Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14607
- Subject:
- NM_001350709.2
- Aligned Length:
- 2415
- Identities:
- 2365
- Gaps:
- 39
Alignment
Query 1 ATGACAAACCAGGAAAAATGGGCCCACCTCAGCCCTTCGGAATTTTCCCAACTTCAGAAATATGCTGAGTATTC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGACAAACCAGGAAAAATGGGCCCACCTCAGCCCTTCGGAATTTTCCCAACTTCAGAAATATGCTGAGTATTC 74
Query 75 TACAAAGAAATTAAAGGATGTTCTTGAAGAATTCCATGGTAATGGTGTGCTTGCAAAGTATAATCCTGAAGGG- 147
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TACAAAGAAATTAAAGGATGTTCTTGAAGAATTCCATGGTAATGGTGTGCTTGCAAAGTATAATCCTGAAGGGA 148
Query 148 --------------------ACAATAGATTTTGAAGGTTTCAAACTATTCATGAAGACATTCCTGGAAGCCGAG 201
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AACAAGACATTCTTAACCAAACAATAGATTTTGAAGGTTTCAAACTATTCATGAAGACATTCCTGGAAGCCGAG 222
Query 202 CTTCCTGATGATTTCACTGCACACCTTTTCATGTCATTTAGCAACAAGTTTCCTCATTCTAGTCCAATGGTAAA 275
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CTTCCTGATGATTTCACTGCACACCTTTTCATGTCATTTAGCAACAAGTTTCCTCATTCTAGTCCAATGGTAAA 296
Query 276 AAGTAAGCCTGCTCTCCTATCAGGCGGTCTGAGAATGAATAAAGGTGCCATCACCCCTCCCCGAACTACTTCTC 349
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 297 AAGTAAGCCTGCTCTCCTATCAGGCGGTCTGAGAATGAATAAAGGTGCCATCACCCCTCCCCGGACTACTTCTC 370
Query 350 CTGCAAATACGTGTTCCCCAGAAGTAATCCATCTGAAGGACATTGTCTGTTACCTGTCTCTGCTTGAAAGAGGA 423
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CTGCAAATACGTGTTCCCCAGAAGTAATCCATCTGAAGGACATTGTCTGTTACCTGTCTCTGCTTGAAAGAGGA 444
Query 424 AGACCTGAGGATAAGCTTGAGTTTATGTTTCGCCTTTATGACACGGATGGGAATGGCTTCCTGGACAGCTCGGA 497
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AGACCTGAGGATAAGCTTGAGTTTATGTTTCGCCTTTATGACACGGATGGGAATGGCTTCCTGGACAGCTCGGA 518
Query 498 GCTAGAAAATATCATCAGTCAGATGATGCATGTTGCAGAATACCTTGAGTGGGATGTCACTGAACTTAATCCAA 571
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GCTAGAAAATATCATCAGTCAGATGATGCATGTTGCAGAATACCTTGAGTGGGATGTCACTGAACTTAATCCAA 592
Query 572 TCCTCCATGAAATGATGGAAGAAATTGACTATGATCATGATGGAACCGTGTCTCTGGAGGAATGGATTCAAGGA 645
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TCCTCCATGAAATGATGGAAGAAATTGACTATGATCATGATGGAACCGTGTCTCTGGAGGAATGGATTCAAGGA 666
Query 646 GGAATGACAACGATTCCACTTCTTGTGCTCCTGGGCTTAGAAAATAACGTGAAAGGATGATGGACAGCACGTGT 719
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GGAATGACAACGATTCCACTTCTTGTGCTCCTGGGCTTAGAAAATAACGTG-AAGGATGATGGACAGCACGTGT 739
Query 720 GGCGACTG-AGCACTTTAACAAACCTG-CTA-TGCA--CTTTG-CTG-ACATGCTGATT-GCGTGGGGAAGCAG 785
|||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct 740 GGCGACTGAAGCACTTTAACAAACCTGCCTATTGCAACCTTTGCCTGAACATGCTGATTGGCGTGGGGAAGCAG 813
