Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14755
- Subject:
- NM_001258459.1
- Aligned Length:
- 1259
- Identities:
- 1159
- Gaps:
- 98
Alignment
Query 1 ATGACCCGGGACGAGGCACTGCCGGACTCTCATTCTGCACAGGACTTCTATGAGAATTATGAGCCCAAAGAGAT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGACCCGGGACGAGGCACTGCCGGACTCTCATTCTGCACAGGACTTCTATGAGAATTATGAGCCCAAAGAGAT 74
Query 75 CCTGGGCAGGGGCGTTAGCAGTGTGGTCAGGCGATGCATCCACAAGCCCACGAGCCAGGAGTACGCCGTGAAGG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CCTGGGCAGGGGCGTTAGCAGTGTGGTCAGGCGATGCATCCACAAGCCCACGAGCCAGGAGTACGCCGTGAAGG 148
Query 149 TCATCGACGTCACCGGTGGAGGCAGCTTCAGCCCGGAGGAGGTGCGGGAGCTGCGAGAAGCCACGCTGAAGGAG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TCATCGACGTCACCGGTGGAGGCAGCTTCAGCCCGGAGGAGGTGCGGGAGCTGCGAGAAGCCACGCTGAAGGAG 222
Query 223 GTGGACATCCTGCGCAAGGTCTCAGGGCACCCCAACATCATACAGCTGAAGGACACTTATGAGACCAACACTTT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GTGGACATCCTGCGCAAGGTCTCAGGGCACCCCAACATCATACAGCTGAAGGACACTTATGAGACCAACACTTT 296
Query 297 CTTCTTCTTGGTGTTTGACCT----------------------------------------------------- 317
|||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CTTCTTCTTGGTGTTTGACCTATGGGAAGACACTGATACAATGGAGATGGAACAGAAATGGTGCTTGGGCTGGG 370
Query 318 -------------------------------------------GATGAAGAGAGGGGAGCTCTTTGACTACCTC 348
|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ACTCTCCCAAGTCCACCAACTTCAGGGCCCAGGGCAGGGCAAGGATGAAGAGAGGGGAGCTCTTTGACTACCTC 444
Query 349 ACTGAGAAGGTCACCTTGAGTGAGAAGGAAACCAGAAAANATCATGCGAGCTCTGCTGGAGGTGATCTGCACCT 422
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ACTGAGAAGGTCACCTTGAGTGAGAAGGAAACCAG-AAAGATCATGCGAGCTCTGCTGGAGGTGATCTGCACCT 517
Query 423 TGCACAAACTCAACATCGTGCACCGGGACCTGAAGCCCGAGAACATTCTCTTGGATGACAACATGAACATCAAG 496
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 518 TGCACAAACTCAACATCGTGCACCGGGACCTGAAGCCCGAGAACATTCTCTTGGATGACAACATGAACATCAAG 591
Query 497 CTCACAGACTTTGGCTTTTCCTGCCAGCTGGAGCCGGGAGAGAGGCTGCGAGAGGTCTGTGGGACCCCCAGTTA 570
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 592 CTCACAGACTTTGGCTTTTCCTGCCAGCTGGAGCCGGGAGAGAGGCTGCGAGAGGTCTGCGGGACCCCCAGTTA 665
Query 571 CCTGGCCCCTGAGATTATCGAGTGCTCCATGAATGAGGACCACCCGGGCTACGGGAAAGAGGTGGACATGTGGA 644
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 666 CCTGGCCCCTGAGATTATCGAGTGCTCCATGAATGAGGACCACCCGGGCTACGGGAAAGAGGTGGACATGTGGA 739
Query 645 GCACTGGCGTCATCATGTACACGCTGCTGGCCGGCTCCCCGCCCTTCTGGCACCGGAAGCAGATGCTGATGCTG 718
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 740 GCACTGGCGTCATCATGTACACGCTGCTGGCCGGCTCCCCGCCCTTCTGGCACCGGAAGCAGATGCTGATGCTG 813
Query 719 AGGATGATCATGAGCGGCAACTACCAGTTTGGCTCGCCCGAGTGGGATGATTACTCGGACACCGTGAAGGACCT 792
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 814 AGGATGATCATGAGCGGCAACTACCAGTTTGGCTCGCCCGAGTGGGATGATTACTCGGACACCGTGAAGGACCT 887
Query 793 GGTTCTCCCGATTCCTGGTGGTGCAACCCCAGAACCGCTACACAGCGGAAGAGGCCTTGGCACACCCCTTCTTC 866
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 888 GG-TCTCCCGATTCCTGGTGGTGCAACCCCAGAACCGCTACACAGCGGAAGAGGCCTTGGCACACCCCTTCTTC 960
Query 867 CAGCAGTACTTGGTGGAGGAAGTGCGGCACTTCAGCCCCCGGGGGAAGTTCAAGGTGATCGCTCTGACCGTGCT 940
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 CAGCAGTACTTGGTGGAGGAAGTGCGGCACTTCAGCCCCCGGGGGAAGTTCAAGGTGATCGCTCTGACCGTGCT 1034
Query 941 GGCTTCAGTGCGGATCTACTACCAGTACCGCCGGGTGAAGCCTGTGACCCGGGAGATCGTCATCCGAGACCCCT 1014
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1035 GGCTTCAGTGCGGATCTACTACCAGTACCGCCGGGTGAAGCCTGTGACCCGGGAGATCGTCATCCGAGACCCCT 1108
Query 1015 ATGCCCTCCGGCCTCTGCGCCGGCTCATCGACGCCTACGCTTTCCGAATCTATGGCCACTGGGTGAAGAAGGGG 1088
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1109 ATGCCCTCCGGCCTCTGCGCCGGCTCATCGACGCCTACGCTTTCCGAATCTATGGCCACTGGGTGAAGAAGGGG 1182
Query 1089 CAGCAGCAGAACCGGGCAGCCCTTTTCGAGAACACACCCAAGGCCGTGCTCCTCTCCCTGGCCGAGGAGGACTA 1162
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1183 CAGCAGCAGAACCGGGCAGCCCTTTTCGAGAACACACCCAAGGCCGTGCTCCTCTCCCTGGCCGAGGAGGACTA 1256
Query 1163 C 1163
|
Sbjct 1257 C 1257