Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14686
- Subject:
- NM_010631.2
- Aligned Length:
- 2476
- Identities:
- 1826
- Gaps:
- 419
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGTCCCCTCTCGCAGGACGTGGAACTTGGGAGCCACGCCTTCACTGCGAGGCCTGTGGAGAGTGGGCCGGGT 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CCAGGAGCCCAAGCCCGGGATGGCTCGCCCCGCCCCAGCCAGCCCAGCCGCCCGCCCTTTCCCACACACCGGCC 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 AGGGGAGGTTGAGAACTGGGCGTGGAAAAGATATTCTACCCAGTGGCGAGGAAGACTCCACTTCTCGGACTGCA 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 GCTCGCCCGTCTCTTGCACAGTGTCGAGCCCTCAGCGTGGACTGGCCTGGCCCTAGGAGTCCCCATAGACTCTA 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 CCTGACAGTGCAGGTGGAGAATCTAAAGGAAAAGCTCATTAGCCAGGCCCAGGAAGTGAGCCGACTGCGATCAG 370
Query 1 -----------------------------------------ATGGTGGAGAATGAGCGACTGAGGCAGGAGATG 33
||||||||||||||||..||||||||||||.||
Sbjct 371 AACTGGGAGGCACGGACGCGGAGAAGCACAGGGACAGACTGATGGTGGAGAATGAGCAGCTGAGGCAGGAGCTG 444
Query 34 CGGCGCTGTGAGGCCGAGCTGCAAGAGCTGCGCACAAAGCCAGCAGGT----CCCTGCCCAGGTTGTGAGCACA 103
.||||||||||||.|||.|||||.|||||.||..| |||||.||| ||||||...||.||||||||||
Sbjct 445 AGGCGCTGTGAGGTCGAACTGCAGGAGCTTCGGGC----CCAGCCGGTGGTGCCCTGCGAGGGCTGTGAGCACA 514
Query 104 GCCAGGAGAGCGCCCAGCTCCGTGACAAGCTGTCCCAGCTGCAGCTGGAGATGGCGGAAAGCAAAGGCATGCTG 177
|||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||.||||..||||.||.|.|||||||||||||
Sbjct 515 GCCAGGAGAGCAGCCAGCTCCGTGACAAGCTGTCCCAGCTGCAGTTGGAAGTGGCTGAGAACAAAGGCATGCTG 588
Query 178 TCAGAGCTGAACCTAGAGGTGCAGCAGAAGACCGACCGGCTGGCTGAGGTGGAGCTGCGACTCAAGGACTGCCT 251
||.||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 589 TCGGAACTGAACCTGGAGGTGCAGCAGAAAACGGACCGGCTGGCAGAGGTAGAGCTGCGCCTCAAGGACTGTCT 662
Query 252 GGCTGAGAAGGCACAGGAGGAGGAGCGGCTTAGTCGGCGCCTGCGTGACAGCCACGAGACCATTGCCAGCCTGC 325
|||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||.
Sbjct 663 GGCTGAGAAAGCCCAGGAGGAGGAACGGCTCAGCCGGCGCCTGCGTGACAGCCATGAGACTATCGCCAGTCTGA 736
Query 326 GGGCCCAGTCCCCACCTGTCAAGTATGTCATCAAGACAGTGGAGGTGGAGTCGTCCAAGACCAAGCAGGCCCTC 399
|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 737 GGGCCCAGTCCCCACCTGTTAAGTATGTCATCAAGACAGTGGAGGTAGAGTCTTCCAAGACCAAGCAGGCCCTC 810
Query 400 AGCGAGTCCCAGGCCCGGAACCAGCACCTGCAGGAGCAGGTGGCTATGCAGAGGCAGGTGCTGAAGGAGATGGA 473
||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 811 AGCGAGTCCCAGACCCGGAACCAGCACCTGCAGGAGCAAGTGGCCATGCAGCGGCAGGTGCTGAAGGAGATGGA 884
Query 474 ACAGCAGCTGCAGAGCTCACACCAGCTGACCGCGCGGCTCCGGGCGCAGATTGCCATGTACGAGTCAGAGCTGG 547
.||||||||.||||.|||.|||||||||||.|..|.|.|.|||||.||||||||||||||.|||.|||||||||
