Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14712
- Subject:
- XM_006502844.3
- Aligned Length:
- 1617
- Identities:
- 1240
- Gaps:
- 273
Alignment
Query 1 ------------------------------------------------ATGTATTCTCCGCTCTG--------T 18
||..|.|..|.|||.|| |
Sbjct 1 ATGAAGCTTGCTGACAGCGTAATGGCAGGGAAAGCTTCCGACGGCTCCATCAAATGGCAGCTTTGCTACGACAT 74
Query 19 CTCACCCA-------------GGATGAATTTCATCCTTTCATCGAAGCACTTCTGCCCCACGTCCGAGCCTTTG 79
|||..||| ||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|
Sbjct 75 CTCGGCCAGAACTTGGTGGATGGATGAGTTTCATCCTTTCATTGAAGCACTTCTGCCCCATGTCCGCGCCTTCG 148
Query 80 CCTACACATGGTTCAACCTGCAGGCCCGAAAACGAAAATACTTCAAAAAACATGAAAAGCGTATGTCAAAAGAA 153
|||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||
Sbjct 149 CCTACACATGGTTCAACCTGCAGGCCCGAAAGCGGAAATACTTCAAAAAACATGAGAAGCGCATGTCGAAAGAA 222
Query 154 GAAGAGAGAGCCGTGAAGGATGAATTGCTAAGTGAAAAACCAGAGGTCAAGCAGAAGTGGGCATCTCGACTTCT 227
||.|||||.|||||||||||||||.|||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct 223 GAGGAGAGGGCCGTGAAGGATGAACTGCTAAGCGAGAAGCCCGAGGTCAAGCAGAAGTGGGCTTCCCGACTTCT 296
Query 228 GGCAAAGTTGCGGAAAGATATCCGACCCGAATATCGAGAGGATTTTGTTCTTACAGTTACAGGGAAAAAACCTC 301
|||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGCCAAGTTACGGAAAGATATCCGACCCGAGTACCGAGAGGATTTTGTTCTTACAGTTACAGGGAAAAAACCTC 370
Query 302 CATGTTGTGTTCTTTCCAACCCAGACCAGAAAGGCAAGATGCGAAGAATTGACTGCCTCCGCCAGGCAGATAAA 375
||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CATGCTGTGTTCTTTCCAACCCTGATCAGAAAGGCAAGATGCGGAGAATTGACTGCCTCCGCCAGGCAGATAAA 444
Query 376 GTCTGGAGGTTGGACCTTGTTATGGTGATTTTGTTTAAAGGTATTCCGCTGGAAAGTACTGATGGCGAGCGCCT 449
||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GTATGGAGGTTGGACCTCGTCATGGTGATCTTGTTCAAAGGTATTCCGCTGGAAAGTACTGATGGCGAGCGCCT 518
Query 450 TGTAAAGTCCCCACAATGCTCTAATCCAGGGCTCTGTGTCCAACCCCATCACATAGGGGTTTCTGTTAAGGAAC 523
|||||||...|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 519 TGTAAAGAGTCCACAGTGCTCTAATCCAGGGCTCTGTGTCCAGCCCCATCACATAGGGGTTTCTGTAAAGGAAC 592
Query 524 TCGATTTATATTTGGCATACTTTGTGCATGCAGCAGATTCAAGTCAATCTGAAAGTCCCAGCCAGCCAAGTGAC 597
|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 593 TCGATTTATATTTGGCATACTTTGTACATGCAGCAGATTCAAGTCAATCTGAAAGTCCCAGCCAGCCAAGTGAA 666
Query 598 GCTGACATTAAGGACCAGCCAGAAAATGGACATTTGGGCTTCCAGGACAGTTTTGTCACATCAGGTGTTTTTAG 671
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct 667 GCTGACATTAAGGACCAGCCAGAAAATGGACATTTGGGCTTCCAGGACAGCTTTGTCACATCAGGTGTTTTCAG 740
Query 672 TGTCACTGAGCTAGTAAGAGTGTCACAGACACCAATAGCTGCAGGAACTGGCCCAAATTTTTCTCTCTCAGATT 745
