Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14712
• Subject: XM_006502845.2
• Aligned Length: 1494
• Identities: 1276
• Gaps: 129

Alignment

Query    1  ATGTATTCTCCGCTCTGTCTCACCCAGGATGAATTTCATCCTTTCATCGAAGCACTTCTGCCCCACGTCCGAGC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct    1  ATGTATTCTCCGCTCTGTCTCACCCAGGATGAGTTTCATCCTTTCATTGAAGCACTTCTGCCCCATGTCCGCGC  74

Query   75  CTTTGCCTACACATGGTTCAACCTGCAGGCCCGAAAACGAAAATACTTCAAAAAACATGAAAAGCGTATGTCAA  148
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|
Sbjct   75  CTTCGCCTACACATGGTTCAACCTGCAGGCCCGAAAGCGGAAATACTTCAAAAAACATGAGAAGCGCATGTCGA  148

Query  149  AAGAAGAAGAGAGAGCCGTGAAGGATGAATTGCTAAGTGAAAAACCAGAGGTCAAGCAGAAGTGGGCATCTCGA  222
            |||||||.|||||.|||||||||||||||.|||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct  149  AAGAAGAGGAGAGGGCCGTGAAGGATGAACTGCTAAGCGAGAAGCCCGAGGTCAAGCAGAAGTGGGCTTCCCGA  222

Query  223  CTTCTGGCAAAGTTGCGGAAAGATATCCGACCCGAATATCGAGAGGATTTTGTTCTTACAGTTACAGGGAAAAA  296
            ||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTTCTGGCCAAGTTACGGAAAGATATCCGACCCGAGTACCGAGAGGATTTTGTTCTTACAGTTACAGGGAAAAA  296

Query  297  ACCTCCATGTTGTGTTCTTTCCAACCCAGACCAGAAAGGCAAGATGCGAAGAATTGACTGCCTCCGCCAGGCAG  370
            |||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ACCTCCATGCTGTGTTCTTTCCAACCCTGATCAGAAAGGCAAGATGCGGAGAATTGACTGCCTCCGCCAGGCAG  370

Query  371  ATAAAGTCTGGAGGTTGGACCTTGTTATGGTGATTTTGTTTAAAGGTATTCCGCTGGAAAGTACTGATGGCGAG  444
            |||||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATAAAGTATGGAGGTTGGACCTCGTCATGGTGATCTTGTTCAAAGGTATTCCGCTGGAAAGTACTGATGGCGAG  444

Query  445  CGCCTTGTAAAGTCCCCACAATGCTCTAATCCAGGGCTCTGTGTCCAACCCCATCACATAGGGGTTTCTGTTAA  518
            ||||||||||||...|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  445  CGCCTTGTAAAGAGTCCACAGTGCTCTAATCCAGGGCTCTGTGTCCAGCCCCATCACATAGGGGTTTCTGTAAA  518

Query  519  GGAACTCGATTTATATTTGGCATACTTTGTGCATGCAGCAGATTCAAGTCAATCTGAAAGTCCCAGCCAGCCAA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGAACTCGATTTATATTTGGCATACTTTGTACATGCAGCAGATTCAAGTCAATCTGAAAGTCCCAGCCAGCCAA  592

Query  593  GTGACGCTGACATTAAGGACCAGCCAGAAAATGGACATTTGGGCTTCCAGGACAGTTTTGTCACATCAGGTGTT  666
            ||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  593  GTGAAGCTGACATTAAGGACCAGCCAGAAAATGGACATTTGGGCTTCCAGGACAGCTTTGTCACATCAGGTGTT  666

Query  667  TTTAGTGTCACTGAGCTAGTAAGAGTGTCACAGACACCAATAGCTGCAGGAACTGGCCCAAATTTTTCTCTCTC  740
            ||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct  667  TTCAGTGTGACTGAGCTAGTAAGAGTGTCACAAACACCAATAGCTGCAGGAACCGGCCCCAATTTTTCTCTCTC  740

