Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14638
• Subject: XM_011242120.1
• Aligned Length: 2467
• Identities: 2206
• Gaps: 14

Alignment

Query    1  ATGTGGAGCTGGAAGTGCCTCCTCTTCTGGGCTGTGCTGGTCACAGCCACACTCTGCACCGCTAGGCCGTCCCC  74
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||..||||
Sbjct    1  ATGTGGGGCTGGAAGTGCCTCCTCTTCTGGGCTGTGCTGGTCACAGCCACTCTCTGCACTGCCAGGCCAGCCCC  74

Query   75  GACCTTGCCTGAACAAGCCCAGCCCTGGGGAGCCCCTGTGGAAGTGGAGTCCTTCCTGGTCCACCCCGGTGACC  148
            .|||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||||||..|||||||||||||.||.||||
Sbjct   75  AACCTTGCCTGAACAAGCTCAGCCCTGGGGAGTCCCTGTGGAAGTGGAGTCTCTCCTGGTCCACCCTGGCGACC  148

Query  149  TGCTGCAGCTTCGCTGTCGGCTGCGGGACGATGTGCAGAGCATCAACTGGCTGCGGGACGGGGTGCAGCTGGCG  222
            ||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|
Sbjct  149  TGCTACAGCTTCGCTGTCGGCTTCGCGATGATGTGCAGAGCATCAACTGGCTGCGGGATGGGGTGCAGCTGGTG  222

Query  223  GAAAGCAACCGCACCCGCATCACAGGGGAGGAGGTGGAGGTGCAGGACTCCGTGCCCGCAGACTCCGGCCTCTA  296
            ||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|.|||||.|||||.||||||||
Sbjct  223  GAGAGCAACCGTACCCGCATCACAGGGGAGGAGGTGGAGGTGCGGGACTCCATCCCCGCTGACTCTGGCCTCTA  296

Query  297  TGCTTGCGTAACCAGCAGCCCCTCGGGCAGTGACACCACCTACTTCTCCGTCAATGTTTCAGATGCTCTCCCCT  370
            .||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|
Sbjct  297  CGCTTGCGTGACCAGCAGCCCCTCTGGCAGCGATACCACCTACTTCTCCGTCAATGTCTCAGATGCACTCCCAT  370

Query  371  CCTCGGAGGATGATGATGATGATGATGACTCCTCTTCAGAGGAGAAAGAAACAGATAACACCAAACCAAAC---  441
            |||||||.||||||||.||.||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||   
Sbjct  371  CCTCGGAAGATGATGACGACGACGATGACTCCTCCTCGGAGGAGAAAGAGACGGACAACACCAAACCAAACCGT  444

Query  442  ---CCCGTAGCTCCATATTGGACATCCCCAGAAAAGATGGAAAAGAAATTGCATGCAGTGCCGGCTGCCAAGAC  512
               ||.||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||.||||||.|||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct  445  AGGCCTGTAGCTCCCTACTGGACATCCCCAGAGAAAATGGAGAAGAAACTGCATGCGGTGCCCGCTGCCAAGAC  518

Query  513  AGTGAAGTTCAAATGCCCTTCCAGTGGGACCCCAAACCCCACACTGCGCTGGTTGAAAAATGGCAAAGAATTCA  586
            .|||||||||||.|||||.||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct  519  GGTGAAGTTCAAGTGCCCGTCGAGTGGGACACCCAACCCCACTCTGCGCTGGTTGAAAAATGGCAAAGAGTTTA  592

Query  587  AACCTGACCACAGAATTGGAGGCTACAAGGTCCGTTATGCCACCTGGAGCATCATAATGGACTCTGTGGTGCCC  660
            |.|||||||||.|||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct  593  AGCCTGACCACCGAATTGGAGGCTACAAGGTTCGCTATGCCACCTGGAGCATCATAATGGATTCTGTGGTGCCT  666

Query  661  TCTGACAAGGGCAACTACACCTGCATTGTGGAGAATGAGTACGGCAGCATCAACCACACATACCAGCTGGATGT  734
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||.||
Sbjct  667  TCTGACAAGGGCAACTACACCTGCATCGTGGAGAATGAGTATGGGAGCATCAACCACACCTACCAGCTTGACGT  740

Query  735  CGTGGAGCGGTCCCCTCACCGGCCCATCCTGCAAGCAGGGTTGCCCGCCAACAAAACAGTGGCCCTGGGTAGCA  808
            ||||||.||.||.||.|||||.||||||||.||.||||||.||||.||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct  741  CGTGGAACGATCTCCGCACCGACCCATCCTTCAGGCAGGGCTGCCTGCCAACAAGACAGTGGCCCTGGGCAGCA  814

