Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14712
• Subject: XM_011541514.3
• Aligned Length: 1603
• Identities: 1436
• Gaps: 155

Alignment

Query    1  ATGTATTCTCCGCTCTGTCTCACCCA-GGATGAATTTCATCCTTTCATCGAAGCACTTCTGCCCCACGTCCGAG  73
                                     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -------------------------ATGGATGAATTTCATCCTTTCATCGAAGCACTTCTGCCCCACGTCCGAG  49

Query   74  CCTTTGCCTACACATGGTTCAACCTGCAGGCCCGAAAACGAAAATACTTCAAAAAACATGAAAAGCGTATGTCA  147
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   50  CCTTTGCCTACACATGGTTCAACCTGCAGGCCCGAAAACGAAAATACTTCAAAAAACATGAAAAGCGTATGTCA  123

Query  148  AAAGAAGAAGAGAGAGCCGTGAAGGATGAATTGCTAAGTGAAAAACCAGAGGTCAAGCAGAAGTGGGCATCTCG  221
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  124  AAAGAAGAAGAGAGAGCCGTGAAGGATGAATTGCTAAGTGAAAAACCAGAGGTCAAGCAGAAGTGGGCATCTCG  197

Query  222  ACTTCTGGCAAAGTTGCGGAAAGATATCCGACCCGAATATCGAGAGGATTTTGTTCTTACAGTTACAGGGAAAA  295
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  198  ACTTCTGGCAAAGTTGCGGAAAGATATCCGACCCGAATATCGAGAGGATTTTGTTCTTACAGTTACAGGGAAAA  271

Query  296  AACCTCCATGTTGTGTTCTTTCCAACCCAGACCAGAAAGGCAAGATGCGAAGAATTGACTGCCTCCGCCAGGCA  369
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  272  AACCTCCATGTTGTGTTCTTTCCAACCCAGACCAGAAAGGCAAGATGCGAAGAATTGACTGCCTCCGCCAGGCA  345

Query  370  GATAAAGTCTGGAGGTTGGACCTTGTTATGGTGATTTTGTTTAAAGGTATTCCGCTGGAAAGTACTGATGGCGA  443
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  346  GATAAAGTCTGGAGGTTGGACCTTGTTATGGTGATTTTGTTTAAAGGTATTCCGCTGGAAAGTACTGATGGCGA  419

Query  444  GCGCCTTGTAAAGTCCCCACAATGCTCTAATCCAGGGCTCTGTGTCCAACCCCATCACATAGGGGTTTCTGTTA  517
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  420  GCGCCTTGTAAAGTCCCCACAATGCTCTAATCCAGGGCTCTGTGTCCAACCCCATCACATAGGGGTTTCTGTTA  493

Query  518  AGGAACTCGATTTATATTTGGCATACTTTGTGCATGCAGCAGATTCAAGTCAATCTGAAAGTCCCAGCCAGCCA  591
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  494  AGGAACTCGATTTATATTTGGCATACTTTGTGCATGCAGCAGATTCAAGTCAATCTGAAAGTCCCAGCCAGCCA  567

Query  592  AGTGACGCTGACATTAAGGACCAGCCAGAAAATGGACATTTGGGCTTCCAGGACAGTTTTGTCACATCAGGTGT  665
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  568  AGTGACGCTGACATTAAGGACCAGCCAGAAAATGGACATTTGGGCTTCCAGGACAGTTTTGTCACATCAGGTGT  641

Query  666  TTTTAGTGTCACTGAGCTAGTAAGAGTGTCACAGACACCAATAGCTGCAGGAACTGGCCCAAATTTTTCTCTCT  739
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  642  TTTTAGTGTCACTGAGCTAGTAAGAGTGTCACAGACACCAATAGCTGCAGGAACTGGCCCAAATTTTTCTCTCT  715

Query  740  CAGATTTGGAAAGTTCTTCATACTACAGCATGAGTCCAGGAGCAATGAGGAGGTCTTTACCCAGCACATCCTCT  813
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  716  CAGATTTGGAAAGTTCTTCATACTACAGCATGAGTCCAGGAGCAATGAGGAGGTCTTTACCCAGCACATCCTCT  789

