Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14630
• Subject: NR_104001.2
• Aligned Length: 3563
• Identities: 2757
• Gaps: 803

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  TCTAGATGCTGGGAAGTCCAAGATCAGGGTGCCGGCATGGTCAGTTCCTGGCGAAGCCTCTCTTCTAGGTTTCA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GACTGCCCTCTTCTTTGTTGTGTCCTCGAATGGCAGAAAAAGGGGTGGCTGTTGGAGGAAGGGAGGAGAGTAAA  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  TGAAGAGAAAGAACTGGAATAACCCCTTGCAGAAAAAAAAAAAAAGGGAAGCAAGCTTAGCTGTACACCCTGAG  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  TCTTGCAAAAGCTGCAGCCCCACCCAGGAGCAGGGTGGTGGCTGGGGCGATGGTGGACGCCCTGAAGATGTCCC  296

Query    1  ATGGCTACTGAAGGGGCTGCCCAGTTAGGGAACAGAGTGGCGGGCATGGTGTGTAGCCTATGGGTGCTGCTCCT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ATGGCTACTGAAGGGGCTGCCCAGTTAGGGAACAGAGTGGCGGGCATGGTGTGTAGCCTATGGGTGCTGCTCCT  370

Query   75  GGTGTCTTCAGTTCTGGCTCTGGAAGAGGTATTGCTGGACACCACCGGAGAGACATCTGAGATTGGCTGGCTCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGTGTCTTCAGTTCTGGCTCTGGAAGAGGTATTGCTGGACACCACCGGAGAGACATCTGAGATTGGCTGGCTCA  444

Query  149  CCTACCCACCAGGGGGGTGGGACGAGGTGAGTGTTCTGGACGACCAGCGACGCCTGACTCGGACCTTTGAGGCA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCTACCCACCAGGGGGGTGGGACGAGGTGAGTGTTCTGGACGACCAGCGACGCCTGACTCGGACCTTTGAGGCA  518

Query  223  TGTCATGTGGCAGGGGCCCCTCCAGGCACCGGGCAGGACAATTGGTTGCAGACACACTTTGTGGAGCGGCGCGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGTCATGTGGCAGGGGCCCCTCCAGGCACCGGGCAGGACAATTGGTTGCAGACACACTTTGTGGAGCGGCGCGG  592

Query  297  GGCCCAGAGGGCGCACATTCGACTCCACTTCTCTGTGCGGGCATGCTCCAGCCTGGGTGTGAGCGGCGGCACCT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GGCCCAGAGGGCGCACATTCGACTCCACTTCTCTGTGCGGGCATGCTCCAGCCTGGGTGTGAGCGGCGGCACCT  666

Query  371  GCCGGGAGACCTTCACCCTTTACTACCGTCAGGCTGAGGAGCCCGACAGCCCTGACAGCGTTTCCTCCTGGCAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GCCGGGAGACCTTCACCCTTTACTACCGTCAGGCTGAGGAGCCCGACAGCCCTGACAGCGTTTCCTCCTGGCAC  740

Query  445  CTCAAACGCTGGACCAAGGTGGACACAATTGCAGCAGACGAGAGCTTTCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTC  518
            ||||||||||||||||                                                          
Sbjct  741  CTCAAACGCTGGACCA----------------------------------------------------------  756

Query  519  TTCTTCCTCTGCAGCGTGGGCTGTGGGACCCCACGGGGCTGGGCAGCGGGCTGGACTGCAACTGAACGTCAAAG  592
                                                                                      
Sbjct  757  --------------------------------------------------------------------------  756

Query  593  AGCGGAGCTTTGGGCCTCTCACCCAACGCGGCTTCTACGTGGCCTTCCAGGACACGGGGGCCTGCCTGGCCCTG  666
                                                                                      
Sbjct  757  --------------------------------------------------------------------------  756

Query  667  GTCGCTGTCAGGCTCTTCTCCTACACCTGCCCTGCCGTGCTCCGATCCTTTGCTTCCTTTCCAGAGACGCAGGC  740
                                                                          ||||||||||||
Sbjct  757  --------------------------------------------------------------AGAGACGCAGGC  768

