Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14630
• Subject: NM_001280794.2
• Aligned Length: 1021
• Identities: 728
• Gaps: 292

Alignment

Query    1  MATEGAAQLGNRVAGMVCSLWVLLLVSSVLALEEVLLDTTGETSEIGWLTYPPGGWDEVSVLDDQRRLTRTFEA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CHVAGAPPGTGQDNWLQTHFVERRGAQRAHIRLHFSVRACSSLGVSGGTCRETFTLYYRQAEEPDSPDSVSSWH  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  LKRWTKVDTIAADESFPSSSSSSSSSSSAAWAVGPHGAGQRAGLQLNVKERSFGPLTQRGFYVAFQDTGACLAL  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  VAVRLFSYTCPAVLRSFASFPETQASGAGGASLVAAVGTCVAHAEPEEDGVGGQAGGSPPRLHCNGEGKWMVAV  296
                                                                                  ||||
Sbjct    1  ----------------------------------------------------------------------MVAV  4

Query  297  GGCRCQPGYQPARGDKACQACPRGLYKSSAGNAPCSPCPARSHAPNPAAPVCPCLEGFYRASSDPPEAPCTGPP  370
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    5  GGCRCQPGYQPARGDKACQACPRGLYKASAGNAPCSPCPARSHAPNPAAPVCPCLEGFYRASSDPPEAPCTGPP  78

Query  371  SAPQELWFEVQGSALMLHWRLPRELGGRGDLLFNVVCKECEGRQEPASGGGGTCHRCRDEVHFDPRQRGLTESR  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   79  SAPQELWFEVQGSALMLHWRLPRELGGRGDLLFNVVCKECEGRQEPASGGGGTCHRCRDEVHFDPRQRGLTESR  152

Query  445  VLVGGLRAHVPYILEVQAVNGVSELSPDPPQAAAINVSTSHEVPSAVPVVHQVSRASNSITVSWPQPDQTNGNI  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  153  VLVGGLRAHVPYILEVQAVNGVSELSPDPPQAAAINVSTSHEVPSAVPVVHQVSRASNSITVSWPQPDQTNGNI  226

Query  519  LDYQLRYYDQAEDESHSFTLTSETNTATVTQLSPGHIYGFQVRARTAAGHGPYGGKVYFQTLPQGELSSQLPER  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  227  LDYQLRYYDQAEDESHSFTLTSETNTATVTQLSPGHIYGFQVRARTAAGHGPYGGKVYFQTLPQGELSSQLPER  300

Query  593  LSLVIGSILGALAFLLLAAITVLAVVFQRKRRGTGYTEQLQQYSSPGLGVKYYIDPSTYEDPCQAIRELAREVD  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  LSLVIGSILGALAFLLLAAITVLAVVFQRKRRGTGYTEQLQQYSSPGLGVKYYIDPSTYEDPCQAIRELAREVD  374

Query  667  PAYIKIEEVIGTGSFGEVRQGRLQPRGRREQTVAIQALWAGGAESLQMTFLGRAAVLGQFQHPNILRLEGVVTK  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  375  PAYIKIEEVIGTGSFGEVRQGRLQPRGRREQTVAIQALWAGGAESLQMTFLGRAAVLGQFQHPNILRLEGVVTK  448

Query  741  SRPLMVLTEFMELGPLDSFLRQREGQFSSLQLVAMQRGVAAAMQYLSSFAFVHRSLSAHSVLVNSHLVCKVARL  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  449  SRPLMVLTEFMELGPLDSFLRQREGQFSSLQLVAMQRGVAAAMQYLSSFAFVHRSLSAHSVLVNSHLVCKVARL  522

Query  815  GHSPQGPSCLLRWAAPEVIAHGKHTTSSDVWSFGILMWEVMSYGERPYWDMSEQEVLNAIEQEFRLPPPPGCPP  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  523  GHSPQGPSCLLRWAAPEVIAHGKHTTSSDVWSFGILMWEVMSYGERPYWDMSEQEVLNAIEQEFRLPPPPGCPP  596

Query  889  GLHLLMLDTWQKDRARRPHFDQLVAAFDKMIRKPDTLQAGGDPGERPSQALLTPVALDFPCLDSPQAWLSAIGL  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  597  GLHLLMLDTWQKDRARRPHFDQLVAAFDKMIRKPDTLQAGGDPGERPSQALLTPVALDFPCLDSPQAWLSAIGL  670

Query  963  ECYQDNFSKFGLCTFSDVAQLSLEDLPALGITLAGHQKKLLHHIQLLQQHLRQQGSVEV  1021
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  671  ECYQDNFSKFGLCTFSDVAQLSLEDLPALGITLAGHQKKLLHHIQLLQQHLRQQGSVEV  729