Query  814  ACGAGCTCCACAAAGCGCCTCAAGTCTGTGGAGGATGAAATGGACAGTCCTGGTGAGGAGCCATTTTATACAGG  887
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  790  ACGAGCTCCACAAAGCGCCTCAAGTCTGTGGAGGATGAAATGGACAGTCCTGGTGAGGAGCCATTTTATACAGG  863

Query  888  CCAAGGGCGCTCCCCAGGAAGTGGCAGTCAGTCAAGTGGATGGCATGAAGTGGAGCCAGGAATGCCATCTCCAA  961
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  864  CCAAGGGCGCTCCCCAGGAAGTGGCAGTCAGTCAAGTGGATGGCATGAAGTGGAGCCAGGAATGCCATCTCCAA  937

Query  962  CCACACTGAAGAAGTCGGAGAAGTCTGGTTTCAGCAGCCCCTCCCCTTCTCAGACCTCCTCCCTGGGAACGGCG  1035
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  938  CCACACTGAAGAAGTCGGAGAAGTCTGGTTTCAGCAGCCCCTCCCCTTCACAGACCTCCTCCCTGGGAACGGCG  1011

Query 1036  TTCACACAGCATCACCGACCTGTCATTACAGGACCCAG------------------------------------  1073
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                    
Sbjct 1012  TTCACACAGCATCACCGACCTGTCATTACAGGACCCAGAGAATTCAAGATGGCTCCCAGCATCCTCGGCTCTCC  1085

Query 1074  ------------------AGCAAGTCCGCATGCAACACCATCGACTCTTCATTTCCCGACATCACCCATTATCC  1129
                              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1086  TTTCTGGAAAGTCTACTCAGCAAGTCCGCATGCAACACCATCGACTCTTCATTTCCCGACATCACCCATTATCC  1159

Query 1130  AGCAGCCTGGGCCTTACTTCTCACACCCAGCCATCCGCTATCACCCTCAGGAGACGCTGAAAGAATTTGTCCAA  1203
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1160  AGCAGCCTGGGCCTTACTTCTCACACCCAGCCATCCGCTATCACCCTCAGGAGACGCTGAAAGAATTTGTCCAA  1233

Query 1204  CTTGTCTGCCCTGATGCTGGTCAGCAGGCTGGACAGGTGGGGTTCCTCAATCCCAATGGGAGCAGCCAAGGCAA  1277
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1234  CTTGTCTGCCCTGATGCTGGTCAGCAGGCTGGACAGGTGGGGTTCCTCAATCCCAATGGGAGCAGCCAAGGCAA  1307

Query 1278  GGTGCACAACCCATTCCTTCCCACCCCAATGTTGCCACCGCCACCGCCACCACCGATGGCCAGGCCTGTGCCTC  1351
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1308  GGTGCACAACCCATTCCTTCCCACCCCAATGTTGCCACCGCCACCGCCACCACCGATGGCCAGGCCTGTGCCTC  1381

Query 1352  TGCCGGTGCCAGACACAAAGCCTCCAACCACGTCAACAGAAGGAGGTGCAGCCTCCCCCACGTCACCAATCCT-  1424
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| 
Sbjct 1382  TGCCGGTGCCAGACACAAAGCCTCCAACCACGTCAACAGAAGGAGGTGCAGCCTCCCCCACGTCACCAA-CCTA  1454

Query 1425  ----------GGTACCT---------------------------------GGGATAAAAG--TTGCAGCGTCCC  1453
                      .|.||||                                 |||||..|||  |||.|       
Sbjct 1455  CTCGACACCCAGCACCTCCCCCGCAAACCGATTCGTCAGTGTTGGACCACGGGATCCAAGCTTTGTA-------  1521

Query 1454  ACCATCCACCAGACAGAC-CACCCCT----CCCCTTCTCAACTCTG---  1494
            |..||||..|| |||||| ||..|||    |            |||   
Sbjct 1522  AATATCCCTCA-ACAGACACAGTCCTGGTAC------------CTGGGA  1557