Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14748
- Subject:
- NM_001287136.1
- Aligned Length:
- 1353
- Identities:
- 1262
- Gaps:
- 87
Alignment
Query 1 ATGCACGGTTACTTTGGCTGCAATGCTGCTGCAGAGCCCGGTTACTCTGCCTTCGTGGGAACTCCACAGATATG 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 TGTCACAAAGATGTCTACACGGAACTGCCAGGGAATGGACTCAGTGATCAAACCCCTGGACACAATTCCTGAGG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ----------ATGTCTACACGGAACTGCCAGGGAATGGACTCAGTGATCAAACCCCTGGACACAATTCCTGAGG 64
Query 149 ATAAAAAAGTCAGAGTTCAGAGGACACAGAGCACTTTTGACCCATTTGAGAAACCAGCTAATCAAGTAAAGAGG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 65 ATAAAAAAGTCAGAGTTCAGAGGACACAGAGCACTTTTGACCCATTTGAGAAACCAGCTAATCAAGTAAAGAGG 138
Query 223 GTGCATTCTGAGAACAATGCTTGCATTAACTTTAAGACCTCCTCCACTGGCAAAGAGTCACCTAAAGTTAGGCG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 139 GTGCATTCTGAGAACAATGCTTGCATTAACTTTAAGACCTCCTCCACTGGCAAAGAGTCACCTAAAGTTAGGCG 212
Query 297 GCACTCCAGCCCCAGCTCGCCAACAAGTCCCAAATTTGGAAAAGCTGACTCATATGAAAAGCTGGAAAAACTAG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 213 GCACTCCAGCCCCAGCTCGCCAACAAGTCCCAAATTTGGAAAAGCTGACTCATATGAAAAGCTGGAAAAACTAG 286
Query 371 GGGAAGGATCTTATGCTACAGTATACAAAGGGAAAAGCAAGGTAAATGGGAAGTTGGTAGCTCTGAAGGTGATC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 287 GGGAAGGATCTTATGCTACAGTATACAAAGGGAAAAGCAAGGTAAATGGGAAGTTGGTAGCTCTGAAGGTGATC 360
Query 445 AGGCTGCAGGAAGAAGAAGGGACACCTTTCACAGCTATCAGGGAAGCTTCTCTTTTAAAAGGACTAAAACATGC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 AGGCTGCAGGAAGAAGAAGGGACACCTTTCACAGCTATCAGGGAAGCTTCTCTTTTAAAAGGACTAAAACATGC 434
Query 519 TAACATAGTGCTACTTCATGACATCATCCATACCAAGGAGACGCTGACACTTGTGTTTGAATATGTGCACACTG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 435 TAACATAGTGCTACTTCATGACATCATCCATACCAAGGAGACGCTGACACTTGTGTTTGAATATGTGCACACTG 508
Query 593 ATTTATGTCAGTACATGGACAAGCACCCTGGGGGGCTGCATCCAGATAATGTGAAGTTGTTTTTATTTCAGTTG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 509 ATTTATGTCAGTACATGGACAAGCACCCTGGGGGGCTGCATCCAGATAATGTGAAGTTGTTTTTATTTCAGTTG 582
Query 667 CTGCGAGGTCTGTCTTACATCCACCAGCGTTATATTTTGCACAGAGACCTGAAACCACAGAACNTTCTGATCAN 740
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.
Sbjct 583 CTGCGAGGTCTGTCTTACATCCACCAGCGTTATATTTTGCACAGAGACCTGAAACCACAGAACCTTCTGATCAG 656
Query 741 TGACACGGGGGNNTTAAAGCTGGCAGATTTCGGTCTTGCAAGAGCAAAATCCGTCCCTAGCCACACATACTCCA 814
|||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 657 TGACACGGGGGAGTTAAAGCTGGCAGATTTCGGTCTTGCAAGAGCAAAATCCGTCCCTAGCCACACATACTCCA 730
Query 815 ACGAAGTGGTTACCTTGTGGTACAGACCTCCAGATGTCCTTCTAGGCTCAACAGAATATTCCACCTGCCTTGAC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 731 ACGAAGTGGTTACCTTGTGGTACAGACCTCCAGATGTCCTTCTAGGCTCAACAGAATATTCCACCTGCCTTGAC 804
Query 889 ATGTGGGGAGTAGGTTGCATCTTTGTTGAAATGATCCAAGGAGTTGCTGCTTTTCCAGGAATGAAAGACATTCA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 805 ATGTGGGGAGTAGGTTGCATCTTTGTTGAAATGATCCAAGGAGTTGCTGCTTTTCCAGGAATGAAAGACATTCA 878
Query 963 GGATCAACTTGAACGAATATTTCTGGTTCTTGGAACACCAAATGAGGACACATGGCCTGGAGTTCATTCTTTAC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 879 GGATCAACTTGAACGAATATTTCTGGTTCTTGGAACACCAAATGAGGACACATGGCCTGGAGTTCATTCTTTAC 952
Query 1037 CACATTTTAAGCCAGAACGCTTTACCCTGTACAGCTCTAAAAACCTTAGACAAGCATGGAATAAGCTCAGCTAT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 953 CACATTTTAAGCCAGAACGCTTTACCCTGTACAGCTCTAAAAACCTTAGACAAGCATGGAATAAGCTCAGCTAT 1026
Query 1111 GTGAACCATGCAGAGGACCTGGCCTCCAAGCTCCTACAATGTTCCCCAAAGAACAGACTGTCGGCACAGGCTGC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1027 GTGAACCATGCAGAGGACCTGGCCTCCAAGCTCCTACAATGTTCCCCAAAGAACAGACTGTCGGCACAGGCTGC 1100
Query 1185 CTTGAGCCACGAGTATTTTAGTGACCTGCCGCCACGGCTATGGGAACTCACCGACATGTCTTCTATTTTTACTG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1101 CTTGAGCCACGAGTATTTTAGTGACCTGCCGCCACGGCTATGGGAACTCACCGACATGTCTTCTATTTTTACTG 1174
Query 1259 TCCCAAATGTGAGATTGCAACCAGAAGCTGGAGAAAGCATGCGGGCCTTTGGGAAAAACAATAGTTATGGCAAA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1175 TCCCAAATGTGAGATTGCAACCAGAAGCTGGAGAAAGCATGCGGGCCTTTGGGAAAAACAATAGTTATGGCAAA 1248
Query 1333 AGTCTATCAAACAGCAAG--- 1350
||||||||||||||||||
Sbjct 1249 AGTCTATCAAACAGCAAGCAC 1269