Query  809  ACGTGGAGTTCATGTGTAAGGTGTACAGTGACCCGCAGCCGCACATCCAGTGGCTAAAGCACATCGAGGTGAAT  882
            |.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct  815  ATGTGGAGTTCATGTGTAAGGTGTACAGCGATCCGCAGCCTCACATTCAGTGGCTGAAGCACATCGAGGTGAAC  888

Query  883  GGGAGCAAGATTGGCCCAGACAACCTGCCTTATGTCCAGATCTTGAAGACTGCTGGAGTTAATACCACCGACAA  956
            |||||.|||||.||.|||||||||.||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGGAGTAAGATCGGGCCAGACAACTTGCCGTATGTCCAGATCCTGAAGACTGCTGGAGTTAATACCACCGACAA  962

Query  957  AGAGATGGAGGTGCTTCACTTAAGAAATGTCTCCTTTGAGGACGCAGGGGAGTATACGTGCTTGGCGGGTAACT  1030
            .||.||||||||||||||..||.|.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGAAATGGAGGTGCTTCATCTACGGAATGTCTCCTTTGAGGATGCGGGGGAGTATACGTGCTTGGCGGGTAACT  1036

Query 1031  CTATCGGACTCTCCCATCACTCTGCATGGTTGACCGTTCTGGAAGCCCTGGAAGAGAGGCCGGCAGTGATGACC  1104
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||
Sbjct 1037  CTATCGGACTCTCCCATCACTCTGCATGGTTGACCGTTCTGGAAGCCCTGGAAGAGAGACCAGCTGTGATGACC  1110

Query 1105  TCGCCCCTGTACCTGGAGATCATCATCTATTGCACAGGGGCCTTCCTCATCTCCTGCATGGTGGGGTCGGTCAT  1178
            ||.||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||.||||.||.|||||
Sbjct 1111  TCACCGCTCTACCTGGAGATCATTATCTACTGCACCGGGGCCTTCCTGATCTCCTGCATGTTGGGCTCTGTCAT  1184

Query 1179  CGTCTACAAGATGAAGAGTGGTACCAAGAAGAGTGACTTCCACAGCCAGATGGCTGTGCACAAGCTGGCCAAGA  1252
            |.||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CATCTATAAGATGAAGAGCGGCACCAAGAAGAGCGACTTCCATAGCCAGATGGCTGTGCACAAGCTGGCCAAGA  1258

Query 1253  GCATCCCTCTGCGCAGACAGGTAACAGTGTCTGCTGACTCCAGTGCATCCATGAACTCTGGGGTTCTTCTGGTT  1326
            ||||||||||||||||||||      |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1259  GCATCCCTCTGCGCAGACAG------GTGTCAGCTGACTCCAGTGCATCCATGAACTCTGGGGTTCTCCTGGTT  1326

Query 1327  CGGCCATCACGGCTCTCCTCCAGTGGGACTCCCATGCTAGCAGGGGTCTCTGAGTATGAGCTTCCCGAAGACCC  1400
            |||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||.|||||.||.||||||||.||.||.||.||
Sbjct 1327  CGGCCCTCACGGCTCTCCTCCAGCGGGACCCCCATGCTGGCTGGAGTCTCCGAATATGAGCTCCCTGAGGATCC  1400

Query 1401  TCGCTGGGAGCTGCCTCGGGACAGACTGGTCTTAGGCAAACCCCTGGGAGAGGGCTGCTTTGGGCAGGTGGTGT  1474
            .||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1401  CCGCTGGGAGCTGCCACGAGACAGACTGGTCTTAGGCAAACCACTTGGCGAGGGCTGCTTCGGGCAGGTGGTGT  1474

Query 1475  TGGCAGAGGCTATCGGGCTGGACAAGGACAAACCCAACCGTGTGACCAAAGTGGCTGTGAAGATGTTGAAGTCG  1548
            ||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 1475  TGGCTGAGGCCATCGGGCTGGATAAGGACAAACCCAACCGTGTGACCAAAGTGGCCGTGAAGATGTTGAAGTCC  1548

Query 1549  GACGCAACAGAGAAAGACTTGTCAGACCTGATCTCAGAAATGGAGATGATGAAGATGATCGGGAAGCATAAGAA  1622
            ||||||||.|||||.|||.||||.||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||
Sbjct 1549  GACGCAACGGAGAAGGACCTGTCGGATCTGATCTCGGAGATGGAGATGATGAAAATGATTGGGAAGCACAAGAA  1622

