Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14752
- Subject:
- XM_011545537.3
- Aligned Length:
- 3733
- Identities:
- 3588
- Gaps:
- 138
Alignment
Query 1 ATGCGGAGCAGGAGCAATTCCGGGGTCCGCTTGGACGGGTACGCGCGGCTGGTGCAGCAAACCATCCTGTGTTA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCGGAGCAGGAGCAATTCCGGGGTCCGCTTGGACGGGTACGCGCGGCTGGTGCAGCAAACCATCCTGTGTTA 74
Query 75 CCAGAATCCCGTCACGGGGCTGCTGTCAGCCAGCCATGAGCAGAAGGATGCCTGGGTGCGGGATAACATCTACA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CCAGAATCCCGTCACGGGGCTGCTGTCAGCCAGCCATGAGCAGAAGGATGCCTGGGTGCGGGATAACATCTACA 148
Query 149 GTATCCTGGCCGTGTGGGGCCTGGGCATGGCCTACCGTAAGAATGCAGACCGCGATGAGGACAAGGCCAAGGCC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GTATCCTGGCCGTGTGGGGCCTGGGCATGGCCTACCGTAAGAATGCAGACCGCGATGAGGACAAGGCCAAGGCC 222
Query 223 TACGAGCTGGAGCAGAACGTGGTGAAGCTGATGCGAGGTCTTCTCCAGTGCATGATGAGACAGGTGGCCAAAGT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TACGAGCTGGAGCAGAACGTGGTGAAGCTGATGCGAGGTCTTCTCCAGTGCATGATGAGACAGGTGGCCAAAGT 296
Query 297 GGAGAAGTTCAAACACACTCAGAGCACCAAGGACAGCCTGCACGCCAAGTACAACACCGCCACCTGTGGCACGG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGAGAAGTTCAAACACACTCAGAGCACCAAGGACAGCCTGCACGCCAAGTACAACACCGCCACCTGTGGCACGG 370
Query 371 TGGTGGGCGACGACCAGTGGGGCCACCTCCAGGTGGATGCCACCTCTCTCTTCCTCCTGTTCCTGGCCCAGATG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TGGTGGGCGACGACCAGTGGGGCCACCTCCAGGTGGATGCCACCTCTCTCTTCCTCCTGTTCCTGGCCCAGATG 444
Query 445 ACCGCCTCAGGCTTACGTATCATTTTCACTCTCGATGAGGTGGCCTTCATACAGAATCTTGTCTTTTACATAGA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ACCGCCTCAGGCTTACGTATCATTTTCACTCTCGATGAGGTGGCCTTCATACAGAATCTTGTCTTTTACATAGA 518
Query 519 AGCTGCATATAAAGTCGCTGATTATGGAATGTGGGAGCGTGGAGATAAGACTAATCAGGGCATCCCGGAATTGA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AGCTGCATATAAAGTCGCTGATTATGGAATGTGGGAGCGTGGAGATAAGACTAATCAGGGCATCCCGGAATTGA 592
Query 593 ATGCAAGCTCCGTAGGAATGGCCAAGGCAGCTCTTGAGGCAATTGATGAACTGGACCTTTTTGGAGCCCATGGA 666
||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 593 ATGCAAGCTCCGTAGGAATGGCCAAGTC---------------------------------------------- 620
Query 667 GGACGCAAGTCAGTGATTCATGTTCTGCCAGATGAGGTCGAGCACTGCCAGTCTTATTCTTGTTCTCCATGCTG 740
||||| ||||||||||||||
Sbjct 621 ------------------------------------------------------TATTC-TGTTCTCCATGCTG 639
Query 741 CCCAAGAAGCGTCGACATCTAAAGAAATTGATGCTGGACTTCTTTCCATTATTTCCTTCCCGGCCTTTGCAGTG 814
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 640 -CCAAG-AGCGTCGACATCTAAAGAAATTGATGCTGGACTTCTTTCCATTATTTCCTTCCCGGCCTTTGCAGTG 711
Query 815 GAAGATGTAAACCTTGTAAATGTGACCAAAAATGAAATTATTTCTAAGCTCCAGGGGCGTTATGGATGCTGTCG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 712 GAAGATGTAAACCTTGTAAATGTGACCAAAAATGAAATTATTTCTAAGCTCCAGGGGCGTTATGGATGCTGTCG 785
Query 889 CTTCCTTCGAGATGGTTATAAAACTCCAAGAGAGGACCCTAATCGACTGCATTATGACCCTGCTGAACTCAAGC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 786 CTTCCTTCGAGATGGTTATAAAACTCCAAGAGAGGACCCTAATCGACTGCATTATGACCCTGCTGAACTCAAGC 859
