Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14607
• Subject: XM_006515070.2
• Aligned Length: 2394
• Identities: 2132
• Gaps: 18

Alignment

Query    1  ATGACAAACCAGGAAAAATGGGCCCACCTCAGCCCTTCGGAATTTTCCCAACTTCAGAAATATGCTGAGTATTC  74
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGACAAACCAGGAAAAATGGGCCCATCTCAGCCCCTCAGAATTTTCCCAACTTCAGAAATATGCTGAGTATTC  74

Query   75  TACAAAGAAATTAAAGGATGTTCTTGAAGAATTCCATGGTAATGGTGTGCTTGCAAAGTATAATCCTGAAGGGA  148
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TACAAAGAAATTAAAGGATGTTCTTGAAGAATTCCATGGTAATGGCGTGCTTGCAAAGTATAATCCTGAAGGGA  148

Query  149  CAATAGATTTTGAAGGTTTCAAACTATTCATGAAGACATTCCTGGAAGCCGAGCTTCCTGATGATTTCACTGCA  222
            |.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.
Sbjct  149  CCATAGATTTTGAAGGCTTCAAGCTATTCATGAAGACCTTTCTGGAAGCTGAGCTGCCTGACGATTTCACCGCC  222

Query  223  CACCTTTTCATGTCATTTAGCAACAAGTTTCCTCATTCTAGTCCAATGGTAAAAAGTAAGCCTGCTCTCCTATC  296
            ||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||||..|||||.||||||||.|||||.||.||
Sbjct  223  CACCTTTTTATGTCATTCAGCAACAAATTTCCCCATTCTAGCCCAAATGTAAAGAGTAAGCCCGCTCTTCTTTC  296

Query  297  AGGCGGTCTGAGAATGAATAAAGGTGCCATCACCCCTCCCCGAACTACTTCTCCTGCAAATACGTGTTCCCCAG  370
            |||.|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||   |.|.|||||.||||||||.||.|||||||
Sbjct  297  AGGTGGTCTCAGGATGAATAAGGGTGCCATCACCCCTCCACG---TTCCTCTCCAGCAAATACATGCTCCCCAG  367

Query  371  AAGTAATCCATCTGAAGGACATTGTCTGTTACCTGTCTCTGCTTGAAAGAGGAAGACCTGAGGATAAGCTTGAG  444
            ||||.|||||.||.|||||.||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct  368  AAGTGATCCACCTCAAGGATATCGTCTGCTACCTGTCTCTTCTCGAAAGAGGAAGACCCGAGGATAAGCTCGAG  441

Query  445  TTTATGTTTCGCCTTTATGACACGGATGGGAATGGCTTCCTGGACAGCTCGGAGCTAGAAAATATCATCAGTCA  518
            |||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||.||..||||
Sbjct  442  TTTATGTTTCGCCTTTATGACACCGATGGGAATGGCTTCCTGGACAGCTCGGAATTAGAAAATATTATTGGTCA  515

Query  519  GATGATGCATGTTGCAGAATACCTTGAGTGGGATGTCACTGAACTTAATCCAATCCTCCATGAAATGATGGAAG  592
            |||||||||.||.|||||.|||||.||.||||||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct  516  GATGATGCACGTGGCAGAGTACCTCGAATGGGATGTTACCGAACTTAATCCGATCCTTCATGAAATGATGGAAG  589

Query  593  AAATTGACTATGATCATGATGGAACCGTGTCTCTGGAGGAATGGATTCAAGGAGGAATGACAACGATTCCACTT  666
            |||||||||||||.|..|||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct  590  AAATTGACTATGACCGGGATGGCACTGTGTCTCTGGAGGAGTGGATTCAAGGAGGAATGACAACTATCCCACTT  663

Query  667  CTTGTGCTCCTGGGCTTAGAAAATAACGTGAAAGGATGATGGACAGCACGTGTGGCGACT-GAGCACTTTAACA  739
            ||.||.||.||||||||.||.|||||.||| |||||||||||||||||.||||||||||| .||||||||||||
Sbjct  664  CTAGTCCTGCTGGGCTTGGAGAATAATGTG-AAGGATGATGGACAGCATGTGTGGCGACTCAAGCACTTTAACA  736

Query  740  AACCTG-CTA-TGCA--CTTTG-CTG-ACATGCTGATT-GCGTGGGGAAGCAGG--CTCTGCTGTTCCTTCTGC  804
            |.|||| ||| ||||  ||.|| ||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||.|||||||||
Sbjct  737  AGCCTGCCTACTGCAATCTCTGCCTGAACATGCTGATTGGCGTGGGGAAGCAGGGCCTCTGCTGCTCCTTCTGC  810

