Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_14755
Subject:
NM_001258459.1
Aligned Length:
1259
Identities:
1159
Gaps:
98

Alignment

Query    1  ATGACCCGGGACGAGGCACTGCCGGACTCTCATTCTGCACAGGACTTCTATGAGAATTATGAGCCCAAAGAGAT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGACCCGGGACGAGGCACTGCCGGACTCTCATTCTGCACAGGACTTCTATGAGAATTATGAGCCCAAAGAGAT  74

Query   75  CCTGGGCAGGGGCGTTAGCAGTGTGGTCAGGCGATGCATCCACAAGCCCACGAGCCAGGAGTACGCCGTGAAGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTGGGCAGGGGCGTTAGCAGTGTGGTCAGGCGATGCATCCACAAGCCCACGAGCCAGGAGTACGCCGTGAAGG  148

Query  149  TCATCGACGTCACCGGTGGAGGCAGCTTCAGCCCGGAGGAGGTGCGGGAGCTGCGAGAAGCCACGCTGAAGGAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCATCGACGTCACCGGTGGAGGCAGCTTCAGCCCGGAGGAGGTGCGGGAGCTGCGAGAAGCCACGCTGAAGGAG  222

Query  223  GTGGACATCCTGCGCAAGGTCTCAGGGCACCCCAACATCATACAGCTGAAGGACACTTATGAGACCAACACTTT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTGGACATCCTGCGCAAGGTCTCAGGGCACCCCAACATCATACAGCTGAAGGACACTTATGAGACCAACACTTT  296

Query  297  CTTCTTCTTGGTGTTTGACCT-----------------------------------------------------  317
            |||||||||||||||||||||                                                     
Sbjct  297  CTTCTTCTTGGTGTTTGACCTATGGGAAGACACTGATACAATGGAGATGGAACAGAAATGGTGCTTGGGCTGGG  370

Query  318  -------------------------------------------GATGAAGAGAGGGGAGCTCTTTGACTACCTC  348
                                                       |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACTCTCCCAAGTCCACCAACTTCAGGGCCCAGGGCAGGGCAAGGATGAAGAGAGGGGAGCTCTTTGACTACCTC  444

Query  349  ACTGAGAAGGTCACCTTGAGTGAGAAGGAAACCAGAAAANATCATGCGAGCTCTGCTGGAGGTGATCTGCACCT  422
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ACTGAGAAGGTCACCTTGAGTGAGAAGGAAACCAG-AAAGATCATGCGAGCTCTGCTGGAGGTGATCTGCACCT  517

Query  423  TGCACAAACTCAACATCGTGCACCGGGACCTGAAGCCCGAGAACATTCTCTTGGATGACAACATGAACATCAAG  496
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  518  TGCACAAACTCAACATCGTGCACCGGGACCTGAAGCCCGAGAACATTCTCTTGGATGACAACATGAACATCAAG  591

Query  497  CTCACAGACTTTGGCTTTTCCTGCCAGCTGGAGCCGGGAGAGAGGCTGCGAGAGGTCTGTGGGACCCCCAGTTA  570
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  592  CTCACAGACTTTGGCTTTTCCTGCCAGCTGGAGCCGGGAGAGAGGCTGCGAGAGGTCTGCGGGACCCCCAGTTA  665

Query  571  CCTGGCCCCTGAGATTATCGAGTGCTCCATGAATGAGGACCACCCGGGCTACGGGAAAGAGGTGGACATGTGGA  644
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  666  CCTGGCCCCTGAGATTATCGAGTGCTCCATGAATGAGGACCACCCGGGCTACGGGAAAGAGGTGGACATGTGGA  739

Query  645  GCACTGGCGTCATCATGTACACGCTGCTGGCCGGCTCCCCGCCCTTCTGGCACCGGAAGCAGATGCTGATGCTG  718
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  740  GCACTGGCGTCATCATGTACACGCTGCTGGCCGGCTCCCCGCCCTTCTGGCACCGGAAGCAGATGCTGATGCTG  813

Query  719  AGGATGATCATGAGCGGCAACTACCAGTTTGGCTCGCCCGAGTGGGATGATTACTCGGACACCGTGAAGGACCT  792
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  814  AGGATGATCATGAGCGGCAACTACCAGTTTGGCTCGCCCGAGTGGGATGATTACTCGGACACCGTGAAGGACCT  887

Query  793  GGTTCTCCCGATTCCTGGTGGTGCAACCCCAGAACCGCTACACAGCGGAAGAGGCCTTGGCACACCCCTTCTTC  866
            || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  888  GG-TCTCCCGATTCCTGGTGGTGCAACCCCAGAACCGCTACACAGCGGAAGAGGCCTTGGCACACCCCTTCTTC  960

Query  867  CAGCAGTACTTGGTGGAGGAAGTGCGGCACTTCAGCCCCCGGGGGAAGTTCAAGGTGATCGCTCTGACCGTGCT  940
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  961  CAGCAGTACTTGGTGGAGGAAGTGCGGCACTTCAGCCCCCGGGGGAAGTTCAAGGTGATCGCTCTGACCGTGCT  1034

Query  941  GGCTTCAGTGCGGATCTACTACCAGTACCGCCGGGTGAAGCCTGTGACCCGGGAGATCGTCATCCGAGACCCCT  1014
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1035  GGCTTCAGTGCGGATCTACTACCAGTACCGCCGGGTGAAGCCTGTGACCCGGGAGATCGTCATCCGAGACCCCT  1108

Query 1015  ATGCCCTCCGGCCTCTGCGCCGGCTCATCGACGCCTACGCTTTCCGAATCTATGGCCACTGGGTGAAGAAGGGG  1088
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1109  ATGCCCTCCGGCCTCTGCGCCGGCTCATCGACGCCTACGCTTTCCGAATCTATGGCCACTGGGTGAAGAAGGGG  1182

Query 1089  CAGCAGCAGAACCGGGCAGCCCTTTTCGAGAACACACCCAAGGCCGTGCTCCTCTCCCTGGCCGAGGAGGACTA  1162
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1183  CAGCAGCAGAACCGGGCAGCCCTTTTCGAGAACACACCCAAGGCCGTGCTCCTCTCCCTGGCCGAGGAGGACTA  1256

Query 1163  C  1163
            |
Sbjct 1257  C  1257