Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14647
- Subject:
- XM_011535656.2
- Aligned Length:
- 1516
- Identities:
- 1175
- Gaps:
- 341
Alignment
Query 1 ATGAGCAACATCTGTCAGAGGCTCTGGGAGTACCTAGAACCCTATCTCCCCTGTTTGTCCACGGAGGCAGACAA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GTCAACCGTGATTGAAAATCCAGGGGCCCTTTGCTCTCCCCAGTCACAGAGGCATGGCCACTACTTTGTGGCTT 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 TGTTTGATTACCAGGCTCGGACTGCTGAGGACTTGAGCTTCCGAGCAGGTGACAAACTTCAAGTTCTGGACACT 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 TTGCATGAGGGCTGGTGGTTTGCCAGACACTTGGAGAAAAGACGAGATGGCTCCAGTCAGCAACTACAAGGCTA 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 TATTCCTTCTAACTACGTGGCTGAGGACAGAAGCCTACAGGCA-GAGCCGTGGTTCTTTGGAGCAATCGGAAGA 369
| ||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ------------------------------------------ATGAG--GTGGTTCTTTGGAGCAATCGGAAGA 30
Query 370 TCAGATGCAGAGAAACAACTATTATATTCAGAAAACAAGACCGGTTCCTTTCTAATCAGAGAAAGTGAAAGCCA 443
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 31 TCAGATGCAGAGAAACAACTATTATATTCAGAAAACAAGACCGGTTCCTTTCTAATCAGAGAAAGTGAAAGCCA 104
Query 444 AAAAGGAGAATTCTCTCTTTCAGTTTTAGATGGAGCAGTTGTAAAACACTACAGAATTAAAAGACTGGATGAAG 517
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 105 AAAAGGAGAATTCTCTCTTTCAGTTTTAGATGGAGCAGTTGTAAAACACTACAGAATTAAAAGACTGGATGAAG 178
Query 518 GGGGATTTTTTCTCACGCGAAGAAGAATCTTTTCAACACTGAACGAATTTGTGAGCCACTACACCAAGACAAGT 591
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 179 GGGGATTTTTTCTCACGCGAAGAAGAATCTTTTCAACACTGAACGAATTTGTGAGCCACTACACCAAGACAAGT 252
Query 592 GACGGCCTGTGTGTCAAGCTGGGGAAACCATGCTTAAAGATCCAGGTCCCAGCTCCATTTGATTTGTCGTATAA 665
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 253 GACGGCCTGTGTGTCAAGCTGGGGAAACCATGCTTAAAGATCCAGGTCCCAGCTCCATTTGATTTGTCGTATAA 326
Query 666 AACCGTGGACCAATGGGAGATAGACCGCAACTCCATACAGCTTCTGAAGCGATTGGGATCTGGTCAGTTTGGCG 739
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 327 AACCGTGGACCAATGGGAGATAGACCGCAACTCCATACAGCTTCTGAAGCGATTGGGATCTGGTCAGTTTGGCG 400
Query 740 AAGTATGGGAAGGTCTGTGGAACAATACCACTCCAGTAGCAGTGAAAACATTAAAACCAGGTTCAATGGATCCA 813
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 401 AAGTATGGGAAGGTCTGTGGAACAATACCACTCCAGTAGCAGTGAAAACATTAAAACCAGGTTCAATGGATCCA 474
Query 814 AATGACTTCCTGAGGGAGGCACAGATAATGAAGAACCTAAGACATCCAAAGCTTATCCAGCTTTATGCTGTTTG 887
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 475 AATGACTTCCTGAGGGAGGCACAGATAATGAAGAACCTAAGACATCCAAAGCTTATCCAGCTTTATGCTGTTTG 548
Query 888 CACTTTAGAAGATCCAATTTATATTATTACAGAGTTGATGAGACATGGAAGTCTGCAAGAATATCTCCAAAATG 961
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 549 CACTTTAGAAGATCCAATTTATATTATTACAGAGTTGATGAGACATGGAAGTCTGCAAGAATATCTCCAAAATG 622
Query 962 ACACTGGATCAAAAATCCATCTGACTCAACAGGTAGACATGGCGGCACAGGTTGCCTCTGGAATGGCCTATCTG 1035
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 623 ACACTGGATCAAAAATCCATCTGACTCAACAGGTAGACATGGCGGCACAGGTTGCCTCTGGAATGGCCTATCTG 696
Query 1036 GAGTCTCGGAACTACATTCACAGAGATCTGGCTGCCAGAAATGTCCTCGTTGGTGAACATAATATCTACAAAGT 1109
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 697 GAGTCTCGGAACTACATTCACAGAGATCTGGCTGCCAGAAATGTCCTCGTTGGTGAACATAATATCTACAAAGT 770
Query 1110 AGCAGATTTTGGACTTGCCAGAGTTTTTAAGGTAGATAATGAAGACATCTATGAATCTAGACACGAAATAAAGC 1183
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 771 AGCAGATTTTGGACTTGCCAGAGTTTTTAAGGTAGATAATGAAGACATCTATGAATCTAGACACGAAATAAAGC 844
Query 1184 TGCCGGTGAAGTGGACTGCGCCCGAAGCCATTCGTAGTAATAAATTCAGCATTAAGTCCGATGTATGGTCATTT 1257
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 845 TGCCGGTGAAGTGGACTGCGCCCGAAGCCATTCGTAGTAATAAATTCAGCATTAAGTCCGATGTATGGTCATTT 918
Query 1258 GGAATCCTTCTTTATGAAATCATTACTTATGGCAAAATGCCTTACAGTGGTATGACAGGTGCCCAGGTAATCCA 1331
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 919 GGAATCCTTCTTTATGAAATCATTACTTATGGCAAAATGCCTTACAGTGGTATGACAGGTGCCCAGGTAATCCA 992
Query 1332 GATGTTGGCTCAAAACTATAGACTTCCGCAACCATCCAACTGTCCACAGCAATTTTACAACATCATGTTGGAGT 1405
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 993 GATGTTGGCTCAAAACTATAGACTTCCGCAACCATCCAACTGTCCACAGCAATTTTACAACATCATGTTGGAGT 1066
Query 1406 GCTGGAATGCAGAGCCTAAGGAACGACCTACATTTGAGACACTGCGTTGGAAACTTGAAGACTATTTTGAAACA 1479
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1067 GCTGGAATGCAGAGCCTAAGGAACGACCTACATTTGAGACACTGCGTTGGAAACTTGAAGACTATTTTGAAACA 1140
Query 1480 GACTCTTCATATTCAGATGCAAATAACTTCATAAGA 1515
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1141 GACTCTTCATATTCAGATGCAAATAACTTCATAAGA 1176