Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14630
• Subject: XM_011515882.2
• Aligned Length: 3066
• Identities: 2967
• Gaps: 96

Alignment

Query    1  ATGGCTACTGAAGGGGCTGCCCAGTTAGGGAACAGAGTGGCGGGCATGGTGTGTAGCCTATGGGTGCTGCTCCT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCTACTGAAGGGGCTGCCCAGTTAGGGAACAGAGTGGCGGGCATGGTGTGTAGCCTATGGGTGCTGCTCCT  74

Query   75  GGTGTCTTCAGTTCTGGCTCTGGAAGAGGTATTGCTGGACACCACCGGAGAGACATCTGAGATTGGCTGGCTCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGTGTCTTCAGTTCTGGCTCTGGAAGAGGTATTGCTGGACACCACCGGAGAGACATCTGAGATTGGCTGGCTCA  148

Query  149  CCTACCCACCAGGGGGGTGGGACGAGGTGAGTGTTCTGGACGACCAGCGACGCCTGACTCGGACCTTTGAGGCA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCTACCCACCAGGGGGGTGGGACGAGGTGAGTGTTCTGGACGACCAGCGACGCCTGACTCGGACCTTTGAGGCA  222

Query  223  TGTCATGTGGCAGGGGCCCCTCCAGGCACCGGGCAGGACAATTGGTTGCAGACACACTTTGTGGAGCGGCGCGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TGTCATGTGGCAGGGGCCCCTCCAGGCACCGGGCAGGACAATTGGTTGCAGACACACTTTGTGGAGCGGCGCGG  296

Query  297  GGCCCAGAGGGCGCACATTCGACTCCACTTCTCTGTGCGGGCATGCTCCAGCCTGGGTGTGAGCGGCGGCACCT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGCCCAGAGGGCGCACATTCGACTCCACTTCTCTGTGCGGGCATGCTCCAGCCTGGGTGTGAGCGGCGGCACCT  370

Query  371  GCCGGGAGACCTTCACCCTTTACTACCGTCAGGCTGAGGAGCCCGACAGCCCTGACAGCGTTTCCTCCTGGCAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCCGGGAGACCTTCACCCTTTACTACCGTCAGGCTGAGGAGCCCGACAGCCCTGACAGCGTTTCCTCCTGGCAC  444

Query  445  CTCAAACGCTGGACCAAGGTGGACACAATTGCAGCAGACGAGAGCTTTC---CCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTC  515
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTCAAACGCTGGACCAAGGTGGACACAATTGCAGCAGACGAGAGCTTTCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTC  518

Query  516  CTCTTCTTCCTCTGCAGCGTGGGCTGTGGGACCCCACGGGGCTGGGCAGCGGGCTGGACTGCAACTGAACGTCA  589
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTCTTCTTCCTCTGCAGCGTGGGCTGTGGGACCCCACGGGGCTGGGCAGCGGGCTGGACTGCAACTGAACGTCA  592

Query  590  AAGAGCGGAGCTTTGGGCCTCTCACCCAACGCGGCTTCTACGTGGCCTTCCAGGACACGGGGGCCTGCCTGGCC  663
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAGAGCGGAGCTTTGGGCCTCTCACCCAACGCGGCTTCTACGTGGCCTTCCAGGACACGGGGGCCTGCCTGGCC  666

Query  664  CTGGTCGCTGTCAGGCTCTTCTCCTACACCTGCCCTGCCGTGCTCCGATCCTTTGCTTCCTTTCCAGAGACGCA  737
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTGGTCGCTGTCAGGCTCTTCTCCTACACCTGCCCTGCCGTGCTCCGATCCTTTGCTTCCTTTCCAGAGACGCA  740

Query  738  GGCCAGTGGGGCTGGGGGGGCCTCCCTGGTGGCAGCTGTGGGCACCTGTGTGGCTCATGCAGAGCCAGAGGAGG  811
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGCCAGTGGGGCTGGGGGGGCCTCCCTGGTGGCAGCTGTGGGCACCTGTGTGGCTCATGCAGAGCCAGAGGAGG  814

