Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14752
• Subject: XM_006724498.4
• Aligned Length: 3733
• Identities: 3142
• Gaps: 585

Alignment

Query    1  ATGCGGAGCAGGAGCAATTCCGGGGTCCGCTTGGACGGGTACGCGCGGCTGGTGCAGCAAACCATCCTGTGTTA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CCAGAATCCCGTCACGGGGCTGCTGTCAGCCAGCCATGAGCAGAAGGATGCCTGGGTGCGGGATAACATCTACA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GTATCCTGGCCGTGTGGGGCCTGGGCATGGCCTACCGTAAGAATGCAGACCGCGATGAGGACAAGGCCAAGGCC  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  TACGAGCTGGAGCAGAACGTGGTGAAGCTGATGCGAGGTCTTCTCCAGTGCATGATGAGACAGGTGGCCAAAGT  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  GGAGAAGTTCAAACACACTCAGAGCACCAAGGACAGCCTGCACGCCAAGTACAACACCGCCACCTGTGGCACGG  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  TGGTGGGCGACGACCAGTGGGGCCACCTCCAGGTGGATGCCACCTCTCTCTTCCTCCTGTTCCTGGCCCAGATG  444
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  445  ACCGCCTCAGGCTTACGTATCATTTTCACTCTCGATGAGGTGGCCTTCATACAGAATCTTGTCTTTTACATAGA  518
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  519  AGCTGCATATAAAGTCGCTGATTATGGAATGTGGGAGCGTGGAGATAAGACTAATCAGGGCATCCCGGAATTGA  592
                                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ----------------------------ATGTGGGAGCGTGGAGATAAGACTAATCAGGGCATCCCGGAATTGA  46

Query  593  ATGCAAGCTCCGTAGGAATGGCCAAGGCAGCTCTTGAGGCAATTGATGAACTGGACCTTTTTGGAGCCCATGGA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   47  ATGCAAGCTCCGTAGGAATGGCCAAGGCAGCTCTTGAGGCAATTGATGAACTGGACCTTTTTGGAGCCCATGGA  120

Query  667  GGACGCAAGTCAGTGATTCATGTTCTGCCAGATGAGGTCGAGCACTGCCAGTCTTATTCTTGTTCTCCATGCTG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct  121  GGACGCAAGTCAGTGATTCATGTTCTGCCAGATGAGGTCGAGCACTGCCAGTC-TATTC-TGTTCTCCATGCTG  192

Query  741  CCCAAGAAGCGTCGACATCTAAAGAAATTGATGCTGGACTTCTTTCCATTATTTCCTTCCCGGCCTTTGCAGTG  814
             ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  193  -CCAAG-AGCGTCGACATCTAAAGAAATTGATGCTGGACTTCTTTCCATTATTTCCTTCCCGGCCTTTGCAGTG  264

Query  815  GAAGATGTAAACCTTGTAAATGTGACCAAAAATGAAATTATTTCTAAGCTCCAGGGGCGTTATGGATGCTGTCG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  265  GAAGATGTAAACCTTGTAAATGTGACCAAAAATGAAATTATTTCTAAGCTCCAGGGGCGTTATGGATGCTGTCG  338

Query  889  CTTCCTTCGAGATGGTTATAAAACTCCAAGAGAGGACCCTAATCGACTGCATTATGACCCTGCTGAACTCAAGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  339  CTTCCTTCGAGATGGTTATAAAACTCCAAGAGAGGACCCTAATCGACTGCATTATGACCCTGCTGAACTCAAGC  412

Query  963  TCTTCGAAAACATTGAATGTGAGTGGCCTGTGTTTTGGACATATTTTATAATAGATGGAGTCTTCAGTGGTGAT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  413  TCTTCGAAAACATTGAATGTGAGTGGCCTGTGTTTTGGACATATTTTATAATAGATGGAGTCTTCAGTGGTGAT  486

Query 1037  GCTGTTCAGGTCCAAGAATACCGAGAGGCCCTGGAGGGAATACTCATCAGAGGCAAGAATGGGATCCGCCTGGT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  487  GCTGTTCAGGTCCAAGAATACCGAGAGGCCCTGGAGGGAATACTCATCAGAGGCAAGAATGGGATCCGCCTGGT  560

