Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14578
- Subject:
- NM_153599.4
- Aligned Length:
- 1418
- Identities:
- 1146
- Gaps:
- 116
Alignment
Query 1 ATGGACTATGACTTTAAAGTGAAGCTGAGCAGCGAGCGGGAGCGGGTCGAGGACCTGTTTGAATACGAGGGCTG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGACTATGACTTTAAAGTGAAGCTGAGCAGCGAGCGGGAGCGGGTCGAGGACCTGTTTGAATACGAGGGCTG 74
Query 75 CAAAGTTGGCCGAGGCACTTATGGTCACGTCTACAAAGCCAAGAGGAAAGATGGGAAGGATGATAAAGACTATG 148
|||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 75 CAAAGTTGGTCGAGGCACTTACGGGCACGTCTACAAGGCGAAGAGGAAAGATGGGAAGGACGATAAAGACTACG 148
Query 149 CTTTAAAACAAATAGAAGGAACTGGGATCTCTATGTCGGCATGTAGAGAAATAGCATTACTTCGAGAGCTTAAG 222
|||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct 149 CTTTAAAACAAATAGAAGGAACTGGAATTTCTATGTCGGCATGCAGAGAGATAGCATTACTCCGAGAGCTTAAG 222
Query 223 CATCCAAACGTCATTTCTCTTCAAAAGGTGTTTCTGTCTCATGCTGATAGGAAGGTGTGGCTTCTGTTTGACTA 296
||.|||||||||||.||.||||..||||||||||||||||||||||||.||||.||.||||||||.||||||||
Sbjct 223 CACCCAAACGTCATCTCCCTTCTGAAGGTGTTTCTGTCTCATGCTGATCGGAAAGTATGGCTTCTCTTTGACTA 296
Query 297 TGCTGAACATGACCTCTGGCATATAATCAAGTTTCACAGAGCTTCTAAAGCAAACAAGAAGCCAGTTCAGTTAC 370
||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TGCTGAGCATGACCTCTGGCATATAATTAAGTTTCACAGAGCTTCGAAAGCCAACAAGAAGCCAGTTCAGTTAC 370
Query 371 CTCGGGGAATGGTGAAGTCACTATTATATCAGATCCTAGATGGTATTCACTACCTGCATGCTAACTGGGTGTTG 444
||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||
Sbjct 371 CTCGGGGAATGGTGAAGTCACTGTTGTACCAGATCCTAGATGGGATTCACTATCTTCATGCCAACTGGGTGTTG 444
Query 445 CACAGAGATTTGAAACCTGCTAATATTTTAGTTATGGGTGAAGGTCCTGAGCGAGGAAGAGTAAAAATTGCTGA 518
|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CACAGGGATTTGAAACCTGCTAATATTTTAGTTATGGGTGAAGGTCCTGAGCGAGGAAGAGTAAAAATTGCTGA 518
Query 519 CATGGGCTTTGCCCGATTATTTAATTCACCTTTGAAGCCTTTAGCAGATTTGGATCCAGTGGTTGTTACATTCT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 519 CATGGGCTTTGCCCGATTATTTAATTCACCTTTGAAGCCTTTAGCAGATTTGGATCCAGTGGTTGTAACATTCT 592
Query 593 GGTACCGAGCCCCTGAACTACTTCTTGGAGCAAGGCATTATACCAAAGCTATTGATATTTGGGCTCTCGACAGC 666
||||||||||.||.|||.||||.||.|||||..|.||||||||||||||.|||||||||||||||.|.|...|.
