Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14748
• Subject: NM_001287137.1
• Aligned Length: 1353
• Identities: 1013
• Gaps: 336

Alignment

Query    1  ATGCACGGTTACTTTGGCTGCAATGCTGCTGCAGAGCCCGGTTACTCTGCCTTCGTGGGAACTCCACAGATATG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TGTCACAAAGATGTCTACACGGAACTGCCAGGGAATGGACTCAGTGATCAAACCCCTGGACACAATTCCTGAGG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  ATAAAAAAGTCAGAGTTCAGAGGACACAGAGCACTTTTGACCCATTTGAGAAACCAGCTAATCAAGTAAAGAGG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GTGCATTCTGAGAACAATGCTTGCATTAACTTTAAGACCTCCTCCACTGGCAAAGAGTCACCTAAAGTTAGGCG  296
                            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ----------------ATGCTTGCATTAACTTTAAGACCTCCTCCACTGGCAAAGAGTCACCTAAAGTTAGGCG  58

Query  297  GCACTCCAGCCCCAGCTCGCCAACAAGTCCCAAATTTGGAAAAGCTGACTCATATGAAAAGCTGGAAAAACTAG  370
            |||||||||||||||||||                                                       
Sbjct   59  GCACTCCAGCCCCAGCTCG-------------------------------------------------------  77

Query  371  GGGAAGGATCTTATGCTACAGTATACAAAGGGAAAAGCAAGGTAAATGGGAAGTTGGTAGCTCTGAAGGTGATC  444
                                                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   78  ----------------------------------------GGTAAATGGGAAGTTGGTAGCTCTGAAGGTGATC  111

Query  445  AGGCTGCAGGAAGAAGAAGGGACACCTTTCACAGCTATCAGGGAAGCTTCTCTTTTAAAAGGACTAAAACATGC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  112  AGGCTGCAGGAAGAAGAAGGGACACCTTTCACAGCTATCAGGGAAGCTTCTCTTTTAAAAGGACTAAAACATGC  185

Query  519  TAACATAGTGCTACTTCATGACATCATCCATACCAAGGAGACGCTGACACTTGTGTTTGAATATGTGCACACTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  186  TAACATAGTGCTACTTCATGACATCATCCATACCAAGGAGACGCTGACACTTGTGTTTGAATATGTGCACACTG  259

Query  593  ATTTATGTCAGTACATGGACAAGCACCCTGGGGGGCTGCATCCAGATAATGTGAAGTTGTTTTTATTTCAGTTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  260  ATTTATGTCAGTACATGGACAAGCACCCTGGGGGGCTGCATCCAGATAATGTGAAGTTGTTTTTATTTCAGTTG  333

Query  667  CTGCGAGGTCTGTCTTACATCCACCAGCGTTATATTTTGCACAGAGACCTGAAACCACAGAACNTTCTGATCAN  740
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.
Sbjct  334  CTGCGAGGTCTGTCTTACATCCACCAGCGTTATATTTTGCACAGAGACCTGAAACCACAGAACCTTCTGATCAG  407

Query  741  TGACACGGGGGNNTTAAAGCTGGCAGATTTCGGTCTTGCAAGAGCAAAATCCGTCCCTAGCCACACATACTCCA  814
            |||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  408  TGACACGGGGGAGTTAAAGCTGGCAGATTTCGGTCTTGCAAGAGCAAAATCCGTCCCTAGCCACACATACTCCA  481

Query  815  ACGAAGTGGTTACCTTGTGGTACAGACCTCCAGATGTCCTTCTAGGCTCAACAGAATATTCCACCTGCCTTGAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  482  ACGAAGTGGTTACCTTGTGGTACAGACCTCCAGATGTCCTTCTAGGCTCAACAGAATATTCCACCTGCCTTGAC  555

Query  889  ATGTGGGGAGTAGGTTGCATCTTTGTTGAAATGATCCAAGGAGTTGCTGCTTTTCCAGGAATGAAAGACATTCA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  556  ATGTGGGGAGTAGGTTGCATCTTTGTTGAAATGATCCAAGGAGTTGCTGCTTTTCCAGGAATGAAAGACATTCA  629

Query  963  GGATCAACTTGAACGAATATTTCTGGTTCTTGGAACACCAAATGAGGACACATGGCCTGGAGTTCATTCTTTAC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  630  GGATCAACTTGAACGAATATTTCTGGTTCTTGGAACACCAAATGAGGACACATGGCCTGGAGTTCATTCTTTAC  703

Query 1037  CACATTTTAAGCCAGAACGCTTTACCCTGTACAGCTCTAAAAACCTTAGACAAGCATGGAATAAGCTCAGCTAT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  704  CACATTTTAAGCCAGAACGCTTTACCCTGTACAGCTCTAAAAACCTTAGACAAGCATGGAATAAGCTCAGCTAT  777

Query 1111  GTGAACCATGCAGAGGACCTGGCCTCCAAGCTCCTACAATGTTCCCCAAAGAACAGACTGTCGGCACAGGCTGC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  778  GTGAACCATGCAGAGGACCTGGCCTCCAAGCTCCTACAATGTTCCCCAAAGAACAGACTGTCGGCACAGGCTGC  851

Query 1185  CTTGAGCCACGAGTATTTTAGTGACCTGCCGCCACGGCTATGGGAACTCACCGACATGTCTTCTATTTTTACTG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  852  CTTGAGCCACGAGTATTTTAGTGACCTGCCGCCACGGCTATGGGAACTCACCGACATGTCTTCTATTTTTACTG  925

Query 1259  TCCCAAATGTGAGATTGCAACCAGAAGCTGGAGAAAGCATGCGGGCCTTTGGGAAAAACAATAGTTATGGCAAA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  926  TCCCAAATGTGAGATTGCAACCAGAAGCTGGAGAAAGCATGCGGGCCTTTGGGAAAAACAATAGTTATGGCAAA  999

Query 1333  AGTCTATCAAACAGCAAG---  1350
            ||||||||||||||||||   
Sbjct 1000  AGTCTATCAAACAGCAAGCAC  1020