Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14741
• Subject: XM_017023276.1
• Aligned Length: 1346
• Identities: 1245
• Gaps: 88

Alignment

Query    1  ATGGCCAGGACCACCAGCCAGCTGTATGACGCCGTGCCCATCCAGTCCAGCGTGGTGTTATGTTCCTGCCCATC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCAGGACCACCAGCCAGCTGTATGACGCCGTGCCCATCCAGTCCAGCGTGGTGTTATGTTCCTGCCCATC  74

Query   75  CCCATCAATGGTGAGGACCCAGACTGAGTCCAGCACGCCCCCTGGCATTCCTGGTGGCAGCAGGCAGGGCCCCG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCCATCAATGGTGAGGACCCAGACTGAGTCCAGCACGCCCCCTGGCATTCCTGGTGGCAGCAGGCAGGGCCCCG  148

Query  149  CCATGGACGGCACTGCAGCCGAGCCTCGGCCCGGCGCCGGCTCCCTGCAGCATGCCCAGCCTCCGCCGCAGCCT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCATGGACGGCACTGCAGCCGAGCCTCGGCCCGGCGCCGGCTCCCTGCAGCATGCCCAGCCTCCGCCGCAGCCT  222

Query  223  CGGAAGAAGCGGCCTGAGGACTTCAAGTTTGGGAAAATCCTTGGGGAAGGCTCTTTTTCCACGGTTGTCCTGGC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CGGAAGAAGCGGCCTGAGGACTTCAAGTTTGGGAAAATCCTTGGGGAAGGCTCTTTTTCCACGGTTGTCCTGGC  296

Query  297  TCGAGAACTGGCAACCTCCAGAGAATATGCGACCAGGGCCAACTCATTCGTGGGAACAGCGCAGTACGTTTCTC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCGAGAACTGGCAACCTCCAGAGAATATGCGACCAGGGCCAACTCATTCGTGGGAACAGCGCAGTACGTTTCTC  370

Query  371  CAGAGCTGCTCACGGAGAAGTCCGCCTGTAAGAGTTCAGACCTTTGGGCTCTTGGATGCATAATATACCAGCTT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CAGAGCTGCTCACGGAGAAGTCCGCCTGTAAGAGTTCAGACCTTTGGGCTCTTGGATGCATAATATACCAGCTT  444

Query  445  GTGGCAGGACTCCCACCATTCCGAGCTGGAAACGAGTATCTTATATTTCAGAAGATCATTAAGTTGGAATATGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTGGCAGGACTCCCACCATTCCGAGCTGGAAACGAGTATCTTATATTTCAGAAGATCATTAAGTTGGAATATGA  518

Query  519  CTTTCCAGAAAAATTCTTCCCTAAGGCAAGAGACCTCGTGGAGAAACTTTTGGTTTTAGATGCCACAAAGCGGT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTTTCCAGAAAAATTCTTCCCTAAGGCAAGAGACCTCGTGGAGAAACTTTTGGTTTTAGATGCCACAAAGCGGT  592

Query  593  TAGGCTGTGAGGAAATGGAAGGATACGGACCTCTTAAAGCACACCCGTTCTTCGAGTCCGTCACGTGGGAGAAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TAGGCTGTGAGGAAATGGAAGGATACGGACCTCTTAAAGCACACCCGTTCTTCGAGTCCGTCACGTGGGAGAAC  666

Query  667  CTGCACCAGCAGACGCCTCCGAAGCTCACCGCTTACCTGCCGGCTATGTCGGAAGACGACGAGGACTGCTATGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTGCACCAGCAGACGCCTCCGAAGCTCACCGCTTACCTGCCGGCTATGTCGGAAGACGACGAGGACTGCTATGG  740

Query  741  CAATTATGACAATCTCCTGAGCCAGTTTGGCTGCATGCAGGTGTCTTCGTCCTCCTCCTCACACTCCCTGTCAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAATTATGACAATCTCCTGAGCCAGTTTGGCTGCATGCAGGTGTCTTCGTCCTCCTCCTCACACTCCCTGTCAG  814

Query  815  CCTCCGACACGGGCCTGCCCCAGAGGTCAGGCAGCAACATAGAGCAGTACATTCACGATCTGGACTCGAACTCC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCTCCGACACGGGCCTGCCCCAGAGGTCAGGCAGCAACATAGAGCAGTACATTCACGATCTGGACTCGAACTCC  888

Query  889  TTTGAACTGGACTTACAGTTTTCCGAAGATGAGAAGAGGTTGTTGTTGGAGAAGCAGGCTGGCGGAAACCCTTG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TTTGAACTGGACTTACAGTTTTCCGAAGATGAGAAGAGGTTGTTGTTGGAGAAGCAGGCTGGCGGAAACCCTTG  962

Query  963  GCACCAGTTTGTAGAAAATAATTTAATACTAAAGATGGGCCCAGTGGATAAGCGGAAGGGTTTATTTGCAAGAC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GCACCAGTTTGTAGAAAATAATTTAATACTAAAGATGGGCCCAGTGGATAAGCGGAAGGGTTTATTTGCAAGAC  1036

Query 1037  GACGACAGCTGTTGCTCACAGAAGGACCACATTTATATTATGTGGATCCTGTCAACAAAGTTCTGAAAGGTGAA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GACGACAGCTGTTGCTCACAGAAGGACCACATTTATATTATGTGGATCCTGTCAACAAAGTTCTGAAAGGTGAA  1110

Query 1111  ATTCCTTGGTCACAAGAACTTCGACCAGAGGCCAAGAATTTTAAAACTTTCTTTGTCCACACG-----------  1173
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
Sbjct 1111  ATTCCTTGGTCACAAGAACTTCGACCAGAGGCCAAGAATTTTAAAACTTTCTTTGTCCACACGGTGAGTCTGTT  1184

Query 1174  CCTAACAGGACGTATTATCTG-----------ATGG-----------ACCCCAGCGGGAACGCA--CACAAG--  1221
            ||   |||   |.||| ||||           ||||           |||.| |.||||| |||  ||||.|  
Sbjct 1185  CC---CAG---GGATT-TCTGTGTGCAGGGTAATGGGAGGGCTTTGCACCAC-GTGGGAA-GCAGCCACAGGCC  1249

Query 1222  -TGGTGC---AGGAAGATCCAG-GAGGTTTGGAGGCAGC-----------------GATACCAGAGCCACCCGG  1273
             ||  ||   |||.||   ||| |.||.|.|| ||||||                 .||.|||||  |.|||..
Sbjct 1250  TTG--GCCAGAGGGAG---CAGCGGGGATCGG-GGCAGCTGCCTCGCCCTTTCCGACATCCCAGA--CGCCCAC  1315

Query 1274  ACGCCGCTGTGCAG  1287
            ||            
Sbjct 1316  AC------------  1317