Sbjct 593 GGTACCGAGCTCCAGAATTACTCCTCGGAGCGCGACATTATACCAAAGCAATTGATATTTGGGCTATAGGGTGT 666
Query 667 ATA----CAGCATGAA-TGCTAACGCTAATGGAC-------TCAC-GTCGACATGCCGTCGCAAGG-CATC--A 724
||| || ||| |.||||||..| |.|| |||| |||||||.| ||| |||| |
Sbjct 667 ATATTTGCA----GAACTACTAACGTCA--GAACCAATATTTCACTGTCGACAAG--------AGGACATCAAA 726
Query 725 ACTAGT-ATCTATA----CATGA-CAGCT-GAC-GAA---TCAGTAT----GGATT--CTGCAGTAGATGTAGA 781
|||||| |||..|| ||||| ||||| ||| ||| |||.|.| ||||| |||| ||||..|||
Sbjct 727 ACTAGTAATCCTTATCACCATGACCAGCTGGACAGAATATTCAATGTAATGGGATTCCCTGC---AGATAAAGA 797
Query 782 TT------------AAAAGATGCCTG-ACAT--CACAT--ATGAGA---TTCAGA--GAATACGTATACCAACT 833
|| ||||||||||.| |||| .|||| ||||.| |||||| .||||||||||||||.|
Sbjct 798 TTGGGAAGATATAAAAAAGATGCCCGAACATTCAACATTAATGAAAGATTTCAGAAGAAATACGTATACCAATT 871
Query 834 GCAGCC-TATCAAGTATATG--AAAACATAAAGTT-AACCAGATAGTAAAGCATT-CACTTGC-TCAGAAGCTG 901
|||||| ||||||||||||| |||.||||||||| ||||.|||||||||||||| ||||||| |||||||.||
Sbjct 872 GCAGCCTTATCAAGTATATGGAAAAGCATAAAGTTAAACCCGATAGTAAAGCATTCCACTTGCTTCAGAAGTTG 945
Query 902 CTTACCAT-GACCCAATAAAGCGAA-TACCTCAGA-CA-GCTATGCAGGACCCCTA-TTTCTAG-AGAC---CA 966
||.||.|| |||||||||||||||| ||||||||| || ||.|||||||||||||| ||.|||| |||| |.
Sbjct 946 CTCACTATGGACCCAATAAAGCGAATTACCTCAGAGCAGGCCATGCAGGACCCCTACTTCCTAGAAGACCCACT 1019
Query 967 TTCTACATCAGACGTTTTTGCCGG-TGTCAAATCC---TTCCCAAAACGGGAATTTT--ACCGAAGAGGA-CCT 1033
|.|.||.|||||.|||||.||||| |||||.|||| .|||| |||||.||||||| ||.|||||.|| |||
Sbjct 1020 TCCCACGTCAGATGTTTTCGCCGGTTGTCAGATCCCATATCCC-AAACGAGAATTTTTAACAGAAGAAGAGCCT 1092
Query 1034 GATGGCAAAGG-GACCAAAA----CAGGCGCCACAGGAAGGCCATTACCAACA-TAAAGGAACTGGCCCCCCCG 1101
||||..||||| |||.|||| |||..||..|||.|.|||.|..||| ||| |||.||||||||||..||.|
Sbjct 1093 GATGAGAAAGGAGACAAAAAGACCCAGCAGCAGCAGCAGGGCAACAACC-ACACTAACGGAACTGGCCATCCGG 1165
Query 1102 GGAATCCAGG-CCGCCGTTCCCCCCCGGGGCCCCCGGTGAAGGAAATGAGAAGTGTTCCTCCTTCCCATACCTT 1174
|||| ||||| |.||.|...|.|.|.|||||||||..||||..||.|||||..|||.||||||.||..|||| |
Sbjct 1166 GGAA-CCAGGACAGCGGCCACGCACAGGGGCCCCCCTTGAAAAAAGTGAGAGTTGTCCCTCCTACCACTACC-T 1237
Query 1175 CGGGGGGACT-ATCCAGGCCTTCGGCCATTAGGGGTTCCATTCC-CCTGCCGCCTATTCCCACCCCGGGCCCAG 1246
|.||.||||| |||..|.|||.||.|.||.| |.||||||.||| |.|||.||.|| |||||.|||.||.|||.
Sbjct 1238 CAGGTGGACTCATCATGACCTCCGACTATCA-GCGTTCCAATCCACATGCTGCTTA-TCCCAACCCTGGACCAA 1309
Query 1247 CCCCTTCCCA-CCGCAGAGCCGCCAGGGATAATTCAG-TACCTTCCCA-CCGCCTTCCCCAG-ACTCCCCTTCG 1316
.|.|.||.|| ||.||||||.||..||||| |.|||| |||| ||||| |.||| |||.||| ||||.|.|..|
Sbjct 1310 GCACATCACAGCCCCAGAGCAGCATGGGAT-ACTCAGCTACC-TCCCAGCAGCC-TCCACAGTACTCACATCAG 1380
Query 1317 GCCCATTGGGAA 1328
.|.|||.||.|.
Sbjct 1381 ACACATCGGTAC 1392