Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14622
- Subject:
- NM_005228.3:c.2369C>T
- Aligned Length:
- 3841
- Identities:
- 3130
- Gaps:
- 547
Alignment
Query 1 ATGCGACCCTCCGGGACGGCCGGGGCAGCGCTCCTGGCGCTGCTGGCTGCGCTCTGCCCGGCGAGTCGGGCTCT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCGACCCTCCGGGACGGCCGGGGCAGCGCTCCTGGCGCTGCTGGCTGCGCTCTGCCCGGCGAGTCGGGCTCT 74
Query 75 GGAGGAAAAGAAAGTTTGCCAAGGCACGAGTAACAAGCTCACGCAGTTGGGCACTTTTGAAGATCATTTTCTCA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GGAGGAAAAGAAAGTTTGCCAAGGCACGAGTAACAAGCTCACGCAGTTGGGCACTTTTGAAGATCATTTTCTCA 148
Query 149 GCCTCCAGAGGATGTTCAATAACTGTGAGGTGGTCCTTGGGAATTTGGAAATTACCTATGTGCAGAGGAATTAT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GCCTCCAGAGGATGTTCAATAACTGTGAGGTGGTCCTTGGGAATTTGGAAATTACCTATGTGCAGAGGAATTAT 222
Query 223 GATCTTTCCTTCTTAAAGACCATCCAGGAGGTGGCTGGTTATGTCCTCATTGCCCTCAACACAGTGGAGCGAAT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GATCTTTCCTTCTTAAAGACCATCCAGGAGGTGGCTGGTTATGTCCTCATTGCCCTCAACACAGTGGAGCGAAT 296
Query 297 TCCTTTGGAAAACCTGCAGATCATCAGAGGAAATATGTACTACGAAAATTCCTATGCCTTAGCAGTCTTATCTA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TCCTTTGGAAAACCTGCAGATCATCAGAGGAAATATGTACTACGAAAATTCCTATGCCTTAGCAGTCTTATCTA 370
Query 371 ACTATGATGCAAATAAAACCGGACTGAAGGAGCTGCCCATGAGAAATTTACAGGAAATCCTGCATGGCGCCGTG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ACTATGATGCAAATAAAACCGGACTGAAGGAGCTGCCCATGAGAAATTTACAGGAAATCCTGCATGGCGCCGTG 444
Query 445 CGGTTCAGCAACAACCCTGCCCTGTGCAACGTGGAGAGCATCCAGTGGCGGGACATAGTCAGCAGTGACTTTCT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CGGTTCAGCAACAACCCTGCCCTGTGCAACGTGGAGAGCATCCAGTGGCGGGACATAGTCAGCAGTGACTTTCT 518
Query 519 CAGCAACATGTCGATGGACTTCCAGAACCACCTGGGCAGCTGCCAAAAGTGTGATCCAAGCTGTCCCAATGGGA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CAGCAACATGTCGATGGACTTCCAGAACCACCTGGGCAGCTGCCAAAAGTGTGATCCAAGCTGTCCCAATGGGA 592
Query 593 GCTGCTGGGGTGCAGGAGAGGAGAACTGCCAGAAACTGACCAAAATCATCTGTGCCCAGCAGTGCTCCGGGCGC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GCTGCTGGGGTGCAGGAGAGGAGAACTGCCAGAAACTGACCAAAATCATCTGTGCCCAGCAGTGCTCCGGGCGC 666