Query  741  CAGTGGGGCTGGGGGGGCCTCCCTGGTGGCAGCTGTGGGCACCTGTGTGGCTCATGCAGAGCCAGAGGAGGATG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  769  CAGTGGGGCTGGGGGGGCCTCCCTGGTGGCAGCTGTGGGCACCTGTGTGGCTCATGCAGAGCCAGAGGAGGATG  842

Query  815  GAGTAGGGGGCCAGGCAGGAGGCAGCCCCCCCAGGCTGCACTGCAACGGGGAGGGCAAGTGGATGGTAGCTGTC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  843  GAGTAGGGGGCCAGGCAGGAGGCAGCCCCCCCAGGCTGCACTGCAACGGGGAGGGCAAGTGGATGGTAGCTGTC  916

Query  889  GGGGGCTGCCGCTGCCAGCCTGGATACCAACCAGCACGAGGAGACAAGGCCTGCCAAGCCTGCCCACGGGGGCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  917  GGGGGCTGCCGCTGCCAGCCTGGATACCAACCAGCACGAGGAGACAAGGCCTGCCAAGCCTGCCCACGGGGGCT  990

Query  963  CTATAAGTCTTCTGCTGGGAATGCTCCCTGCTCACCATGCCCTGCCCGCAGTCACGCTCCCAACCCAGCAGCCC  1036
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  991  CTATAAGGCTTCTGCTGGGAATGCTCCCTGCTCACCATGCCCTGCCCGCAGTCACGCTCCCAACCCAGCAGCCC  1064

Query 1037  CCGTTTGCCCCTGCCTGGAGGGCTTCTACCGGGCCAGTTCCGACCCACCAGAGGCCCCCTGCACTGGTCCTCCA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1065  CCGTTTGCCCCTGCCTGGAGGGCTTCTACCGGGCCAGTTCCGACCCACCAGAGGCCCCCTGCACTGGTCCTCCA  1138

Query 1111  TCGGCTCCCCAGGAGCTTTGGTTTGAGGTGCAAGGCTCAGCACTCATGCTACACTGGCGCCTGCCTCGGGAGCT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1139  TCGGCTCCCCAGGAGCTTTGGTTTGAGGTGCAAGGCTCAGCACTCATGCTACACTGGCGCCTGCCTCGGGAGCT  1212

Query 1185  GGGGGGTCGAGGGGACCTGCTCTTCAATGTCGTGTGCAAGGAGTGTGAAGGCCGCCAGGAACCTGCCAGCGGTG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1213  GGGGGGTCGAGGGGACCTGCTCTTCAATGTCGTGTGCAAGGAGTGTGAAGGCCGCCAGGAACCTGCCAGCGGTG  1286

Query 1259  GTGGGGGCACTTGTCACCGCTGCAGGGATGAGGTCCACTTCGACCCTCGCCAGAGAGGCCTGACTGAGAGCCGA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1287  GTGGGGGCACTTGTCACCGCTGCAGGGATGAGGTCCACTTCGACCCTCGCCAGAGAGGCCTGACTGAGAGCCGA  1360

Query 1333  GTGTTAGTGGGGGGACTCCGGGCACACGTACCCTACATCTTAGAGGTGCAGGCTGTTAATGGGGTGTCTGAGCT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1361  GTGTTAGTGGGGGGACTCCGGGCACACGTACCCTACATCTTAGAGGTGCAGGCTGTTAATGGGGTGTCTGAGCT  1434

Query 1407  CAGCCCTGACCCTCCTCAGGCTGCAGCCATCAATGTCAGCACCAGCCATGAAGTGCCCTCTGCTGTCCCTGTGG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1435  CAGCCCTGACCCTCCTCAGGCTGCAGCCATCAATGTCAGCACCAGCCATGAAGTGCCCTCTGCTGTCCCTGTGG  1508

Query 1481  TGCACCAGGTGAGCCGGGCATCCAACAGCATCACGGTGTCCTGGCCGCAGCCCGACCAGACCAATGGGAACATC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1509  TGCACCAGGTGAGCCGGGCATCCAACAGCATCACGGTGTCCTGGCCGCAGCCCGACCAGACCAATGGGAACATC  1582

