Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14755
• Subject: XM_005271772.5
• Aligned Length: 1163
• Identities: 925
• Gaps: 236

Alignment

Query    1  ATGACCCGGGACGAGGCACTGCCGGACTCTCATTCTGCACAGGACTTCTATGAGAATTATGAGCCCAAAGAGAT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGACCCGGGACGAGGCACTGCCGGACTCTCATTCTGCACAGGACTTCTATGAGAATTATGAGCCCAAAGAGAT  74

Query   75  CCTGGGCAGGGGCGTTAGCAGTGTGGTCAGGCGATGCATCCACAAGCCCACGAGCCAGGAGTACGCCGTGAAGG  148
            |||||||||                                                                 
Sbjct   75  CCTGGGCAG-----------------------------------------------------------------  83

Query  149  TCATCGACGTCACCGGTGGAGGCAGCTTCAGCCCGGAGGAGGTGCGGGAGCTGCGAGAAGCCACGCTGAAGGAG  222
                                                                                      
Sbjct   84  --------------------------------------------------------------------------  83

Query  223  GTGGACATCCTGCGCAAGGTCTCAGGGCACCCCAACATCATACAGCTGAAGGACACTTATGAGACCAACACTTT  296
                                                                                      
Sbjct   84  --------------------------------------------------------------------------  83

Query  297  CTTCTTCTTGGTGTTTGACCTGATGAAGAGAGGGGAGCTCTTTGACTACCTCACTGAGAAGGTCACCTTGAGTG  370
                                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   84  ---------------------GATGAAGAGAGGGGAGCTCTTTGACTACCTCACTGAGAAGGTCACCTTGAGTG  136

Query  371  AGAAGGAAACCAGAAAANATCATGCGAGCTCTGCTGGAGGTGATCTGCACCTTGCACAAACTCAACATCGTGCA  444
            ||||||||||||| |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  137  AGAAGGAAACCAG-AAAGATCATGCGAGCTCTGCTGGAGGTGATCTGCACCTTGCACAAACTCAACATCGTGCA  209

Query  445  CCGGGACCTGAAGCCCGAGAACATTCTCTTGGATGACAACATGAACATCAAGCTCACAGACTTTGGCTTTTCCT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  210  CCGGGACCTGAAGCCCGAGAACATTCTCTTGGATGACAACATGAACATCAAGCTCACAGACTTTGGCTTTTCCT  283

Query  519  GCCAGCTGGAGCCGGGAGAGAGGCTGCGAGAGGTCTGTGGGACCCCCAGTTACCTGGCCCCTGAGATTATCGAG  592
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  284  GCCAGCTGGAGCCGGGAGAGAGGCTGCGAGAGGTCTGCGGGACCCCCAGTTACCTGGCCCCTGAGATTATCGAG  357

Query  593  TGCTCCATGAATGAGGACCACCCGGGCTACGGGAAAGAGGTGGACATGTGGAGCACTGGCGTCATCATGTACAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  358  TGCTCCATGAATGAGGACCACCCGGGCTACGGGAAAGAGGTGGACATGTGGAGCACTGGCGTCATCATGTACAC  431

Query  667  GCTGCTGGCCGGCTCCCCGCCCTTCTGGCACCGGAAGCAGATGCTGATGCTGAGGATGATCATGAGCGGCAACT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  432  GCTGCTGGCCGGCTCCCCGCCCTTCTGGCACCGGAAGCAGATGCTGATGCTGAGGATGATCATGAGCGGCAACT  505

Query  741  ACCAGTTTGGCTCGCCCGAGTGGGATGATTACTCGGACACCGTGAAGGACCTGGTTCTCCCGATTCCTGGTGGT  814
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct  506  ACCAGTTTGGCTCGCCCGAGTGGGATGATTACTCGGACACCGTGAAGGACCTGG-TCTCCCGATTCCTGGTGGT  578

Query  815  GCAACCCCAGAACCGCTACACAGCGGAAGAGGCCTTGGCACACCCCTTCTTCCAGCAGTACTTGGTGGAGGAAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  579  GCAACCCCAGAACCGCTACACAGCGGAAGAGGCCTTGGCACACCCCTTCTTCCAGCAGTACTTGGTGGAGGAAG  652

Query  889  TGCGGCACTTCAGCCCCCGGGGGAAGTTCAAGGTGATCGCTCTGACCGTGCTGGCTTCAGTGCGGATCTACTAC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  653  TGCGGCACTTCAGCCCCCGGGGGAAGTTCAAGGTGATCGCTCTGACCGTGCTGGCTTCAGTGCGGATCTACTAC  726

Query  963  CAGTACCGCCGGGTGAAGCCTGTGACCCGGGAGATCGTCATCCGAGACCCCTATGCCCTCCGGCCTCTGCGCCG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  727  CAGTACCGCCGGGTGAAGCCTGTGACCCGGGAGATCGTCATCCGAGACCCCTATGCCCTCCGGCCTCTGCGCCG  800

Query 1037  GCTCATCGACGCCTACGCTTTCCGAATCTATGGCCACTGGGTGAAGAAGGGGCAGCAGCAGAACCGGGCAGCCC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  801  GCTCATCGACGCCTACGCTTTCCGAATCTATGGCCACTGGGTGAAGAAGGGGCAGCAGCAGAACCGGGCAGCCC  874

Query 1111  TTTTCGAGAACACACCCAAGGCCGTGCTCCTCTCCCTGGCCGAGGAGGACTAC  1163
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  875  TTTTCGAGAACACACCCAAGGCCGTGCTCCTCTCCCTGGCCGAGGAGGACTAC  927