Query 1111  GCCTGAACTCTACGCTGTCCCGCCTAACAAGGTAGATGAAGAGTACAAGAATCCTCACACAGTAGACCGAGTTC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  561  GCCTGAACTCTACGCTGTCCCGCCTAACAAGGTAGATGAAGAGTACAAGAATCCTCACACAGTAGACCGAGTTC  634

Query 1185  CTATGGGGAAGGTGCCTCATCTGTGGGGCCAATCCTTGTACATCCTCAGCTCGCTGTTGGCAGAGGGATTCCTT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  635  CTATGGGGAAGGTGCCTCATCTGTGGGGCCAATCCTTGTACATCCTCAGCTCGCTGTTGGCAGAGGGATTCCTT  708

Query 1259  GCCGCTGGTGAAATCGATCCCTTAAATAGAAGATTTTCCACTTCAGTCAAACCTGATGTTGTAGTACAAGTTAC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  709  GCCGCTGGTGAAATCGATCCCTTAAATAGAAGATTTTCCACTTCAGTCAAACCTGATGTTGTAGTACAAGTTAC  782

Query 1333  TGTTTTGGCAGAAAACAATCACATTAAGGACTTATTGAGGAAACACGGGGTGAACGTCCAGAGTATCGCGGACA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  783  TGTTTTGGCAGAAAACAATCACATTAAGGACTTATTGAGGAAACACGGGGTGAACGTCCAGAGTATCGCGGACA  856

Query 1407  TTCATCCAATTCAAGTCCAGCCGGGCCGGATTCTTAGTCACATATATGCCAAGCTTGGACGGAATAAGAATATG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  857  TTCATCCAATTCAAGTCCAGCCGGGCCGGATTCTTAGTCACATATATGCCAAGCTTGGACGGAATAAGAATATG  930

Query 1481  AATTTGAGTGGGCGACCGTATCGACATATTGGTGTCCTTGGAACCTCTAAACTATATGTGATTAGGAACCAAAT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  931  AATTTGAGTGGGCGACCGTATCGACATATTGGTGTCCTTGGAACCTCTAAACTATATGTGATTAGGAACCAAAT  1004

Query 1555  CTTTACTTTTACACCCCAGTTCACCGACGAGCATCACTTCTACCTGGCCCTCGACAATGAGATGATCGTGGAGA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1005  CTTTACTTTTACACCCCAGTTCACCGACCAGCATCACTTCTACCTGGCCCTCGACAATGAGATGATCGTGGAGA  1078

Query 1629  TGCTAAGGATCGAGCTGGCCTACCTGTGCACCTGCTGGAGGATGACGGGCAGACCCACACTCACCTTCCCCATC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1079  TGCTAAGGATCGAGCTGGCCTACCTGTGCACCTGCTGGAGGATGACGGGCAGACCCACACTCACCTTCCCCATC  1152

Query 1703  AGTCGCACCATGCTCACAAATGATGGCTCAGACATTCATTCTGCTGTGCTCTCCACAATTAGAAAACTAGAGGA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1153  AGTCGCACCATGCTCACAAATGATGGCTCAGACATTCATTCTGCTGTGCTCTCCACAATTAGAAAACTAGAGGA  1226

Query 1777  TGGATATTTTGGAGGAGCCAGAGTAAAATTAGGGAACCTTTCGGAATTTCTCACCACATCGTTCTACACATATC  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1227  TGGATATTTTGGAGGAGCCAGAGTAAAATTAGGGAACCTTTCGGAATTTCTCACCACATCGTTCTACACATATC  1300

Query 1851  TGACTTTTCTGGATCCAGACTGTGATGAGAAGTTGTTTGACAATGCCAGCGAAGGGACTTTCAGTCCTGATAGT  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1301  TGACTTTTCTGGATCCAGACTGTGATGAGAAGTTGTTTGACAATGCCAGCGAAGGGACTTTCAGTCCTGATAGT  1374

Query 1925  GATTCAGATTTGGTAGGATATCTGGAAGACACCTGTAATCAAGAAAGCCAAGACGAACTTGACCATTATATCAA  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1375  GATTCAGATTTGGTAGGATATCTGGAAGACACCTGTAATCAAGAAAGCCAAGACGAACTTGACCATTATATCAA  1448

Query 1999  CCACCTTCTGCAAAGCACATCGTTGAGGTCCTATCTGCCTCCTCTTTGTAAGAACACAGAAGACCGCCATGTCT  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1449  CCACCTTCTGCAAAGCACATCGTTGAGGTCCTATCTGCCTCCTCTTTGTAAGAACACAGAAGACCGCCATGTCT  1522

