Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14578
• Subject: XM_006504838.4
• Aligned Length: 1418
• Identities: 1110
• Gaps: 155

Alignment

Query    1  ATGGACTATGACTTTAAAGTGAAGCTGAGCAGCGAGCGGGAGCGGGTCGAGGACCTGTTTGAATACGAGGGCTG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGACTATGACTTTAAAGTGAAGCTGAGCAGCGAGCGGGAGCGGGTCGAGGACCTGTTTGAATACGAGGGCTG  74

Query   75  CAAAGTTGGCCGAGGCACTTATGGTCACGTCTACAAAGCCAAGAGGAAAGATGGGAAGGATGATAAAGACTATG  148
            |||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct   75  CAAAGTTGGTCGAGGCACTTACGGGCACGTCTACAAGGCGAAGAGGAAAGATGGGAAGGACGATAAAGACTACG  148

Query  149  CTTTAAAACAAATAGAAGGAACTGGGATCTCTATGTCGGCATGTAGAGAAATAGCATTACTTCGAGAGCTTAAG  222
            |||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct  149  CTTTAAAACAAATAGAAGGAACTGGAATTTCTATGTCGGCATGCAGAGAGATAGCATTACTCCGAGAGCTTAAG  222

Query  223  CATCCAAACGTCATTTCTCTTCAAAAGGTGTTTCTGTCTCATGCTGATAGGAAGGTGTGGCTTCTGTTTGACTA  296
            ||.|||||||||||.||.||||..||||||||||||||||||||||||.||||                     
Sbjct  223  CACCCAAACGTCATCTCCCTTCTGAAGGTGTTTCTGTCTCATGCTGATCGGAA---------------------  275

Query  297  TGCTGAACATGACCTCTGGCATATAATCAAGTTTCACAGAGCTTCTAAAGCAAACAAGAAGCCAGTTCAGTTAC  370
                              .||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  276  ------------------ACATATAATTAAGTTTCACAGAGCTTCGAAAGCCAACAAGAAGCCAGTTCAGTTAC  331

Query  371  CTCGGGGAATGGTGAAGTCACTATTATATCAGATCCTAGATGGTATTCACTACCTGCATGCTAACTGGGTGTTG  444
            ||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||
Sbjct  332  CTCGGGGAATGGTGAAGTCACTGTTGTACCAGATCCTAGATGGGATTCACTATCTTCATGCCAACTGGGTGTTG  405

Query  445  CACAGAGATTTGAAACCTGCTAATATTTTAGTTATGGGTGAAGGTCCTGAGCGAGGAAGAGTAAAAATTGCTGA  518
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  406  CACAGGGATTTGAAACCTGCTAATATTTTAGTTATGGGTGAAGGTCCTGAGCGAGGAAGAGTAAAAATTGCTGA  479

Query  519  CATGGGCTTTGCCCGATTATTTAATTCACCTTTGAAGCCTTTAGCAGATTTGGATCCAGTGGTTGTTACATTCT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  480  CATGGGCTTTGCCCGATTATTTAATTCACCTTTGAAGCCTTTAGCAGATTTGGATCCAGTGGTTGTAACATTCT  553

Query  593  GGTACCGAGCCCCTGAACTACTTCTTGGAGCAAGGCATTATACCAAAGCTATTGATATTTGGGCTCTCGACAGC  666
            ||||||||||.||.|||.||||.||.|||||..|.||||||||||||||.|||||||||||||||.|.|...|.
Sbjct  554  GGTACCGAGCTCCAGAATTACTCCTCGGAGCGCGACATTATACCAAAGCAATTGATATTTGGGCTATAGGGTGT  627

Query  667  ATA----CAGCATGAA-TGCTAACGCTAATGGAC-------TCAC-GTCGACATGCCGTCGCAAGG-CATC--A  724
            |||    ||    ||| |.||||||..|  |.||       |||| |||||||.|        ||| ||||  |
Sbjct  628  ATATTTGCA----GAACTACTAACGTCA--GAACCAATATTTCACTGTCGACAAG--------AGGACATCAAA  687

Query  725  ACTAGT-ATCTATA----CATGA-CAGCT-GAC-GAA---TCAGTAT----GGATT--CTGCAGTAGATGTAGA  781
            |||||| |||..||    ||||| ||||| ||| |||   |||.|.|    |||||  ||||   ||||..|||
Sbjct  688  ACTAGTAATCCTTATCACCATGACCAGCTGGACAGAATATTCAATGTAATGGGATTCCCTGC---AGATAAAGA  758