Query 667 TGCCGTGGCAAGTCCCCCAGTGACTGCTGCCACAACCAGTGTGCTGCAGGCTGCACAGGCCCCCGGGAGAGCGA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TGCCGTGGCAAGTCCCCCAGTGACTGCTGCCACAACCAGTGTGCTGCAGGCTGCACAGGCCCCCGGGAGAGCGA 740
Query 741 CTGCCTGGTCTGCCGCAAATTCCGAGACGAAGCCACGTGCAAGGACACCTGCCCCCCACTCATGCTCTACAACC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CTGCCTGGTCTGCCGCAAATTCCGAGACGAAGCCACGTGCAAGGACACCTGCCCCCCACTCATGCTCTACAACC 814
Query 815 CCACCACGTACCAGATGGATGTGAACCCCGAGGGCAAATACAGCTTTGGTGCCACCTGCGTGAAGAAGTGTCCC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CCACCACGTACCAGATGGATGTGAACCCCGAGGGCAAATACAGCTTTGGTGCCACCTGCGTGAAGAAGTGTCCC 888
Query 889 CGTAATTATGTGGTGACAGATCACGGCTCGTGCGTCCGAGCCTGTGGGGCCGACAGCTATGAGATGGAGGAAGA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CGTAATTATGTGGTGACAGATCACGGCTCGTGCGTCCGAGCCTGTGGGGCCGACAGCTATGAGATGGAGGAAGA 962
Query 963 CGGCGTCCGCACTAGTACGACGTTATAAGGTCGCCCGGGGGCA----GTGTATACGACCATTGGGACGAATCTG 1032
|||||||||||...|||.||.||...|||| |||..|..||| ||||| ||| ||||..|
Sbjct 963 CGGCGTCCGCAAGTGTAAGAAGTGCGAAGG--GCCTTGCCGCAAAGTGTGTA-ACG-----------GAATAGG 1022
Query 1033 TTGTAAATGGT---TTCAAA------------ATAGCTGCT-CTAATATGGAAA---TTAAGA----------- 1076
| |.|||| ||.||| |||..|||| |.||||| .||| ||.|.|
Sbjct 1023 T----ATTGGTGAATTTAAAGACTCACTCTCCATAAATGCTACGAATAT-TAAACACTTCAAAAACTGCACCTC 1091
Query 1077 -----------------------GGCCGG---------GGGG-------------------CCTC-----GGTC 1094
.||||| |||| |||| |.||
Sbjct 1092 CATCAGTGGCGATCTCCACATCCTGCCGGTGGCATTTAGGGGTGACTCCTTCACACATACTCCTCCTCTGGATC 1165
Query 1095 TA-AG--------TATAATAAAAACATGATCCGCCGTACAGCGGAGAA-----AGGG--------------GG- 1139
.| || |||..|.|||| |||||.|| ||| |||| ||
Sbjct 1166 CACAGGAACTGGATATTCTGAAAA---------CCGTAAAG----GAAATCACAGGGTTTTTGCTGATTCAGGC 1226
Query 1140 --GGACTGGA--------GGAGTTAGATGGC---GGG----TAAGGGAGT----CGGGGCGGGA---------- 1182
||.|||.| |||..|..|||.| |.| || |.|.| ||.|||.|||
Sbjct 1227 TTGGCCTGAAAACAGGACGGACCTCCATGCCTTTGAGAACCTA--GAAATCATACGCGGCAGGACCAAGCAACA 1298
Query 1183 --------------TAGCTAG-----AGCCAGACAGATAAGATACATTGAGAGTTTGGACAATCCACAACT--A 1235
|.|| || ||||.|| |.||||.|| |.|||.||.| ||..||| || |
Sbjct 1299 TGGTCAGTTTTCTCTTGC-AGTCGTCAGCCTGA-ACATAACAT-CCTTGGGATT----ACGCTCC----CTCAA 1361