Query  812  ATGGAGTAGGGGGCCAGGCAGGAGGCAGCCCCCCCAGGCTGCACTGCAACGGGGAGGGCAAGTGGATGGTAGCT  885
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATGGAGTAGGGGGCCAGGCAGGAGGCAGCCCCCCCAGGCTGCACTGCAACGGGGAGGGCAAGTGGATGGTAGCT  888

Query  886  GTCGGGGGCTGCCGCTGCCAGCCTGGATACCAACCAGCACGAGGAGACAAGGCCTGCCAAGCCTGCCCACGGGG  959
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GTCGGGGGCTGCCGCTGCCAGCCTGGATACCAACCAGCACGAGGAGACAAGGCCTGCCAAGCCTGCCCACGGGG  962

Query  960  GCTCTATAAGTCTTCTGCTGGGAATGCTCCCTGCTCACCATGCCCTGCCCGCAGTCACGCTCCCAACCCAGCAG  1033
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GCTCTATAAGGCTTCTGCTGGGAATGCTCCCTGCTCACCATGCCCTGCCCGCAGTCACGCTCCCAACCCAGCAG  1036

Query 1034  CCCCCGTTTGCCCCTGCCTGGAGGGCTTCTACCGGGCCAGTTCCGACCCACCAGAGGCCCCCTGCACTGGTCCT  1107
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCCCCGTTTGCCCCTGCCTGGAGGGCTTCTACCGGGCCAGTTCCGACCCACCAGAGGCCCCCTGCACTGGTCCT  1110

Query 1108  CCATCGGCTCCCCAGGAGCTTTGGTTTGAGGTGCAAGGCTCAGCACTCATGCTACACTGGCGCCTGCCTCGGGA  1181
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CCATCGGCTCCCCAGGAGCTTTGGTTTGAGGTGCAAGGCTCAGCACTCATGCTACACTGGCGCCTGCCTCGGGA  1184

Query 1182  GCTGGGGGGTCGAGGGGACCTGCTCTTCAATGTCGTGTGCAAGGAGTGTGAAGGCCGCCAGGAACCTGCCAGCG  1255
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GCTGGGGGGTCGAGGGGACCTGCTCTTCAATGTCGTGTGCAAGGAGTGTGAAGGCCGCCAGGAACCTGCCAGCG  1258

Query 1256  GTGGTGGGGGCACTTGTCACCGCTGCAGGGATGAGGTCCACTTCGACCCTCGCCAGAGAGGCCTGACTGAGAGC  1329
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GTGGTGGGGGCACTTGTCACCGCTGCAGGGATGAGGTCCACTTCGACCCTCGCCAGAGAGGCCTGACTGAGAGC  1332

Query 1330  CGAGTGTTAGTGGGGGGACTCCGGGCACACGTACCCTACATCTTAGAGGTGCAGGCTGTTAATGGGGTGTCTGA  1403
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CGAGTGTTAGTGGGGGGACTCCGGGCACACGTACCCTACATCTTAGAGGTGCAGGCTGTTAATGGGGTGTCTGA  1406

Query 1404  GCTCAGCCCTGACCCTCCTCAGGCTGCAGCCATCAATGTCAGCACCAGCCATGAAGTGCCCTCTGCTGTCCCTG  1477
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GCTCAGCCCTGACCCTCCTCAGGCTGCAGCCATCAATGTCAGCACCAGCCATGAAGTGCCCTCTGCTGTCCCTG  1480

Query 1478  TGGTGCACCAGGTGAGCCGGGCATCCAACAGCATCACGGTGTCCTGGCCGCAGCCCGACCAGACCAATGGGAAC  1551
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TGGTGCACCAGGTGAGCCGGGCATCCAACAGCATCACGGTGTCCTGGCCGCAGCCCGACCAGACCAATGGGAAC  1554

