Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14625
• Subject: NM_023580.4
• Aligned Length: 2949
• Identities: 2530
• Gaps: 39

Alignment

Query    1  ATGGAGCGGCGCTGGCCCCTGGGGCT---AGGGCTGGTGCTGCTGCTCTGCGCCCCGCTGCCCCCGGGGGCGCG  71
            ||||||||||||||||||||||||||   |..||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGCGGCGCTGGCCCCTGGGGCTTGCATTGCTGCTGCTGCTGCTCTGCGCCCCGCTGCCCCCGGGGGCGCG  74

Query   72  CGCCAAGGAAGTTACTCTGATGGACACAAGCAAGGCACAGGGAGAGCTGGGCTGGCTGCTGGATCCCCCAAAAG  145
            ||||.|||||||.|||||.|||||||||||||..|||||.|||||||||||||||||.||||||||||| |.||
Sbjct   75  CGCCGAGGAAGTCACTCTAATGGACACAAGCACAGCACAAGGAGAGCTGGGCTGGCTTCTGGATCCCCC-AGAG  147

Query  146  A-TGGGTGGAGTGAACAGCAACAGATACTGAATGGGACACCCCTGTACATGTACCAGGACTGCCCAATGCAAGG  218
            | ||||||||||||...||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|.
Sbjct  148  ACTGGGTGGAGTGAGGTGCAACAAATGCTAAACGGGACACCCCTGTACATGTACCAAGACTGCCCAATACAGGA  221

Query  219  ACGCAGAGACACTGACCACTGGCTTCGCTCCAATTGGATCTACCGCGGGGAGGAGGCTTCCCGCGTCCACGTGG  292
            |.|..|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||.||.||||||
Sbjct  222  AGGTGGGGACACTGACCACTGGCTTCGCTCCAATTGGATCTACCGCGGAGAGGAAGCTTCACGCATCTACGTGG  295

Query  293  AGCTGCAGTTCACCGTGCGGGACTGCAAGAGTTTCCCTGGGGGAGCCGGGCCTCTGGGCTGCAAGGAGACCTTC  366
            |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct  296  AGCTGCAGTTCACCGTGCGGGACTGTAAGAGTTTCCCAGGGGGAGCTGGGCCTCTGGGATGCAAAGAGACCTTC  369

Query  367  AACCTTCTGTACATGGAGAGTGACCAGGATGTGGGCATTCAGCTCCGACGGCCCTTGTTCCAGAAGGTAACCAC  440
            ||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||
Sbjct  370  AACCTTTTCTACATGGAGAGTGACCAGGATGTGGGCATTCAGCTCCGACGACCTTTGTTCCAAAAGGTAACAAC  443

Query  441  GGTGGCTGCAGACCAGAGCTTCACCATTCGAGACCTTGCGTCTGGCTCCGTGAAGCTGAATGTGGAGCGCTGCT  514
            .|||||.||||||||||||||||||||..|||||||.||.||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||
Sbjct  444  TGTGGCAGCAGACCAGAGCTTCACCATCAGAGACCTGGCATCTGGCTCTGTAAAGCTGAATGTAGAACGCTGCT  517

Query  515  CTCTGGGCCGCCTGACCCGCCGTGGCCTCTACCTCGCTTTCCACAACCCGGGTGCCTGTGTGGCCCTGGTGTCT  588
            |..||||||.|||.||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||.||||||||||.||.||||||
Sbjct  518  CGTTGGGCCACCTCACCCGCCGTGGCCTCTACTTAGCTTTCCACAACCCGGGTTCCTGTGTGGCGCTAGTGTCT  591

Query  589  GTCCGGGTCTTCTACCAGCGCTGTCCTGAGACCCTGAATGGCTTGGCCCAATTCCCAGACACTCTGCCTGGCCC  662
            ||..||||.|||||||||||||||.|.||||||.||.|||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||
Sbjct  592  GTAAGGGTGTTCTACCAGCGCTGTGCCGAGACCGTGCATGGCTTGGCCCACTTCCCTGACACTCTCCCTGGACC  665

Query  663  CGCTGGGTTGGTGGAAGTGGCGGGGACCTGCTTGCCCCACGCGCGGGCCAGCCCCAGGCCCTCAGGTGCACCCC  736
            .|..||||||||.|||||.||.||.||.|||.|..||||.||.|.|..||||....||.||||||||.||||.|
Sbjct  666  TGGAGGGTTGGTTGAAGTAGCTGGAACGTGCCTCTCCCATGCACAGATCAGCTTGGGGTCCTCAGGTACACCAC  739