Query 2073  TCAGTGCTATCCACTCCACGCGGGACATACTTTCTGTGATGGCAAAAGCAAAGGGTTTGGAAGTTCCATTTGTT  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1523  TCAGTGCTATCCACTCCACGCGGGACATACTTTCTGTGATGGCAAAAGCAAAGGGTTTGGAAGTTCCATTTGTT  1596

Query 2147  CCCATGACTTTGCCGACTAAAGTTCTAAGTGCCCACCGTAAATCACTGAATCTTGTTGATTCTCCTCAGCCACT  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1597  CCCATGACTTTGCCGACTAAAGTTCTAAGTGCCCACCGTAAATCACTGAATCTTGTTGATTCTCCTCAGCCACT  1670

Query 2221  CCTAGAAAAGGTTCCTGAAAGTGACTTTCAGTGGCCCAGAGATGACCATAGTGACGTGGACTGTGAGAAGCTGG  2294
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1671  CCTAGAAAAGGTTCCTGAAAGTGACTTTCAGTGGCCCAGAGATGACCATGGTGACGTGGACTGTGAGAAGCTGG  1744

Query 2295  TTGAGCAGCTAAAAGATTGTTCGAACCTACAGGACCAAGCAGACATTCTGTACATTCTTTATGTCATAAAGGGT  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1745  TTGAGCAGCTAAAAGATTGTTCGAACCTACAGGACCAAGCAGACATTCTGTACATTCTTTATGTCATAAAGGGT  1818

Query 2369  CCCAGCTGGGACACAAATCTCTCTGGACAGCACGGGGTCACCGTTCAAAACCTTCTTGGTGAGCTCTATGGGAA  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1819  CCCAGCTGGGACACAAATCTCTCTGGACAGCACGGGGTCACCGTTCAAAACCTTCTTGGTGAGCTCTATGGGAA  1892

Query 2443  AGCCGGCTTGAACCAGGAGTGGGGTCTGATTCGCTACATCTCAGGCCTTCTCAGGAAGAAAGTGGAGGTCCTGG  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1893  AGCCGGCTTGAACCAGGAGTGGGGTCTGATTCGCTACATCTCAGGCCTTCTCAGGAAGAAAGTGGAGGTCCTGG  1966

Query 2517  CTGAGGCCTGCACAGACCTGCTTTCGCACCAGAAGCAGCTCACCGTGGGCCTGCCGCCCGAGCCCCGGGAGAAG  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1967  CTGAGGCCTGCACAGACCTGCTTTCGCACCAGAAGCAGCTCACCGTGGGCCTGCCGCCCGAGCCCCGGGAGAAG  2040

Query 2591  ATCATCTCTGCGCCCCTTCCCCCAGAGGAGCTCACAAAACTCATCTACGAGGCCAGTGGGCAGGACATCAGCAT  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2041  ATCATCTCTGCGCCCCTTCCCCCAGAGGAGCTCACAAAACTCATCTACGAGGCCAGTGGGCAGGACATCAGCAT  2114

Query 2665  TGCCGTCCTCACGCAGGAGATTGTGGTTTACCTGGCCATGTATGTCAGGGCGCAGCCCAGCCTCTTTGTGGAGA  2738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2115  TGCCGTCCTCACGCAGGAGATTGTGGTTTACCTGGCCATGTATGTCAGGGCGCAGCCCAGCCTCTTTGTGGAGA  2188

Query 2739  TGCTGAGACTCCGGATTGGACTGATCATTCAGGTGATGGCCACGGAGCTGGCACGGAGCCTGAACTGCTCAGGA  2812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2189  TGCTGAGACTCCGGATTGGACTGATCATTCAGGTGATGGCCACGGAGCTGGCACGGAGCCTGAACTGCTCAGGA  2262

Query 2813  GAAGAGGCTTCTGAAAGTTTGATGAACCTCAGCCCTTTCGATATGAAAAATCTCCTGCACCATATTCTAAGTGG  2886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2263  GAAGAGGCTTCTGAAAGTTTGATGAACCTCAGCCCTTTCGATATGAAAAATCTCCTGCACCATATTCTAAGTGG  2336

