Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14638
- Subject:
- XM_006509013.1
- Aligned Length:
- 2461
- Identities:
- 2212
- Gaps:
- 2
Alignment
Query 1 ATGTGGAGCTGGAAGTGCCTCCTCTTCTGGGCTGTGCTGGTCACAGCCACACTCTGCACCGCTAGGCCGTCCCC 74
||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||..||||
Sbjct 1 ATGTGGGGCTGGAAGTGCCTCCTCTTCTGGGCTGTGCTGGTCACAGCCACTCTCTGCACTGCCAGGCCAGCCCC 74
Query 75 GACCTTGCCTGAACAAGCCCAGCCCTGGGGAGCCCCTGTGGAAGTGGAGTCCTTCCTGGTCCACCCCGGTGACC 148
.|||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||||||..|||||||||||||.||.||||
Sbjct 75 AACCTTGCCTGAACAAGCTCAGCCCTGGGGAGTCCCTGTGGAAGTGGAGTCTCTCCTGGTCCACCCTGGCGACC 148
Query 149 TGCTGCAGCTTCGCTGTCGGCTGCGGGACGATGTGCAGAGCATCAACTGGCTGCGGGACGGGGTGCAGCTGGCG 222
||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|
Sbjct 149 TGCTACAGCTTCGCTGTCGGCTTCGCGATGATGTGCAGAGCATCAACTGGCTGCGGGATGGGGTGCAGCTGGTG 222
Query 223 GAAAGCAACCGCACCCGCATCACAGGGGAGGAGGTGGAGGTGCAGGACTCCGTGCCCGCAGACTCCGGCCTCTA 296
||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|.|||||.|||||.||||||||
Sbjct 223 GAGAGCAACCGTACCCGCATCACAGGGGAGGAGGTGGAGGTGCGGGACTCCATCCCCGCTGACTCTGGCCTCTA 296
Query 297 TGCTTGCGTAACCAGCAGCCCCTCGGGCAGTGACACCACCTACTTCTCCGTCAATGTTTCAGATGCTCTCCCCT 370
.||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|
Sbjct 297 CGCTTGCGTGACCAGCAGCCCCTCTGGCAGCGATACCACCTACTTCTCCGTCAATGTCTCAGATGCACTCCCAT 370
Query 371 CCTCGGAGGATGATGATGATGATGATGACTCCTCTTCAGAGGAGAAAGAAACAGATAACACCAAACCAAACCCC 444
|||||||.||||||||.||.||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.
Sbjct 371 CCTCGGAAGATGATGACGACGACGATGACTCCTCCTCGGAGGAGAAAGAGACGGACAACACCAAACCAAACCCT 444
Query 445 GTAGCTCCATATTGGACATCCCCAGAAAAGATGGAAAAGAAATTGCATGCAGTGCCGGCTGCCAAGACAGTGAA 518
||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||.||||||.|||||||.|||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 445 GTAGCTCCCTACTGGACATCCCCAGAGAAAATGGAGAAGAAACTGCATGCGGTGCCCGCTGCCAAGACGGTGAA 518
Query 519 GTTCAAATGCCCTTCCAGTGGGACCCCAAACCCCACACTGCGCTGGTTGAAAAATGGCAAAGAATTCAAACCTG 592
||||||.|||||.||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||
Sbjct 519 GTTCAAGTGCCCGTCGAGTGGGACACCCAACCCCACTCTGCGCTGGTTGAAAAATGGCAAAGAGTTTAAGCCTG 592
Query 593 ACCACAGAATTGGAGGCTACAAGGTCCGTTATGCCACCTGGAGCATCATAATGGACTCTGTGGTGCCCTCTGAC 666
|||||.|||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 593 ACCACCGAATTGGAGGCTACAAGGTTCGCTATGCCACCTGGAGCATCATAATGGATTCTGTGGTGCCTTCTGAC 666
Query 667 AAGGGCAACTACACCTGCATTGTGGAGAATGAGTACGGCAGCATCAACCACACATACCAGCTGGATGTCGTGGA 740
||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||
Sbjct 667 AAGGGCAACTACACCTGCATCGTGGAGAATGAGTATGGGAGCATCAACCACACCTACCAGCTTGACGTCGTGGA 740
Query 741 GCGGTCCCCTCACCGGCCCATCCTGCAAGCAGGGTTGCCCGCCAACAAAACAGTGGCCCTGGGTAGCAACGTGG 814
.||.||.||.|||||.||||||||.||.||||||.||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct 741 ACGATCTCCGCACCGACCCATCCTTCAGGCAGGGCTGCCTGCCAACAAGACAGTGGCCCTGGGCAGCAATGTGG 814
