Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14686
• Subject: NM_001145831.1
• Aligned Length: 788
• Identities: 645
• Gaps: 111

Alignment

Query   1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                     
Sbjct   1  MNVENTGGRLFGIGRCSSLSGAPGPDPVVHRTVEAMSQLQEELVVLRERLALHDSDRQATTTQLQNQVENLKEK  74

Query   1  ---------------------------MVENERLRQEMRRCEAELQELRTKPAGPCPGCEHSQESAQLRDKLSQ  47
                                      |||||.||||.||||.||||||..|..||.||||||||.||||||||
Sbjct  75  LISQAQEVSRLRSELGGTDAEKHRDRLMVENEQLRQELRRCEVELQELRAQPVVPCEGCEHSQESSQLRDKLSQ  148

Query  48  LQLEMAESKGMLSELNLEVQQKTDRLAEVELRLKDCLAEKAQEEERLSRRLRDSHETIASLRAQSPPVKYVIKT  121
           ||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  LQLEVAENKGMLSELNLEVQQKTDRLAEVELRLKDCLAEKAQEEERLSRRLRDSHETIASLRAQSPPVKYVIKT  222

Query 122  VEVESSKTKQALSESQARNQHLQEQVAMQRQVLKEMEQQLQSSHQLTARLRAQIAMYESELERAHGQMLEEMQS  195
           ||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||..|||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 223  VEVESSKTKQALSESQTRNQHLQEQVAMQRQVLKEMEQQLQNSHQLTVQLRAQIAMYEAELERAHGQMLEEMQS  296

Query 196  LEEDKNRAIEEAFARAQVEMKAVHENLAGVRTNLLTLQPALRTLTNDYNGLKRQVRVFPLLLQEALRSVKAEIG  269
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 297  LEEDKNRAIEEAFARAQVEMKAVHENLAGVRTNLLTLQPALRTLTNDYNGLKRQVRGFPLLLQEALRSVKAEIG  370

Query 270  QAIEEVNSNNQELLRKYRRELQLRKKCHNELVRLKGNIRVIARVRPVTKEDGEGPEATNAVTFDADDDSIIHLL  343
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 371  QAIEEVNSNNQELLRKYRRELQLRKKCHNELVRLKGNIRVIARVRPVTKEDGEGPEATNAVTFDPDDDSIIHLL  444

Query 344  HKGKPVSFELDKVFSPQASQQDVFQEVQALVTSCIDGFNVCIFAYGQTGAGKTYTMEGTAENPGINQRALQLLF  417
           ||||||||||||          ||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 445  HKGKPVSFELDK----------VFQEVQALITSCIDGFNVCIFAYGQTGAGKTYTMEGTPENPGINQRALQLLF  508

Query 418  SEVQEKASDWEYTITVSAAEIYNEVLRDLLGKEPQEKLEIRLCPDGSGQLYVPGLTEFQVQSVDDINKVFEFGH  491
           ||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 509  SEVQEKASDWQYNITVSAAEIYNEVLRDLLGKEPQEKLEIRLCPDGSGQLYVPGLTEFQVQSVDDINKVFEFGY  582

Query 492  TNRTTEFTNLNEHSSRSHALLIVTVRGVDCSTGLRTTGKLNLVDLAGSERVGKSGAEGSRLREAQHINKSLSAL  565
           .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||
Sbjct 583  NNRTTEFTNLNEHSSRSHALLIVTVRGVDCSTGLRTTGKLNLVDLAGSERVGKSGAEGNRLREAQHINRSLSAL  656

Query 566  GDVIAALRSRQGHVPFRNSKLTYLLQDSLSGDSKTLMVVQVSPVEKNTSETLYSLKFAERVRSVELGPGLRRAE  639
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||.|
Sbjct 657  GDVIAALRSRQGHVPFRNSKLTYLLQDSLSGDSKTLMVVQVSPVEKNTSETLYSLRFAERVRSVELGPGSRRTE  730

Query 640  LGSWSSQEHLEWEPACQTPQPSAWAHSAPSSGTSSRPGSIRRKLQPSA  687
           |||||||||||||||||||||.|.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 731  LGSWSSQEHLEWEPACQTPQPTARAHSAPGSGTSSRPGSIRRKLQPSA  778