Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14704
• Subject: NM_001037130.1
• Aligned Length: 2608
• Identities: 2272
• Gaps: 29

Alignment

Query    1  ATGAGAGAGCTCGTCAACATTCCACTGGTACATATTCTTACTCTGGTTGCCTTCAGCGGAACTGAGAAACTTCC  74
            |||||||||||.|||||||||||||||.||||.||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGAGAGCTTGTCAACATTCCACTGTTACAGATGCTCACCCTGGTTGCCTTCAGCGGGACTGAGAAACTTCC  74

Query   75  AAAAGCTCCTGTCATCACCACTCCTCTTGAAACAGTGGATGCCTTAGTTGAAGAAGTGGCTACTTTCATGTGTG  148
            ||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct   75  AAAAGCCCCTGTCATCACCACGCCTCTTGAAACTGTAGATGCCTTGGTTGAAGAAGTAGCGACTTTCATGTGTG  148

Query  149  CAGTGGAATCCTACCCCCAGCCTGAGATTTCCTGGACTAGAAATAAAATTCTCATTAAACTCTTTGACACCCGG  222
            |.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.
Sbjct  149  CCGTGGAATCCTACCCTCAGCCCGAGATTTCTTGGACCAGAAATAAAATTCTCATTAAGCTGTTTGACACCCGC  222

Query  223  TACAGCATCCGGGAGAATGGGCAGCTCCTCACCATCCTGAGTGTGGAAGACAGTGATGATGGCATTTACTGCTG  296
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  223  TACAGCATCCGGGAGAATGGTCAGCTCCTCACCATTCTGAGCGTGGAAGACAGTGATGATGGCATCTACTGCTG  296

Query  297  CACGGCCAACAATGGTGTGGGAGGAGCTGTGGAGAGTTGTGGAGCCCTGCAAGTGAAGATGAAACCTAAAATAA  370
            ||..|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CATAGCCAACAATGGAGTGGGAGGAGCCGTGGAGAGTTGTGGTGCCCTGCAAGTGAAGATGAAACCTAAAATAA  370

Query  371  CTCGCCCTCCCATAAATGTGAAAATAATAGAGGGATTAAAAGCAGTCCTACCATGTACTACAATGGGTAATCCC  444
            ||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||.||.||.|||||.||||||||.|||
Sbjct  371  CTCGTCCTCCCATTAATGTAAAAATAATAGAGGGATTGAAGGCAGTTCTGCCGTGCACTACGATGGGTAACCCC  444

Query  445  AAACCATCAGTGTCTTGGATAAAGGGAGACAGCCCTCTCAGGGAAAATTCCCGAATTGCAGTTCTTGAATCTGG  518
            ||||||||.|||||.|||||.|||||.||||...|||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||
Sbjct  445  AAACCATCTGTGTCCTGGATCAAGGGGGACAATGCTCTCAGGGAAAATTCCAGAATCGCAGTTCTTGAATCTGG  518

Query  519  GAGCTTGAGGATTCATAACGTACAAAAGGAAGATGCAGGACAGTATCGATGTGTGGCAAAAAACAGCCTCGGGA  592
            ||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.|
Sbjct  519  GAGCTTAAGGATCCATAATGTGCAAAAGGAAGATGCAGGACAGTACCGCTGTGTGGCCAAAAACAGCCTGGGCA  592

Query  593  CAGCATATTCCAAAGTGGTGAAGCTGGAAGTTGAGGTTTTTGCCAGGATCCTGCGGGCTCCTGAATCCCACAAT  666
            ||||.||.||||||.||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  593  CAGCTTACTCCAAACTGGTGAAGCTGGAAGTGGAGGTTTTTGCAAGAATCCTGCGTGCTCCTGAATCCCACAAT  666