Query 1555  CTGGACTATCAGCTCCGCTACTATGACCAGGCAGAAGACGAATCCCACTCCTTCACCCTGACCAGCGAGACCAA  1628
            |||||||||||||||||||||||                                   ||||||||||||||||
Sbjct 1583  CTGGACTATCAGCTCCGCTACTA-----------------------------------TGACCAGCGAGACCAA  1621

Query 1629  CACTGCCACCGTGACACAGCTGAGCCCTGGCCACATCTATGGTTTCCAGGTGCGGGCCCGGACTGCTGCCGGCC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1622  CACTGCCACCGTGACACAGCTGAGCCCTGGCCACATCTATGGTTTCCAGGTGCGGGCCCGGACTGCTGCCGGCC  1695

Query 1703  ACGGCCCCTACGGGGGCAAAGTCTATTTCCAGACACTTCCTCAAGGGGAGCTGTCTTCCCAGCTTCCGGAAAGA  1776
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1696  ACGGCCCCTACGGGGGCAAAGTCTATTTCCAGACACTTCCTCAAGGGGAGCTGTCTTCCCAGCTTCCAGAAAGA  1769

Query 1777  CTCTCCTTGGTGATCGGCTCCATCCTGGGGGCTTTGGCCTTCCTCCTGCTGGCAGCCATCACCGTGCTGGCGGT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1770  CTCTCCTTGGTGATCGGCTCCATCCTGGGGGCTTTGGCCTTCCTCCTGCTGGCAGCCATCACCGTGCTGGCGGT  1843

Query 1851  CGTCTTCCAGCGGAAGCGGCGTGGGACTGGCTACACGGAGCAGCTGCAGCAATACAGCAGCCCAGGACTCGGGG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1844  CGTCTTCCAGCGGAAGCGGCGTGGGACTGGCTACACAGAGCAGCTGCAGCAATACAGCAGCCCAGGACTCGGGG  1917

Query 1925  TGAAGTATTACATCGACCCCTCCACCTACGAGGACCCCTGTCAGGCCATCCGAGAACTTGCCCGGGAAGTCGAT  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1918  TGAAGTATTACATCGACCCCTCCACCTACGAGGACCCCTGTCAGGCCATCCGAGAACTTGCCCGGGAAGTCGAT  1991

Query 1999  CCTGCTTATATCAAGATTGAGGAGGTCATTGGGACAGGCTCTTTTGGAGAAGTGCGCCAGGGCCGCCTGCAGCC  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1992  CCTGCTTATATCAAGATTGAGGAGGTCATTGGGACAGGCTCTTTTGGAGAAGTGCGCCAGGGCCGCCTGCAGCC  2065

Query 2073  ACGGGGACGGAGGGAGCAGACTGTGGCCATCCAGGCCCTGTGGGCCGGGGGCGCCGAAAGCCTGCAGATGACCT  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2066  ACGGGGACGGAGGGAGCAGACTGTGGCCATCCAGGCCCTGTGGGCCGGGGGCGCCGAAAGCCTGCAGATGACCT  2139

Query 2147  TCCTGGGCCGGGCCGCAGTGCTGGGTCAGTTCCAGCACCCCAACATCCTGCGGCTGGAGGGCGTGGTCACCAAG  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2140  TCCTGGGCCGGGCCGCAGTGCTGGGTCAGTTCCAGCACCCCAACATCCTGCGGCTGGAGGGCGTGGTCACCAAG  2213

Query 2221  AGCCGACCCCTCATGGTGCTGACGGAGTTCATGGAGCTTGGCCCCCTGGACAGCTTCCTCAGGCAGCGGGAGGG  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2214  AGCCGACCCCTCATGGTGCTGACGGAGTTCATGGAGCTTGGCCCCCTGGACAGCTTCCTCAGGCAGCGGGAGGG  2287

Query 2295  CCAGTTCAGCAGCCTGCAGCTGGTGGCCATGCAGCGGGGAGTGGCTGCTGCCATGCAGTACCTGTCCAGCTTTG  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2288  CCAGTTCAGCAGCCTGCAGCTGGTGGCCATGCAGCGGGGAGTGGCTGCTGCCATGCAGTACCTGTCCAGCTTTG  2361

Query 2369  CCTTCGTCCATCGCTCGCTGTCTGCCCACAGCGTGCTGGTGAATAGCCACTTGGTGTGCAAGGTGGCCCGTCTT  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2362  CCTTCGTCCATCGCTCGCTGTCTGCCCACAGCGTGCTGGTGAATAGCCACTTGGTGTGCAAGGTGGCCCGTCTT  2435