Query  741  AGATTTGGAAAGTTCTTCATACTACAGCATGAGTCCAGGAGCAATGAGGAGGTCTTTACCCAGCACATCCTCTA  814
            .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||
Sbjct  741  TGATTTGGAAAGTTCTTCATACTACAGCATGAGTCCAGGAGCAATGAGGAGGTCTCTGCCCAGCACATCCTCTA  814

Query  815  CGAGCTCCACAAAGCGCCTCAAGTCTGTGGAGGATGAAATGGACAGTCCTGGTGAGGAGCCATTTTATACAGGC  888
            |.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||
Sbjct  815  CCAGCTCTACAAAGCGCCTCAAGTCTGTGGAGGATGAAATGGACAGTCCTGGTGAAGAACCATTTTACACAGGC  888

Query  889  CAAGGGCGCTCCCCAGGAAGTGGCAGTCAGTCAAGTGGATGGCATGAAGTGGAGCCAGGAATGCCATCTCCAAC  962
            |||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||                  
Sbjct  889  CAAGGGCGCTCCCCAGGGAGTGGCAGCCAGTCCAGTGGATGGCATGAAGTAGAGCC------------------  944

Query  963  CACACTGAAGAAGTCGGAGAAGTCTGGTTTCAGCAGCCCCTCCCCTTCTCAGACCTCCTCCCTGGGAACGGCGT  1036
                                                                                      
Sbjct  945  --------------------------------------------------------------------------  944

Query 1037  TCACACAGCATCACCGACCTGTCATTACAGGACCCAGAGCAAGTCCGCATGCAACACCATCGACTCTTCATTTC  1110
                                                 |||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.||.
Sbjct  945  -------------------------------------AGCAAGTCCACATGCGACGCCATCGACTCTCCACTTT  981

Query 1111  CCGACATCACCCATTATCCAGCAGCCTGGGCCTTACTTCTCACACCCAGCCATCCGCTATCACCCTCAGGAGAC  1184
            ||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct  982  CCAACGTCACCCATCATCCAGCAGCCTGGGCCTTACTTCTCACACCCAGCCATCCGTTACCACCCTCAGGAGAC  1055

Query 1185  GCTGAAAGAATTTGTCCAACTTGTCTGCCCTGATGCTGGTCAGCAGGCTGGACAGGTGGGGTTCCTCAATCCCA  1258
            |||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1056  GCTGAAAGAGTTTGTCCAACTTGTCTGTCCTGATGCTGGTCAGCAAGCTGGACAGGTGGGGTTCCTCAATCCCA  1129

Query 1259  ATGGGAGCAGCCAAGGCAAGGTGCACAACCCATTCCTTCCCACCCCAATGTTGCCACCGCCACCGCCACCACCG  1332
            ||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||
Sbjct 1130  ATGGAAGCAGTCAAGGCAAGGTGCACAACCCATTCCTCCCCACCCCAATGTTGCCGCCGCCGCCACCACCACCG  1203

Query 1333  ATGGCCAGGCCTGTGCCTCTGCCGGTGCCAGACACAAAGCCTCCAACCACGTCAACAGAAGGAGGTGCAGCCTC  1406
            |||||||||||||||||||||||..||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1204  ATGGCCAGGCCTGTGCCTCTGCCCATGCCAGACACCAAGCCTCCAACCACATCAACAGAAGGAGGTGCAGCCTC  1277

Query 1407  CCCCACGTCACCAATCCTGGTACCTGGGATAAAAGTTGCAGCGTCCCACCATCCACCAGACAGACCACCCCTCC  1480
            ||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||...||
Sbjct 1278  CCCCACCTCACCGATCCTGGTACCTGGGATAAAAGTTGCAGCATCCCACCATCCTCCAGACAGACCACCTGACC  1351

Query 1481  CCTTCTCAACTCTG  1494
            ||||||||||||||
Sbjct 1352  CCTTCTCAACTCTG  1365