Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14721
- Subject:
- NM_001282961.1
- Aligned Length:
- 2469
- Identities:
- 2162
- Gaps:
- 9
Alignment
Query 1 ATGTCGTCCTGGATAAGGTGGCATGGACCCGCCATGGCGCGGCTCTGGGGCTTCTGCTGGCTGGTTGTGGGCTT 74
||||||.|||||.|.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||..||||||..|||||||
Sbjct 1 ATGTCGCCCTGGCTGAAGTGGCATGGACCCGCCATGGCGCGGCTCTGGGGCTTATGCCTGCTGGTCTTGGGCTT 74
Query 75 CTGGAGGGCCGCTTTCGCCTGTCCCACGTCCTGCAAATGCAGTGCCTCTCGGATCTGGTGCAGCGACCCTTCTC 148
||||||||||.||.|||||||.||.||||||||||||||||||.||.||.||||.|||||.|..||.|||||||
Sbjct 75 CTGGAGGGCCTCTCTCGCCTGCCCGACGTCCTGCAAATGCAGTTCCGCTAGGATTTGGTGTACTGAGCCTTCTC 148
Query 149 CTGGCATCGTGGCATTTCCGAGATTGGAGCCTAACAGTGTAGATCCTGAGAACATCACCGAAATTTTCATCGCA 222
|.||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.||.||.|||||||||||.||||||.||||.|||
Sbjct 149 CAGGCATCGTGGCATTCCCGAGGTTGGAACCTAACAGCGTTGACCCGGAGAACATCACGGAAATTCTCATTGCA 222
Query 223 AACCAGAAAAGGTTAGAAATCATCAACGAAGATGATGTTGAAGCTTATGTGGGACTGAGAAATCTGACAATTGT 296
||||||||||||.|||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||
Sbjct 223 AACCAGAAAAGGCTAGAAATCATCAATGAAGATGACGTTGAAGCTTACGTGGGGCTGAGAAACCTTACAATTGT 296
Query 297 GGATTCTGGATTAAAATTTGTGGCTCATAAAGCATTTCTGAAAAACAGCAACCTGCAGCACATCAATTTTACCC 370
||||||.||.|||||.|||||||||.|.|||||.||||||||||||||||||||||.||||||.|||||.||.|
Sbjct 297 GGATTCCGGCTTAAAGTTTGTGGCTTACAAAGCGTTTCTGAAAAACAGCAACCTGCGGCACATAAATTTCACAC 370
Query 371 GAAACAAACTGACGAGTTTGTCTAGGAAACATTTCCGTCACCTTGACTTGTCTGAACTGATCCTGGTGGGCAAT 444
|||||||.||||||||||||||.||||.|||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||..|||.|||
Sbjct 371 GAAACAAGCTGACGAGTTTGTCCAGGAGACATTTCCGCCACCTTGACTTGTCTGACCTGATCCTGACGGGTAAT 444
Query 445 CCATTTACATGCTCCTGTGACATTATGTGGATCAAGACTCTCCAAGAGGCTAAATCCAGTCCAGACACTCAGGA 518
||.||.||.||||||||.|||||.||||||.|||||||||||||.|||.||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 445 CCGTTCACGTGCTCCTGCGACATCATGTGGCTCAAGACTCTCCAGGAGACTAAATCCAGCCCCGACACTCAGGA 518
Query 519 TTTGTACTGCCTGAATGAAAGCAGCAAGAATATTCCCCTGGCAAACCTGCAGATACCCAATTGTGGTTTGCCAT 592
||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 519 TTTGTACTGCCTCAATGAGAGCAGCAAGAACATGCCCCTGGCGAACCTGCAGATACCCAATTGTGGTCTGCCAT 592
Query 593 CTGCAAATCTGGCCGCACCTAACCTCACTGTGGAGGAAGGAAAGTCTATCACATTATCCTGTAGTGTGGCAGGT 666
|||||..||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||.|.||..|.|||||.|||||||..|||
Sbjct 593 CTGCACGTCTGGCTGCTCCTAACCTCACCGTGGAGGAAGGAAAGTCTGTGACCCTTTCCTGCAGTGTGGGGGGT 666
Query 667 GATCCGGTTCCTAATATGTATTGGGATGTTGGTAACCTGGTTTCCAAACATATGAATGAAACAAGCCACACACA 740
||.||..|.||.|...||||.|||||.|||||.||..||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GACCCACTCCCCACCTTGTACTGGGACGTTGGGAATTTGGTTTCCAAGCACATGAATGAAACAAGCCACACACA 740
Query 741 GGGCTCCTTAAGGATAACTAACATTTCATCCGATGACAGTGGGAAGCAGATCTCTTGTGTGGCGGAAAATCTTG 814
||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct 741 GGGCTCCTTAAGGATAACGAACATTTCATCTGATGACAGTGGAAAGCAAATCTCTTGTGTGGCAGAAAACCTTG 814
Query 815 TAGGAGAAGATCAAGATTCTGTCAACCTCACTGTGCATTTTGCACCAACTATCACATTTCTCGAATCTCCAACC 888
