Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14578
• Subject: XM_006504836.4
• Aligned Length: 1419
• Identities: 1136
• Gaps: 133

Alignment

Query    1  ATGGACTATGACTTTAAAGTGAAGCTGAGCAGCGAGCGGGAGCGGGTCGAGGACCTGTTTGAATACGAGGGCTG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGACTATGACTTTAAAGTGAAGCTGAGCAGCGAGCGGGAGCGGGTCGAGGACCTGTTTGAATACGAGGGCTG  74

Query   75  CAAAGTTGGCCGAGGCACTTATGGTCACGTCTACAAAGCCAAGAGGAAAGATGGGAAGGATGATAAAGACTATG  148
            |||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct   75  CAAAGTTGGTCGAGGCACTTACGGGCACGTCTACAAGGCGAAGAGGAAAGATGGGAAGGACGATAAAGACTACG  148

Query  149  CTTTAAAACAAATAGAAGGAACTGGGATCTCTATGTCGGCATGTAGAGAAATAGCATTACTTCGAGAGCTTAAG  222
            |||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct  149  CTTTAAAACAAATAGAAGGAACTGGAATTTCTATGTCGGCATGCAGAGAGATAGCATTACTCCGAGAGCTTAAG  222

Query  223  CATCCAAACGTCATTTCTCTTCAAAAGGTGTTTCTGTCTCATGCTGATAGGAAGGTGTGGCTTCTGTTTGACTA  296
            ||.|||||||||||.||.||||..||||||||||||||||||||||||.||||.||.||||||||.||||||||
Sbjct  223  CACCCAAACGTCATCTCCCTTCTGAAGGTGTTTCTGTCTCATGCTGATCGGAAAGTATGGCTTCTCTTTGACTA  296

Query  297  TGCTGAACATGACCTCTGGCATATAATCAAGTTTCACAGAGCTTCTAAAGCAAACAAGAAGCCAGTTCAGTTAC  370
            ||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGCTGAGCATGACCTCTGGCATATAATTAAGTTTCACAGAGCTTCGAAAGCCAACAAGAAGCCAGTTCAGTTAC  370

Query  371  CTCGGGGAATGGTGAAGTCACTATTATATCAGATCCTAGATGGTATTCACTACCTGCATGCTAACTGGGTGTTG  444
            ||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||
Sbjct  371  CTCGGGGAATGGTGAAGTCACTGTTGTACCAGATCCTAGATGGGATTCACTATCTTCATGCCAACTGGGTGTTG  444

Query  445  CACAGAGATTTGAAACCTGCTAATATTTTAGTTATGGGTGAAGGTCCTGAGCGAGGAAGAGTAAAAATTGCTGA  518
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CACAGGGATTTGAAACCTGCTAATATTTTAGTTATGGGTGAAGGTCCTGAGCGAGGAAGAGTAAAAATTGCTGA  518

Query  519  CATGGGCTTTGCCCGATTATTTAATTCACCTTTGAAGCCTTTAGCAGATTTGGATCCAGTGGTTGTTACATTCT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  519  CATGGGCTTTGCCCGATTATTTAATTCACCTTTGAAGCCTTTAGCAGATTTGGATCCAGTGGTTGTAACATTCT  592

Query  593  GGTACCGAGCCCCTGAACTACTTCTTGGAGCAAGGCATTATACCAAAGCTATTG-----ATATTTGGGCTCTCG  661
            ||||||||||.||.|||.||||.||.|||||..|.||||||||||||||.||||     |||||||        
Sbjct  593  GGTACCGAGCTCCAGAATTACTCCTCGGAGCGCGACATTATACCAAAGCAATTGGGTGTATATTTG--------  658

Query  662  ACAGCATACAGCATGAA-TGCTAACGCTAATGGAC-------TCAC-GTCGACATGCCGTCGCAAGG-CATC--  723
             ||           ||| |.||||||..|  |.||       |||| |||||||.|        ||| ||||  
Sbjct  659  -CA-----------GAACTACTAACGTCA--GAACCAATATTTCACTGTCGACAAG--------AGGACATCAA  710

Query  724  AACTAGT-ATCTATA----CATGA-CAGCT-GAC-GAA---TCAGTAT----GGATT--CTGCAGTAGATGTAG  780
            ||||||| |||..||    ||||| ||||| ||| |||   |||.|.|    |||||  ||||   ||||..||
Sbjct  711  AACTAGTAATCCTTATCACCATGACCAGCTGGACAGAATATTCAATGTAATGGGATTCCCTGC---AGATAAAG  781

