Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14712
• Subject: NM_010905.3
• Aligned Length: 1548
• Identities: 1371
• Gaps: 75

Alignment

Query    1  ATGTATTCTCCGCTCTGTCTCACCCAGGATGAATTTCATCCTTTCATCGAAGCACTTCTGCCCCACGTCCGAGC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct    1  ATGTATTCTCCGCTCTGTCTCACCCAGGATGAGTTTCATCCTTTCATTGAAGCACTTCTGCCCCATGTCCGCGC  74

Query   75  CTTTGCCTACACATGGTTCAACCTGCAGGCCCGAAAACGAAAATACTTCAAAAAACATGAAAAGCGTATGTCAA  148
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|
Sbjct   75  CTTCGCCTACACATGGTTCAACCTGCAGGCCCGAAAGCGGAAATACTTCAAAAAACATGAGAAGCGCATGTCGA  148

Query  149  AAGAAGAAGAGAGAGCCGTGAAGGATGAATTGCTAAGTGAAAAACCAGAGGTCAAGCAGAAGTGGGCATCTCGA  222
            |||||||.|||||.|||||||||||||||.|||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct  149  AAGAAGAGGAGAGGGCCGTGAAGGATGAACTGCTAAGCGAGAAGCCCGAGGTCAAGCAGAAGTGGGCTTCCCGA  222

Query  223  CTTCTGGCAAAGTTGCGGAAAGATATCCGACCCGAATATCGAGAGGATTTTGTTCTTACAGTTACAGGGAAAAA  296
            ||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTTCTGGCCAAGTTACGGAAAGATATCCGACCCGAGTACCGAGAGGATTTTGTTCTTACAGTTACAGGGAAAAA  296

Query  297  ACCTCCATGTTGTGTTCTTTCCAACCCAGACCAGAAAGGCAAGATGCGAAGAATTGACTGCCTCCGCCAGGCAG  370
            |||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ACCTCCATGCTGTGTTCTTTCCAACCCTGATCAGAAAGGCAAGATGCGGAGAATTGACTGCCTCCGCCAGGCAG  370

Query  371  ATAAAGTCTGGAGGTTGGACCTTGTTATGGTGATTTTGTTTAAAGGTATTCCGCTGGAAAGTACTGATGGCGAG  444
            |||||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATAAAGTATGGAGGTTGGACCTCGTCATGGTGATCTTGTTCAAAGGTATTCCGCTGGAAAGTACTGATGGCGAG  444

Query  445  CGCCTTGTAAAGTCCCCACAATGCTCTAATCCAGGGCTCTGTGTCCAACCCCATCACATAGGGGTTTCTGTTAA  518
            ||||||||||||...|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  445  CGCCTTGTAAAGAGTCCACAGTGCTCTAATCCAGGGCTCTGTGTCCAGCCCCATCACATAGGGGTTTCTGTAAA  518

Query  519  GGAACTCGATTTATATTTGGCATACTTTGTGCATGCAGCAGATTCAAGTCAATCTGAAAGTCCCAGCCAGCCAA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGAACTCGATTTATATTTGGCATACTTTGTACATGCAGCAGATTCAAGTCAATCTGAAAGTCCCAGCCAGCCAA  592

Query  593  GTGACGCTGACATTAAGGACCAGCCAGAAAATGGACATTTGGGCTTCCAGGACAGTTTTGTCACATCAGGTGTT  666
            ||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  593  GTGAAGCTGACATTAAGGACCAGCCAGAAAATGGACATTTGGGCTTCCAGGACAGCTTTGTCACATCAGGTGTT  666

Query  667  TTTAGTGTCACTGAGCTAGTAAGAGTGTCACAGACACCAATAGCTGCAGGAACTGGCCCAAATTTTTCTCTCTC  740
            ||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct  667  TTCAGTGTGACTGAGCTAGTAAGAGTGTCACAAACACCAATAGCTGCAGGAACCGGCCCCAATTTTTCTCTCTC  740