Sbjct 885 GCAGCAGCTACAGAACTCCCACCAGCTGACAGTCCAGTTGCGGGCTCAGATTGCCATGTATGAGGCAGAGCTGG 958
Query 548 AGCGGGCCCATGGGCAGATGCTGGAGGAGATGCAGTCCCTGGAAGAGGACAAGAACCGGGCCATTGAGGAGGCC 621
|||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 959 AGCGGGCACACGGGCAGATGCTGGAGGAGATGCAGTCCTTGGAGGAGGATAAGAACCGGGCCATTGAGGAGGCC 1032
Query 622 TTTGCCAGAGCCCAGGTGGAGATGAAGGCTGTGCACGAGAATCTAGCAGGCGTCCGGACCAACTTGCTGACCTT 695
|||||..|.||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||.|||.||||||||.|||||||..|
Sbjct 1033 TTTGCACGGGCCCAGGTGGAGATGAAGGCAGTACACGAGAACCTGGCAGGTGTCAGGACCAACCTGCTGACGCT 1106
Query 696 GCAGCCGGCACTGCGGACCCTCACCAACGACTACAATGGGCTCAAGCGGCAGGTGCGCGTCTTCCCACTGCTGC 769
||||||.||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||..||||||
Sbjct 1107 GCAGCCTGCGCTGAGGACCCTCACCAACGACTACAATGGGCTCAAGCGGCAGGTGCGGGGCTTCCCCTTGCTGC 1180
Query 770 TGCAGGAGGCCCTCAGGAGTGTCAAGGCCGAGATAGGCCAGGCCATCGAGGAGGTCAACAGCAACAACCAGGAG 843
||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 1181 TGCAGGAGGCTCTCAGGAGTGTCAAAGCTGAGATCGGCCAGGCCATCGAGGAGGTTAATAGCAACAACCAGGAG 1254
Query 844 CTGCTGCGCAAGTACCGCCGCGAGCTGCAGCTGCGTAAGAAGTGCCACAATGAGCTCGTGCGGCTGAAAGGGAA 917
|||.||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||.||||||||.||.||
Sbjct 1255 CTGTTGCGCAAGTACCGCCGGGAACTACAGCTGCGCAAGAAATGCCATAACGAGCTGGTCCGGCTGAAGGGAAA 1328
Query 918 CATCCGAGTGATTGCTCGTGTCCGGCCAGTCACCAAAGAGGATGGGGAAGGACCTGAGGCCACCAATGCTGTGA 991
||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 1329 CATCCGGGTGATTGCCCGAGTCCGGCCAGTCACCAAGGAGGATGGAGAAGGACCCGAGGCAACCAATGCTGTGA 1402
Query 992 CTTTCGATGCCGACGACGACTCCATCATCCACCTGCTGCACAAGGGCAAGCCTGTGTCCTTCGAGCTGGACAAG 1065
|.||.||..|.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1403 CCTTTGACCCTGATGATGACTCCATCATCCACCTGCTGCACAAGGGCAAGCCCGTGTCCTTCGAGCTGGACAAG 1476
Query 1066 GTCTTCTCCCCACAGGCCTCGCAGCAGGACGTGTTCCAGGAGGTGCAGGCCCTGGTCACCTCTTGCATTGATGG 1139
|||||||||||...|||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||..|.|||||.|||||.|||||
Sbjct 1477 GTCTTCTCCCCGTGGGCTTCCCAGCAGGACGTGTTCCAGGAGGTGCAGGCCCTCATTACCTCCTGCATCGATGG 1550
Query 1140 CTTCAATGTCTGCATCTTTGCGTACGGCCAGACGGGCGCCGGCAAGACGTACACGATGGAGGGGACCGCTGAGA 1213
||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.||.|||||||||||..|.||||
Sbjct 1551 CTTCAATGTCTGTATCTTTGCTTACGGCCAGACAGGTGCCGGCAAGACATATACAATGGAGGGGACTCCCGAGA 1624
Query 1214 ACCCAGGTATCAACCAGCGGGCCCTGCAGCTGCTCTTCTCCGAGGTGCAGGAGAAGGCGTCTGACTGGGAGTAC 1287
||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1625 ACCCGGGCATCAACCAGCGGGCCCTGCAGCTGCTCTTCTCGGAGGTGCAGGAGAAGGCGTCTGACTGGCAGTAC 1698
Query 1288 ACCATCACCGTCAGCGCTGCGGAGATCTACAATGAGGTCCTCAGGGACCTGCTAGGGAAAGAGCCTCAGGAAAA 1361
