Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14752
- Subject:
- XM_017029580.2
- Aligned Length:
- 3733
- Identities:
- 2782
- Gaps:
- 945
Alignment
Query 1 ATGCGGAGCAGGAGCAATTCCGGGGTCCGCTTGGACGGGTACGCGCGGCTGGTGCAGCAAACCATCCTGTGTTA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CCAGAATCCCGTCACGGGGCTGCTGTCAGCCAGCCATGAGCAGAAGGATGCCTGGGTGCGGGATAACATCTACA 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 GTATCCTGGCCGTGTGGGGCCTGGGCATGGCCTACCGTAAGAATGCAGACCGCGATGAGGACAAGGCCAAGGCC 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 TACGAGCTGGAGCAGAACGTGGTGAAGCTGATGCGAGGTCTTCTCCAGTGCATGATGAGACAGGTGGCCAAAGT 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 GGAGAAGTTCAAACACACTCAGAGCACCAAGGACAGCCTGCACGCCAAGTACAACACCGCCACCTGTGGCACGG 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 TGGTGGGCGACGACCAGTGGGGCCACCTCCAGGTGGATGCCACCTCTCTCTTCCTCCTGTTCCTGGCCCAGATG 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 ACCGCCTCAGGCTTACGTATCATTTTCACTCTCGATGAGGTGGCCTTCATACAGAATCTTGTCTTTTACATAGA 518
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 519 AGCTGCATATAAAGTCGCTGATTATGGAATGTGGGAGCGTGGAGATAAGACTAATCAGGGCATCCCGGAATTGA 592
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 593 ATGCAAGCTCCGTAGGAATGGCCAAGGCAGCTCTTGAGGCAATTGATGAACTGGACCTTTTTGGAGCCCATGGA 666
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 667 GGACGCAAGTCAGTGATTCATGTTCTGCCAGATGAGGTCGAGCACTGCCAGTCTTATTCTTGTTCTCCATGCTG 740
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 741 CCCAAGAAGCGTCGACATCTAAAGAAATTGATGCTGGACTTCTTTCCATTATTTCCTTCCCGGCCTTTGCAGTG 814
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 815 GAAGATGTAAACCTTGTAAATGTGACCAAAAATGAAATTATTTCTAAGCTCCAGGGGCGTTATGGATGCTGTCG 888
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 -------------------------------ATGAAATTATTTCTAAGCTCCAGGGGCGTTATGGATGCTGTCG 43
Query 889 CTTCCTTCGAGATGGTTATAAAACTCCAAGAGAGGACCCTAATCGACTGCATTATGACCCTGCTGAACTCAAGC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 44 CTTCCTTCGAGATGGTTATAAAACTCCAAGAGAGGACCCTAATCGACTGCATTATGACCCTGCTGAACTCAAGC 117
Query 963 TCTTCGAAAACATTGAATGTGAGTGGCCTGTGTTTTGGACATATTTTATAATAGATGGAGTCTTCAGTGGTGAT 1036
||||||||||||||||||
Sbjct 118 TCTTCGAAAACATTGAAT-------------------------------------------------------- 135
Query 1037 GCTGTTCAGGTCCAAGAATACCGAGAGGCCCTGGAGGGAATACTCATCAGAGGCAAGAATGGGATCCGCCTGGT 1110
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 136 ---------GTCCAAGAATACCGAGAGGCCCTGGAGGGAATACTCATCAGAGGCAAGAATGGGATCCGCCTGGT 200
Query 1111 GCCTGAACTCTACGCTGTCCCGCCTAACAAGGTAGATGAAGAGTACAAGAATCCTCACACAGTAGACCGAGTTC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 201 GCCTGAACTCTACGCTGTCCCGCCTAACAAGGTAGATGAAGAGTACAAGAATCCTCACACAGTAGACCGAGTTC 274