Query  667  GTCACCTTTGGCTCCTTTGTGACCCTGCACTGTACAGCAACAGGCATTCCTGTCCCCACCATCACCTGGATTGA  740
            |||||||||||.||||||||.|||||.|.|||.|||||||.||||||.||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  667  GTCACCTTTGGTTCCTTTGTAACCCTACGCTGCACAGCAATAGGCATCCCTGTCCCCACCATCAGCTGGATTGA  740

Query  741  AAACGGAAATGCTGTTTCTTCTGGGTCCATTCAAGAGAGTGTGAAAGACCGAGTGATTGACTCAAGACTGCAGC  814
            |||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  741  AAACGGAAATGCTGTTTCTTCAGGTTCCATTCAAGAGAGTGTGAAAGACCGAGTGATTGACTCAAGACTCCAGC  814

Query  815  TGTTTATCACCAAGCCAGGACTCTACACATGCATAGCTACCAATAAGCATGGGGAGAAGTTCAGTACTGCCAAG  888
            |.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||.|||
Sbjct  815  TCTTCATCACAAAGCCAGGACTCTACACATGCATAGCTACCAATAAGCACGGAGAAAAGTTCAGTACCGCAAAG  888

Query  889  GCTGCAGCCACCATCAGCATAGCAGAATGGAGTAAACCACAGAAAGATAACAAAGGCTACTGCGCCCAGTACAG  962
            |||||||||||..||||||||||||||||||||||..||||||||||.|.|.||||||||||.|||||||||||
Sbjct  889  GCTGCAGCCACTGTCAGCATAGCAGAATGGAGTAAGTCACAGAAAGACAGCCAAGGCTACTGTGCCCAGTACAG  962

Query  963  AGGGGAGGTGTGTAATGCAGTCCTGGCAAAAGATGCTCTTGTTTTTCTCAACACCTCCTATGCGGACCCTGAGG  1036
            |||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||.||..|||||||||||||...||||||.||||
Sbjct  963  AGGGGAGGTGTGTGATGCAGTCCTGGCGAAAGATGCTCTTGTCTTCTTCAACACCTCCTACCGGGACCCCGAGG  1036

Query 1037  AGGCCCAAGAGCTACTGGTCCACACGGCCTGGAATGAACTGAAAGTAGTGAGCCCAGTCTGCCGGCCAGCTGCT  1110
            |.|||||.|||||.|||.|||||||.||.||||||||.|||||.|..|||||.|||.|.|||||||||||||||
Sbjct 1037  ACGCCCAGGAGCTGCTGATCCACACTGCGTGGAATGAGCTGAAGGCTGTGAGTCCACTGTGCCGGCCAGCTGCT  1110

Query 1111  GAGGCTTTGTTGTGTAACCACATCTTCCAGGAGTGCAGTCCTGGAGTAGTGCCTACTCCTATTCCCATTTGCAG  1184
            ||||||.||.|||||||||||.|||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 1111  GAGGCTCTGCTGTGTAACCACCTCTTCCAAGAGTGCAGCCCTGGAGTGGTACCTACTCCCATGCCCATTTGCAG  1184

Query 1185  AGAGTACTGCTTGGCAGTAAAGGAGCTCTTCTGCGCAAAAGAATGGCTGGTAATGGAAGAGAAGACCCACAGAG  1258
            ||||||||||.||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||.||.||||||||..|||.|||||.|.|
Sbjct 1185  AGAGTACTGCCTGGCGGTAAAGGAGCTCTTCTGTGCAAAGGAATGGCAGGCAATGGAAGGAAAGGCCCACCGGG  1258

Query 1259  GACTCTACAGATCCGAGATGCATTTGCTGTCC-GTGCCAGAATGCAGCAAGCTTCCCAGCATGCATTGGGACCC  1331
            |.|||||||||||.|.|||||||.|.|| ||| ||.|||||.|||||||||||||||||||||||..|||||||
Sbjct 1259  GCCTCTACAGATCTGGGATGCATCTCCT-TCCGGTACCAGAGTGCAGCAAGCTTCCCAGCATGCACCGGGACCC  1331