Query 1236 GAATGCCGTGAAAAAAATGATTTATGTGTG-----------------AAATTTGTGATGCTATTGCTTTATTTG 1292
| ||.|.||.||||..|..|||| ||||||| ||||| ||
Sbjct 1362 G--------GAGATAAGTGATGGAGATGTGATAATTTCAGGAAACAAAAATTTG---TGCTA----------TG 1414
Query 1293 TAACCATTATAAGCTGCAATAAACAAGTT-----CCTC---TCACTCTGTGATATTCATTTCTTTGCAAGTTAT 1358
.||..|..||||.|||.||.|||| .||| |||| ||| ||.|..|| ||.||||
Sbjct 1415 CAAATACAATAAACTGGAAAAAAC-TGTTTGGGACCTCCGGTCA------GAAAACCA---------AAATTAT 1472
Query 1359 AAATA------GTGAATAATAAGATG-------ACA----TGAACTACTATACGTACTGCT----AGAGATTTT 1411
||..| |||| ||..||.|| ||| .|..||.|.||.|.|..|||| .|||
Sbjct 1473 AAGCAACAGAGGTGA--AAACAGCTGCAAGGCCACAGGCCAGGTCTGCCATGCCTTGTGCTCCCCCGAG----- 1539
Query 1412 CCAGACTGACTAAAAGGGTCTG------AGGGA-----TCTCTAGTTACCAGA--GTCACACAA--CAG----- 1465
|.||| || .|||.|.| ||||| |||| ||.||.|| ||||..|.| |||
Sbjct 1540 ---GGCTG-CT---GGGGCCCGGAGCCCAGGGACTGCGTCTC---TTGCCGGAATGTCAGCCGAGGCAGGGAAT 1603
Query 1466 ACGGGCACA----CA--CTACTAGA-----AGCACTCAAGGCAAGCTTTATTGAG----------GCTTAAGCA 1518
.||.|.||| || ||.||.|| ||| |||||.| .|||.|.||| ||.|| ||
Sbjct 1604 GCGTGGACAAGTGCAACCTTCTGGAGGGTGAGC---CAAGGGA--GTTTGTGGAGAACTCTGAGTGCATA--CA 1670
Query 1519 GTGGGTTCCCTAGTTAGCCAGAGAGCTCCCAGGCTCAG------------ATCTGGTCTA--------ACCAGA 1572
||| || |.|||||| |.||.|.||||| |.|||..| | ||||||
Sbjct 1671 GTG----CC------ACCCAGAG---TGCCTGCCTCAGGCCATGAACATCACCTGCAC-AGGACGGGGACCAGA 1730
Query 1573 GAGACCCGTTTATGTATCGAGCTAGGCACTTAAATACAATATCTTTG--------CAATGCGGCAATTC----- 1633
.| || ||||||.|| |..||.| |.|||| ||| ||.||||.|||..|
Sbjct 1731 CA-AC-------TGTATCCAG-TGTGCCC---ACTACA------TTGACGGCCCCCACTGCGTCAAGACCTGCC 1786
Query 1634 -------AGTGGTTCGTCCAATCCATGTCAG--------ACCC--GTCTGTTGCCTTCCTAATAAGGCA----- 1685
||| ||||..|| |||| ||||| .||..|.|||
Sbjct 1787 CGGCAGGAGT-------------CATGGGAGAAAACAACACCCTGGTCTG---------GAAGTACGCAGACGC 1838
Query 1686 ---CGAT-CGTACCACCTGACTTCCA-CCAATCGGC--------ATGCACGGTGCTTTTTCTCTC----CTTGT 1742
|.|| .||.||||||| |.||| ||||.|.|| ||||||.|.|| | ||||
Sbjct 1839 CGGCCATGTGTGCCACCTG--TGCCATCCAAACTGCACCTACGGATGCACTGGGC---------CAGGTCTTG- 1900
Query 1743 AAGGCAAGTTG-CTAACTCATCGTTACCATGTTGC--AAGACTACAAGTTTATTGCATAAGACTACATT---AA 1810
||||| || |.|||..||.| || |||| .|..||..||.|| ||.| |.