Query 1552  ATCCTGGACTATCAGCTCCGCTACTATGACCAGGCAGAAGACGAATCCCACTCCTTCACCCTGACCAGCGAGAC  1625
            |||||||||||||||||||||||||||||                                             
Sbjct 1555  ATCCTGGACTATCAGCTCCGCTACTATGA---------------------------------------------  1583

Query 1626  CAACACTGCCACCGTGACACAGCTGAGCCCTGGCCACATCTATGGTTTCCAGGTGCGGGCCCGGACTGCTGCCG  1699
                                                            ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1584  ------------------------------------------------CCAGGTGCGGGCCCGGACTGCTGCCG  1609

Query 1700  GCCACGGCCCCTACGGGGGCAAAGTCTATTTCCAGACACTTCCTCAAGGGGAGCTGTCTTCCCAGCTTCCGGAA  1773
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1610  GCCACGGCCCCTACGGGGGCAAAGTCTATTTCCAGACACTTCCTCAAGGGGAGCTGTCTTCCCAGCTTCCAGAA  1683

Query 1774  AGACTCTCCTTGGTGATCGGCTCCATCCTGGGGGCTTTGGCCTTCCTCCTGCTGGCAGCCATCACCGTGCTGGC  1847
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1684  AGACTCTCCTTGGTGATCGGCTCCATCCTGGGGGCTTTGGCCTTCCTCCTGCTGGCAGCCATCACCGTGCTGGC  1757

Query 1848  GGTCGTCTTCCAGCGGAAGCGGCGTGGGACTGGCTACACGGAGCAGCTGCAGCAATACAGCAGCCCAGGACTCG  1921
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1758  GGTCGTCTTCCAGCGGAAGCGGCGTGGGACTGGCTACACAGAGCAGCTGCAGCAATACAGCAGCCCAGGACTCG  1831

Query 1922  GGGTGAAGTATTACATCGACCCCTCCACCTACGAGGACCCCTGTCAGGCCATCCGAGAACTTGCCCGGGAAGTC  1995
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1832  GGGTGAAGTATTACATCGACCCCTCCACCTACGAGGACCCCTGTCAGGCCATCCGAGAACTTGCCCGGGAAGTC  1905

Query 1996  GATCCTGCTTATATCAAGATTGAGGAGGTCATTGGGACAGGCTCTTTTGGAGAAGTGCGCCAGGGCCGCCTGCA  2069
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1906  GATCCTGCTTATATCAAGATTGAGGAGGTCATTGGGACAGGCTCTTTTGGAGAAGTGCGCCAGGGCCGCCTGCA  1979

Query 2070  GCCACGGGGACGGAGGGAGCAGACTGTGGCCATCCAGGCCCTGTGGGCCGGGGGCGCCGAAAGCCTGCAGATGA  2143
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1980  GCCACGGGGACGGAGGGAGCAGACTGTGGCCATCCAGGCCCTGTGGGCCGGGGGCGCCGAAAGCCTGCAGATGA  2053

Query 2144  CCTTCCTGGGCCGGGCCGCAGTGCTGGGTCAGTTCCAGCACCCCAACATCCTGCGGCTGGAGGGCGTGGTCACC  2217
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2054  CCTTCCTGGGCCGGGCCGCAGTGCTGGGTCAGTTCCAGCACCCCAACATCCTGCGGCTGGAGGGCGTGGTCACC  2127

Query 2218  AAGAGCCGACCCCTCATGGTGCTGACGGAGTTCATGGAGCTTGGCCCCCTGGACAGCTTCCTCAGGCAGCGGGA  2291
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2128  AAGAGCCGACCCCTCATGGTGCTGACGGAGTTCATGGAGCTTGGCCCCCTGGACAGCTTCCTCAGGCAGCGGGA  2201