||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 815 TAGGAGAAGATCAAGATTCTGTGAACCTCACTGTGCATTTTGCGCCAACTATCACGTTTCTCGAGTCTCCAACC 888
Query 889 TCAGACCACCACTGGTGCATTCCATTCACTGTGAAAGGCAACCCCAAACCAGCGCTTCAGTGGTTCTATAACGG 962
|||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||
Sbjct 889 TCAGATCACCACTGGTGCATTCCATTCACTGTGAGAGGCAACCCCAAGCCTGCGCTTCAGTGGTTCTACAATGG 962
Query 963 GGCAATATTGAATGAGTCCAAATACATCTGTACTAAAATACATGTTACCAATCACACGGAGTACCACGGCTGCC 1036
|||.|||.|||||||||||||.||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 963 GGCCATACTGAATGAGTCCAAGTACATCTGTACTAAGATCCACGTCACCAATCACACGGAGTACCATGGCTGCC 1036
Query 1037 TCCAGCTGGATAATCCCACTCACATGAACAATGGGGACTACACTCTAATAGCCAAGAATGAGTATGGGAAGGAT 1110
|||||||||||||.||||||||.|||||.||.||.||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1037 TCCAGCTGGATAACCCCACTCATATGAATAACGGAGACTACACCCTGATGGCCAAGAACGAGTATGGGAAGGAT 1110
Query 1111 GAGAAACAGATTTCTGCTCACTTCATGGGCTGGCCTGGAATTGACGATGGTGCAAACCCAAATTATCCTGATGT 1184
||||.||||||.||.|||||||||||||||.||||||||.|.|||.|.|...|||||||||||||.|||||.||
Sbjct 1111 GAGAGACAGATCTCCGCTCACTTCATGGGCCGGCCTGGAGTCGACTACGAGACAAACCCAAATTACCCTGAAGT 1184
Query 1185 AATTTATGAAGATTATGGA--ACTGCAGCGAA-TGACATCGGGGACACCACGAACAGAAGTAATGAAATCCCTT 1255
..|.|||||||| .|||| || ||.|| ||||||.|||||.||.|||||||.|||||||||||||||.|
Sbjct 1185 CCTCTATGAAGA--CTGGACCAC----GCCAACTGACATTGGGGATACTACGAACAAAAGTAATGAAATCCCCT 1252
Query 1256 CCACAGACGTCACTGATAAAACCGGTCGGGAACATCTCTCGGTCTATGCTGTGGTGGTGATTGCGTCTGTGGTG 1329
||||.||.||..||||..|||.|..||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1253 CCACGGATGTTGCTGACCAAAGCAATCGGGAGCATCTCTCGGTCTATGCCGTGGTGGTGATTGCATCTGTGGTG 1326
Query 1330 GGATTTTGCCTTTTGGTAATGCTGTTTCTGCTTAAGTTGGCAAGACACTCCAAGTTTGGCATGAAAGGCCCAGC 1403
|||||.|||||..||||.|||.||.|.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1327 GGATTCTGCCTGCTGGTGATGTTGCTCCTGCTCAAGTTGGCGAGACATTCCAAGTTTGGCATGAAAGGCCCAGC 1400
Query 1404 CTCCGTTATCAGCAATGATGATGACTCTGCCAGCCCACTCCATCACATCTCCAATGGGAGTAACACTCCATCTT 1477
.||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1401 TTCGGTCATCAGCAACGACGATGACTCTGCCAGCCCCCTCCACCACATCTCCAATGGGAGTAACACTCCATCTT 1474
Query 1478 CTTCGGAAGGTGGCCCAGATGCTGTCATTATTGGAATGACCAAGATCCCTGTCATTGAAAATCCCCAGTACTTT 1551
|||||||.||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 1475 CTTCGGAGGGCGGTCCCGACGCTGTCATTATTGGAATGACCAAGATTCCTGTTATTGAAAACCCCCAGTACTTT 1548
Query 1552 GGCATCACCAACAGTCAGCTCAAGCCAGACACATTTGTTCAGCACATCAAGCGACATAACATTGTTCTGAAAAG 1625
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||.|||||.||||||||.||
Sbjct 1549 GGCATCACCAACAGTCAGCTCAAGCCAGACACATTTGTTCAGCATATCAAGAGACACAACATCGTTCTGAAGAG 1622
Query 1626 GGAGCTAGGCGAAGGAGCCTTTGGAAAAGTGTTCCTAGCTGAATGCTATAACCTCTGTCCTGAGCAGGACAAGA 1699
|||.||.||.|||||||||||.||.|||||.|||||.||.||.|||||.||||||||.||.||||||||.||||
Sbjct 1623 GGAACTTGGGGAAGGAGCCTTCGGGAAAGTTTTCCTTGCCGAGTGCTACAACCTCTGCCCAGAGCAGGATAAGA 1696
Query 1700 TCTTGGTGGCAGTGAAGACCCTGAAGGATGCCAGTGACAATGCACGCAAGGACTTCCACCGTGAGGCCGAGCTC 1773
||.|||||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||.
