Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14748
- Subject:
- XM_006503544.4
- Aligned Length:
- 1431
- Identities:
- 1228
- Gaps:
- 81
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGCTTTTGAAGCAGCACTGCATTGCAAATCAATATCTTTCTGGAGAGACAGGGTGTAGTGGATTGCCTGGACA 74
Query 1 ----ATGCACGGTTACTTTGGCTGCAATGCTGCTGCAGAGCCCGGTTACTCTGCCTTCGTGGGAACTCCACAGA 70
||||..||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.|||||||.|||||||
Sbjct 75 GCATATGCGTGGTTCCTCTGGCTGCAATGCTGCTGCAGAGCCCGCTCACTCTGCCTTCCTGGGAACCCCACAGA 148
Query 71 TATGTGTCACAAAGATGTCTACACGGAACTGCCAGGGAATGGACTCAGTGATCAAACCCCTGGACACAATTCCT 144
||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|..||.|||||||||||.|.||||||||||||||||
Sbjct 149 TATGTGTCACAAAGATGTCTACCCGGAACTGCCAGGGGACAGATTCAGTGATCAAGCACCTGGACACAATTCCT 222
Query 145 GAGGATAAAAAAGTCAGAGTTCAGAGGACACAGAGCACTTTTGACCCATTTGAGAAACCAGCTAATCAAGTAAA 218
||.||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||
Sbjct 223 GAAGACAAGAAAGTCAGGGTTCAGAGGACGCAGAGCACTTTTGACCCATTTGAGAAACCAGCCAACCAAGTCAA 296
Query 219 GAGGGTGCATTCTGAGAACAATGCTTGCATTAACTTTAAGACCTCCTCCACTGGCAAAGAGTCACCTAAAGTTA 292
.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||..|||||||..|||||||||||||||||||||||.
Sbjct 297 AAGGGTCCATTCTGAGAACAATGCATGCATTAACTTTAAATCCTCCTCTGCTGGCAAAGAGTCACCTAAAGTTC 370
Query 293 GGCGGCACTCCAGCCCCAGCTCGCCAACAAGTCCCAAATTTGGAAAAGCTGACTCATATGAAAAGCTGGAAAAA 366
||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct 371 GGCGGCACTCCAGCCCCAGCTCGCCAACGAGTCCCAAATTTGGAAAAGCTGACTCATACGAAAAACTGGAAAAA 444
Query 367 CTAGGGGAAGGATCTTATGCTACAGTATACAAAGGGAAAAGCAAGGTAAATGGGAAGTTGGTAGCTCTGAAGGT 440
||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||.||||.|||||.|||||
Sbjct 445 CTGGGGGAAGGATCTTATGCAACAGTGTACAAAGGGAAAAGCAAAGTGAATGGGAAGCTGGTGGCTCTAAAGGT 518
Query 441 GATCAGGCTGCAGGAAGAAGAAGGGACACCTTTCACAGCTATCAGGGAAGCTTCTCTTTTAAAAGGACTAAAAC 514
||||.||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|
Sbjct 519 GATCCGGCTGCAGGAAGAAGAGGGCACACCTTTCACAGCCATCAGGGAAGCTTCCCTGTTGAAAGGACTAAAGC 592
Query 515 ATGCTAACATAGTGCTACTTCATGACATCATCCATACCAAGGAGACGCTGACACTTGTGTTTGAATATGTGCAC 588
|.||.|||||.|||.|.|||||.|||||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||.||||||||.||||||
Sbjct 593 ACGCCAACATCGTGTTGCTTCACGACATCATCCACACTAAGGAAACCCTGACCCTTGTCTTTGAATACGTGCAC 666
Query 589 ACTGATTTATGTCAGTACATGGACAAGCACCCTGGGGGGCTGCATCCAGATAATGTGAAGTTGTTTTTATTTCA 662
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 ACTGATTTATGTCAGTACATGGACAAGCACCCTGGAGGACTCCATCCAGATAATGTGAAGTTGTTTTTATTTCA 740
Query 663 GTTGCTGCGAGGTCTGTCTTACATCCACCAGCGTTATATTTTGCACAGAGACCTGAAACCACAGAACNTTCTGA 736
|.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||.|
Sbjct 741 GCTGCTGCGAGGACTGTCTTACATCCACCAGCGTTATATTTTGCACAGAGACCTGAAACCGCAGAACCTTCTCA 814
Query 737 TCANTGACACGGGGGNNTTAAAGCTGGCAGATTTCGGTCTTGCAAGAGCAAAATCCGTCCCTAGCCACACATAC 810
|||..||.|||||||..||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TCAGCGATACGGGGGAGTTGAAGCTGGCAGATTTCGGTCTGGCAAGAGCAAAATCCGTCCCTAGCCACACATAC 888
Query 811 TCCAACGAAGTGGTTACCTTGTGGTACAGACCTCCAGATGTCCTTCTAGGCTCAACAGAATATTCCACCTGCCT 884
|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TCCAATGAAGTGGTTACCTTGTGGTACAGACCTCCAGATGTTCTTCTGGGCTCTACAGAATATTCCACCTGCCT 962
Query 885 TGACATGTGGGGAGTAGGTTGCATCTTTGTTGAAATGATCCAAGGAGTTGCTGCTTTTCCAGGAATGAAAGACA 958
|||||||||||||||.||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 963 TGACATGTGGGGAGTTGGCTGTATCTTCGTTGAGATGATCCAAGGAGTTGCTGCGTTTCCAGGAATGAAAGACA 1036
Query 959 TTCAGGATCAACTTGAACGAATATTTCTGGTTCTTGGAACACCAAATGAGGACACATGGCCTGGAGTTCATTCT 1032
|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TTCAGGATCAACTTGAACGGATATTTCTGGTTCTTGGAACACCGAATGAGGACACGTGGCCTGGAGTTCATTCT 1110
Query 1033 TTACCACATTTTAAGCCAGAACGCTTTACCCTGTACAGCTCTAAAAACCTTAGACAAGCATGGAATAAGCTCAG 1106
||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TTACCACATTTTAAGCCAGAACGCTTTACCGTGTACAGCTCTAAAAGCCTTAGACAAGCATGGAATAAGCTCAG 1184
Query 1107 CTATGTGAACCATGCAGAGGACCTGGCCTCCAAGCTCCTACAATGTTCCCCAAAGAACAGACTGTCGGCACAGG 1180
||||||.||.|||||.||.|||.|||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||
Sbjct 1185 CTATGTAAATCATGCTGAAGACTTGGCCTCCAAGCTTCTCCAGTGTTCCCCAAAGAACAGGCTATCAGCACAGG 1258
Query 1181 CTGCCTTGAGCCACGAGTATTTTAGTGACCTGCCGCCACGGCTATGGGAACTCACCGACATGTCTTCTATTTTT 1254
|.|||||||||||.||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||
Sbjct 1259 CCGCCTTGAGCCATGAGTATTTCAGCGATCTGCCTCCACGGCTATGGGAGCTGACTGATATGTCTTCTATTTTT 1332
Query 1255 ACTGTCCCAAATGTGAGATTGCAACCAGAAGCTGGAGAAAGCATGCGGGCCTTTGGGAAAAACAATAGTTATGG 1328
||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1333 ACCGTCCCAAATGTGAGATTGCAACCAGAAGCTGGAGAGAGCATGAGGGCCTTTGGAAAAAACAATAGTTATGG 1406
Query 1329 CAAAAGTCTATCAAACAGCAAG--- 1350
.|||||.|||||.||||||||.
Sbjct 1407 GAAAAGCCTATCGAACAGCAAACAC 1431