Sbjct 1901 AAGGC----TGTCCAACGAATGG----------GCCTAAGA--TCCCGTCCATCGC---------CACTGGGAT 1949
Query 1811 GCTTGCAGCTCCAGCTTTTGTTCCCGTTAGTGAGGGTAAATGCGCGCTGGCGTTTCCGGCCTATTCATGCGAAG 1884
|.|.|..|| ||..||.|||.|.|.|.|.||| ||.||||.|.| ||||||.|||||||||||
Sbjct 1950 GGTGGGGGC-CCTCCTCTTGCTGCTGGTGGTG-----------GCCCTGGGGAT--CGGCCTCTTCATGCGAAG 2009
Query 1885 GCGCCACATCGTTCGGAAGCGCACGCTGCGGAGGCTGCTGCAGGAGAGGGAGCTTGTGGAGCCTCTTACACCCA 1958
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2010 GCGCCACATCGTTCGGAAGCGCACGCTGCGGAGGCTGCTGCAGGAGAGGGAGCTTGTGGAGCCTCTTACACCCA 2083
Query 1959 GTGGAGAAGCTCCCAACCAAGCTCTCTTGAGGATCTTGAAGGAAACTGAATTCAAAAAGATCAAAGTGCTGGGC 2032
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2084 GTGGAGAAGCTCCCAACCAAGCTCTCTTGAGGATCTTGAAGGAAACTGAATTCAAAAAGATCAAAGTGCTGGGC 2157
Query 2033 TCCGGTGCGTTCGGCACGGTGTATAAGGGACTCTGGATCCCAGAAGGTGAGAAAGTTAAAATTCCCGTCGCTAT 2106
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2158 TCCGGTGCGTTCGGCACGGTGTATAAGGGACTCTGGATCCCAGAAGGTGAGAAAGTTAAAATTCCCGTCGCTAT 2231
Query 2107 CAAGGAATTAAGAGAAGCAACATCTCCGAAAGCCAACAAGGAAATCCTCGATGAAGCCTACGTGATGGCCAGCG 2180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2232 CAAGGAATTAAGAGAAGCAACATCTCCGAAAGCCAACAAGGAAATCCTCGATGAAGCCTACGTGATGGCCAGCG 2305
Query 2181 TGGACAACCCCCACGTGTGCCGCCTGCTGGGCATCTGCCTCACCTCCACCGTGCAGCTCATCACGCAGCTCATG 2254
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 2306 TGGACAACCCCCACGTGTGCCGCCTGCTGGGCATCTGCCTCACCTCCACCGTGCAGCTCATCATGCAGCTCATG 2379
Query 2255 CCCTTCGGCTGCCTCCTGGACTATGTCCGGGAACACAAAGACAATATTGGCTCCCAGTACCTGCTCAACTGGTG 2328
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2380 CCCTTCGGCTGCCTCCTGGACTATGTCCGGGAACACAAAGACAATATTGGCTCCCAGTACCTGCTCAACTGGTG 2453
Query 2329 TGTGCAGATCGCAAAGGGCATGAACTACTTGGAGGACCGTCGCTTGGTGCACCGCGACCTGGCAGCCAGGAACG 2402
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2454 TGTGCAGATCGCAAAGGGCATGAACTACTTGGAGGACCGTCGCTTGGTGCACCGCGACCTGGCAGCCAGGAACG 2527
Query 2403 TACTGGTGAAAACACCGCAGCATGTCAAGATCACAGATTTTGGGCTGGCCAAACTGCTGGGTGCGGAAGAGAAA 2476
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2528 TACTGGTGAAAACACCGCAGCATGTCAAGATCACAGATTTTGGGCTGGCCAAACTGCTGGGTGCGGAAGAGAAA 2601
Query 2477 GAATACCATGCAGAAGGAGGCAAAGTGCCTATCAAGTGGATGGCATTGGAATCAATTTTACACAGAATCTATAC 2550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2602 GAATACCATGCAGAAGGAGGCAAAGTGCCTATCAAGTGGATGGCATTGGAATCAATTTTACACAGAATCTATAC 2675
Query 2551 CCACCAGAGTGATGTCTGGAGCTACGGGGTGACCGTTTGGGAGTTGATGACCTTTGGATCCAAGCCATATGACG 2624
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2676 CCACCAGAGTGATGTCTGGAGCTACGGGGTGACCGTTTGGGAGTTGATGACCTTTGGATCCAAGCCATATGACG 2749
Query 2625 GAATCCCTGCCAGCGAGATCTCCTCCATCCTGGAGAAAGGAGAACGCCTCCCTCAGCCACCCATATGTACCATC 2698