Sbjct 1697 TCCTGGTGGCTGTGAAGACGCTGAAGGACGCCAGCGACAATGCACGCAAGGACTTTCATCGGGAAGCTGAGCTG 1770
Query 1774 CTGACCAACCTCCAGCATGAGCACATCGTCAAGTTCTATGGCGTCTGCGTGGAGGGCGACCCCCTCATCATGGT 1847
|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1771 CTGACCAACCTCCAGCACGAGCACATTGTCAAGTTCTACGGTGTCTGTGTGGAGGGCGACCCACTCATCATGGT 1844
Query 1848 CTTTGAGTACATGAAGCATGGGGACCTCAACAAGTTCCTCAGGGCACACGGCCCTGATGCCGTGCTGATGGCTG 1921
||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||.|||||||||||.|
Sbjct 1845 CTTTGAGTACATGAAGCACGGGGACCTCAACAAGTTCCTTAGGGCACACGGGCCCGACGCAGTGCTGATGGCAG 1918
Query 1922 AGGGCAACCCGCCCACGGAACTGACGCAGTCGCAGATGCTGCATATAGCCCAGCAGATCGCCGCGGGCATGGTC 1995
||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||.||.||.||||||
Sbjct 1919 AGGGTAACCCGCCCACAGAGCTGACGCAGTCGCAGATGCTGCACATCGCTCAGCAAATCGCAGCAGGTATGGTC 1992
Query 1996 TACCTGGCGTCCCAGCACTTCGTGCACCGCGATTTGGCCACCAGGAACTGCCTGGTCGGGGAGAACTTGCTGGT 2069
||||||||||||||.|||||.||||||||.||..||||||||.|||||||||||||.||.||||||.|||||||
Sbjct 1993 TACCTGGCGTCCCAACACTTTGTGCACCGTGACCTGGCCACCCGGAACTGCCTGGTGGGAGAGAACCTGCTGGT 2066
Query 2070 GAAAATCGGGGACTTTGGGATGTCCCGGGACGTGTACAGCACTGACTACTACAGGGTCGGTGGCCACACAATGC 2143
||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||..||||||||||||||||||||.
Sbjct 2067 GAAAATTGGGGACTTTGGGATGTCCCGAGATGTGTACAGCACCGACTACTATCGGGTCGGTGGCCACACAATGT 2140
Query 2144 TGCCCATTCGCTGGATGCCTCCAGAGAGCATCATGTACAGGAAATTCACGACGGAAAGCGACGTCTGGAGCCTG 2217
|||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||
Sbjct 2141 TGCCCATCCGATGGATGCCTCCAGAGAGCATCATGTACAGGAAATTCACCACCGAGAGCGACGTCTGGAGCCTG 2214
Query 2218 GGGGTCGTGTTGTGGGAGATTTTCACCTATGGCAAACAGCCCTGGTACCAGCTGTCAAACAATGAGGTGATAGA 2291
||.||.||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 2215 GGCGTTGTGTTGTGGGAGATCTTCACCTACGGCAAGCAGCCCTGGTATCAGCTATCGAACAATGAGGTGATAGA 2288
Query 2292 GTGTATCACTCAGGGCCGAGTCCTGCAGCGACCCCGCACGTGCCCCCAGGAGGTGTATGAGCTGATGCTGGGGT 2365
|||.|||||.|||||..|||||||.|||||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|
Sbjct 2289 GTGCATCACCCAGGGAAGAGTCCTTCAGCGGCCTCGAACGTGTCCCCAGGAGGTGTATGAGCTCATGCTTGGAT 2362
Query 2366 GCTGGCAGCGAGAGCCCCACATGAGGAAGAACATCAAGGGCATCCATACCCTCCTTCAGAACTTGGCCAAGGCA 2439
||||||||||.||.||.||||...||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2363 GCTGGCAGCGGGAACCACACACCCGGAAGAACATCAAGAGCATCCACACCCTCCTTCAGAACTTGGCCAAGGCA 2436
Query 2440 TCTCCGGTCTACCTGGACATTCTAGGC 2466
|||||.|||||||||||.||.||||||
Sbjct 2437 TCTCCCGTCTACCTGGATATCCTAGGC 2463