Query 1332  CACGGCCTGTGCCAGACTGCCACATCTAGATTATAACAAAGAAAACCTAAAAACATTCCCACCAATGACGTCCT  1405
            |||.|||||..|.|||||||||.||.|||                        |||||||..||||.|||||||
Sbjct 1332  CACAGCCTGCACAAGACTGCCATATTTAG------------------------CATTCCCGTCAATAACGTCCT  1381

Query 1406  CAAAGCCAAGTGTGGACATTCCAAATCTGCCTTCCTCCTCCTCTTCTTCCTTCTCTGTCTCACCTACATACTCC  1479
            |.|.|||.||.|.||||||||||||.||||||.|||||.||   ||||||||..|.|||||.|||.|.||||||
Sbjct 1382  CCAGGCCGAGCGCGGACATTCCAAACCTGCCTGCCTCCACC---TCTTCCTTTGCCGTCTCGCCTGCGTACTCC  1452

Query 1480  ATGACTGTAATAATCTCCATCATGTCCAGCTTTGCAATATTTGTGCTTCTTACCATAACTACTCTCTATTGCTG  1553
            |||||.||.||.|||||||||.|||||||||||||..|.||||..|||||.|||||..||||||||||||||||
Sbjct 1453  ATGACCGTCATCATCTCCATCGTGTCCAGCTTTGCCCTGTTTGCTCTTCTCACCATCGCTACTCTCTATTGCTG  1526

Query 1554  CCGAAGAAGAAAACAATGGAAAAATAAGAAAAGAGAATCAGCAGCAGTAACCCTCACCACACTGCCTTCTGAGC  1627
            ||||||.||.|||.||||||||||||||||||||||.||..|.||.||.|||||||||||..|||||||.||||
Sbjct 1527  CCGAAGGAGGAAAGAATGGAAAAATAAGAAAAGAGAGTCGACCGCGGTGACCCTCACCACGTTGCCTTCCGAGC  1600

Query 1628  TCTTACTAGATAGACTTCATCCCAACCCCATGTACCAGAGGATGCCGCTCCTTCTGAACCCCAAATTGCTCAGC  1701
            ||.|.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||
Sbjct 1601  TCCTGCTGGATAGGCTCCATCCCAACCCCATGTACCAGAGGATGCCACTCCTTCTGAATCCTAAGTTGCTCAGC  1674

Query 1702  CTGGAGTATCCAAGGAATAACATTGAATATGTGAGAGACATCGGAGAGGGAGCGTTTGGAAGGGTGTTTCAAGC  1775
            |||||||||||.||||||||||||||.|||||..||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||
Sbjct 1675  CTGGAGTATCCGAGGAATAACATTGAGTATGTCCGAGACATCGGAGAGGGGGCGTTTGGAAGAGTCTTCCAAGC  1748

Query 1776  AAGGGCACCAGGCTTACTTCCCTATGAACCTTTCACTATGGTGGCAGTAAAGATGCTCAAAGAAGAAGCCTCGG  1849
            ||||||.||.|||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||.|||||.|
Sbjct 1749  AAGGGCCCCTGGCTTGCTGCCTTATGAACCTTTCACTATGGTGGCCGTGAAGATGCTTAAGGAAGAGGCCTCTG  1822

Query 1850  CAGATATGCAAGCGGACTTTCAGAGGGAGGCAGCCCTCATGGCAGAATTTGACAACCCTAACATTGTGAAGCTA  1923
            ||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.
Sbjct 1823  CAGACATGCAAGCGGACTTTCAGAGGGAGGCGGCCCTCATGGCAGAGTTTGACAACCCCAACATTGTGAAACTC  1896

Query 1924  TTAGGAGTGTGTGCTGTCGGGAAGCCAATGTGCCTGCTCTTTGAATACATGGCCTATGGTGACCTCAATGAGTT  1997
            |||||.||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1897  TTAGGTGTGTGTGCCGTTGGGAAGCCGATGTGTCTGCTCTTTGAATATATGGCCTATGGTGACCTCAATGAGTT  1970