Query 1185 CTATGGGGAAGGTGCCTCATCTGTGGGGCCAATCCTTGTACATCCTCAGCTCGCTGTTGGCAGAGGGATTCCTT 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 275 CTATGGGGAAGGTGCCTCATCTGTGGGGCCAATCCTTGTACATCCTCAGCTCGCTGTTGGCAGAGGGATTCCTT 348
Query 1259 GCCGCTGGTGAAATCGATCCCTTAAATAGAAGATTTTCCACTTCAGTCAAACCTGATGTTGTAGTACAAGTTAC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 349 GCCGCTGGTGAAATCGATCCCTTAAATAGAAGATTTTCCACTTCAGTCAAACCTGATGTTGTAGTACAAGTTAC 422
Query 1333 TGTTTTGGCAGAAAACAATCACATTAAGGACTTATTGAGGAAACACGGGGTGAACGTCCAGAGTATCGCGGACA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 423 TGTTTTGGCAGAAAACAATCACATTAAGGACTTATTGAGGAAACACGGGGTGAACGTCCAGAGTATCGCGGACA 496
Query 1407 TTCATCCAATTCAAGTCCAGCCGGGCCGGATTCTTAGTCACATATATGCCAAGCTTGGACGGAATAAGAATATG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 497 TTCATCCAATTCAAGTCCAGCCGGGCCGGATTCTTAGTCACATATATGCCAAGCTTGGACGGAATAAGAATATG 570
Query 1481 AATTTGAGTGGGCGACCGTATCGACATATTGGTGTCCTTGGAACCTCTAAACTATATGTGATTAGGAACCAAAT 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 571 AATTTGAGTGGGCGACCGTATCGACATATTGGTGTCCTTGGAACCTCTAAACTATATGTGATTAGGAACCAAAT 644
Query 1555 CTTTACTTTTACACCCCAGTTCACCGACGAGCATCACTTCTACCTGGCCCTCGACAATGAGATGATCGTGGAGA 1628
||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 645 CTTTACTTTTACACCCCAGTTCACCGACCAGCATCACTTCTACCTGGCCCTCGACAATGAGATGATCGTGGAGA 718
Query 1629 TGCTAAGGATCGAGCTGGCCTACCTGTGCACCTGCTGGAGGATGACGGGCAGACCCACACTCACCTTCCCCATC 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 719 TGCTAAGGATCGAGCTGGCCTACCTGTGCACCTGCTGGAGGATGACGGGCAGACCCACACTCACCTTCCCCATC 792
Query 1703 AGTCGCACCATGCTCACAAATGATGGCTCAGACATTCATTCTGCTGTGCTCTCCACAATTAGAAAACTAGAGGA 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 793 AGTCGCACCATGCTCACAAATGATGGCTCAGACATTCATTCTGCTGTGCTCTCCACAATTAGAAAACTAGAGGA 866
Query 1777 TGGATATTTTGGAGGAGCCAGAGTAAAATTAGGGAACCTTTCGGAATTTCTCACCACATCGTTCTACACATATC 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 867 TGGATATTTTGGAGGAGCCAGAGTAAAATTAGGGAACCTTTCGGAATTTCTCACCACATCGTTCTACACATATC 940
Query 1851 TGACTTTTCTGGATCCAGACTGTGATGAGAAGTTGTTTGACAATGCCAGCGAAGGGACTTTCAGTCCTGATAGT 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 941 TGACTTTTCTGGATCCAGACTGTGATGAGAAGTTGTTTGACAATGCCAGCGAAGGGACTTTCAGTCCTGATAGT 1014
Query 1925 GATTCAGATTTGGTAGGATATCTGGAAGACACCTGTAATCAAGAAAGCCAAGACGAACTTGACCATTATATCAA 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1015 GATTCAGATTTGGTAGGATATCTGGAAGACACCTGTAATCAAGAAAGCCAAGACGAACTTGACCATTATATCAA 1088
Query 1999 CCACCTTCTGCAAAGCACATCGTTGAGGTCCTATCTGCCTCCTCTTTGTAAGAACACAGAAGACCGCCATGTCT 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1089 CCACCTTCTGCAAAGCACATCGTTGAGGTCCTATCTGCCTCCTCTTTGTAAGAACACAGAAGACCGCCATGTCT 1162
