Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14578
• Subject: XM_030254515.1
• Aligned Length: 1371
• Identities: 1060
• Gaps: 169

Alignment

Query    1  ATGGACTATGACTTTAAAGTGAAGCTGAGCAGCGAGCGGGAGCGGGTCGAGGACCTGTTTGAATACGAGGGCTG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGACTATGACTTTAAAGTGAAGCTGAGCAGCGAGCGGGAGCGGGTCGAGGACCTGTTTGAATACGAGGGCTG  74

Query   75  CAAAGTTGGCCGAGGCACTTATGGTCACGTCTACAAAGCCAAGAGGAAAGATGGGAAGGATGATAAAGACTATG  148
            |||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct   75  CAAAGTTGGTCGAGGCACTTACGGGCACGTCTACAAGGCGAAGAGGAAAGATGGGAAGGACGATAAAGACTACG  148

Query  149  CTTTAAAACAAATAGAAGGAACTGGGATCTCTATGTCGGCATGTAGAGAAATAGCATTACTTCGAGAGCTTAAG  222
            |||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct  149  CTTTAAAACAAATAGAAGGAACTGGAATTTCTATGTCGGCATGCAGAGAGATAGCATTACTCCGAGAGCTTAAG  222

Query  223  CATCCAAACGTCATTTCTCTTCAAAAGGTGTTTCTGTCTCATGCTGATAGGAAGGTGTGGCTTCTGTTTGACTA  296
            ||.|||||||||||.||.||||..||||||||||||||||||||||||.||||.||.||||||||.||||||||
Sbjct  223  CACCCAAACGTCATCTCCCTTCTGAAGGTGTTTCTGTCTCATGCTGATCGGAAAGTATGGCTTCTCTTTGACTA  296

Query  297  TGCTGAACATGACCTCTGGCATATAATCAAGTTTCACAGAGCTTCTAAAGCAAACAAGAAGCCAGTTCAGTTAC  370
            ||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGCTGAGCATGACCTCTGGCATATAATTAAGTTTCACAGAGCTTCGAAAGCCAACAAGAAGCCAGTTCAGTTAC  370

Query  371  CTCGGGGAATGGTGAAGTCACTATTATATCAGATCCTAGATGGTATTCACTACCTGCATGCTAACTGGGTGTTG  444
            ||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||
Sbjct  371  CTCGGGGAATGGTGAAGTCACTGTTGTACCAGATCCTAGATGGGATTCACTATCTTCATGCCAACTGGGTGTTG  444

Query  445  CACAGAGATTTGAAACCTGCTAATATTTTAGTTATGGGTGAAGGTCCTGAGCGAGGAAGAGTAAAAATTGCTGA  518
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CACAGGGATTTGAAACCTGCTAATATTTTAGTTATGGGTGAAGGTCCTGAGCGAGGAAGAGTAAAAATTGCTGA  518

Query  519  CATGGGCTTTGCCCGATTATTTAATTCACCTTTGAAGCCTTTAGCAGATTTGGATCCAGTGGTTGTTACATTCT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  519  CATGGGCTTTGCCCGATTATTTAATTCACCTTTGAAGCCTTTAGCAGATTTGGATCCAGTGGTTGTAACATTCT  592

Query  593  GGTACCGAGCCCCTGAACTACTTCTTGGAGCAAGGCATTATACCAAAGCTATTGATATTTGGGCTCTCGACAGC  666
            ||||||||||.||.|||.||||.||.|||||..|.||||||||||||||.|||||||                 
Sbjct  593  GGTACCGAGCTCCAGAATTACTCCTCGGAGCGCGACATTATACCAAAGCAATTGATA-----------------  649

Query  667  ATACAGCATGAATGCTAACGCTAATGGACTCACGTCGACATGCCGTCGCAAGGCATCAACTAGTATCTATACAT  740
                   |.||.||           |||                                              
Sbjct  650  -------AAGATTG-----------GGA----------------------------------------------  659