Query  805  -AGTACACAGTCCATGAGCGCTGTGTGGCTCGAGCACCTCCCTCTTGCATCAAGACCTATGTGAAGTCCAAAAG  877
             |||||||.||||||||||||||||||||..||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.|.
Sbjct  811  AAGTACACGGTCCATGAGCGCTGTGTGGCCAGAGCCCCGCCCTCCTGCATCAAGACATATGTGAAGTCCAAGAA  884

Query  878  GAACACTGATGTCATGCACCATTACTGGGTTGAAGGTAACTGCCCAACCAAGTGTGATAAGTGCCACAAAACTG  951
            .|||||.||.|||||||||||.||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct  885  AAACACAGACGTCATGCACCACTATTGGGTCGAAGGCAATTGCCCAACCAAGTGCGATAAGTGCCACAAAACAG  958

Query  952  TTAAATGTTACCAGGGCCTGACAGGACTGCATTGTGTTTGGTGTCAGATCACACTGCATAATAAATGTGCTTCT  1025
            |.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||.|||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  959  TGAAATGTTACCAGGGCCTGACGGGCCTGCATTGTGTTTGGTGCCAGACCACACTGCACAATAAATGTGCTTCT  1032

Query 1026  CATCTAAAACCTGAATGTGACTGTGGACCTTTGAAGGACCATATTTTACCACCCACAACAATCTGTCCAGTGGT  1099
            |||||.||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||
Sbjct 1033  CATCTGAAGCCCGAGTGTGACTGTGGACCCTTGAAGGACCATATTTTGCCACCTACCACAATCTGTCCAGTTGT  1106

Query 1100  ACTGCAGACTCTGCCCACTTCAGGAGTTTCAGTTCCTGAGGAAAGACAATCAACAGTGAAAAAGGAAAAGAGTG  1173
            |.||||||||.||||||.|.|.||||..||||||||||||||||||||.||.||||..||||||||||||||..
Sbjct 1107  ATTGCAGACTATGCCCAGTGCTGGAGCCTCAGTTCCTGAGGAAAGACAGTCCACAGCTAAAAAGGAAAAGAGCA  1180

Query 1174  GTTCCCAGCAGCCAAACAAAGTGATTGACAAGAATAAAATGCAAAGAGCCAACTCTGTTACTGTAGATGGACAA  1247
            |.||||||||||||||.||||..|..|||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||.|.|||||||||
Sbjct 1181  GCTCCCAGCAGCCAAATAAAGCAACAGACAAAAATAAAATGCAAAGAGCTAACTCAGTTACTATGGATGGACAA  1254

Query 1248  GGCCTGCAGGTCACTCCTGTGCCTGGTACTCACCCACTTTTAGTTTTTGTGAACCCCAAAAGTGGTGGAAAACA  1321
            ||..|||||.||||||||||.|||||.||.||.||.|||.||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||
Sbjct 1255  GGTTTGCAGATCACTCCTGTTCCTGGCACACATCCGCTTCTAGTTTTTGTCAACCCTAAAAGTGGTGGGAAGCA  1328

Query 1322  AGGAGAACGAATTTACAGAAAATTCCAGTATCTATTAAATCCTCGTCAGGTTTACAGTCTTTCTGGAAATGGAC  1395
            |||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1329  AGGAGAACGAATTTACAGAAAATTCCAGTATCTCCTAAATCCTCGTCAGGTTTACAGTCTTTCTGGAAATGGAC  1402

Query 1396  CAATGCCAGGGTTAAACTTTTTCCGTGATGTTCCTGACTTCAGAGTGTTAGCCTGTGGTGGAGATGGAACCGTG  1469
            ||||||||||||||.|||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||
Sbjct 1403  CAATGCCAGGGTTACACTTTTTTCGCGATGTCCCTGACTTCAGAGTGTTAGCATGCGGTGGAGATGGGACTGTG  1476

Query 1470  GGCTGGGTTTTGGATTGCATAGAAAAGGCCAATGTAGGCAAGCATCCTCCAGTTGCGATTCTGCCTCTTGGGAC  1543
            ||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 1477  GGCTGGATTTTGGATTGCATAGAGAAGGCCAATGTAGTCAAGCACCCTCCAGTTGCCATCCTGCCTCTTGGGAC  1550