Query 2073 TCAGTGCTATCCACTCCACGCGGGACATACTTTCTGTGATGGCAAAAGCAAAGGGTTTGGAAGTTCCATTTGTT 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1163 TCAGTGCTATCCACTCCACGCGGGACATACTTTCTGTGATGGCAAAAGCAAAGGGTTTGGAAGTTCCATTTGTT 1236
Query 2147 CCCATGACTTTGCCGACTAAAGTTCTAAGTGCCCACCGTAAATCACTGAATCTTGTTGATTCTCCTCAGCCACT 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1237 CCCATGACTTTGCCGACTAAAGTTCTAAGTGCCCACCGTAAATCACTGAATCTTGTTGATTCTCCTCAGCCACT 1310
Query 2221 CCTAGAAAAGGTTCCTGAAAGTGACTTTCAGTGGCCCAGAGATGACCATAGTGACGTGGACTGTGAGAAGCTGG 2294
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1311 CCTAGAAAAGGTTCCTGAAAGTGACTTTCAGTGGCCCAGAGATGACCATGGTGACGTGGACTGTGAGAAGCTGG 1384
Query 2295 TTGAGCAGCTAAAAGATTGTTCGAACCTACAGGACCAAGCAGACATTCTGTACATTCTTTATGTCATAAAGGGT 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1385 TTGAGCAGCTAAAAGATTGTTCGAACCTACAGGACCAAGCAGACATTCTGTACATTCTTTATGTCATAAAGGGT 1458
Query 2369 CCCAGCTGGGACACAAATCTCTCTGGACAGCACGGGGTCACCGTTCAAAACCTTCTTGGTGAGCTCTATGGGAA 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1459 CCCAGCTGGGACACAAATCTCTCTGGACAGCACGGGGTCACCGTTCAAAACCTTCTTGGTGAGCTCTATGGGAA 1532
Query 2443 AGCCGGCTTGAACCAGGAGTGGGGTCTGATTCGCTACATCTCAGGCCTTCTCAGGAAGAAAGTGGAGGTCCTGG 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1533 AGCCGGCTTGAACCAGGAGTGGGGTCTGATTCGCTACATCTCAGGCCTTCTCAGGAAGAAAGTGGAGGTCCTGG 1606
Query 2517 CTGAGGCCTGCACAGACCTGCTTTCGCACCAGAAGCAGCTCACCGTGGGCCTGCCGCCCGAGCCCCGGGAGAAG 2590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1607 CTGAGGCCTGCACAGACCTGCTTTCGCACCAGAAGCAGCTCACCGTGGGCCTGCCGCCCGAGCCCCGGGAGAAG 1680
Query 2591 ATCATCTCTGCGCCCCTTCCCCCAGAGGAGCTCACAAAACTCATCTACGAGGCCAGTGGGCAGGACATCAGCAT 2664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1681 ATCATCTCTGCGCCCCTTCCCCCAGAGGAGCTCACAAAACTCATCTACGAGGCCAGTGGGCAGGACATCAGCAT 1754
Query 2665 TGCCGTCCTCACGCAGGAGATTGTGGTTTACCTGGCCATGTATGTCAGGGCGCAGCCCAGCCTCTTTGTGGAGA 2738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1755 TGCCGTCCTCACGCAGGAGATTGTGGTTTACCTGGCCATGTATGTCAGGGCGCAGCCCAGCCTCTTTGTGGAGA 1828
Query 2739 TGCTGAGACTCCGGATTGGACTGATCATTCAGGTGATGGCCACGGAGCTGGCACGGAGCCTGAACTGCTCAGGA 2812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1829 TGCTGAGACTCCGGATTGGACTGATCATTCAGGTGATGGCCACGGAGCTGGCACGGAGCCTGAACTGCTCAGGA 1902
Query 2813 GAAGAGGCTTCTGAAAGTTTGATGAACCTCAGCCCTTTCGATATGAAAAATCTCCTGCACCATATTCTAAGTGG 2886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1903 GAAGAGGCTTCTGAAAGTTTGATGAACCTCAGCCCTTTCGATATGAAAAATCTCCTGCACCATATTCTAAGTGG 1976
Query 2887 GAAAGAGTTTGGCGTTGAAAGAAGTGTGCGCCCTATCCACTC--TCACAATCAGCCCTA-CATCT-CAT-CACG 2955