Query 963 TCTTCGAAAACATTGAATGTGAGTGGCCTGTGTTTTGGACATATTTTATAATAGATGGAGTCTTCAGTGGTGAT 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 860 TCTTCGAAAACATTGAATGTGAGTGGCCTGTGTTTTGGACATATTTTATAATAGATGGAGTCTTCAGTGGTGAT 933
Query 1037 GCTGTTCAGGTCCAAGAATACCGAGAGGCCCTGGAGGGAATACTCATCAGAGGCAAGAATGGGATCCGCCTGGT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 934 GCTGTTCAGGTCCAAGAATACCGAGAGGCCCTGGAGGGAATACTCATCAGAGGCAAGAATGGGATCCGCCTGGT 1007
Query 1111 GCCTGAACTCTACGCTGTCCCGCCTAACAAGGTAGATGAAGAGTACAAGAATCCTCACACAGTAGACCGAGTTC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1008 GCCTGAACTCTACGCTGTCCCGCCTAACAAGGTAGATGAAGAGTACAAGAATCCTCACACAGTAGACCGAGTTC 1081
Query 1185 CTATGGGGAAGGTGCCTCATCTGTGGGGCCAATCCTTGTACATCCTCAGCTCGCTGTTGGCAGAGGGATTCCTT 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1082 CTATGGGGAAGGTGCCTCATCTGTGGGGCCAATCCTTGTACATCCTCAGCTCGCTGTTGGCAGAGGGATTCCTT 1155
Query 1259 GCCGCTGGTGAAATCGATCCCTTAAATAGAAGATTTTCCACTTCAGTCAAACCTGATGTTGTAGTACAAGTTAC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1156 GCCGCTGGTGAAATCGATCCCTTAAATAGAAGATTTTCCACTTCAGTCAAACCTGATGTTGTAGTACAAGTTAC 1229
Query 1333 TGTTTTGGCAGAAAACAATCACATTAAGGACTTATTGAGGAAACACGGGGTGAACGTCCAGAGTATCGCGGACA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1230 TGTTTTGGCAGAAAACAATCACATTAAGGACTTATTGAGGAAACACGGGGTGAACGTCCAGAGTATCGCGGACA 1303
Query 1407 TTCATCCAATTCAAGTCCAGCCGGGCCGGATTCTTAGTCACATATATGCCAAGCTTGGACGGAATAAGAATATG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1304 TTCATCCAATTCAAGTCCAGCCGGGCCGGATTCTTAGTCACATATATGCCAAGCTTGGACGGAATAAGAATATG 1377
Query 1481 AATTTGAGTGGGCGACCGTATCGACATATTGGTGTCCTTGGAACCTCTAAACTATATGTGATTAGGAACCAAAT 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1378 AATTTGAGTGGGCGACCGTATCGACATATTGGTGTCCTTGGAACCTCTAAACTATATGTGATTAGGAACCAAAT 1451
Query 1555 CTTTACTTTTACACCCCAGTTCACCGACGAGCATCACTTCTACCTGGCCCTCGACAATGAGATGATCGTGGAGA 1628
||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1452 CTTTACTTTTACACCCCAGTTCACCGACCAGCATCACTTCTACCTGGCCCTCGACAATGAGATGATCGTGGAGA 1525
Query 1629 TGCTAAGGATCGAGCTGGCCTACCTGTGCACCTGCTGGAGGATGACGGGCAGACCCACACTCACCTTCCCCATC 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1526 TGCTAAGGATCGAGCTGGCCTACCTGTGCACCTGCTGGAGGATGACGGGCAGACCCACACTCACCTTCCCCATC 1599
Query 1703 AGTCGCACCATGCTCACAAATGATGGCTCAGACATTCATTCTGCTGTGCTCTCCACAATTAGAAAACTAGAGGA 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1600 AGTCGCACCATGCTCACAAATGATGGCTCAGACATTCATTCTGCTGTGCTCTCCACAATTAGAAAACTAGAGGA 1673
Query 1777 TGGATATTTTGGAGGAGCCAGAGTAAAATTAGGGAACCTTTCGGAATTTCTCACCACATCGTTCTACACATATC 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1674 TGGATATTTTGGAGGAGCCAGAGTAAAATTAGGGAACCTTTCGGAATTTCTCACCACATCGTTCTACACATATC 1747
