Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_14755
Subject:
NM_011079.3
Aligned Length:
1168
Identities:
1016
Gaps:
9

Alignment

Query    1  ATGACCCGGGACGAGGCACTGCCGGACTCTCATTCTGCACAGGAC-TTCTATGAGAATTATGAGCCCAAAGAGA  73
            |||||||||||.||.||.||.||.|||||.||||||||||| ||| |||||.|||||.|||||||||||.||||
Sbjct    1  ATGACCCGGGATGACGCCCTCCCTGACTCGCATTCTGCACA-GACTTTCTACGAGAACTATGAGCCCAAGGAGA  73

Query   74  TCCTGGGCAGGGGCGTTAGCAGTGTGGTCAGGCGATGCATCCACAAGCCCACGAGCCAGGAGTACGCCGTGAAG  147
            |||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||..|||||||.|||||.|||||.
Sbjct   74  TCCTGGGCAGGGGAGTCAGCAGTGTGGTCAGGCGCTGCATCCACAAACCCACATGCCAGGAATACGCAGTGAAA  147

Query  148  GTCATCGACGTCACCGGTGGAGGCAGCTTCAGCCCGGAGGAGGTGCGGGAGCTGCGAGAAGCCACGCTGAAGGA  221
            .||||.|||.|||||||.|||||.|||||.|||.|.||||||||.|.||||||.||.||||||||.||||||||
Sbjct  148  ATCATTGACATCACCGGAGGAGGAAGCTTTAGCTCTGAGGAGGTACAGGAGCTTCGGGAAGCCACCCTGAAGGA  221

Query  222  GGTGGACATCCTGCGCAAGGTCTCAGGGCACCCCAACATCATACAGCTGAAGGACACTTATGAGACCAACACTT  295
            ||||||||||||||..||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  222  GGTGGACATCCTGCAGAAGGTCTCGGGACACCCCAACATCATACAGCTGAAGGACACTTACGAGACCAACACTT  295

Query  296  TCTTCTTCTTGGTGTTTGACCTGATGAAGAGAGGGGAGCTCTTTGACTACCTCACTGAGAAGGTCACCTTGAGT  369
            |||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|..
Sbjct  296  TCTTCTTCTTGGTATTTGATCTGATGAAGAGAGGGGAACTCTTTGACTATCTCACTGAGAAGGTCACCTTAACC  369

Query  370  GAGAAGGAAACCAGAAAANATCATGCGAGCTCTGCTGGAGGTGATCTGCACCTTGCACAAACTCAACATCGTGC  443
            |||||||||||||| |||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||.||.|
Sbjct  370  GAGAAGGAAACCAG-AAAGATCATGCGGGCCCTGCTGGAGGTGATCTGTACCCTGCACAAACTCAACATTGTCC  442

Query  444  ACCGGGACCTGAAGCCCGAGAACATTCTCTTGGATGACAACATGAACATCAAGCTCACAGACTTTGGCTTTTCC  517
            |.||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.||||||
Sbjct  443  ATCGGGACCTGAAGCCGGAGAATATCCTTTTGGATGACAACATGAATATAAAGCTCACAGACTTCGGGTTTTCC  516

Query  518  TGCCAGCTGGAGCCGGGAGAGAGGCTGCGAGAGGTCTGTGGGACCCCCAGTTACCTGGCCCCTGAGATTATCGA  591
            |||||||||.||||.|||||||.|||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||..|
Sbjct  517  TGCCAGCTGCAGCCAGGAGAGAAGCTCCGAGAGGTTTGTGGGACTCCCAGTTATCTGGCCCCTGAAATCATACA  590

Query  592  GTGCTCCATGAATGAGGACCACCCGGGCTACGGGAAAGAGGTGGACATGTGGAGCACTGGCGTCATCATGTACA  665
            ||||||||||.|.||.|.|||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  591  GTGCTCCATGGACGACGGCCATCCTGGCTATGGGAAGGAGGTGGACATGTGGAGCACAGGCGTCATCATGTACA  664

Query  666  CGCTGCTGGCCGGCTCCCCGCCCTTCTGGCACCGGAAGCAGATGCTGATGCTGAGGATGATCATGAGCGGCAAC  739
            |.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||.||.|||||||||||..||||||.
Sbjct  665  CTCTGCTGGCTGGCTCCCCGCCTTTCTGGCACCGGAAGCAAATGCTGATGTTGCGGATGATCATGGACGGCAAA  738

Query  740  TACCAGTTTGGCTCGCCCGAGTGGGATGATTACTCGGACACCGTGAAGGACCTGGT-TCTCCCGATTCCTGGTG  812
            ||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||.|||| |||  ||||||.|||||
Sbjct  739  TACCAGTTTGGCTCACCAGAGTGGGATGACTACTCTGACACAGTGAAAGACTTGGTGTCT--CGATTCTTGGTG  810

Query  813  GTGCAACCCCAGAACCGCTACACAGCGGAAGAGGCCTTGGCACACCCCTTCTTCCAGCAGTACTTGGTGGAGGA  886
            ||||||||.|||.||||||.|.|.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||.|||||.|.||.||.||
Sbjct  811  GTGCAACCTCAGGACCGCTGCTCGGCGGAAGAGGCCTTGGCACACCCTTTCTTTCAGGAGTACGTAGTAGAAGA  884

Query  887  AGTGCGGCACTTCAGCCCCCGGGGGAAGTTCAAGGTGATCGCTCTGACCGTGCTGGCTTCAGTGCGGATCTACT  960
            |||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||..|||.||.||||||||.|||||...||||||||
Sbjct  885  AGTACGGCACTTCAGCCCCCGAGGGAAGTTCAAGGTGATCTGTCTAACTGTGCTGGCATCAGTAAAGATCTACT  958

Query  961  ACCAGTACCGCCGGGTGAAGCCTGTGACCCGGGAGATCGTCATCCGAGACCCCTATGCCCTCCGGCCTCTGCGC  1034
            ||||||||||.|||||||||||.||.|||.|||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.
Sbjct  959  ACCAGTACCGTCGGGTGAAGCCGGTAACCAGGGAGATCGTCATCCGAGACCCCTACGCCCTTCGGCCGCTGCGG  1032

Query 1035  CGGCTCATCGACGCCTACGCTTTCCGAATCTATGGCCACTGGGTGAAGAAGGGGCAGCAGCAGAACCGGGCAGC  1108
            .|||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||.|.||.||
Sbjct 1033  AGGCTCATTGACGCCTATGCTTTCCGTATCTACGGCCACTGGGTGAAGAAAGGGCAACAGCAGAACAGAGCCGC  1106

Query 1109  CCTTTTCGAGAACACACCCAAGGCCGTGCTCCTCTCCCTGGCCGAGGAGGACTAC---  1163
            |||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||.||||.||||||||..||   
Sbjct 1107  CCTCTTCGAGAACACGCCCAAGGCTGTGCTCCTCTCCTTGGCTGAGGAGGAGGACTTC  1164