Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14755
• Subject: XM_017012325.2
• Aligned Length: 1298
• Identities: 997
• Gaps: 299

Alignment

Query    1  ATGACCCGGGACGAGGCACTGCCGGACTCTCATTCTGCACAGGACTTCTATGAGAATTATGAGCCCAAAGAGAT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CCTGGGCAGGGGCGTTAGCAGTGTGGTCAGGCGATGCATCCACAAGCCCACGAGCCAGGAGTACGCCGTGAAGG  148
                                             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ---------------------------------ATGCATCCACAAGCCCACGAGCCAGGAGTACGCCGTGAAGG  41

Query  149  TCATCGACGTCACCGGTGGAGGCAGCTTCAGCCCGGAGGAGGTGCGGGAGCTGCGAGAAGCCACGCTGAAGGAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   42  TCATCGACGTCACCGGTGGAGGCAGCTTCAGCCCGGAGGAGGTGCGGGAGCTGCGAGAAGCCACGCTGAAGGAG  115

Query  223  GTGGACATCCTGCGCAAGGTCTCAGGGCACCCCAACATCATACAGCTGAAGGACACTTATGAGACCAACACTTT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                  
Sbjct  116  GTGGACATCCTGCGCAAGGTCTCAGGGCACCCCAACATCA----------------------------------  155

Query  297  CTTCTTCTTGGTGTTTGACCTGATGAAGAGAGGGGAGCTCTTTGACTACCTCACTGAGAAGGTCACCTTGAGTG  370
                                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  156  ---------------------GATGAAGAGAGGGGAGCTCTTTGACTACCTCACTGAGAAGGTCACCTTGAGTG  208

Query  371  AGAAGGAAACCAGAAAANATCATGCGAGCTCTGCTGGAGGTGATCTGCACCTTGCACAAACTCAACATCGTGCA  444
            ||||||||||||| |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  209  AGAAGGAAACCAG-AAAGATCATGCGAGCTCTGCTGGAGGTGATCTGCACCTTGCACAAACTCAACATCGTGCA  281

Query  445  CCGGGACCTGAAGCCCGAGAACATTCTCTTGGATGACAACATGAACATCAAGCTCACAGACTTTGGCTTTTCCT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  282  CCGGGACCTGAAGCCCGAGAACATTCTCTTGGATGACAACATGAACATCAAGCTCACAGACTTTGGCTTTTCCT  355

Query  519  GCCAGCTGGAGCCGGGAGAGAGGCTGCG----------------------------------------------  546
            ||||||||||||||||||||||||||||                                              
Sbjct  356  GCCAGCTGGAGCCGGGAGAGAGGCTGCGAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAACTC  429

Query  547  --------------------------------------------------------------------------  546
                                                                                      
Sbjct  430  CTGACCTTACGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGTGATTACAGGCGTGAGCCACCATGCCCAGCAGG  503

Query  547  ---------------AGAGGTCTGTGGGACCCCCAGTTACCTGGCCCCTGAGATTATCGAGTGCTCCATGAATG  605
                           |||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  504  GCTAGGCATTTCTTCAGAGGTCTGCGGGACCCCCAGTTACCTGGCCCCTGAGATTATCGAGTGCTCCATGAATG  577

Query  606  AGGACCACCCGGGCTACGGGAAAGAGGTGGACATGTGGAGCACTGGCGTCATCATGTACACGCTGCTGGCCGGC  679
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  578  AGGACCACCCGGGCTACGGGAAAGAGGTGGACATGTGGAGCACTGGCGTCATCATGTACACGCTGCTGGCCGGC  651

Query  680  TCCCCGCCCTTCTGGCACCGGAAGCAGATGCTGATGCTGAGGATGATCATGAGCGGCAACTACCAGTTTGGCTC  753
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  652  TCCCCGCCCTTCTGGCACCGGAAGCAGATGCTGATGCTGAGGATGATCATGAGCGGCAACTACCAGTTTGGCTC  725

Query  754  GCCCGAGTGGGATGATTACTCGGACACCGTGAAGGACCTGGTTCTCCCGATTCCTGGTGGTGCAACCCCAGAAC  827
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  726  GCCCGAGTGGGATGATTACTCGGACACCGTGAAGGACCTGG-TCTCCCGATTCCTGGTGGTGCAACCCCAGAAC  798

Query  828  CGCTACACAGCGGAAGAGGCCTTGGCACACCCCTTCTTCCAGCAGTACTTGGTGGAGGAAGTGCGGCACTTCAG  901
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  799  CGCTACACAGCGGAAGAGGCCTTGGCACACCCCTTCTTCCAGCAGTACTTGGTGGAGGAAGTGCGGCACTTCAG  872

Query  902  CCCCCGGGGGAAGTTCAAGGTGATCGCTCTGACCGTGCTGGCTTCAGTGCGGATCTACTACCAGTACCGCCGGG  975
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  873  CCCCCGGGGGAAGTTCAAGGTGATCGCTCTGACCGTGCTGGCTTCAGTGCGGATCTACTACCAGTACCGCCGGG  946

Query  976  TGAAGCCTGTGACCCGGGAGATCGTCATCCGAGACCCCTATGCCCTCCGGCCTCTGCGCCGGCTCATCGACGCC  1049
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  947  TGAAGCCTGTGACCCGGGAGATCGTCATCCGAGACCCCTATGCCCTCCGGCCTCTGCGCCGGCTCATCGACGCC  1020

Query 1050  TACGCTTTCCGAATCTATGGCCACTGGGTGAAGAAGGGGCAGCAGCAGAACCGGGCAGCCCTTTTCGAGAACAC  1123
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021  TACGCTTTCCGAATCTATGGCCACTGGGTGAAGAAGGGGCAGCAGCAGAACCGGGCAGCCCTTTTCGAGAACAC  1094

Query 1124  ACCCAAGGCCGTGCTCCTCTCCCTGGCCGAGGAGGACTAC  1163
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1095  ACCCAAGGCCGTGCTCCTCTCCCTGGCCGAGGAGGACTAC  1134