Query 815 AGTTCATGTGTAAGGTGTACAGTGACCCGCAGCCGCACATCCAGTGGCTAAAGCACATCGAGGTGAATGGGAGC 888
||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 815 AGTTCATGTGTAAGGTGTACAGCGATCCGCAGCCTCACATTCAGTGGCTGAAGCACATCGAGGTGAACGGGAGT 888
Query 889 AAGATTGGCCCAGACAACCTGCCTTATGTCCAGATCTTGAAGACTGCTGGAGTTAATACCACCGACAAAGAGAT 962
|||||.||.|||||||||.||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 889 AAGATCGGGCCAGACAACTTGCCGTATGTCCAGATCCTGAAGACTGCTGGAGTTAATACCACCGACAAGGAAAT 962
Query 963 GGAGGTGCTTCACTTAAGAAATGTCTCCTTTGAGGACGCAGGGGAGTATACGTGCTTGGCGGGTAACTCTATCG 1036
||||||||||||..||.|.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GGAGGTGCTTCATCTACGGAATGTCTCCTTTGAGGATGCGGGGGAGTATACGTGCTTGGCGGGTAACTCTATCG 1036
Query 1037 GACTCTCCCATCACTCTGCATGGTTGACCGTTCTGGAAGCCCTGGAAGAGAGGCCGGCAGTGATGACCTCGCCC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||.
Sbjct 1037 GACTCTCCCATCACTCTGCATGGTTGACCGTTCTGGAAGCCCTGGAAGAGAGACCAGCTGTGATGACCTCACCG 1110
Query 1111 CTGTACCTGGAGATCATCATCTATTGCACAGGGGCCTTCCTCATCTCCTGCATGGTGGGGTCGGTCATCGTCTA 1184
||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||.||||.||.||||||.||||
Sbjct 1111 CTCTACCTGGAGATCATTATCTACTGCACCGGGGCCTTCCTGATCTCCTGCATGTTGGGCTCTGTCATCATCTA 1184
Query 1185 CAAGATGAAGAGTGGTACCAAGAAGAGTGACTTCCACAGCCAGATGGCTGTGCACAAGCTGGCCAAGAGCATCC 1258
.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TAAGATGAAGAGCGGCACCAAGAAGAGCGACTTCCATAGCCAGATGGCTGTGCACAAGCTGGCCAAGAGCATCC 1258
Query 1259 CTCTGCGCAGACAGGTAACAGTGTCTGCTGACTCCAGTGCATCCATGAACTCTGGGGTTCTTCTGGTTCGGCCA 1332
|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 1259 CTCTGCGCAGACAGGTAACAGTGTCAGCTGACTCCAGTGCATCCATGAACTCTGGGGTTCTCCTGGTTCGGCCC 1332
Query 1333 TCACGGCTCTCCTCCAGTGGGACTCCCATGCTAGCAGGGGTCTCTGAGTATGAGCTTCCCGAAGACCCTCGCTG 1406
|||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||.|||||.||.||||||||.||.||.||.||.|||||
Sbjct 1333 TCACGGCTCTCCTCCAGCGGGACCCCCATGCTGGCTGGAGTCTCCGAATATGAGCTCCCTGAGGATCCCCGCTG 1406
Query 1407 GGAGCTGCCTCGGGACAGACTGGTCTTAGGCAAACCCCTGGGAGAGGGCTGCTTTGGGCAGGTGGTGTTGGCAG 1480
|||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 1407 GGAGCTGCCACGAGACAGACTGGTCTTAGGCAAACCACTTGGCGAGGGCTGCTTCGGGCAGGTGGTGTTGGCTG 1480
Query 1481 AGGCTATCGGGCTGGACAAGGACAAACCCAACCGTGTGACCAAAGTGGCTGTGAAGATGTTGAAGTCGGACGCA 1554
||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1481 AGGCCATCGGGCTGGATAAGGACAAACCCAACCGTGTGACCAAAGTGGCCGTGAAGATGTTGAAGTCCGACGCA 1554
Query 1555 ACAGAGAAAGACTTGTCAGACCTGATCTCAGAAATGGAGATGATGAAGATGATCGGGAAGCATAAGAATATCAT 1628
||.|||||.|||.||||.||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 1555 ACGGAGAAGGACCTGTCGGATCTGATCTCGGAGATGGAGATGATGAAAATGATTGGGAAGCACAAGAATATCAT 1628
Query 1629 CAACCTGCTGGGGGCCTGCACGCAGGATGGTCC-CTTGTATGTCATCGTGGAGTATGCCTCCAAGGGCAACCTG 1701
||||||.|||||.||.|||||.||||||||||| ||| ||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||.
