Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14755
- Subject:
- NM_011079.3
- Aligned Length:
- 1168
- Identities:
- 1016
- Gaps:
- 9
Alignment
Query 1 ATGACCCGGGACGAGGCACTGCCGGACTCTCATTCTGCACAGGAC-TTCTATGAGAATTATGAGCCCAAAGAGA 73
|||||||||||.||.||.||.||.|||||.||||||||||| ||| |||||.|||||.|||||||||||.||||
Sbjct 1 ATGACCCGGGATGACGCCCTCCCTGACTCGCATTCTGCACA-GACTTTCTACGAGAACTATGAGCCCAAGGAGA 73
Query 74 TCCTGGGCAGGGGCGTTAGCAGTGTGGTCAGGCGATGCATCCACAAGCCCACGAGCCAGGAGTACGCCGTGAAG 147
|||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||..|||||||.|||||.|||||.
Sbjct 74 TCCTGGGCAGGGGAGTCAGCAGTGTGGTCAGGCGCTGCATCCACAAACCCACATGCCAGGAATACGCAGTGAAA 147
Query 148 GTCATCGACGTCACCGGTGGAGGCAGCTTCAGCCCGGAGGAGGTGCGGGAGCTGCGAGAAGCCACGCTGAAGGA 221
.||||.|||.|||||||.|||||.|||||.|||.|.||||||||.|.||||||.||.||||||||.||||||||
Sbjct 148 ATCATTGACATCACCGGAGGAGGAAGCTTTAGCTCTGAGGAGGTACAGGAGCTTCGGGAAGCCACCCTGAAGGA 221
Query 222 GGTGGACATCCTGCGCAAGGTCTCAGGGCACCCCAACATCATACAGCTGAAGGACACTTATGAGACCAACACTT 295
||||||||||||||..||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 222 GGTGGACATCCTGCAGAAGGTCTCGGGACACCCCAACATCATACAGCTGAAGGACACTTACGAGACCAACACTT 295
Query 296 TCTTCTTCTTGGTGTTTGACCTGATGAAGAGAGGGGAGCTCTTTGACTACCTCACTGAGAAGGTCACCTTGAGT 369
|||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|..
Sbjct 296 TCTTCTTCTTGGTATTTGATCTGATGAAGAGAGGGGAACTCTTTGACTATCTCACTGAGAAGGTCACCTTAACC 369
Query 370 GAGAAGGAAACCAGAAAANATCATGCGAGCTCTGCTGGAGGTGATCTGCACCTTGCACAAACTCAACATCGTGC 443
|||||||||||||| |||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||.||.|
Sbjct 370 GAGAAGGAAACCAG-AAAGATCATGCGGGCCCTGCTGGAGGTGATCTGTACCCTGCACAAACTCAACATTGTCC 442
Query 444 ACCGGGACCTGAAGCCCGAGAACATTCTCTTGGATGACAACATGAACATCAAGCTCACAGACTTTGGCTTTTCC 517
|.||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 443 ATCGGGACCTGAAGCCGGAGAATATCCTTTTGGATGACAACATGAATATAAAGCTCACAGACTTCGGGTTTTCC 516
Query 518 TGCCAGCTGGAGCCGGGAGAGAGGCTGCGAGAGGTCTGTGGGACCCCCAGTTACCTGGCCCCTGAGATTATCGA 591
|||||||||.||||.|||||||.|||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||..|
Sbjct 517 TGCCAGCTGCAGCCAGGAGAGAAGCTCCGAGAGGTTTGTGGGACTCCCAGTTATCTGGCCCCTGAAATCATACA 590
Query 592 GTGCTCCATGAATGAGGACCACCCGGGCTACGGGAAAGAGGTGGACATGTGGAGCACTGGCGTCATCATGTACA 665
||||||||||.|.||.|.|||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 591 GTGCTCCATGGACGACGGCCATCCTGGCTATGGGAAGGAGGTGGACATGTGGAGCACAGGCGTCATCATGTACA 664
Query 666 CGCTGCTGGCCGGCTCCCCGCCCTTCTGGCACCGGAAGCAGATGCTGATGCTGAGGATGATCATGAGCGGCAAC 739
|.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||.||.|||||||||||..||||||.
Sbjct 665 CTCTGCTGGCTGGCTCCCCGCCTTTCTGGCACCGGAAGCAAATGCTGATGTTGCGGATGATCATGGACGGCAAA 738
Query 740 TACCAGTTTGGCTCGCCCGAGTGGGATGATTACTCGGACACCGTGAAGGACCTGGT-TCTCCCGATTCCTGGTG 812
||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||.|||| ||| ||||||.|||||
Sbjct 739 TACCAGTTTGGCTCACCAGAGTGGGATGACTACTCTGACACAGTGAAAGACTTGGTGTCT--CGATTCTTGGTG 810
Query 813 GTGCAACCCCAGAACCGCTACACAGCGGAAGAGGCCTTGGCACACCCCTTCTTCCAGCAGTACTTGGTGGAGGA 886
||||||||.|||.||||||.|.|.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||.|||||.|.||.||.||
Sbjct 811 GTGCAACCTCAGGACCGCTGCTCGGCGGAAGAGGCCTTGGCACACCCTTTCTTTCAGGAGTACGTAGTAGAAGA 884
Query 887 AGTGCGGCACTTCAGCCCCCGGGGGAAGTTCAAGGTGATCGCTCTGACCGTGCTGGCTTCAGTGCGGATCTACT 960
|||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||..|||.||.||||||||.|||||...||||||||
Sbjct 885 AGTACGGCACTTCAGCCCCCGAGGGAAGTTCAAGGTGATCTGTCTAACTGTGCTGGCATCAGTAAAGATCTACT 958
Query 961 ACCAGTACCGCCGGGTGAAGCCTGTGACCCGGGAGATCGTCATCCGAGACCCCTATGCCCTCCGGCCTCTGCGC 1034
||||||||||.|||||||||||.||.|||.|||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.
Sbjct 959 ACCAGTACCGTCGGGTGAAGCCGGTAACCAGGGAGATCGTCATCCGAGACCCCTACGCCCTTCGGCCGCTGCGG 1032
Query 1035 CGGCTCATCGACGCCTACGCTTTCCGAATCTATGGCCACTGGGTGAAGAAGGGGCAGCAGCAGAACCGGGCAGC 1108
.|||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||.|.||.||
Sbjct 1033 AGGCTCATTGACGCCTATGCTTTCCGTATCTACGGCCACTGGGTGAAGAAAGGGCAACAGCAGAACAGAGCCGC 1106
Query 1109 CCTTTTCGAGAACACACCCAAGGCCGTGCTCCTCTCCCTGGCCGAGGAGGACTAC--- 1163
|||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||.||||.||||||||..||
Sbjct 1107 CCTCTTCGAGAACACGCCCAAGGCTGTGCTCCTCTCCTTGGCTGAGGAGGAGGACTTC 1164