Query  781  ATT------------AAAAGATGCCTG-ACAT--CACAT--ATGAGA---TTCAGA--GAATACGTATACCAAC  832
            |||            ||||||||||.| ||||  .||||  ||||.|   ||||||  .||||||||||||||.
Sbjct  782  ATTGGGAAGATATAAAAAAGATGCCCGAACATTCAACATTAATGAAAGATTTCAGAAGAAATACGTATACCAAT  855

Query  833  TGCAGCC-TATCAAGTATATG--AAAACATAAAGTT-AACCAGATAGTAAAGCATT-CACTTGC-TCAGAAGCT  900
            ||||||| |||||||||||||  |||.||||||||| ||||.|||||||||||||| ||||||| |||||||.|
Sbjct  856  TGCAGCCTTATCAAGTATATGGAAAAGCATAAAGTTAAACCCGATAGTAAAGCATTCCACTTGCTTCAGAAGTT  929

Query  901  GCTTACCAT-GACCCAATAAAGCGAA-TACCTCAGA-CA-GCTATGCAGGACCCCTA-TTTCTAG-AGAC---C  965
            |||.||.|| |||||||||||||||| ||||||||| || ||.|||||||||||||| ||.|||| ||||   |
Sbjct  930  GCTCACTATGGACCCAATAAAGCGAATTACCTCAGAGCAGGCCATGCAGGACCCCTACTTCCTAGAAGACCCAC  1003

Query  966  ATTCTACATCAGACGTTTTTGCCGG-TGTCAAATCC---TTCCCAAAACGGGAATTTT--ACCGAAGAGGA-CC  1032
            .|.|.||.|||||.|||||.||||| |||||.||||   .|||| |||||.|||||||  ||.|||||.|| ||
Sbjct 1004  TTCCCACGTCAGATGTTTTCGCCGGTTGTCAGATCCCATATCCC-AAACGAGAATTTTTAACAGAAGAAGAGCC  1076

Query 1033  TGATGGCAAAGG-GACCAAAA----CAGGCGCCACAGGAAGGCCATTACCAACA-TAAAGGAACTGGCCCCCCC  1100
            |||||..||||| |||.||||    |||..||..|||.|.|||.|..||| ||| |||.||||||||||..||.
Sbjct 1077  TGATGAGAAAGGAGACAAAAAGACCCAGCAGCAGCAGCAGGGCAACAACC-ACACTAACGGAACTGGCCATCCG  1149

Query 1101  GGGAATCCAGG-CCGCCGTTCCCCCCCGGGGCCCCCGGTGAAGGAAATGAGAAGTGTTCCTCCTTCCCATACCT  1173
            ||||| ||||| |.||.|...|.|.|.|||||||||..||||..||.|||||..|||.||||||.||..|||| 
Sbjct 1150  GGGAA-CCAGGACAGCGGCCACGCACAGGGGCCCCCCTTGAAAAAAGTGAGAGTTGTCCCTCCTACCACTACC-  1221

Query 1174  TCGGGGGGACT-ATCCAGGCCTTCGGCCATTAGGGGTTCCATTCC-CCTGCCGCCTATTCCCACCCCGGGCCCA  1245
            ||.||.||||| |||..|.|||.||.|.||.| |.||||||.||| |.|||.||.|| |||||.|||.||.|||
Sbjct 1222  TCAGGTGGACTCATCATGACCTCCGACTATCA-GCGTTCCAATCCACATGCTGCTTA-TCCCAACCCTGGACCA  1293

Query 1246  GCCCCTTCCCA-CCGCAGAGCCGCCAGGGATAATTCAG-TACCTTCCCA-CCGCCTTCCCCAG-ACTCCCCTTC  1315
            ..|.|.||.|| ||.||||||.||..||||| |.|||| |||| ||||| |.||| |||.||| ||||.|.|..
Sbjct 1294  AGCACATCACAGCCCCAGAGCAGCATGGGAT-ACTCAGCTACC-TCCCAGCAGCC-TCCACAGTACTCACATCA  1364

Query 1316  GGCCCATTGGGAA  1328
            |.|.|||.||.|.
Sbjct 1365  GACACATCGGTAC  1377