Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14601
• Subject: XM_011245650.2
• Aligned Length: 1309
• Identities: 1118
• Gaps: 77

Alignment

Query    1  ATGGAGCTACGTGTGGGGAACAAGTACCGCCTGGGACGGAAGATCGGGAGCGGGTCCTTCGGAGATATCTACCT  74
            ||||||.|.||||||||.||.|||||.||||||||.||.||||||||.||.||.|||||.|||||.||||||||
Sbjct    1  ATGGAGTTGCGTGTGGGAAATAAGTATCGCCTGGGCCGAAAGATCGGCAGTGGCTCCTTTGGAGACATCTACCT  74

Query   75  GGGTGCCAACATCGCCTCTGGTGAGGAAGTCGCCATCAAGCTGGAGTGTGTGAAGACAAAGCACCCCCAGCTGC  148
            ||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.||.||||||||.|
Sbjct   75  GGGTGCCAACATTGCCTCTGGTGAGGAAGTAGCCATCAAGCTCGAATGTGTGAAGACGAAACATCCCCAGCTCC  148

Query  149  ACATCGAGAGCAAGTTCTACAAGATGATGCAGGGTGGCGTGGGGATCCCGTCCATCAAGTGGTGCGGAGCTGAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  149  ACATCGAGAGCAAGTTCTACAAGATGATGCAGGGCGGAGTGGGGATCCCGTCCATCAAGTGGTGCGGGGCTGAG  222

Query  223  GGCGACTACAACGTGATGGTCATGGAGCTGCTGGGGCCTAGCCTCGAGGACCTGTTCAACTTCTGTTCCCGCAA  296
            ||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct  223  GGAGACTATAACGTGATGGTCATGGAGCTGCTGGGGCCCAGCCTGGAGGACCTCTTCAACTTCTGTTCCCGGAA  296

Query  297  ATTCAGCCTCAAGACGGTGCTGCTCTTGGCCGACCAGATGATCAGCCGCATCGAGTATATCCACTCCAAGAACT  370
            .|||||||||||||||||||||.|..|||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct  297  GTTCAGCCTCAAGACGGTGCTGTTGCTGGCCGACCAGATGATCAGCCGCATCGAGTACATACACTCCAAGAACT  370

Query  371  TCATCCACCGGGACGTCAAGCCCGACAACTTCCTCATGGGGCTGGGGAAGAAGGGCAACCTGGTCTACATCATC  444
            |||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.
Sbjct  371  TCATCCACCGGGATGTGAAGCCCGACAACTTCCTCATGGGCCTGGGGAAGAAAGGCAACCTGGTGTACATCATT  444

Query  445  GACTTCGGCCTGGCCAAGAAGTACCGGGACGCCCGCACCCACCAGCACATTCCCTACCGGGAAAACAAGAACCT  518
            ||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GACTTCGGCCTGGCCAAGAAGTACCGCGATGCCCGCACACACCAGCATATTCCCTACCGGGAAAACAAGAACCT  518

Query  519  GACCGGCACGGCCCGCTACGCTTCCATCAACACGCACCTGGGCATTGAGCAAAGCCGTCGAGATGACCTGGAGA  592
            |||||||||.||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  519  GACCGGCACTGCCCGCTATGCCTCTATCAACACCCACCTGGGCATTGAGCAAAGCCGTCGAGATGACCTAGAGA  592

Query  593  GCCTGGGCTACGTGCTCATGTACTTCAACCTGGGCTCCCTGCCCTGGCAGGGGCTCAAAGCAGCCACCAAGCGC  666
            ||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct  593  GCTTGGGCTATGTGCTCATGTACTTCAACCTGGGCTCCCTGCCCTGGCAGGGCCTCAAAGCAGCCACCAAGCGT  666

Query  667  CAGAAGTATGAACGGATCAGCGAGAAGAAGATGTCAACGCCCATCGAGGTCCTCTGCAAAGGCTATCCCTCCGA  740
            ||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  667  CAGAAGTACGAGCGGATTAGCGAGAAGAAGATGTCAACGCCAATCGAGGTCCTCTGCAAAGGCTACCCCTCCGA  740

Query  741  ATTCTCAACATACCTCAACTTCTGCCGCTCCCTGCGGTTTGACGACAAGCCCGACTACTCTTACCTACGTCAGC  814
            .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||.|||||.||.||||
Sbjct  741  GTTCTCAACATACCTCAACTTCTGCCGCTCCCTGCGGTTCGATGATAAGCCTGACTACTCCTACCTGCGCCAGC  814

Query  815  TCTTCCGCAACCTCTTCCACCGGCAGGGCTTCTCCTATGACTACGTCTTTGACTGGAACATGCTGAAATTC---  885
            |||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||   
Sbjct  815  TCTTCCGAAATCTCTTTCACCGGCAGGGTTTCTCCTACGACTACGTCTTCGACTGGAACATGCTCAAATTCATG  888

Query  886  ----------------------------------------------------------GGTGCAGCCCGGAATC  901
                                                                      ||||||||||||||||
Sbjct  889  CGGCCCCCCTTCCACCAGCCCCCTGCCCTTCCCTGTGGACGGCCCCAGGACCAGCTAGGGTGCAGCCCGGAATC  962

Query  902  CCGAGGATGTGGACCGGGAGCGGCGAGAACACGAACGCGAGGAGAGGATGGGGCAGCTACGGGGGTCCGCGACC  975
            ||||||||||.||||||||..|.||.||.||||||||.||.|||||||||||||||.|.||.||||||||||||
Sbjct  963  CCGAGGATGTAGACCGGGAAAGACGGGAGCACGAACGGGAAGAGAGGATGGGGCAGTTGCGAGGGTCCGCGACC  1036

Query  976  CGAGCCCTGCCCCCTGGCCCACCCACGGGGGCCACTGCCAACCGGCTCCGCAGTGCCGCCGAGCCCGTGGCTTC  1049
            .||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||
Sbjct 1037  AGAGCCCTGCCCCCTGGCCCACCTACAGGGGCTACCGCCAACCGACTCCGAAGTGCAGCCGAGCCTGTGGCTTC  1110

Query 1050  CACGCCAGCCTCCCGCATCCAGCCGGCTGGCAATACTTCTCCCAGAGCGATCTCGCGGGTCGACCGGGAGAGGA  1123
            |||.|||||||||||||||||.|...||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||.|||||||
Sbjct 1111  CACTCCAGCCTCCCGCATCCAACAAACTGGCAATACTTCTCCCAGAGCGATCTCACGGGCCGACCGAGAGAGGA  1184

Query 1124  AGGTGAGTATGAGGCTGCACAGGGGTGCGCCCGCCAACGTCTCCTCCTCAGACCTCACTGGGCGGCAAGAGGTC  1197
            |||||||.|||||.||.|||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AGGTGAGCATGAGACTCCACAGAGGTGCCCCTGCCAATGTCTCCTCCTCAGACCTCACTGGGCGGCAAGAGGTC  1258

Query 1198  TCCCGGATCCCAGCCTCACAGACAAGTGTGCCATTTGACCATCTCGGGAAG  1248
            ||||||.|..||||||||||||||||.||||||||                
Sbjct 1259  TCCCGGCTTGCAGCCTCACAGACAAGCGTGCCATT----------------  1293