Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14601
• Subject: NM_001289898.1
• Aligned Length: 1248
• Identities: 1132
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGAGCTACGTGTGGGGAACAAGTACCGCCTGGGACGGAAGATCGGGAGCGGGTCCTTCGGAGATATCTACCT  74
            ||||||.|.||||||||.||.|||||.||||||||.||.||||||||.||.||.|||||.|||||.||||||||
Sbjct    1  ATGGAGTTGCGTGTGGGAAATAAGTATCGCCTGGGCCGAAAGATCGGCAGTGGCTCCTTTGGAGACATCTACCT  74

Query   75  GGGTGCCAACATCGCCTCTGGTGAGGAAGTCGCCATCAAGCTGGAGTGTGTGAAGACAAAGCACCCCCAGCTGC  148
            ||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.||.||||||||.|
Sbjct   75  GGGTGCCAACATTGCCTCTGGTGAGGAAGTAGCCATCAAGCTCGAATGTGTGAAGACGAAACATCCCCAGCTCC  148

Query  149  ACATCGAGAGCAAGTTCTACAAGATGATGCAGGGTGGCGTGGGGATCCCGTCCATCAAGTGGTGCGGAGCTGAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  149  ACATCGAGAGCAAGTTCTACAAGATGATGCAGGGCGGAGTGGGGATCCCGTCCATCAAGTGGTGCGGGGCTGAG  222

Query  223  GGCGACTACAACGTGATGGTCATGGAGCTGCTGGGGCCTAGCCTCGAGGACCTGTTCAACTTCTGTTCCCGCAA  296
            ||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct  223  GGAGACTATAACGTGATGGTCATGGAGCTGCTGGGGCCCAGCCTGGAGGACCTCTTCAACTTCTGTTCCCGGAA  296

Query  297  ATTCAGCCTCAAGACGGTGCTGCTCTTGGCCGACCAGATGATCAGCCGCATCGAGTATATCCACTCCAAGAACT  370
            .|||||||||||||||||||||.|..|||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct  297  GTTCAGCCTCAAGACGGTGCTGTTGCTGGCCGACCAGATGATCAGCCGCATCGAGTACATACACTCCAAGAACT  370

Query  371  TCATCCACCGGGACGTCAAGCCCGACAACTTCCTCATGGGGCTGGGGAAGAAGGGCAACCTGGTCTACATCATC  444
            |||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.
Sbjct  371  TCATCCACCGGGATGTGAAGCCCGACAACTTCCTCATGGGCCTGGGGAAGAAAGGCAACCTGGTGTACATCATT  444

Query  445  GACTTCGGCCTGGCCAAGAAGTACCGGGACGCCCGCACCCACCAGCACATTCCCTACCGGGAAAACAAGAACCT  518
            ||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GACTTCGGCCTGGCCAAGAAGTACCGCGATGCCCGCACACACCAGCATATTCCCTACCGGGAAAACAAGAACCT  518

Query  519  GACCGGCACGGCCCGCTACGCTTCCATCAACACGCACCTGGGCATTGAGCAAAGCCGTCGAGATGACCTGGAGA  592
            |||||||||.||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  519  GACCGGCACTGCCCGCTATGCCTCTATCAACACCCACCTGGGCATTGAGCAAAGCCGTCGAGATGACCTAGAGA  592

Query  593  GCCTGGGCTACGTGCTCATGTACTTCAACCTGGGCTCCCTGCCCTGGCAGGGGCTCAAAGCAGCCACCAAGCGC  666
            ||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct  593  GCTTGGGCTATGTGCTCATGTACTTCAACCTGGGCTCCCTGCCCTGGCAGGGCCTCAAAGCAGCCACCAAGCGT  666

Query  667  CAGAAGTATGAACGGATCAGCGAGAAGAAGATGTCAACGCCCATCGAGGTCCTCTGCAAAGGCTATCCCTCCGA  740
            ||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  667  CAGAAGTACGAGCGGATTAGCGAGAAGAAGATGTCAACGCCAATCGAGGTCCTCTGCAAAGGCTACCCCTCCGA  740

Query  741  ATTCTCAACATACCTCAACTTCTGCCGCTCCCTGCGGTTTGACGACAAGCCCGACTACTCTTACCTACGTCAGC  814
            .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||.|||||.||.||||
Sbjct  741  GTTCTCAACATACCTCAACTTCTGCCGCTCCCTGCGGTTCGATGATAAGCCTGACTACTCCTACCTGCGCCAGC  814

Query  815  TCTTCCGCAACCTCTTCCACCGGCAGGGCTTCTCCTATGACTACGTCTTTGACTGGAACATGCTGAAATTCGGT  888
            |||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  815  TCTTCCGAAATCTCTTTCACCGGCAGGGTTTCTCCTACGACTACGTCTTCGACTGGAACATGCTCAAATTCGGT  888

Query  889  GCAGCCCGGAATCCCGAGGATGTGGACCGGGAGCGGCGAGAACACGAACGCGAGGAGAGGATGGGGCAGCTACG  962
            |||||||||||||||||||||||.||||||||..|.||.||.||||||||.||.|||||||||||||||.|.||
Sbjct  889  GCAGCCCGGAATCCCGAGGATGTAGACCGGGAAAGACGGGAGCACGAACGGGAAGAGAGGATGGGGCAGTTGCG  962

Query  963  GGGGTCCGCGACCCGAGCCCTGCCCCCTGGCCCACCCACGGGGGCCACTGCCAACCGGCTCCGCAGTGCCGCCG  1036
            .||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||.||||
Sbjct  963  AGGGTCCGCGACCAGAGCCCTGCCCCCTGGCCCACCTACAGGGGCTACCGCCAACCGACTCCGAAGTGCAGCCG  1036

Query 1037  AGCCCGTGGCTTCCACGCCAGCCTCCCGCATCCAGCCGGCTGGCAATACTTCTCCCAGAGCGATCTCGCGGGTC  1110
            ||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|...||||||||||||||||||||||||||||.||||.|
Sbjct 1037  AGCCTGTGGCTTCCACTCCAGCCTCCCGCATCCAACAAACTGGCAATACTTCTCCCAGAGCGATCTCACGGGCC  1110

Query 1111  GACCGGGAGAGGAAGGTGAGTATGAGGCTGCACAGGGGTGCGCCCGCCAACGTCTCCTCCTCAGACCTCACTGG  1184
            |||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GACCGAGAGAGGAAGGTGAGCATGAGACTCCACAGAGGTGCCCCTGCCAATGTCTCCTCCTCAGACCTCACTGG  1184

Query 1185  GCGGCAAGAGGTCTCCCGGATCCCAGCCTCACAGACAAGTGTGCCATTTGACCATCTCGGGAAG  1248
            |||||||||||||||||||.|..||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 1185  GCGGCAAGAGGTCTCCCGGCTTGCAGCCTCACAGACAAGCGTGCCATTTGACCATCTTGGGAAA  1248