|||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 741 TGTGACTGAGCTAGTAAGAGTGTCACAAACACCAATAGCTGCAGGAACCGGCCCCAATTTTTCTCTCTCTGATT 814
Query 746 TGGAAAGTTCTTCATACTACAGCATGAGTCCAGGAGCAATGAGGAGGTCTTTACCCAGCACATCCTCTACGAGC 819
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 815 TGGAAAGTTCTTCATACTACAGCATGAGTCCAGGAGCAATGAGGAGGTCTCTGCCCAGCACATCCTCTACCAGC 888
Query 820 TCCACAAAGCGCCTCAAGTCTGTGGAGGATGAAATGGACAGTCCTGGTGAGGAGCCATTTTATACAGGCCAAGG 893
||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 889 TCTACAAAGCGCCTCAAGTCTGTGGAGGATGAAATGGACAGTCCTGGTGAAGAACCATTTTACACAGGCCAAGG 962
Query 894 GCGCTCCCCAGGAAGTGGCAGTCAGTCAAGTGGATGGCATGAAGTGGAGCCAGGAATGCCATCTCCAACCACAC 967
||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 963 GCGCTCCCCAGGGAGTGGCAGCCAGTCCAGTGGATGGCATGAAGTAGAGCC----------------------- 1013
Query 968 TGAAGAAGTCGGAGAAGTCTGGTTTCAGCAGCCCCTCCCCTTCTCAGACCTCCTCCCTGGGAACGGCGTTCACA 1041
Sbjct 1014 -------------------------------------------------------------------------- 1013
Query 1042 CAGCATCACCGACCTGTCATTACAGGACCCAGAGCAAGTCCGCATGCAACACCATCGACTCTTCATTTCCCGAC 1115
|||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.||.||.||
Sbjct 1014 --------------------------------AGCAAGTCCACATGCGACGCCATCGACTCTCCACTTTCCAAC 1055
Query 1116 ATCACCCATTATCCAGCAGCCTGGGCCTTACTTCTCACACCCAGCCATCCGCTATCACCCTCAGGAGACGCTGA 1189
.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1056 GTCACCCATCATCCAGCAGCCTGGGCCTTACTTCTCACACCCAGCCATCCGTTACCACCCTCAGGAGACGCTGA 1129
Query 1190 AAGAATTTGTCCAACTTGTCTGCCCTGATGCTGGTCAGCAGGCTGGACAGGTGGGGTTCCTCAATCCCAATGGG 1263
||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1130 AAGAGTTTGTCCAACTTGTCTGTCCTGATGCTGGTCAGCAAGCTGGACAGGTGGGGTTCCTCAATCCCAATGGA 1203
Query 1264 AGCAGCCAAGGCAAGGTGCACAACCCATTCCTTCCCACCCCAATGTTGCCACCGCCACCGCCACCACCGATGGC 1337
|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||
Sbjct 1204 AGCAGTCAAGGCAAGGTGCACAACCCATTCCTCCCCACCCCAATGTTGCCGCCGCCGCCACCACCACCGATGGC 1277
Query 1338 CAGGCCTGTGCCTCTGCCGGTGCCAGACACAAAGCCTCCAACCACGTCAACAGAAGGAGGTGCAGCCTCCCCCA 1411
||||||||||||||||||..||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1278 CAGGCCTGTGCCTCTGCCCATGCCAGACACCAAGCCTCCAACCACATCAACAGAAGGAGGTGCAGCCTCCCCCA 1351
Query 1412 CGTCACCAATCCT-----------GGTACCT---------------------------------GGGATAAAAG 1441
|.|||||.| ||| .|.|||| |||||..|||
Sbjct 1352 CCTCACCGA-CCTACTCGACACCCAGCACCTCCCCCGCAAACCGATTCGTCAGTGTTGGACCACGGGATCCAAG 1424
Query 1442 --TTGCAGCGTCCCACCATCCACCAGACAGAC-CACCCCT----CCCCTTCTCAACTCTG--- 1494
|||.| |..||||..|| |||||| ||..||| | |||
Sbjct 1425 CTTTGTA-------AATATCCCTCA-ACAGACACAGTCCTGGTAC------------CTGGGA 1467