Query  737  GCATGCACTGCAGCCCTGATGGCGAGTGGCTGGTGCCTGTAGGACGGTGCCACTGTGAGCCTGGCTATGAGGAA  810
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|.||||||.||.||||||||||||||.|||
Sbjct  740  GAATGCACTGCAGCCCTGATGGCGAGTGGCTGGTGCCTGTGGGTCAGTGCCAGTGCGAGCCTGGCTATGAAGAA  813

Query  811  GGTGGCAGTGGCGAAGCATGTG-------TTGCCTGCCCTAGCGGCTCCTACCGGATGGACATGGACACACCCC  877
               .||||||  |||  |||||       .||||||.||||..||.|.|||.||..||||||||.|.||||.||
Sbjct  814  ---AGCAGTG--GAA--ATGTGGGATGCACTGCCTGTCCTACTGGTTTCTATCGAGTGGACATGAATACACTCC  880

Query  878  ATTGTCTCACGTGCCCCCAGCAGAGCACTGCTGAGTCTGAGGGGGCCACCATCTGTACCTGTGAGAGCGGCCAT  951
            .||||||||.|||||||||.||.||||..||.||||||||||||.|.|||||||||||||||||||..||.|||
Sbjct  881  GTTGTCTCAAGTGCCCCCAACATAGCATAGCAGAGTCTGAGGGGTCTACCATCTGTACCTGTGAGAATGGACAT  954

Query  952  TACAGAGCTCCCGGGGAGGGCCCCCAGGTGGCATGCACAGGTCCCCCCTCGGCCCCCCGAAACCTGAGCTTCTC  1025
            ||..||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||.|||||||.|||||.||||.|||.|||||||||||
Sbjct  955  TATCGAGCCCCTGGGGAGGGTCCCCAGGTAGCATGCACACGTCCCCCATCGGCTCCCCAAAATCTGAGCTTCTC  1028

Query 1026  TGCCTCAGGGACTCAGCTCTCCCTGCGTTGGGA-ACCCCCAGCAGATACGGGGGGACGCCAGGATGTCAGATAC  1098
            ..|.|||||||||||.|||||||||||.||||| .||||||| ||||||.|||||||||||.|||.||||||||
Sbjct 1029  CACATCAGGGACTCAACTCTCCCTGCGCTGGGAGCCCCCCAG-AGATACAGGGGGACGCCATGATATCAGATAC  1101

Query 1099  AGTGTGAGGTGTTCCCAGTGTCAGGGCACAGCACAGGACGGGGGGCCCTGCCAGCCCTGTGG----GGTGGGCG  1168
            ||.|||..|||.|..|||||||.|||||..||||||||.|||||.||||||||.||||||||    |||    |
Sbjct 1102  AGCGTGGAGTGCTTGCAGTGTCGGGGCATTGCACAGGATGGGGGTCCCTGCCAACCCTGTGGAAAAGGT----G  1171

Query 1169  TGCACTTCTCGCCGGGGGC--CCGGGGGCTCACCACACCTGCAGTGCATGT-CAATGGCCTTGAACCTTATGCC  1239
            |||||||.||.||||..||  ||  ||||||||||||.||.|.|||||.|| ||| |||||.||.|||||.|||
Sbjct 1172  TGCACTTTTCCCCGGCTGCTTCC--GGGCTCACCACATCTACCGTGCAAGTGCAA-GGCCTCGAGCCTTACGCC  1242

Query 1240  AACTACACCTTTAATGTGGAAGCCCAAAATGGAGTGTCAGGGCTGGGCAGCTCTGGCCATGCCAGCACCTCAGT  1313
            ||||||||.||||..||..||.|||||||..||||||||||.||||.|||.||..|||.|..||||.||||..|
Sbjct 1243  AACTACACATTTACCGTCAAATCCCAAAACAGAGTGTCAGGACTGGACAGTTCCAGCCCTAGCAGCGCCTCCCT  1316

Query 1314  CAGCATCAGCATGGGGCATGCAGAGTCACTGTCAGGCCTGTCTCTGAGACTGGTGAAGAAAGAACCGAGGCAAC  1387
            |||.||||.|||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||||..|||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1317  CAGTATCAACATGGGGCACGCAGAGTCACTCTCTGGCCTGTCACTGAAGCTGGTGAAGAAAGAACCGAGGCAGC  1390