Query 1851 TGACTTTTCTGGATCCAGACTGTGATGAGAAGTTGTTTGACAATGCCAGCGAAGGGACTTTCAGTCCTGATAGT 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1748 TGACTTTTCTGGATCCAGACTGTGATGAGAAGTTGTTTGACAATGCCAGCGAAGGGACTTTCAGTCCTGATAGT 1821
Query 1925 GATTCAGATTTGGTAGGATATCTGGAAGACACCTGTAATCAAGAAAGCCAAGACGAACTTGACCATTATATCAA 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1822 GATTCAGATTTGGTAGGATATCTGGAAGACACCTGTAATCAAGAAAGCCAAGACGAACTTGACCATTATATCAA 1895
Query 1999 CCACCTTCTGCAAAGCACATCGTTGAGGTCCTATCTGCCTCCTCTTTGTAAGAACACAGAAGACCGCCATGTCT 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1896 CCACCTTCTGCAAAGCACATCGTTGAGGTCCTATCTGCCTCCTCTTTGTAAGAACACAGAAGACCGCCATGTCT 1969
Query 2073 TCAGTGCTATCCACTCCACGCGGGACATACTTTCTGTGATGGCAAAAGCAAAGGGTTTGGAAGTTCCATTTGTT 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1970 TCAGTGCTATCCACTCCACGCGGGACATACTTTCTGTGATGGCAAAAGCAAAGGGTTTGGAAGTTCCATTTGTT 2043
Query 2147 CCCATGACTTTGCCGACTAAAGTTCTAAGTGCCCACCGTAAATCACTGAATCTTGTTGATTCTCCTCAGCCACT 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2044 CCCATGACTTTGCCGACTAAAGTTCTAAGTGCCCACCGTAAATCACTGAATCTTGTTGATTCTCCTCAGCCACT 2117
Query 2221 CCTAGAAAAGGTTCCTGAAAGTGACTTTCAGTGGCCCAGAGATGACCATAGTGACGTGGACTGTGAGAAGCTGG 2294
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2118 CCTAGAAAAGGTTCCTGAAAGTGACTTTCAGTGGCCCAGAGATGACCATGGTGACGTGGACTGTGAGAAGCTGG 2191
Query 2295 TTGAGCAGCTAAAAGATTGTTCGAACCTACAGGACCAAGCAGACATTCTGTACATTCTTTATGTCATAAAGGGT 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2192 TTGAGCAGCTAAAAGATTGTTCGAACCTACAGGACCAAGCAGACATTCTGTACATTCTTTATGTCATAAAGGGT 2265
Query 2369 CCCAGCTGGGACACAAATCTCTCTGGACAGCACGGGGTCACCGTTCAAAACCTTCTTGGTGAGCTCTATGGGAA 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2266 CCCAGCTGGGACACAAATCTCTCTGGACAGCACGGGGTCACCGTTCAAAACCTTCTTGGTGAGCTCTATGGGAA 2339
Query 2443 AGCCGGCTTGAACCAGGAGTGGGGTCTGATTCGCTACATCTCAGGCCTTCTCAGGAAGAAAGTGGAGGTCCTGG 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2340 AGCCGGCTTGAACCAGGAGTGGGGTCTGATTCGCTACATCTCAGGCCTTCTCAGGAAGAAAGTGGAGGTCCTGG 2413
Query 2517 CTGAGGCCTGCACAGACCTGCTTTCGCACCAGAAGCAGCTCACCGTGGGCCTGCCGCCCGAGCCCCGGGAGAAG 2590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2414 CTGAGGCCTGCACAGACCTGCTTTCGCACCAGAAGCAGCTCACCGTGGGCCTGCCGCCCGAGCCCCGGGAGAAG 2487
Query 2591 ATCATCTCTGCGCCCCTTCCCCCAGAGGAGCTCACAAAACTCATCTACGAGGCCAGTGGGCAGGACATCAGCAT 2664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2488 ATCATCTCTGCGCCCCTTCCCCCAGAGGAGCTCACAAAACTCATCTACGAGGCCAGTGGGCAGGACATCAGCAT 2561
Query 2665 TGCCGTCCTCACGCAGGAGATTGTGGTTTACCTGGCCATGTATGTCAGGGCGCAGCCCAGCCTCTTTGTGGAGA 2738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2562 TGCCGTCCTCACGCAGGAGATTGTGGTTTACCTGGCCATGTATGTCAGGGCGCAGCCCAGCCTCTTTGTGGAGA 2635
Query 2739 TGCTGAGACTCCGGATTGGACTGATCATTCAGGTGATGGCCACGGAGCTGGCACGGAGCCTGAACTGCTCAGGA 2812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2636 TGCTGAGACTCCGGATTGGACTGATCATTCAGGTGATGGCCACGGAGCTGGCACGGAGCCTGAACTGCTCAGGA 2709