Query  741  AGATTTGGAAAGTTCTTCATACTACAGCATGAGTCCAGGAGCAATGAGGAGGTCTTTACCCAGCACATCCTCTA  814
            .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||
Sbjct  741  TGATTTGGAAAGTTCTTCATACTACAGCATGAGTCCAGGAGCAATGAGGAGGTCTCTGCCCAGCACATCCTCTA  814

Query  815  CGAGCTCCACAAAGCGCCTCAAGTCTGTGGAGGATGAAATGGACAGTCCTGGTGAGGAGCCATTTTATACAGGC  888
            |.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||
Sbjct  815  CCAGCTCTACAAAGCGCCTCAAGTCTGTGGAGGATGAAATGGACAGTCCTGGTGAAGAACCATTTTACACAGGC  888

Query  889  CAAGGGCGCTCCCCAGGAAGTGGCAGTCAGTCAAGTGGATGGCATGAAGTGGAGCCAGGAATGCCATCTCCAAC  962
            |||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||..||||||||||||.
Sbjct  889  CAAGGGCGCTCCCCAGGGAGTGGCAGCCAGTCCAGTGGATGGCATGAAGTAGAGCCAGGCTTGCCATCTCCAAG  962

Query  963  CACACTGAAGAAGTCGGAGAAGTCTGGTTTCAGCAGCCCCTCCCCTTCTCAGACCTCCTCCCTGGGAACGGCGT  1036
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct  963  CACACTGAAGAAGTCTGAGAAGTCTGGTTTCAGCAGCCCCTCCCCTTCGCAGACCTCCTCCCTGGGAACAGCAT  1036

Query 1037  TCACACAGCATCACCGACCTGTCATTACAGGACCCAGAGCAAGTCCGCATGCAACACCATCGACTCTTCATTTC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.||.
Sbjct 1037  TCACACAGCATCACCGACCTGTCATTACAGGACCCAGAGCAAGTCCACATGCGACGCCATCGACTCTCCACTTT  1110

Query 1111  CCGACATCACCCATTATCCAGCAGCCTGGGCCTTACTTCTCACACCCAGCCATCCGCTATCACCCTCAGGAGAC  1184
            ||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 1111  CCAACGTCACCCATCATCCAGCAGCCTGGGCCTTACTTCTCACACCCAGCCATCCGTTACCACCCTCAGGAGAC  1184

Query 1185  GCTGAAAGAATTTGTCCAACTTGTCTGCCCTGATGCTGGTCAGCAGGCTGGACAGGTGGGGTTCCTCAATCCCA  1258
            |||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GCTGAAAGAGTTTGTCCAACTTGTCTGTCCTGATGCTGGTCAGCAAGCTGGACAGGTGGGGTTCCTCAATCCCA  1258

Query 1259  ATGGGAGCAGCCAAGGCAAGGTGCACAACCCATTCCTTCCCACCCCAATGTTGCCACCGCCACCGCCACCACCG  1332
            ||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||
Sbjct 1259  ATGGAAGCAGTCAAGGCAAGGTGCACAACCCATTCCTCCCCACCCCAATGTTGCCGCCGCCGCCACCACCACCG  1332

Query 1333  ATGGCCAGGCCTGTGCCTCTGCCGGTGCCAGACACAAAGCCTCCAACCACGTCAACAGAAGGAGGTGCAGCCTC  1406
            |||||||||||||||||||||||..||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ATGGCCAGGCCTGTGCCTCTGCCCATGCCAGACACCAAGCCTCCAACCACATCAACAGAAGGAGGTGCAGCCTC  1406

Query 1407  CCCCACGTCACCAATCCT-----------GGTACCT---------------------------------GGGAT  1436
            ||||||.|||||.| |||           .|.||||                                 |||||
Sbjct 1407  CCCCACCTCACCGA-CCTACTCGACACCCAGCACCTCCCCCGCAAACCGATTCGTCAGTGTTGGACCACGGGAT  1479

Query 1437  AAAAG--TTGCAGCGTCCCACCATCCACCAGACAGAC-CACCCCT----CCCCTTCTCAACTCTG---  1494
            ..|||  |||.|       |..||||..|| |||||| ||..|||    |            |||   
Sbjct 1480  CCAAGCTTTGTA-------AATATCCCTCA-ACAGACACAGTCCTGGTAC------------CTGGGA  1527