Query 1998  CCTCCGCAGCATGTCCCCTCACACCGTGTGCAGCCTCAGTCACAGTGACTTGTCTATGAGGGCTCAGGTCTCCA  2071
            ||||||.||.||||||||.|||||.||.|||||||||||.|||||||||.||||.|.||||||||.|||.||.|
Sbjct 1971  CCTCCGAAGTATGTCCCCGCACACTGTTTGCAGCCTCAGCCACAGTGACCTGTCCACGAGGGCTCGGGTGTCTA  2044

Query 2072  GCCCTGGGCCCCCACCCCTCTCCTGTGCTGAGCAGCTTTGCATTGCCAGGCAGGTGGCAGCTGGCATGGCTTAC  2145
            |||||||.||.|||||.||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 2045  GCCCTGGTCCTCCACCACTGTCCTGTGCAGAACAGCTCTGCATTGCCAGGCAGGTGGCAGCTGGCATGGCCTAC  2118

Query 2146  CTCTCAGAACGTAAGTTTGTTCACCGAGATTTAGCCACCAGGAACTGCCTGGTGGGCGAGAACATGGTGGTGAA  2219
            ||.|||||.||.||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||.||||||||||||
Sbjct 2119  CTTTCAGAGCGCAAGTTTGTCCACCGGGACTTAGCTACCAGGAACTGCCTGGTTGGGGAGACCATGGTGGTGAA  2192

Query 2220  AATTGCCGACTTTGGCCTCTCCAGGAACATCTACTCAGCAGACTACTACAAAGCTAATGAAAACGACGCTATCC  2293
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||.|||.|||.|||||.||||
Sbjct 2193  AATTGCAGACTTTGGCCTCTCCAGGAACATCTATTCCGCAGACTACTACAAAGCTGATGGAAATGACGCCATCC  2266

Query 2294  CTATCCGTTGGATGCCACCAGAGTCCATTTTTTATAACCGCTACACTACAGAGTCTGATGTGTGGGCCTATGGC  2367
            |||||||.||||||||.||.|||||.||.||.||.|||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.
Sbjct 2267  CTATCCGCTGGATGCCGCCCGAGTCTATCTTCTACAACCGCTACACCACTGAGTCGGATGTATGGGCCTATGGT  2340

Query 2368  GTGGTCCTCTGGGAGATCTTCTCCTATGGCCTGCAGCCCTACTATGGGATGGCCCATGAGGAGGTCATTTACTA  2441
            |||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 2341  GTGGTCCTCTGGGAGATCTTCTCCTATGGGCTGCAGCCCTACTATGGAATGGCCCACGAGGAGGTCATTTACTA  2414

Query 2442  CGTGCGAGATGGCAACATCCTCTCCTGCCCTGAGAACTGCCCCGTGGAGCTGTACAATCTCATGCGTCTATGTT  2515
            .|||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||.||||||||.||||||||.||.||||
Sbjct 2415  TGTGAGAGATGGCAACATCCTCGCCTGCCCTGAGAACTGCCCCTTGGAACTGTACAACCTCATGCGCCTGTGTT  2488

Query 2516  GGAGCAAGCTGCCTGCAGACAGACCCAGTTTCACCAGTATTCACCGAATTCTGGAACGCATGTGTGAGAGGGCA  2589
            ||||||||||||||||.||.||||||||.|||..||||||.|||.|.||.|||.|.||||||||.|||||.|||
Sbjct 2489  GGAGCAAGCTGCCTGCTGATAGACCCAGCTTCTGCAGTATCCACAGGATCCTGCAGCGCATGTGCGAGAGAGCA  2562

Query 2590  GAGGGAACTGTGAGTGTC  2607
            ||||||||.|||.|||||
Sbjct 2563  GAGGGAACGGTGGGTGTC  2580