Query  782  TT------------AAAAGATGCCTG-ACAT--CACAT--ATGAGA---TTCAGA--GAATACGTATACCAACT  833
            ||            ||||||||||.| ||||  .||||  ||||.|   ||||||  .||||||||||||||.|
Sbjct  759  TTGGGAAGATATAAAAAAGATGCCCGAACATTCAACATTAATGAAAGATTTCAGAAGAAATACGTATACCAATT  832

Query  834  GCAGCC-TATCAAGTATATG--AAAACATAAAGTT-AACCAGATAGTAAAGCATT-CACTTGC-TCAGAAGCTG  901
            |||||| |||||||||||||  |||.||||||||| ||||.|||||||||||||| ||||||| |||||||.||
Sbjct  833  GCAGCCTTATCAAGTATATGGAAAAGCATAAAGTTAAACCCGATAGTAAAGCATTCCACTTGCTTCAGAAGTTG  906

Query  902  CTTACCAT-GACCCAATAAAGCGAA-TACCTCAGA-CA-GCTATGCAGGACCCCTA-TTTCTAG-AGAC---CA  966
            ||.||.|| |||||||||||||||| ||||||||| || ||.|||||||||||||| ||.|||| ||||   |.
Sbjct  907  CTCACTATGGACCCAATAAAGCGAATTACCTCAGAGCAGGCCATGCAGGACCCCTACTTCCTAGAAGACCCACT  980

Query  967  TTCTACATCAGACGTTTTTGCCGG-TGTCAAATCC---TTCCCAAAACGGGAATTTT--ACCGAAGAGGA-CCT  1033
            |.|.||.|||||.|||||.||||| |||||.||||   .|||| |||||.|||||||  ||.|||||.|| |||
Sbjct  981  TCCCACGTCAGATGTTTTCGCCGGTTGTCAGATCCCATATCCC-AAACGAGAATTTTTAACAGAAGAAGAGCCT  1053

Query 1034  GATGGCAAAGG-GACCAAAA----CAGGCGCCACAGGAAGGCCATTACCAACA-TAAAGGAACTGGCCCCCCCG  1101
            ||||..||||| |||.||||    |||..||..|||.|.|||.|..||| ||| |||.||||||||||..||.|
Sbjct 1054  GATGAGAAAGGAGACAAAAAGACCCAGCAGCAGCAGCAGGGCAACAACC-ACACTAACGGAACTGGCCATCCGG  1126

Query 1102  GGAATCCAGG-CCGCCGTTCCCCCCCGGGGCCCCCGGTGAAGGAAATGAGAAGTGTTCCTCCTTCCCATACCTT  1174
            |||| ||||| |.||.|...|.|.|.|||||||||..||||..||.|||||..|||.||||||.||..|||| |
Sbjct 1127  GGAA-CCAGGACAGCGGCCACGCACAGGGGCCCCCCTTGAAAAAAGTGAGAGTTGTCCCTCCTACCACTACC-T  1198

Query 1175  CGGGGGGACT-ATCCAGGCCTTCGGCCATTAGGGGTTCCATTCC-CCTGCCGCCTATTCCCACCCCGGGCCCAG  1246
            |.||.||||| |||..|.|||.||.|.||.| |.||||||.||| |.|||.||.|| |||||.|||.||.|||.
Sbjct 1199  CAGGTGGACTCATCATGACCTCCGACTATCA-GCGTTCCAATCCACATGCTGCTTA-TCCCAACCCTGGACCAA  1270

Query 1247  CCCCTTCCCA-CCGCAGAGCCGCCAGGGATAATTCAG-TACCTTCCCA-CCGCCTTCCCCAG-ACTCCCCTTCG  1316
            .|.|.||.|| ||.||||||.||..||||| |.|||| |||| ||||| |.||| |||.||| ||||.|.|..|
Sbjct 1271  GCACATCACAGCCCCAGAGCAGCATGGGAT-ACTCAGCTACC-TCCCAGCAGCC-TCCACAGTACTCACATCAG  1341

Query 1317  GCCCATTGGGAA  1328
            .|.|||.||.|.
Sbjct 1342  ACACATCGGTAC  1353