Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14712
- Subject:
- XM_006502842.3
- Aligned Length:
- 1549
- Identities:
- 1346
- Gaps:
- 101
Alignment
Query 1 ATGTATTCTCCGCTCTGTCTCACCCA-GGATGAATTTCATCCTTTCATCGAAGCACTTCTGCCCCACGTCCGAG 73
| ||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 1 -------------------------ATGGATGAGTTTCATCCTTTCATTGAAGCACTTCTGCCCCATGTCCGCG 49
Query 74 CCTTTGCCTACACATGGTTCAACCTGCAGGCCCGAAAACGAAAATACTTCAAAAAACATGAAAAGCGTATGTCA 147
||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.
Sbjct 50 CCTTCGCCTACACATGGTTCAACCTGCAGGCCCGAAAGCGGAAATACTTCAAAAAACATGAGAAGCGCATGTCG 123
Query 148 AAAGAAGAAGAGAGAGCCGTGAAGGATGAATTGCTAAGTGAAAAACCAGAGGTCAAGCAGAAGTGGGCATCTCG 221
||||||||.|||||.|||||||||||||||.|||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 124 AAAGAAGAGGAGAGGGCCGTGAAGGATGAACTGCTAAGCGAGAAGCCCGAGGTCAAGCAGAAGTGGGCTTCCCG 197
Query 222 ACTTCTGGCAAAGTTGCGGAAAGATATCCGACCCGAATATCGAGAGGATTTTGTTCTTACAGTTACAGGGAAAA 295
|||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 198 ACTTCTGGCCAAGTTACGGAAAGATATCCGACCCGAGTACCGAGAGGATTTTGTTCTTACAGTTACAGGGAAAA 271
Query 296 AACCTCCATGTTGTGTTCTTTCCAACCCAGACCAGAAAGGCAAGATGCGAAGAATTGACTGCCTCCGCCAGGCA 369
||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 272 AACCTCCATGCTGTGTTCTTTCCAACCCTGATCAGAAAGGCAAGATGCGGAGAATTGACTGCCTCCGCCAGGCA 345
Query 370 GATAAAGTCTGGAGGTTGGACCTTGTTATGGTGATTTTGTTTAAAGGTATTCCGCTGGAAAGTACTGATGGCGA 443
||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 346 GATAAAGTATGGAGGTTGGACCTCGTCATGGTGATCTTGTTCAAAGGTATTCCGCTGGAAAGTACTGATGGCGA 419
Query 444 GCGCCTTGTAAAGTCCCCACAATGCTCTAATCCAGGGCTCTGTGTCCAACCCCATCACATAGGGGTTTCTGTTA 517
|||||||||||||...|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 420 GCGCCTTGTAAAGAGTCCACAGTGCTCTAATCCAGGGCTCTGTGTCCAGCCCCATCACATAGGGGTTTCTGTAA 493
Query 518 AGGAACTCGATTTATATTTGGCATACTTTGTGCATGCAGCAGATTCAAGTCAATCTGAAAGTCCCAGCCAGCCA 591
|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 494 AGGAACTCGATTTATATTTGGCATACTTTGTACATGCAGCAGATTCAAGTCAATCTGAAAGTCCCAGCCAGCCA 567
Query 592 AGTGACGCTGACATTAAGGACCAGCCAGAAAATGGACATTTGGGCTTCCAGGACAGTTTTGTCACATCAGGTGT 665
|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 568 AGTGAAGCTGACATTAAGGACCAGCCAGAAAATGGACATTTGGGCTTCCAGGACAGCTTTGTCACATCAGGTGT 641
Query 666 TTTTAGTGTCACTGAGCTAGTAAGAGTGTCACAGACACCAATAGCTGCAGGAACTGGCCCAAATTTTTCTCTCT 739
|||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 642 TTTCAGTGTGACTGAGCTAGTAAGAGTGTCACAAACACCAATAGCTGCAGGAACCGGCCCCAATTTTTCTCTCT 715
Query 740 CAGATTTGGAAAGTTCTTCATACTACAGCATGAGTCCAGGAGCAATGAGGAGGTCTTTACCCAGCACATCCTCT 813