Query 786 G--CTCTGCTGTTCCTTCTGC-AGTACACAGTCCATGAGCGCTGTGTGGCTCGAGCACCTCCCTCTTGCATCAA 856
| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 814 GGCCTCTGCTGTTCCTTCTGCAAGTACACAGTCCATGAGCGCTGTGTGGCTCGAGCACCTCCCTCTTGCATCAA 887
Query 857 GACCTATGTGAAGTCCAAAAGGAACACTGATGTCATGCACCATTACTGGGTTGAAGGTAACTGCCCAACCAAGT 930
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 888 GACCTATGTGAAGTCCAAAAGGAACACTGATGTCATGCACCATTACTGGGTTGAAGGTAACTGCCCAACCAAGT 961
Query 931 GTGATAAGTGCCACAAAACTGTTAAATGTTACCAGGGCCTGACAGGACTGCATTGTGTTTGGTGTCAGATCACA 1004
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 962 GTGATAAGTGCCACAAAACTGTTAAATGTTACCAGGGCCTGACAGGACTGCATTGTGTTTGGTGTCAGATCACA 1035
Query 1005 CTGCATAATAAATGTGCTTCTCATCTAAAACCTGAATGTGACTGTGGACCTTTGAAGGACCATATTTTACCACC 1078
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036 CTGCATAATAAATGTGCTTCTCATCTAAAACCTGAATGTGACTGTGGACCTTTGAAGGACCATATTTTACCACC 1109
Query 1079 CACAACAATCTGTCCAGTGGTACTGCAGACTCTGCCCACTTCAGGAGTTTCAGTTCCTGAGGAAAGACAATCAA 1152
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110 CACAACAATCTGTCCAGTGGTACT---GACTCTGCCCACTTCAGGAGTTTCAGTTCCTGAGGAAAGACAATCAA 1180
Query 1153 CAGTGAAAAAGGAAAAGAGTGGTTCCCAGCAGCCAAACAAAGTGATTGACAAGAATAAAATGCAAAGAGCCAAC 1226
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1181 CAGTGAAAAAGGAAAAGAGTGGTTCCCAGCAGCCAAACAAAGTGATTGACAAGAATAAAATGCAAAGAGCCAAC 1254
Query 1227 TCTGTTACTGTAGATGGACAAGGCCTGCAGGTCACTCCTGTGCCTGGTACTCACCCACTTTTAGTTTTTGTGAA 1300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1255 TCTGTTACTGTAGATGGACAAGGCCTGCAGGTCACTCCTGTGCCTGGTACTCACCCACTTTTAGTTTTTGTGAA 1328
Query 1301 CCCCAAAAGTGGTGGAAAACAAGGAGAACGAATTTACAGAAAATTCCAGTATCTATTAAATCCTCGTCAGGTTT 1374
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1329 CCCCAAAAGTGGTGGAAAACAAGGAGAACGAATTTACAGAAAATTCCAGTATCTATTAAATCCTCGTCAGGTTT 1402
Query 1375 ACAGTCTTTCTGGAAATGGACCAATGCCAGGGTTAAACTTTTTCCGTGATGTTCCTGACTTCAGAGTGTTAGCC 1448
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1403 ACAGTCTTTCTGGAAATGGACCAATGCCAGGGTTAAACTTTTTCCGTGATGTTCCTGACTTCAGAGTGTTAGCC 1476
Query 1449 TGTGGTGGAGATGGAACCGTGGGCTGGGTTTTGGATTGCATAGAAAAGGCCAATGTAGGCAAGCATCCTCCAGT 1522
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1477 TGTGGTGGAGATGGAACCGTGGGCTGGGTTTTGGATTGCATAGAAAAGGCCAATGTAGGCAAGCATCCTCCAGT 1550
Query 1523 TGCGATTCTGCCTCTTGGGACTGGCAATGATCTAGCAAGATGCCTGCGATGGGGAGGAGGTTACGAAGGTGAGG 1596
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1551 TGCGATTCTGCCTCTTGGGACTGGCAATGATCTAGCAAGATGCCTGCGATGGGGAGGAGGTTACGAAGGTGAGA 1624