Query 1623  TATCATCAACCTGCTGGGGGCCTGCACGCAGGATGGTCC-CTTGTATGTCATCGTGGAGTATGCCTCCAAGGGC  1695
            ||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||||| ||| ||||||||.||||||||.||||||||.|||
Sbjct 1623  TATCATCAACCTTCTGGGAGCGTGCACACAGGATGGTCCTCTT-TATGTCATTGTGGAGTACGCCTCCAAAGGC  1695

Query 1696  AACCTGCGGGAGTACCTGCAGGCCCGGAGGCCCCCAGGGCTGGAATACTGCTACAACCCCAGCCACAACCCAGA  1769
            ||.||.||||||||.||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 1696  AATCTCCGGGAGTATCTACAGGCCCGGAGGCCTCCTGGGCTGGAGTACTGCTATAACCCCAGCCACAACCCCGA  1769

Query 1770  GGAGCAGCTCTCCTCCAAGGACCTGGTGTCCTGCGCCTACCAGGTGGCCCGAGGCATGGAGTATCTGGCCTCCA  1843
            |||.|||||.||.|||||.||.|||||.|||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 1770  GGAACAGCTGTCTTCCAAAGATCTGGTATCCTGTGCCTATCAGGTGGCTCGGGGCATGGAGTATCTTGCCTCTA  1843

Query 1844  AGAAGTGCATACACCGAGACCTGGCAGCCAGGAATGTCCTGGTGACAGAGGACAATGTGATGAAGATAGCAGAC  1917
            |||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||.||||||||.||||||
Sbjct 1844  AGAAGTGTATACACCGAGACCTGGCTGCTAGGAACGTCCTGGTGACCGAGGATAACGTAATGAAGATCGCAGAC  1917

Query 1918  TTTGGCCTCGCACGGGACATTCACCACATCGACTACTATAAAAAGACAACCAACGGCCGACTGCCTGTGAAGTG  1991
            ||||||.|.||.||.||||||||.||.|||||||||||.||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1918  TTTGGCTTAGCTCGAGACATTCATCATATCGACTACTACAAGAAAACCACCAACGGCCGGCTGCCTGTGAAGTG  1991

Query 1992  GATGGCACCCGAGGCATTATTTGACCGGATCTACACCCACCAGAGTGATGTGTGGTCTTTCGGGGTGCTCCTGT  2065
            ||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||||||.|||
Sbjct 1992  GATGGCCCCTGAGGCGTTGTTTGACCGGATCTACACACACCAGAGCGATGTGTGGTCTTTTGGAGTGCTCTTGT  2065

Query 2066  GGGAGATCTTCACTCTGGGCGGCTCCCCATACCCCGGTGTGCCTGTGGAGGAACTTTTCAAGCTGCTGAAGGAG  2139
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2066  GGGAGATCTTCACTCTGGGTGGCTCCCCATACCCCGGTGTGCCTGTGGAGGAACTTTTCAAGCTGCTGAAGGAG  2139

Query 2140  GGTCACCGCATGGACAAGCCCAGTAACTGCACCAACGAGCTGTACATGATGATGCGGGACTGCTGGCATGCAGT  2213
            |||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2140  GGTCATCGAATGGACAAGCCCAGTAACTGTACCAATGAGCTGTACATGATGATGCGGGACTGCTGGCATGCAGT  2213

Query 2214  GCCCTCACAGAGACCCACCTTCAAGCAGCTGGTGGAAGACCTGGACCGCATCGTGGCCTTGACCTCCAACCAGG  2287
            ||||||.||||||||.||.|||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 2214  GCCCTCTCAGAGACCTACGTTCAAGCAGTTGGTGGAAGACCTGGACCGCATTGTGGCCTTGACCTCCAACCAGG  2287

Query 2288  AGTACCTGGACCTGTCCATGCCCCTGGACCAGTACTCCCCCAGCTTTCCCGACACCCGGAGCTCTACGTGCTCC  2361
            ||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||||||
Sbjct 2288  AGTATCTGGACCTGTCCATACCGCTGGACCAGTACTCACCCAGCTTTCCCGACACACGGAGCTCCACCTGCTCC  2361

Query 2362  TCAGGGGAGGATTCCGTCTTCTCTCATGAGCCGCTGCCCGAGGAGCCCTGCCTGCCCCGACACCCAGCCCAGCT  2435
            |||||||||||.||.||||||||||||||||||.|.||.|||||||||||.|||||.||||||||..|||||||
Sbjct 2362  TCAGGGGAGGACTCTGTCTTCTCTCATGAGCCGTTACCTGAGGAGCCCTGTCTGCCTCGACACCCCACCCAGCT  2435

Query 2436  TGCCAATGGCGGACTCAAACGCCGC  2460
            ||||||..|.|||||||||||.|||
Sbjct 2436  TGCCAACAGTGGACTCAAACGGCGC  2460