Query 2292  GGGCCAGTTCAGCAGCCTGCAGCTGGTGGCCATGCAGCGGGGAGTGGCTGCTGCCATGCAGTACCTGTCCAGCT  2365
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2202  GGGCCAGTTCAGCAGCCTGCAGCTGGTGGCCATGCAGCGGGGAGTGGCTGCTGCCATGCAGTACCTGTCCAGCT  2275

Query 2366  TTGCCTTCGTCCATCGCTCGCTGTCTGCCCACAGCGTGCTGGTGAATAGCCACTTGGTGTGCAAGGTGGCCCGT  2439
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2276  TTGCCTTCGTCCATCGCTCGCTGTCTGCCCACAGCGTGCTGGTGAATAGCCACTTGGTGTGCAAGGTGGCCCGT  2349

Query 2440  CTTGGCCACAGTCCTCAGGGCCCAAGTTGTTTGCTTCGCTGGGCAGCCCCAGAGGTCATTGCACATGGAAAGCA  2513
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2350  CTTGGCCACAGTCCTCAGGGCCCAAGTTGTTTGCTTCGCTGGGCAGCCCCAGAGGTCATTGCACATGGAAAGCA  2423

Query 2514  TACAACATCCAGTGATGTCTGGAGCTTTGGGATACTCATGTGGGAAGTGATGAGTTATGGAGAACGGCCTTACT  2587
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2424  TACAACATCCAGTGATGTCTGGAGCTTTGGGATACTCATGTGGGAAGTGATGAGTTATGGAGAACGGCCTTACT  2497

Query 2588  GGGACATGAGTGAGCAGGAGGTACTAAATGCAATAGAGCAGGAGTTCCGGCTGCCCCCGCCTCCAGGCTGTCCT  2661
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2498  GGGACATGAGTGAGCAGGAGGTACTAAATGCAATAGAGCAGGAGTTCCGGCTGCCCCCGCCTCCAGGCTGTCCT  2571

Query 2662  CCTGGATTACATCTACTTATGTTGGACACTTGGCAGAAGGACCGTGCCCGGCGGCCTCATTTTGACCAGCTGGT  2735
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2572  CCTGGATTACATCTACTTATGTTGGACACTTGGCAGAAGGACCGTGCCCGGCGGCCTCATTTTGACCAGCTGGT  2645

Query 2736  GGCTGCATTTGACAAGATGATCCGCAAGCCAGATACCCTGCAGGCTGGCGGGGACCCAGGGGAAAGGCCTTCCC  2809
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2646  GGCTGCATTTGACAAGATGATCCGCAAGCCAGATACCCTGCAGGCTGGCGGGGACCCAGGGGAAAGGCCTTCCC  2719

Query 2810  AGGCCCTTCTGACCCCTGTGGCCCTGGACTTTCCTTGTCTGGACTCACCCCAGGCCTGGCTTTCAGCCATTGGA  2883
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2720  AGGCCCTTCTGACCCCTGTGGCCCTGGACTTTCCTTGTCTGGACTCACCCCAGGCCTGGCTTTCAGCCATTGGA  2793

Query 2884  CTGGAGTGCTACCAGGACAACTTCTCCAAGTTTGGCCTCTGTACCTTCAGTGATGTGGCTCAGCTCAGCCTAGA  2957
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2794  CTGGAGTGCTACCAGGACAACTTCTCCAAGTTTGGCCTCTGTACCTTCAGTGATGTGGCTCAGCTCAGCCTAGA  2867

Query 2958  AGACCTGCCTGCCCTGGGCATCACCCTGGCTGGCCACCAGAAGAAGCTGCTGCACCACATCCAGCTCCTTCAGC  3031
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2868  AGACCTGCCTGCCCTGGGCATCACCCTGGCTGGCCACCAGAAGAAGCTGCTGCACCACATCCAGCTCCTTCAGC  2941

Query 3032  AACACCTGAGGCAGCAGGGCTCAGTGGAGGTC  3063
            ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2942  AACACCTGAGGCAGCAGGGCTCAGTGGAGGTC  2973