Query 1597 ATCTGATGAAAATTTTAAAAGACATTGNAAACAGCACAGAAATCATG-TGGACAGGTGGAAGTTTGAAAGTCAT 1669
||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1625 ATCTGATGAAAATTCTAAAAGACATTGAAAACAGCACAGAAATCATGTTGGACAGGTGGAAGTTTG-AAGTCAT 1697
Query 1670 ACNTAATGACAAGNATGAGAAAGGAGACCCAGTGCCTANCAGTATCATCAATAATTACTTTTCCATTGGCGTGG 1743
||.|||||||||..|||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1698 ACCTAATGACAAAGATGAGAAAGGAGACCCAGTGCCTTACAGTATCATCAATAATTACTTTTCCATTGGCGTGG 1771
Query 1744 ATGCCTCCATGNCACACAGATTCCACATCATGAGAGAAAAACACCCNAGAGAAATTCAACAGTAGAATGAAGAA 1817
||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1772 ATGCCTCCATTGCACACAGATTCCACATCATGAGAGAAAAACACCC-AGAGAAATTCAACAGTAGAATGAAGAA 1844
Query 1818 CAAATTTTGGTATTTTGAGTTTGGCACATCTGAAACTTTCTCAGCCACCTGCAAGAAGCTACATGAATCTGTAG 1891
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1845 CAAATTTTGGTATTTTGAGTTTGGCACATCTGAAACTTTCTCAGCCACCTGCAAGAAGCTACATGAATCTGTAG 1918
Query 1892 AAATAGAATGTGATGGAGTACAGATAGATTTAATAAACATCTCTCTGGAAGGAATTGCTATTTTGAATATACCA 1965
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1919 AAATAGAATGTGATGGAGTACAGATAGATTTAATAAACATCTCTCTGGAAGGAATTGCTATTTTGAATATACCA 1992
Query 1966 AGCATGCATGGAGGATCCAATCTTTGGGGAGAGTCTAAGAAAAGACGAAGCCATCGACGAATAGAGAAAAAAGG 2039
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1993 AGCATGCATGGAGGATCCAATCTTTGGGGAGAGTCTAAGAAAAGACGAAGCCATCGACGAATAGAGAAAAAAGG 2066
Query 2040 GTCTGACAAAAGGACCACCGTCACAGATGCCAAAGAGTTGAAGTTTGCAAGTCAAGATCTCAGTGACCAGCTGC 2113
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2067 GTCTGACAAAAGGACCACCGTCACAGATGCCAAAGAGTTGAAGTTTGCAAGTCAAGATCTCAGTGACCAGCTGC 2140
Query 2114 TGGAGGTGGTCGGCTTGGAAGGAGCCATGGAGATGGGGCAAATATACACAGGCCTGAAAAGTGCTGGCCGGCGG 2187
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2141 TGGAGGTGGTCGGCTTGGAAGGAGCCATGGAGATGGGGCAAATATACACAGGCCTGAAAAGTGCTGGCCGGCGG 2214
Query 2188 CTGGCTCAGTGCTCCTGCGTGGTCATCAGGACGAGCAAGTCTCTGCCAATGCAAATTGATGGGGAGCCATGGAT 2261
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2215 CTGGCTCAGTGCTCCTGCGTGGTCATCAGGACGAGCAAGTCTCTGCCAATGCAAATTGATGGGGAGCCATGGAT 2288
Query 2262 GCAGACCCCATGCACAATAAAAATTACACACAAGAACCAAGCCCCAATGCTGATGGGCCCGCCTCCAAAAACCG 2335
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2289 GCAGACCCCATGCACAATAAAAATTACACACAAGAACCAAGCCCCAATGCTGATGGGCCCGCCTCCAAAAACCG 2362
Query 2336 GTTTATTCTGCTCCCTCGTCAAAAGGACAAGAAACCGAAGCAAGGAA 2382
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2363 GTTTATTCTGCTCCCTCGTCAAAAGGACAAGAAACCGAAGCAAGGAA 2409