Query  741  GACAGCTGACGAATCAGTATGGATTCTGCAGTAGATGTAGATTAAAAGATGCCTG-ACAT--CACAT--ATGAG  809
                                            ||||.||   .||||||||||.| ||||  .||||  ||||.
Sbjct  660  --------------------------------AGATATA---AAAAAGATGCCCGAACATTCAACATTAATGAA  698

Query  810  A---TTCAGA--GAATACGTATACCAACTGCAGCC-TATCAAGTATATG--AAAACATAAAGTT-AACCAGATA  874
            |   ||||||  .||||||||||||||.||||||| |||||||||||||  |||.||||||||| ||||.||||
Sbjct  699  AGATTTCAGAAGAAATACGTATACCAATTGCAGCCTTATCAAGTATATGGAAAAGCATAAAGTTAAACCCGATA  772

Query  875  GTAAAGCATT-CACTTGC-TCAGAAGCTGCTTACCAT-GACCCAATAAAGCGAA-TACCTCAGA-CA-GCTATG  942
            |||||||||| ||||||| |||||||.||||.||.|| |||||||||||||||| ||||||||| || ||.|||
Sbjct  773  GTAAAGCATTCCACTTGCTTCAGAAGTTGCTCACTATGGACCCAATAAAGCGAATTACCTCAGAGCAGGCCATG  846

Query  943  CAGGACCCCTA-TTTCTAG-AGAC---CATTCTACATCAGACGTTTTTGCCGG-TGTCAAATCC---TTCCCAA  1007
            ||||||||||| ||.|||| ||||   |.|.|.||.|||||.|||||.||||| |||||.||||   .|||| |
Sbjct  847  CAGGACCCCTACTTCCTAGAAGACCCACTTCCCACGTCAGATGTTTTCGCCGGTTGTCAGATCCCATATCCC-A  919

Query 1008  AACGGGAATTTT--ACCGAAGAGGA-CCTGATGGCAAAGG-GACCAAAA--CAGGCGCCACAGGAAGGCCATTA  1075
            ||||.|||||||  ||.|||||.|| |||||||..||||| || |||||  |||..||..|||.|.|||.|..|
Sbjct  920  AACGAGAATTTTTAACAGAAGAAGAGCCTGATGAGAAAGGAGA-CAAAACCCAGCAGCAGCAGCAGGGCAACAA  992

Query 1076  CCAACA-TAAAGGAACTGGCCCCCCCGGGAATCCAGG-CCGCCGTTCCCCCCCGGGGCCCCCGGTGAAGGAAAT  1147
            || ||| |||.||||||||||..||.||||| ||||| |.||.|...|.|.|.|||||||||..||||..||.|
Sbjct  993  CC-ACACTAACGGAACTGGCCATCCGGGGAA-CCAGGACAGCGGCCACGCACAGGGGCCCCCCTTGAAAAAAGT  1064

Query 1148  GAGAAGTGTTCCTCCTTCCCATACCTTCGGGGGGACT-ATCCAGGCCTTCGGCCATTAGGGGTTCCATTCC-CC  1219
            ||||..|||.||||||.||..|||| ||.||.||||| |||..|.|||.||.|.||.| |.||||||.||| |.
Sbjct 1065  GAGAGTTGTCCCTCCTACCACTACC-TCAGGTGGACTCATCATGACCTCCGACTATCA-GCGTTCCAATCCACA  1136

Query 1220  TGCCGCCTATTCCCACCCCGGGCCCAGCCCCTTCCCA-CCGCAGAGCCGCCAGGGATAATTCAG-TACCTTCCC  1291
            |||.||.|| |||||.|||.||.|||..|.|.||.|| ||.||||||.||..||||| |.|||| |||| ||||
Sbjct 1137  TGCTGCTTA-TCCCAACCCTGGACCAAGCACATCACAGCCCCAGAGCAGCATGGGAT-ACTCAGCTACC-TCCC  1207

Query 1292  A-CCGCCTTCCCCAG-ACTCCCCTTCGGCCCATTGGGAA  1328
            | |.||| |||.||| ||||.|.|..|.|.|||.||.|.
Sbjct 1208  AGCAGCC-TCCACAGTACTCACATCAGACACATCGGTAC  1245