Query 1544  TGGCAATGATCTAGCAAGATGCCTGCGATGGGGAGGAGGTTACGAAGGTGAGGATCTGATGAAAATTTTAAAAG  1617
            |||||||||..|||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.||..||||.|||||.||..||||||
Sbjct 1551  TGGCAATGACTTAGCAAGGTGCCTGCGGTGGGGTGGAGGTTATGAAGGGGAAAATCTTATGAAGATCCTAAAAG  1624

Query 1618  ACATTGNAAACAGCACAGAAATCATG-TGGACAGGTGGAAGTTTGAAAGTCATACNTAATGACAAGNATGAGAA  1690
            ||||||.||.|||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||.||..||.|||||..|||||||
Sbjct 1625  ACATTGAAAGCAGCACAGAAATCATGCTGGACAGGTGGAAGTTTG-AAGTCACACCCAACGACAAAGATGAGAA  1697

Query 1691  AGGAGACCCAGTGCCTANCAGTATCATCAATAATTACTTTTCCATTGGCGTGGATGCCTCCATGNCACACAGAT  1764
            |||||||||.||||||..|||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||
Sbjct 1698  AGGAGACCCTGTGCCTTACAGCATCATCAATAACTACTTTTCCATTGGCGTGGATGCCTCCATTGCACACAGAT  1771

Query 1765  TCCACATCATGAGAGAAAAACACCCNAGAGAAATTCAACAGTAGAATGAAGAACAAATTTTGGTATTTTGAGTT  1838
            |||||||||||||||||||.||||| |||||||||||||||..||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1772  TCCACATCATGAGAGAAAAGCACCC-AGAGAAATTCAACAGCCGAATGAAGAACAAATTTTGGTACTTTGAGTT  1844

Query 1839  TGGCACATCTGAAACTTTCTCAGCCACCTGCAAGAAGCTACATGAATCTGTAGAAATAGAATGTGATGGAGTAC  1912
            |||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1845  TGGCACATCTGAAACCTTCTCAGCGACCTGCAAGAAGCTGCATGAATCTGTAGAAATAGAATGTGATGGAGTAC  1918

Query 1913  AGATAGATTTAATAAACATCTCTCTGGAAGGAATTGCTATTTTGAATATACCAAGCATGCATGGAGGATCCAAT  1986
            |.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1919  AAATAGATTTGATAAACATCTCTCTGGAAGGAATTGCAATTTTGAATATACCAAGCATGCATGGAGGATCTAAT  1992

Query 1987  CTTTGGGGAGAGTCTAAGAAAAGACGAAGCCATCGACGAATAGAGAAAAAAGGGTCTGACAAAAGGACCACCGT  2060
            |||||||||||||||||.||.|.|.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||..||||..|
Sbjct 1993  CTTTGGGGAGAGTCTAAAAAGAAAAGAAGCCATCGACGAATAGAGAAAAAAGGCTCTGACAAAAGACCCACTCT  2066

Query 2061  CACAGATGCCAAAGAGTTGAAGTTTGCAAGTCAAGATCTCAGTGACCAGCTGCTGGAGGTGGTCGGCTTGGAAG  2134
            |||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 2067  CACAGATGCAAAAGAGCTGAAGTTTGCAAGTCAAGATCTGAGTGACCAGCTGCTGGAGGTCGTTGGCTTGGAAG  2140

Query 2135  GAGCCATGGAGATGGGGCAAATATACACAGGCCTGAAAAGTGCTGGCCGGCGGCTGGCTCAGTGCTCCTGCGTG  2208
            ||||.|||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||..|||
Sbjct 2141  GAGCAATGGAAATGGGCCAAATTTACACGGGCCTGAAAAGTGCGGGCCGGCGGCTGGCTCAGTGCTCCTCTGTG  2214

Query 2209  GTCATCAGGACGAGCAAGTCTCTGCCAATGCAAATTGATGGGGAGCCATGGATGCAGACCCCATGCACAATAAA  2282
            ||.|||||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2215  GTTATCAGAACAAGCAAGTCACTGCCAATGCAGATTGATGGAGAGCCCTGGATGCAGACCCCATGCACAATAAA  2288

Query 2283  AATTACACACAAGAACCAAGCCCCAATGCTGATGGGCCCGCCTCCAAAAACCGGTTTATTCTGCTCCCTCGTCA  2356
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||.|||||||||||.||..|||
Sbjct 2289  AATTACACACAAGAACCAAGCCCCAATGCTGATGGGCCCTCCACCCAAAACTGGATTATTCTGCTCACTTATCA  2362

Query 2357  AAAGGACAAGAAACCGAAGCAAGGAA  2382
            ||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 2363  AAAGAACAAGAAACCGAAGCAAGGAG  2388