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2750 GAATCCCTGCCAGCGAGATCTCCTCCATCCTGGAGAAAGGAGAACGCCTCCCTCAGCCACCCATATGTACCATC 2823
Query 2699 GATGTCTACATGATCATGGTCAAGTGCTGGATGATAGACGCAGATAGTCGCCCAAAGTTCCGTGAGTTGATCAT 2772
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2824 GATGTCTACATGATCATGGTCAAGTGCTGGATGATAGACGCAGATAGTCGCCCAAAGTTCCGTGAGTTGATCAT 2897
Query 2773 CGAATTCTCCAAAATGGCCCGAGACCCCCAGCGCTACCTTGTCATTCAGGGGGATGAAAGAATGCATTTGCCAA 2846
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2898 CGAATTCTCCAAAATGGCCCGAGACCCCCAGCGCTACCTTGTCATTCAGGGGGATGAAAGAATGCATTTGCCAA 2971
Query 2847 GTCCTACAGACTCCAACTTCTACCGTGCCCTGATGGATGAAGAAGACATGGACGACGTGGTGGATGCCGACGAG 2920
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2972 GTCCTACAGACTCCAACTTCTACCGTGCCCTGATGGATGAAGAAGACATGGACGACGTGGTGGATGCCGACGAG 3045
Query 2921 TACCTCATCCCACAGCAGGGCTTCTTCAGCAGCCCCTCCACGTCACGGACTCCCCTCCTGAGCTCTCTGAGTGC 2994
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3046 TACCTCATCCCACAGCAGGGCTTCTTCAGCAGCCCCTCCACGTCACGGACTCCCCTCCTGAGCTCTCTGAGTGC 3119
Query 2995 AACCAGCAACAATTCCACCGTGGCTTGCATTGATAGAAATGGGCTGCAAAGCTGTCCCATCAAGGAAGACAGCT 3068
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3120 AACCAGCAACAATTCCACCGTGGCTTGCATTGATAGAAATGGGCTGCAAAGCTGTCCCATCAAGGAAGACAGCT 3193
Query 3069 TCTTGCAGCGATACAGCTCAGACCCCACAGGCGCCTTGACTGAGGACAGCATAGACGACACCTTCCTCCCAGTG 3142
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3194 TCTTGCAGCGATACAGCTCAGACCCCACAGGCGCCTTGACTGAGGACAGCATAGACGACACCTTCCTCCCAGTG 3267
Query 3143 CCTGAATACATAAACCAGTCCGTTCCCAAAAGGCCCGCTGGCTCTGTGCAGAATCCTGTCTATCACAATCAGCC 3216
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3268 CCTGAATACATAAACCAGTCCGTTCCCAAAAGGCCCGCTGGCTCTGTGCAGAATCCTGTCTATCACAATCAGCC 3341
Query 3217 TCTGAACCCCGCGCCCAGCAGAGACCCACACTACCAGGACCCCCACAGCACTGCAGTGGGCAACCCCGAGTATC 3290
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3342 TCTGAACCCCGCGCCCAGCAGAGACCCACACTACCAGGACCCCCACAGCACTGCAGTGGGCAACCCCGAGTATC 3415
Query 3291 TCAACACTGTCCAGCCCACCTGTGTCAACAGCACATTCGACAGCCCTGCCCACTGGGCCCAGAAAGGCAGCCAC 3364
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3416 TCAACACTGTCCAGCCCACCTGTGTCAACAGCACATTCGACAGCCCTGCCCACTGGGCCCAGAAAGGCAGCCAC 3489
Query 3365 CAAATTAGCCTGGACAACCCTGACTACCAGCAGGACTTCTTTCCCAAGGAAGCCAAGCCAAATGGCATCTTTAA 3438
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3490 CAAATTAGCCTGGACAACCCTGACTACCAGCAGGACTTCTTTCCCAAGGAAGCCAAGCCAAATGGCATCTTTAA 3563
Query 3439 GGGCTCCACAGCTGAAAATGCAGAATACCTAAGGGTCGCGCCACAAAGCAGTGAATTTATTGGAGCA 3505
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3564 GGGCTCCACAGCTGAAAATGCAGAATACCTAAGGGTCGCGCCACAAAGCAGTGAATTTATTGGAGCA 3630