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| .||||..|||||||| ||||| ||| ||||
Sbjct 1977 GAAAGAGTTTGGCGTTGAAAGAAGTGTGCGCCCTATCCACTCCTCCACATCCAGCCCTACCATCTCCATCCACG 2050
Query 2956 AGGT--GTCATA-CGGAGTCA-CAAAACTGAGAGGAGTGGCATT-ACAGACTGA-GAGTGAAATGAAACAGATG 3023
|||| |.|||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct 2051 AGGTGGGCCATACCGGAGTCACCAAAACTGAGAGGAGTGGCATTAACAGACTGAGGAGTGAAATGAAACAGATG 2124
Query 3024 ACTAGGCGGTTTAGTGCTGATGAACAGTTCTTTTCTGTGGGCCAGGCCGCGTCCAGCAGTGCGCATTCCTCCAA 3097
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2125 ACTAGGCGGTTTAGTGCTGATGAACAGTTCTTTTCTGTGGGCCAGGCCGCGTCCAGCAGTGCGCATTCCTCCAA 2198
Query 3098 GTCTGCG------------------------AGGTCCAGCACCCCATCCTCGCCCACTGGCACGTCATCCTCAG 3147
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2199 GTCTGCGGTAACAGTGCCTCGGGATTATTGTAGGTCCAGCACCCCATCCTCGCCCACTGGCACGTCATCCTCAG 2272
Query 3148 ACTCGGGAGGACATCACATCGGCTGGGGTGAGCGGCAGGGCCAGTGGCTGCGCAGGAGAAGGCTGGATGGGGCC 3221
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2273 ACTCGGGAGGACATCACATCGGCTGGGGTGAGCGGCAGGGCCAGTGGCTGCGCAGGAGAAGGCTGGATGGGGCC 2346
Query 3222 ATCAACAGGGTCCCCGTGGGATTCTACCAGAGGGTGTGGAAGATCCTCCAGAAGTGCCACGGTCTCTCCATCGA 3295
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2347 ATCAACAGGGTCCCCGTGGGATTCTACCAGAGGGTGTGGAAGATCCTCCAGAAGTGCCACGGTCTCTCCATCGA 2420
Query 3296 TGGTTATGTCCTCCCATCCTCGACGACCCGAGAGATGACCCCGCATGAGATCAAGTTTGCTGTCCATGTCGAAT 3369
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2421 TGGTTATGTCCTCCCATCCTCGACGACCCGAGAGATGACCCCGCATGAGATCAAGTTTGCTGTCCATGTCGAAT 2494
Query 3370 CGGTGCTGAACCGCGTGCCGCAGCCCGAGTACCGGCAGCTGCTGGTGGAAGCCATCATGGTGCTGACGCTGCTC 3443
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2495 CGGTGCTGAACCGCGTGCCGCAGCCCGAGTACCGGCAGCTGCTGGTGGAAGCCATCATGGTGCTGACGCTGCTC 2568
Query 3444 TCGGACACGGAGATGACCAGCATCGGGGGCATCATCCACGTGGACCAGATCGTGCAGATGGCCAGTCAGCTGTT 3517
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2569 TCGGACACGGAGATGACCAGCATCGGGGGCATCATCCACGTGGACCAGATCGTGCAGATGGCCAGTCAGCTGTT 2642
Query 3518 CTTGCAGGACCAGGTGTCAATTGGTGCCATGGACACCCTGGAGAAAGACCAAGCCACAGGAATCTGCCACTTCT 3591
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2643 CTTGCAGGACCAGGTGTCAATTGGTGCCATGGACACCCTGGAGAAAGACCAAGCCACAGGAATCTGCCACTTCT 2716
Query 3592 TTTATGACAGCGCTCCGAGTGGGGCTTATGGGACGATGACCTACCTAACAAGAGCAGTGGCTTCTTATTTGCAG 3665
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2717 TTTATGACAGCGCTCCGAGTGGGGCTTATGGGACGATGACCTACCTAACAAGAGCAGTGGCTTCTTATTTGCAG 2790
Query 3666 GAATTGTTGCCCAATTCGGGCTGCCAGATGCAA 3698
|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2791 GAATTGTTGCCCAATTCGGGCTGCCAGATGCAA 2823