Query 2813 GAAGAGGCTTCTGAAAGTTTGATGAACCTCAGCCCTTTCGATATGAAAAATCTCCTGCACCATATTCTAAGTGG 2886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2710 GAAGAGGCTTCTGAAAGTTTGATGAACCTCAGCCCTTTCGATATGAAAAATCTCCTGCACCATATTCTAAGTGG 2783
Query 2887 GAAAGAGTTTGGCGTTGAAAGAAGTGTGCGCCCTATCCACTC--TCACAATCAGCCCTA-CATCT-CAT-CACG 2955
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| .||||..|||||||| ||||| ||| ||||
Sbjct 2784 GAAAGAGTTTGGCGTTGAAAGAAGTGTGCGCCCTATCCACTCCTCCACATCCAGCCCTACCATCTCCATCCACG 2857
Query 2956 AGGT--GTCATA-CGGAGTCA-CAAAACTGAGAGGAGTGGCATT-ACAGACTGA-GAGTGAAATGAAACAGATG 3023
|||| |.|||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2858 AGGTGGGCCATACCGGAGTCACCAAAACTGAGAGGAGTGGCATTAACAGACTGAGGAGTGAAATGAAACAGATG 2931
Query 3024 ACTAGGCGGTTTAGTGCTGATGAACAGTTCTTTTCTGTGGGCCAGGCCGCGTCCAGCAGTGCGCATTCCTCCAA 3097
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2932 ACTAGGCGGTTTAGTGCTGATGAACAGTTCTTTTCTGTGGGCCAGGCCGCGTCCAGCAGTGCGCATTCCTCCAA 3005
Query 3098 GTCTGCG------------------------AGGTCCAGCACCCCATCCTCGCCCACTGGCACGTCATCCTCAG 3147
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3006 GTCTGCGGTAACAGTGCCTCGGGATTATTGTAGGTCCAGCACCCCATCCTCGCCCACTGGCACGTCATCCTCAG 3079
Query 3148 ACTCGGGAGGACATCACATCGGCTGGGGTGAGCGGCAGGGCCAGTGGCTGCGCAGGAGAAGGCTGGATGGGGCC 3221
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3080 ACTCGGGAGGACATCACATCGGCTGGGGTGAGCGGCAGGGCCAGTGGCTGCGCAGGAGAAGGCTGGATGGGGCC 3153
Query 3222 ATCAACAGGGTCCCCGTGGGATTCTACCAGAGGGTGTGGAAGATCCTCCAGAAGTGCCACGGTCTCTCCATCGA 3295
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3154 ATCAACAGGGTCCCCGTGGGATTCTACCAGAGGGTGTGGAAGATCCTCCAGAAGTGCCACGGTCTCTCCATCGA 3227
Query 3296 TGGTTATGTCCTCCCATCCTCGACGACCCGAGAGATGACCCCGCATGAGATCAAGTTTGCTGTCCATGTCGAAT 3369
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3228 TGGTTATGTCCTCCCATCCTCGACGACCCGAGAGATGACCCCGCATGAGATCAAGTTTGCTGTCCATGTCGAAT 3301
Query 3370 CGGTGCTGAACCGCGTGCCGCAGCCCGAGTACCGGCAGCTGCTGGTGGAAGCCATCATGGTGCTGACGCTGCTC 3443
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3302 CGGTGCTGAACCGCGTGCCGCAGCCCGAGTACCGGCAGCTGCTGGTGGAAGCCATCATGGTGCTGACGCTGCTC 3375
Query 3444 TCGGACACGGAGATGACCAGCATCGGGGGCATCATCCACGTGGACCAGATCGTGCAGATGGCCAGTCAGCTGTT 3517
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3376 TCGGACACGGAGATGACCAGCATCGGGGGCATCATCCACGTGGACCAGATCGTGCAGATGGCCAGTCAGCTGTT 3449
Query 3518 CTTGCAGGACCAGGTGTCAATTGGTGCCATGGACACCCTGGAGAAAGACCAAGCCACAGGAATCTGCCACTTCT 3591
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3450 CTTGCAGGACCAGGTGTCAATTGGTGCCATGGACACCCTGGAGAAAGACCAAGCCACAGGAATCTGCCACTTCT 3523
Query 3592 TTTATGACAGCGCTCCGAGTGGGGCTTATGGGACGATGACCTACCTAACAAGAGCAGTGGCTTCTTATTTGCAG 3665
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3524 TTTATGACAGCGCTCCGAGTGGGGCTTATGGGACGATGACCTACCTAACAAGAGCAGTGGCTTCTTATTTGCAG 3597
Query 3666 GAATTGTTGCCCAATTCGGGCTGCCAGATGCAA 3698
|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3598 GAATTGTTGCCCAATTCGGGCTGCCAGATGCAA 3630