Query 1388  TAGAGCTGACCTGGGCGGGGTCCCGGCCCCGAAGCCCTGGGGCGAACCTGACCTATGAGCTGCACGTGCTGAAC  1461
            |.||||||||.|||||.||||||||.|||||||..|||||.|.|||.||||.|||||||||||||||||||||.
Sbjct 1391  TGGAGCTGACTTGGGCAGGGTCCCGACCCCGAAATCCTGGAGGGAATCTGAGCTATGAGCTGCACGTGCTGAAT  1464

Query 1462  CAGGATGAAGAACGGTACCAGATGGTTCTAGAACCCAGGGTCTTGCTGACAGAGCTGCAGCCTGACACCACATA  1535
            |||||.||||||.||.||||||||||..|.|||||||||||||||||||||.|.||.|||||.||.||||||||
Sbjct 1465  CAGGACGAAGAATGGCACCAGATGGTGTTGGAACCCAGGGTCTTGCTGACAAAACTTCAGCCAGATACCACATA  1538

Query 1536  CATCGTCAGAGTCCGAATGCTGACCCCACTGGGTCCTGGCCCTTTCTCCCCTGATCATGAGTTTCGGACCAGCC  1609
            |||.||||||||.||||..||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 1539  CATTGTCAGAGTGCGAACACTGACCCCACTGGGGCCTGGCCCTTTCTCCCCTGACCATGAGTTTCGGACAAGCC  1612

Query 1610  CACCAGTGTCCAGGGGCCTGACTGGAGGAGAGATTGTAGCCGTCATCTTTGGGCTGCTGCTTGGTGCAGCCTTG  1683
            |||||||.|||||..|||||||.||||||||||||||.||||||||||||||..||||||||||...|||..||
Sbjct 1613  CACCAGTTTCCAGAAGCCTGACCGGAGGAGAGATTGTGGCCGTCATCTTTGGATTGCTGCTTGGAATAGCTCTG  1686

Query 1684  CTGCTTGGGATTCTCGTTTTCCGGTCCAGGAGAGCCCAGCGGCAGAGGCAGCAGAGGCAGCGTGACCGCGCCAC  1757
            |||.|.||||||...||.|||||.||.|||||||.||||.|.|||||.|||||||||||||||||.|||.||||
Sbjct 1687  CTGATCGGGATTTATGTCTTCCGTTCAAGGAGAGGCCAGAGACAGAGACAGCAGAGGCAGCGTGAACGCACCAC  1760

Query 1758  CGATGTGGATCGAGAGGACAAGCTGTGGCTGAAGCCTTATGTGGACCTCCAGGCATACGAGGACCCTGCACAGG  1831
            |.||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||
Sbjct 1761  CAATGTCGATCGAGAGGACAAGCTGTGGCTAAAACCCTATGTGGACCTCCAGGCCTATGAGGACCCTGCACAGG  1834

Query 1832  GAGCCCTGGACTTTACCCGGGAGCTTGATCCAGCGTGGCTGATGGTGGACACTGTCATAGGAGAAGGAGAGTTT  1905
            |||||.|.||||||.|||.|||.||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1835  GAGCCTTAGACTTTGCCCAGGAACTGGACCCAGCCTGGCTGATTGTGGACACTGTCATAGGAGAAGGGGAGTTT  1908

Query 1906  GGGGAAGTGTATCGAGGGA-CCCTGAGGCTCCCCAGCCAGGACTGCAAGACTGTGGCCATTAAGACCTTAAAAG  1978
            ||.||||||||||| |||| |||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1909  GGTGAAGTGTATCG-GGGAGCCCTGAGACTCCCCAGCCAAGATTGCAAGACTGTGGCCATTAAGACCTTGAAAG  1981

Query 1979  ACACATCCCCAGGTGGCCAGTGGTGGAACTTCCTTCGAGAGGCAACTATCATGGGCCAGTTTAGCCACCCGCAT  2052
            |.||||||||||.||||.|.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||.||.
Sbjct 1982  ATACATCCCCAGATGGCTACTGGTGGAATTTCCTTCGAGAGGCAACTATCATGGGCCAGTTCAACCACCCACAC  2055

Query 2053  ATTCTGCATCTGGAAGGCGTCGTCACAAAGCGAAAGCCGATCATGATCATCACAGAATTTATGGAGAATGGAGC  2126
            |||||.|..||.|||||.|||.|||||||..|||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 2056  ATTCTACGCCTAGAAGGTGTCATCACAAAAAGAAAGCCCATCATGATCATCACAGAATTTATGGAAAATGGAGC  2129