Sbjct 1629 CAACCTTCTGGGAGCGTGCACACAGGATGGTCCTCTT-TATGTCATTGTGGAGTACGCCTCCAAAGGCAATCTC 1701
Query 1702 CGGGAGTACCTGCAGGCCCGGAGGCCCCCAGGGCTGGAATACTGCTACAACCCCAGCCACAACCCAGAGGAGCA 1775
||||||||.||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 1702 CGGGAGTATCTACAGGCCCGGAGGCCTCCTGGGCTGGAGTACTGCTATAACCCCAGCCACAACCCCGAGGAACA 1775
Query 1776 GCTCTCCTCCAAGGACCTGGTGTCCTGCGCCTACCAGGTGGCCCGAGGCATGGAGTATCTGGCCTCCAAGAAGT 1849
|||.||.|||||.||.|||||.|||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 1776 GCTGTCTTCCAAAGATCTGGTATCCTGTGCCTATCAGGTGGCTCGGGGCATGGAGTATCTTGCCTCTAAGAAGT 1849
Query 1850 GCATACACCGAGACCTGGCAGCCAGGAATGTCCTGGTGACAGAGGACAATGTGATGAAGATAGCAGACTTTGGC 1923
|.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 1850 GTATACACCGAGACCTGGCTGCTAGGAACGTCCTGGTGACCGAGGATAACGTAATGAAGATCGCAGACTTTGGC 1923
Query 1924 CTCGCACGGGACATTCACCACATCGACTACTATAAAAAGACAACCAACGGCCGACTGCCTGTGAAGTGGATGGC 1997
.|.||.||.||||||||.||.|||||||||||.||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1924 TTAGCTCGAGACATTCATCATATCGACTACTACAAGAAAACCACCAACGGCCGGCTGCCTGTGAAGTGGATGGC 1997
Query 1998 ACCCGAGGCATTATTTGACCGGATCTACACCCACCAGAGTGATGTGTGGTCTTTCGGGGTGCTCCTGTGGGAGA 2071
.||.|||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||||||.|||||||||
Sbjct 1998 CCCTGAGGCGTTGTTTGACCGGATCTACACACACCAGAGCGATGTGTGGTCTTTTGGAGTGCTCTTGTGGGAGA 2071
Query 2072 TCTTCACTCTGGGCGGCTCCCCATACCCCGGTGTGCCTGTGGAGGAACTTTTCAAGCTGCTGAAGGAGGGTCAC 2145
|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 2072 TCTTCACTCTGGGTGGCTCCCCATACCCCGGTGTGCCTGTGGAGGAACTTTTCAAGCTGCTGAAGGAGGGTCAT 2145
Query 2146 CGCATGGACAAGCCCAGTAACTGCACCAACGAGCTGTACATGATGATGCGGGACTGCTGGCATGCAGTGCCCTC 2219
||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2146 CGAATGGACAAGCCCAGTAACTGTACCAATGAGCTGTACATGATGATGCGGGACTGCTGGCATGCAGTGCCCTC 2219
Query 2220 ACAGAGACCCACCTTCAAGCAGCTGGTGGAAGACCTGGACCGCATCGTGGCCTTGACCTCCAACCAGGAGTACC 2293
.||||||||.||.|||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 2220 TCAGAGACCTACGTTCAAGCAGTTGGTGGAAGACCTGGACCGCATTGTGGCCTTGACCTCCAACCAGGAGTATC 2293
Query 2294 TGGACCTGTCCATGCCCCTGGACCAGTACTCCCCCAGCTTTCCCGACACCCGGAGCTCTACGTGCTCCTCAGGG 2367
|||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 2294 TGGACCTGTCCATACCGCTGGACCAGTACTCACCCAGCTTTCCCGACACACGGAGCTCCACCTGCTCCTCAGGG 2367
Query 2368 GAGGATTCCGTCTTCTCTCATGAGCCGCTGCCCGAGGAGCCCTGCCTGCCCCGACACCCAGCCCAGCTTGCCAA 2441
|||||.||.||||||||||||||||||.|.||.|||||||||||.|||||.||||||||..|||||||||||||
Sbjct 2368 GAGGACTCTGTCTTCTCTCATGAGCCGTTACCTGAGGAGCCCTGTCTGCCTCGACACCCCACCCAGCTTGCCAA 2441
Query 2442 TGGCGGACTCAAACGCCGC 2460
..|.|||||||||||.|||
Sbjct 2442 CAGTGGACTCAAACGGCGC 2460