|.|||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 1699 AACATCACCGTCAGCGCAGCTGAGATTTACAATGAAGTCCTCAGGGACCTGCTGGGGAAAGAGCCTCAGGAGAA 1772
Query 1362 ACTGGAGATCCGGCTGTGCCCAGACGGCAGTGGGCAGCTGTATGTACCAGGGCTGACTGAGTTCCAAGTGCAGA 1435
.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1773 GCTGGAGATCCGACTGTGCCCGGATGGCAGTGGGCAACTGTATGTGCCAGGGCTGACTGAGTTCCAGGTGCAGA 1846
Query 1436 GCGTGGACGACATCAACAAGGTGTTTGAGTTTGGCCACACTAATCGCACGACCGAGTTCACCAACCTGAACGAG 1509
|||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||..||.|||||.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1847 GCGTGGATGACATCAACAAGGTGTTTGAGTTTGGCTACAACAACCGCACCACCGAGTTCACCAACCTGAACGAA 1920
Query 1510 CACAGCTCCCGCTCGCACGCACTGCTCATCGTGACGGTGCGAGGCGTGGACTGCAGCACAGGCCTCCGCACCAC 1583
||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||.||||.|||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1921 CACAGCTCCCGCTCCCACGCTCTGCTCATCGTGACAGTGAGAGGTGTGGATTGCAGCACAGGCCTCCGCACCAC 1994
Query 1584 GGGGAAGCTGAACCTGGTGGACTTGGCTGGCTCGGAGCGCGTGGGCAAGTCGGGGGCCGAGGGCAGCCGCCTGC 1657
||||||||||||||||||||||.|||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||.||||||||
Sbjct 1995 GGGGAAGCTGAACCTGGTGGACCTGGCTGGTTCAGAGCGTGTGGGCAAGTCGGGGGCTGAGGGCAACCGCCTGC 2068
Query 1658 GGGAGGCGCAGCACATCAACAAGTCGCTGTCGGCTCTGGGGGACGTCATTGCTGCCCTGCGCTCCCGCCAGGGC 1731
|.|||||.|||||||||||||.|||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||
Sbjct 2069 GAGAGGCACAGCACATCAACAGGTCACTATCCGCCCTGGGGGACGTCATTGCTGCCCTGCGTTCTCGACAAGGC 2142
Query 1732 CACGTGCCCTTCCGCAACTCCAAGCTCACCTACCTGCTGCAGGATTCGCTTAGTGGTGACAGCAAGACCCTCAT 1805
||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct 2143 CATGTGCCCTTCCGCAATTCCAAACTCACCTACCTGCTGCAGGACTCACTCAGTGGTGACAGCAAGACCCTTAT 2216
Query 1806 GGTGGTACAGGTGTCCCCCGTGGAGAAGAACACTAGCGAGACGCTCTATTCCCTCAAGTTTGCTGAGAGGGTGC 1879
||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||||..||||||||||||||.|
Sbjct 2217 GGTGGTACAGGTGTCCCCAGTGGAGAAGAACACCAGCGAGACTCTGTACTCCCTCAGATTTGCTGAGAGGGTTC 2290
Query 1880 GCTCTGTGGAGCTGGGGCCTGGGCTACGCAGGGCAGAGCTTGGGTCCTGGTCAAGCCAGGAGCATCTAGAGTGG 1953
|||||||||||.||||.||||||...|||.|..|||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 2291 GCTCTGTGGAGTTGGGCCCTGGGTCCCGCCGCACAGAGCTGGGTTCCTGGTCAAGCCAGGAGCACCTGGAGTGG 2364
Query 1954 GAGCCGGCTTGTCAGACGCCACAGCCCTCGGCCTGGGCCCACTCAGCCCCCAGCTCTGGGACCAGTAGCCGCCC 2027
|||||||||||.|||||.||||||||..|.||..|.||||||||.|||||..||||||||||||||||||||||
Sbjct 2365 GAGCCGGCTTGCCAGACACCACAGCCTACAGCACGAGCCCACTCTGCCCCTGGCTCTGGGACCAGTAGCCGCCC 2438
Query 2028 TGGATCCATCCGGAGGAAGCTGCAGCCCTCGGCC 2061
.||.||||||||.|||||.||||||||.||.|||
Sbjct 2439 AGGTTCCATCCGAAGGAAACTGCAGCCGTCAGCC 2472