|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||
Sbjct 716 CTGATTTGGAAAGTTCTTCATACTACAGCATGAGTCCAGGAGCAATGAGGAGGTCTCTGCCCAGCACATCCTCT 789
Query 814 ACGAGCTCCACAAAGCGCCTCAAGTCTGTGGAGGATGAAATGGACAGTCCTGGTGAGGAGCCATTTTATACAGG 887
||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||
Sbjct 790 ACCAGCTCTACAAAGCGCCTCAAGTCTGTGGAGGATGAAATGGACAGTCCTGGTGAAGAACCATTTTACACAGG 863
Query 888 CCAAGGGCGCTCCCCAGGAAGTGGCAGTCAGTCAAGTGGATGGCATGAAGTGGAGCCAGGAATGCCATCTCCAA 961
||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||..||||||||||||
Sbjct 864 CCAAGGGCGCTCCCCAGGGAGTGGCAGCCAGTCCAGTGGATGGCATGAAGTAGAGCCAGGCTTGCCATCTCCAA 937
Query 962 CCACACTGAAGAAGTCGGAGAAGTCTGGTTTCAGCAGCCCCTCCCCTTCTCAGACCTCCTCCCTGGGAACGGCG 1035
.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 938 GCACACTGAAGAAGTCTGAGAAGTCTGGTTTCAGCAGCCCCTCCCCTTCGCAGACCTCCTCCCTGGGAACAGCA 1011
Query 1036 TTCACACAGCATCACCGACCTGTCATTACAGGACCCAGAGCAAGTCCGCATGCAACACCATCGACTCTTCATTT 1109
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.||
Sbjct 1012 TTCACACAGCATCACCGACCTGTCATTACAGGACCCAGAGCAAGTCCACATGCGACGCCATCGACTCTCCACTT 1085
Query 1110 CCCGACATCACCCATTATCCAGCAGCCTGGGCCTTACTTCTCACACCCAGCCATCCGCTATCACCCTCAGGAGA 1183
.||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct 1086 TCCAACGTCACCCATCATCCAGCAGCCTGGGCCTTACTTCTCACACCCAGCCATCCGTTACCACCCTCAGGAGA 1159
Query 1184 CGCTGAAAGAATTTGTCCAACTTGTCTGCCCTGATGCTGGTCAGCAGGCTGGACAGGTGGGGTTCCTCAATCCC 1257
||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1160 CGCTGAAAGAGTTTGTCCAACTTGTCTGTCCTGATGCTGGTCAGCAAGCTGGACAGGTGGGGTTCCTCAATCCC 1233
Query 1258 AATGGGAGCAGCCAAGGCAAGGTGCACAACCCATTCCTTCCCACCCCAATGTTGCCACCGCCACCGCCACCACC 1331
|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||
Sbjct 1234 AATGGAAGCAGTCAAGGCAAGGTGCACAACCCATTCCTCCCCACCCCAATGTTGCCGCCGCCGCCACCACCACC 1307
Query 1332 GATGGCCAGGCCTGTGCCTCTGCCGGTGCCAGACACAAAGCCTCCAACCACGTCAACAGAAGGAGGTGCAGCCT 1405
||||||||||||||||||||||||..||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1308 GATGGCCAGGCCTGTGCCTCTGCCCATGCCAGACACCAAGCCTCCAACCACATCAACAGAAGGAGGTGCAGCCT 1381
Query 1406 CCCCCACGTCACCAATCCT-----------GGTACCT---------------------------------GGGA 1435
|||||||.|||||.| ||| .|.|||| ||||
Sbjct 1382 CCCCCACCTCACCGA-CCTACTCGACACCCAGCACCTCCCCCGCAAACCGATTCGTCAGTGTTGGACCACGGGA 1454
Query 1436 TAAAAG--TTGCAGCGTCCCACCATCCACCAGACAGAC-CACCCCT----CCCCTTCTCAACTCTG--- 1494
|..||| |||.| |..||||..|| |||||| ||..||| | |||
Sbjct 1455 TCCAAGCTTTGTA-------AATATCCCTCA-ACAGACACAGTCCTGGTAC------------CTGGGA 1503