Query 2443  GGCCACAGTCCTCAGGGCCCAAGTTGTTTGCTTCGCTGGGCAGCCCCAGAGGTCATTGCACATGGAAAGCATAC  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2436  GGCCACAGTCCTCAGGGCCCAAGTTGTTTGCTTCGCTGGGCAGCCCCAGAGGTCATTGCACATGGAAAGCATAC  2509

Query 2517  AACATCCAGTGATGTCTGGAGCTTTGGGATACTCATGTGGGAAGTGATGAGTTATGGAGAACGGCCTTACTGGG  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2510  AACATCCAGTGATGTCTGGAGCTTTGGGATACTCATGTGGGAAGTGATGAGTTATGGAGAACGGCCTTACTGGG  2583

Query 2591  ACATGAGTGAGCAGGAGGTACTAAATGCAATAGAGCAGGAGTTCCGGCTGCCCCCGCCTCCAGGCTGTCCTCCT  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2584  ACATGAGTGAGCAGGAGGTACTAAATGCAATAGAGCAGGAGTTCCGGCTGCCCCCGCCTCCAGGCTGTCCTCCT  2657

Query 2665  GGATTACATCTACTTATGTTGGACACTTGGCAGAAGGACCGTGCCCGGCGGCCTCATTTTGACCAGCTGGTGGC  2738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2658  GGATTACATCTACTTATGTTGGACACTTGGCAGAAGGACCGTGCCCGGCGGCCTCATTTTGACCAGCTGGTGGC  2731

Query 2739  TGCATTTGACAAGATGATCCGCAAGCCAGATACCCTGCAGGCTGGCGGGGACCCAGGGGAAAGGCCTTCCCAGG  2812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2732  TGCATTTGACAAGATGATCCGCAAGCCAGATACCCTGCAGGCTGGCGGGGACCCAGGGGAAAGGCCTTCCCAGG  2805

Query 2813  CCCTTCTGACCCCTGTGGCCCTGGACTTTCCTTGTCTGGACTCACCCCAGGCCTGGCTTTCAGCCATTGGACTG  2886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2806  CCCTTCTGACCCCTGTGGCCCTGGACTTTCCTTGTCTGGACTCACCCCAGGCCTGGCTTTCAGCCATTGGACTG  2879

Query 2887  GAGTGCTACCAGGACAACTTCTCCAAGTTTGGCCTCTGTACCTTCAGTGATGTGGCTCAGCTCAGCCTAGAAGA  2960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2880  GAGTGCTACCAGGACAACTTCTCCAAGTTTGGCCTCTGTACCTTCAGTGATGTGGCTCAGCTCAGCCTAGAAGA  2953

Query 2961  CCTGCCTGCCCTGGGCATCACCCTGGCTGGCCACCAGAAGAAGCTGCTGCACCACATCCAGCTCCTTCAGCAAC  3034
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2954  CCTGCCTGCCCTGGGCATCACCCTGGCTGGCCACCAGAAGAAGCTGCTGCACCACATCCAGCTCCTTCAGCAAC  3027

Query 3035  ACCTGAGGCAGCAGGGCTCAGTGGAGGTC---------------------------------------------  3063
            |||||||||||||||||||||||||||||                                             
Sbjct 3028  ACCTGAGGCAGCAGGGCTCAGTGGAGGTCTGAGAATGACGATACCCGTGACTCAGCCCTGGACACTGGTCCGAG  3101

Query 3064  --------------------------------------------------------------------------  3063
                                                                                      
Sbjct 3102  AAGGGACATGTGGGACGTGAGCCGGGCTCCAACAGCCTCTGTGAGAGATGCCCCACACCAAACCCAACCCTCCC  3175

Query 3064  --------------------------------------------------------------------------  3063
                                                                                      
Sbjct 3176  GATGGCTGCATTCCCTGGTCCTCCGCCTCTCCACCAGCCCCCTCCTCATTAAAGGGAAAGAAGGGAATTTGCAA  3249

Query 3064  -----------  3063
                       
Sbjct 3250  AAAAAAAAAAA  3260