Query 2127  CCTGGATGCCTTCCTGAGGGAGCGGGAGGACCAGCTGGTCCCTGGGCAGCTAGTGGCCATGCTGCAGGGCATAG  2200
            ||||||||||||.||||.|||.|||||||||||.||.|..|||||.|||||||||||.|||||.|.||||||||
Sbjct 2130  CCTGGATGCCTTTCTGAAGGAACGGGAGGACCAACTAGCTCCTGGTCAGCTAGTGGCTATGCTACTGGGCATAG  2203

Query 2201  CATCTGGCATGAACTACCTCAGTAATCACAATTATGTCCACCGGGACCTGGCTGCCAGAAACATCTTGGTGAAT  2274
            ||||.||||||||||.|||||||...||||||||||||||..|.||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 2204  CATCAGGCATGAACTGCCTCAGTGGCCACAATTATGTCCATAGAGACCTGGCTGCCAGGAACATCTTGGTGAAT  2277

Query 2275  CAAAACCTGTGCTGCAAGGTGTCTGACTTTGGCCTGACTCGCCTCCTGGATGACTTTGATGGCACATACGAAAC  2348
            ||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||
Sbjct 2278  CAGAACCTGTGCTGCAAGGTGTCTGACTTTGGCTTGACCCGCCTCCTGGATGACTTTGACGGCACCTATGAAAC  2351

Query 2349  CCAGGGAGGAAAGATCCCTATCCGTTGGACAGCCCCTGAAGCCATTGCCCATCGGATCTTCACCACAGCCAGCG  2422
            ||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 2352  CCAGGGAGGAAAGATCCCCATCCGATGGACAGCCCCAGAAGCTATTGCCCATCGGATCTTCACCACAGCCAGTG  2425

Query 2423  ATGTGTGGAGCTTTGGGATTGTGATGTGGGAGGTGCTGAGCTTTGGGGACAAGCCTTATGGGGAGATGAGCAAT  2496
            ||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||.
Sbjct 2426  ATGTGTGGAGCTTTGGGATTGTAATGTGGGAGGTGTTGAGTTTTGGCGACAAACCCTATGGGGAGATGAGCAAC  2499

Query 2497  CAGGAGGTTATGAAGAGCATTGAGGATGGGTACCGGTTGCCCCCTCCTGTGGACTGCCCTGCCCCTCTGTATGA  2570
            ||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 2500  CAAGAGGTAATGAAAAGCATTGAAGATGGGTACCGGTTGCCCCCTCCTGTGGACTGTCCTGCCCCTCTCTATGA  2573

Query 2571  GCTCATGAAGAACTGCTGGGCATATGACCGTGCCCGCCGGCCACACTTCCAGAAGCTTCAGGCACATCTGGAGC  2644
            .||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.||.||.|||||||...||||.||||||||||||||.|
Sbjct 2574  ACTCATGAAGAACTGCTGGGCTTACGATCGTGCCCGTCGACCCCACTTCCTCCAGCTGCAGGCACATCTGGAAC  2647

Query 2645  AACTGCTTGCCAACCCCCACTCCCTGCGGACCATTGCCAACTTTGACCCCAGGATGACTCTT-CGCCTGCCCAG  2717
            |..|||||.|..|||||||.|||||..||||.|||||||||||||||||.|||.|||| ||| |||||||||||
Sbjct 2648  AGTTGCTTACTGACCCCCATTCCCTAAGGACAATTGCCAACTTTGACCCTAGGGTGAC-CTTACGCCTGCCCAG  2720

Query 2718  CCTGAGTGGCTCAGATGGGATCCCATATCGAACCGTCTCTGAGTGGCTCGAGTCCATACGCATGAAACGCTACA  2791
            ||||||||||||.|||||||||||.|||||||..||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct 2721  CCTGAGTGGCTCTGATGGGATCCCTTATCGAAGTGTCTCTGAGTGGCTTGAATCCATACGCATGAAGCGCTACA  2794

Query 2792  TCCTGCACTTCCACTCGGCTGGGCTGGACACCATGGAGTGTGTGCTGGAGCTGACCGCTGAGGACCTGACGCAG  2865
            ||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 2795  TCCTGCACTTCCGTTCGGCTGGGCTGGACACCATGGAGTGTGTGCTGGAGCTGACGGCTGAGGACCTGACGCAG  2868

Query 2866  ATGGGAATCACACTGCCCGGGCACCAGAAGCGCATTCTTTGCAGTATTCAGGGATTCAAGGAC  2928
            ||||||||.||..||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 2869  ATGGGAATAACGTTGCCAGGGCACCAGAAACGAATTCTCTGCAGTATTCAAGGATTTAAGGAC  2931