Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14712
• Subject: NM_001134673.4
• Aligned Length: 1548
• Identities: 1461
• Gaps: 75

Alignment

Query    1  ATGTATTCTCCGCTCTGTCTCACCCAGGATGAATTTCATCCTTTCATCGAAGCACTTCTGCCCCACGTCCGAGC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTATTCTCCGCTCTGTCTCACCCAGGATGAATTTCATCCTTTCATCGAAGCACTTCTGCCCCACGTCCGAGC  74

Query   75  CTTTGCCTACACATGGTTCAACCTGCAGGCCCGAAAACGAAAATACTTCAAAAAACATGAAAAGCGTATGTCAA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTTTGCCTACACATGGTTCAACCTGCAGGCCCGAAAACGAAAATACTTCAAAAAACATGAAAAGCGTATGTCAA  148

Query  149  AAGAAGAAGAGAGAGCCGTGAAGGATGAATTGCTAAGTGAAAAACCAGAGGTCAAGCAGAAGTGGGCATCTCGA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AAGAAGAAGAGAGAGCCGTGAAGGATGAATTGCTAAGTGAAAAACCAGAGGTCAAGCAGAAGTGGGCATCTCGA  222

Query  223  CTTCTGGCAAAGTTGCGGAAAGATATCCGACCCGAATATCGAGAGGATTTTGTTCTTACAGTTACAGGGAAAAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTTCTGGCAAAGTTGCGGAAAGATATCCGACCCGAATATCGAGAGGATTTTGTTCTTACAGTTACAGGGAAAAA  296

Query  297  ACCTCCATGTTGTGTTCTTTCCAACCCAGACCAGAAAGGCAAGATGCGAAGAATTGACTGCCTCCGCCAGGCAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ACCTCCATGTTGTGTTCTTTCCAACCCAGACCAGAAAGGCAAGATGCGAAGAATTGACTGCCTCCGCCAGGCAG  370

Query  371  ATAAAGTCTGGAGGTTGGACCTTGTTATGGTGATTTTGTTTAAAGGTATTCCGCTGGAAAGTACTGATGGCGAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATAAAGTCTGGAGGTTGGACCTTGTTATGGTGATTTTGTTTAAAGGTATTCCGCTGGAAAGTACTGATGGCGAG  444

Query  445  CGCCTTGTAAAGTCCCCACAATGCTCTAATCCAGGGCTCTGTGTCCAACCCCATCACATAGGGGTTTCTGTTAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CGCCTTGTAAAGTCCCCACAATGCTCTAATCCAGGGCTCTGTGTCCAACCCCATCACATAGGGGTTTCTGTTAA  518

Query  519  GGAACTCGATTTATATTTGGCATACTTTGTGCATGCAGCAGATTCAAGTCAATCTGAAAGTCCCAGCCAGCCAA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGAACTCGATTTATATTTGGCATACTTTGTGCATGCAGCAGATTCAAGTCAATCTGAAAGTCCCAGCCAGCCAA  592

Query  593  GTGACGCTGACATTAAGGACCAGCCAGAAAATGGACATTTGGGCTTCCAGGACAGTTTTGTCACATCAGGTGTT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GTGACGCTGACATTAAGGACCAGCCAGAAAATGGACATTTGGGCTTCCAGGACAGTTTTGTCACATCAGGTGTT  666

Query  667  TTTAGTGTCACTGAGCTAGTAAGAGTGTCACAGACACCAATAGCTGCAGGAACTGGCCCAAATTTTTCTCTCTC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TTTAGTGTCACTGAGCTAGTAAGAGTGTCACAGACACCAATAGCTGCAGGAACTGGCCCAAATTTTTCTCTCTC  740

Query  741  AGATTTGGAAAGTTCTTCATACTACAGCATGAGTCCAGGAGCAATGAGGAGGTCTTTACCCAGCACATCCTCTA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGATTTGGAAAGTTCTTCATACTACAGCATGAGTCCAGGAGCAATGAGGAGGTCTTTACCCAGCACATCCTCTA  814

Query  815  CGAGCTCCACAAAGCGCCTCAAGTCTGTGGAGGATGAAATGGACAGTCCTGGTGAGGAGCCATTTTATACAGGC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CGAGCTCCACAAAGCGCCTCAAGTCTGTGGAGGATGAAATGGACAGTCCTGGTGAGGAGCCATTTTATACAGGC  888

Query  889  CAAGGGCGCTCCCCAGGAAGTGGCAGTCAGTCAAGTGGATGGCATGAAGTGGAGCCAGGAATGCCATCTCCAAC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CAAGGGCGCTCCCCAGGAAGTGGCAGTCAGTCAAGTGGATGGCATGAAGTGGAGCCAGGAATGCCATCTCCAAC  962

Query  963  CACACTGAAGAAGTCGGAGAAGTCTGGTTTCAGCAGCCCCTCCCCTTCTCAGACCTCCTCCCTGGGAACGGCGT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CACACTGAAGAAGTCGGAGAAGTCTGGTTTCAGCAGCCCCTCCCCTTCACAGACCTCCTCCCTGGGAACGGCGT  1036

Query 1037  TCACACAGCATCACCGACCTGTCATTACAGGACCCAGAGCAAGTCCGCATGCAACACCATCGACTCTTCATTTC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCACACAGCATCACCGACCTGTCATTACAGGACCCAGAGCAAGTCCGCATGCAACACCATCGACTCTTCATTTC  1110

Query 1111  CCGACATCACCCATTATCCAGCAGCCTGGGCCTTACTTCTCACACCCAGCCATCCGCTATCACCCTCAGGAGAC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CCGACATCACCCATTATCCAGCAGCCTGGGCCTTACTTCTCACACCCAGCCATCCGCTATCACCCTCAGGAGAC  1184

Query 1185  GCTGAAAGAATTTGTCCAACTTGTCTGCCCTGATGCTGGTCAGCAGGCTGGACAGGTGGGGTTCCTCAATCCCA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GCTGAAAGAATTTGTCCAACTTGTCTGCCCTGATGCTGGTCAGCAGGCTGGACAGGTGGGGTTCCTCAATCCCA  1258

Query 1259  ATGGGAGCAGCCAAGGCAAGGTGCACAACCCATTCCTTCCCACCCCAATGTTGCCACCGCCACCGCCACCACCG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ATGGGAGCAGCCAAGGCAAGGTGCACAACCCATTCCTTCCCACCCCAATGTTGCCACCGCCACCGCCACCACCG  1332

Query 1333  ATGGCCAGGCCTGTGCCTCTGCCGGTGCCAGACACAAAGCCTCCAACCACGTCAACAGAAGGAGGTGCAGCCTC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ATGGCCAGGCCTGTGCCTCTGCCGGTGCCAGACACAAAGCCTCCAACCACGTCAACAGAAGGAGGTGCAGCCTC  1406

Query 1407  CCCCACGTCACCAATCCT-----------GGTACCT---------------------------------GGGAT  1436
            |||||||||||||| |||           .|.||||                                 |||||
Sbjct 1407  CCCCACGTCACCAA-CCTACTCGACACCCAGCACCTCCCCCGCAAACCGATTCGTCAGTGTTGGACCACGGGAT  1479

Query 1437  AAAAG--TTGCAGCGTCCCACCATCCACCAGACAGAC-CACCCCT----CCCCTTCTCAACTCTG---  1494
            ..|||  |||.|       |..||||..|| |||||| ||..|||    |            |||   
Sbjct 1480  CCAAGCTTTGTA-------AATATCCCTCA-ACAGACACAGTCCTGGTAC------------CTGGGA  1527