Query 2887  GAAAGAGTTTGGCGTTGAAAGAAGTGTGCGCCCTATCCACTC--TCACAATCAGCCCTA-CATCT-CAT-CACG  2955
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  .||||..|||||||| ||||| ||| ||||
Sbjct 2337  GAAAGAGTTTGGCGTTGAAAGAAGTGTGCGCCCTATCCACTCCTCCACATCCAGCCCTACCATCTCCATCCACG  2410

Query 2956  AGGT--GTCATA-CGGAGTCA-CAAAACTGAGAGGAGTGGCATT-ACAGACTGA-GAGTGAAATGAAACAGATG  3023
            ||||  |.|||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2411  AGGTGGGCCATACCGGAGTCACCAAAACTGAGAGGAGTGGCATTAACAGACTGAGGAGTGAAATGAAACAGATG  2484

Query 3024  ACTAGGCGGTTTAGTGCTGATGAACAGTTCTTTTCTGTGGGCCAGGCCGCGTCCAGCAGTGCGCATTCCTCCAA  3097
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2485  ACTAGGCGGTTTAGTGCTGATGAACAGTTCTTTTCTGTGGGCCAGGCCGCGTCCAGCAGTGCGCATTCCTCCAA  2558

Query 3098  GTCTGCG------------------------AGGTCCAGCACCCCATCCTCGCCCACTGGCACGTCATCCTCAG  3147
            |||||||                        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2559  GTCTGCGGTAACAGTGCCTCGGGATTATTGTAGGTCCAGCACCCCATCCTCGCCCACTGGCACGTCATCCTCAG  2632

Query 3148  ACTCGGGAGGACATCACATCGGCTGGGGTGAGCGGCAGGGCCAGTGGCTGCGCAGGAGAAGGCTGGATGGGGCC  3221
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2633  ACTCGGGAGGACATCACATCGGCTGGGGTGAGCGGCAGGGCCAGTGGCTGCGCAGGAGAAGGCTGGATGGGGCC  2706

Query 3222  ATCAACAGGGTCCCCGTGGGATTCTACCAGAGGGTGTGGAAGATCCTCCAGAAGTGCCACGGTCTCTCCATCGA  3295
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2707  ATCAACAGGGTCCCCGTGGGATTCTACCAGAGGGTGTGGAAGATCCTCCAGAAGTGCCACGGTCTCTCCATCGA  2780

Query 3296  TGGTTATGTCCTCCCATCCTCGACGACCCGAGAGATGACCCCGCATGAGATCAAGTTTGCTGTCCATGTCGAAT  3369
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2781  TGGTTATGTCCTCCCATCCTCGACGACCCGAGAGATGACCCCGCATGAGATCAAGTTTGCTGTCCATGTCGAAT  2854

Query 3370  CGGTGCTGAACCGCGTGCCGCAGCCCGAGTACCGGCAGCTGCTGGTGGAAGCCATCATGGTGCTGACGCTGCTC  3443
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2855  CGGTGCTGAACCGCGTGCCGCAGCCCGAGTACCGGCAGCTGCTGGTGGAAGCCATCATGGTGCTGACGCTGCTC  2928

Query 3444  TCGGACACGGAGATGACCAGCATCGGGGGCATCATCCACGTGGACCAGATCGTGCAGATGGCCAGTCAGCTGTT  3517
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2929  TCGGACACGGAGATGACCAGCATCGGGGGCATCATCCACGTGGACCAGATCGTGCAGATGGCCAGTCAGCTGTT  3002

Query 3518  CTTGCAGGACCAGGTGTCAATTGGTGCCATGGACACCCTGGAGAAAGACCAAGCCACAGGAATCTGCCACTTCT  3591
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3003  CTTGCAGGACCAGGTGTCAATTGGTGCCATGGACACCCTGGAGAAAGACCAAGCCACAGGAATCTGCCACTTCT  3076

Query 3592  TTTATGACAGCGCTCCGAGTGGGGCTTATGGGACGATGACCTACCTAACAAGAGCAGTGGCTTCTTATTTGCAG  3665
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3077  TTTATGACAGCGCTCCGAGTGGGGCTTATGGGACGATGACCTACCTAACAAGAGCAGTGGCTTCTTATTTGCAG  3150

Query 3666  GAATTGTTGCCCAATTCGGGCTGCCAGATGCAA  3698
            |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3151  GAATTGTTGCCCAATTCGGGCTGCCAGATGCAA  3183