTCAGCCTCAAGTTC 2352
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Sbjct 2256 TACCACCACGAACCAGGGGGCCTCTGCCGCGGGCCCCGGCTTCAGCCTCAAGTTC 2310