Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14786
- Subject:
- NM_008924.2
- Aligned Length:
- 1234
- Identities:
- 1007
- Gaps:
- 116
Alignment
Query 1 ATGAGCCACATCCAGATCCCGCCGGGGCTCACGGAGCTGCTGCAGGGCTACACGGTGGAGGTGCTGCGACAGCA 74
||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||
Sbjct 1 ATGAGCCACATCCAGATCCCCGCGGGGCTCACGGAGCTGCTGCAGGGCTACACCGTGGAGGTGCTTCGGCAGCA 74
Query 75 GCCGCCTGACCTCGTCGAATTCGCAGTGGAGTACTTCACCCGCCTGCGCGAGGCCCGCGCCCCA-GCCTCAGTC 147
||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||| |.||| |..||||.|
Sbjct 75 GCCGCCCGACCTCGTCGACTTCGCGGTGGAGTACTTCACACGCCTGCGCGAGGCCCGC-CGCCAGGAATCAGAC 147
Query 148 -----------CTGCCCGCCGCCAC----CCCACGCCAGAG-CCTGGGCCACCCCCCGCCAGAACCCGGCCCGG 205
||.||||.|| || |.|||||..||| ||.|.| ||..|||||.||
Sbjct 148 ACGTTCATCGTCTCCCCGACG--ACCTTTCACACGCAGGAGTCCAGCG-CAGTCCCCGTCA------------- 205
Query 206 ACCGTGTCGCCGACGCCAAAGGGGACAGCGAGTCGGA---GGAGGACGAGGACTTGGAAGTTCCAGTTCCTAGC 276
|||..||.| |.|||||.||.||.||||| |||.||.|..||..||||||||||.|||||||||
Sbjct 206 ------TCGAGGAGG---ACGGGGAGAGTGACTCGGACTCGGAAGATGCCGATCTGGAAGTTCCGGTTCCTAGC 270
Query 277 AGATTTAATAGACGAGTATCAGTCTGTGCTGAGACCTATAACCCTGATGAGGAAGAGGAAGATACAGATCCAAG 350
|.|||||.|||||||||||||||||||||.||.||.|.||||||||||||.||||||||.||||..||||||||
Sbjct 271 AAATTTACTAGACGAGTATCAGTCTGTGCAGAAACGTTTAACCCTGATGAAGAAGAGGAGGATAACGATCCAAG 344
Query 351 GGTGATTCATCCTAAAACTGATGAACAGAGATGCAGACTTCAGGAAGCTTGCAAAGATATTCTCCTTTTCAAAA 424
||||.|||||||.|||||||||||.|||||||||.|.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct 345 GGTGGTTCATCCCAAAACTGATGAGCAGAGATGCCGGCTTCAGGAAGCTTGTAAAGATATTCTTCTTTTCAAAA 418
Query 425 ATCTTGATCAGGAACAGCTTTCTCAAGTTCTCGATGCCATGTTTGAAAGGATAGTCAAAGCTGATGAGCATGTC 498
|.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||.||||||.||||.|||||||||
Sbjct 419 ACCTTGATCAGGAACAGCTTTCTCAAGTTCTGGATGCCATGTTTGAAAAGATTGTCAAAACTGACGAGCATGTC 492
Query 499 ATTGACCAAGGAGATGATGGAGACAACTTTTATGTCATAGAACGGGGAACTTATGACATTTTAGTAACAAAAGA 572
|||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 493 ATTGACCAAGGCGACGACGGGGACAACTTTTATGTCATAGAACGGGGAACCTATGACATTTTAGTAACGAAAGA 566
Query 573 TAATCAAACCCGCTCTGTTGGTCAATATGACAACCGTGGCAGTTTTGGAGAACTAGCTCTGATGTACAACACCC 646
|||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 567 TAATCAAACACGTTCTGTTGGTCAGTATGACAACCGTGGCAGTTTTGGAGAACTAGCTCTGATGTACAATACCC 640
Query 647 CGAGAGCTGCTACCATTGTTGCTACCTCAGAAGGCTCCCTTTGGGGACTGGACCGGGTGACTTTTAGAAGAATC 720
||||||||||||||||..|.||.||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 641 CGAGAGCTGCTACCATCATCGCCACCTCAGAAGGCTCCCTTTGGGGATTGGACCGGGTGACTTTTAGAAGAATC 714
Query 721 ATAGTGAAAAATAATGCAAAGAAGAGGAAGATGTTTGAATCATTTATTGAGTCTGTGCCCCTCCTTAAATCACT 794
|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||.||||.|||||
Sbjct 715 ATAGTGAAAAACAATGCAAAGAAGAGGAAGATGTTTGAATCATTTATTGAGTCTGTTCCACTCTTTAAGTCACT 788
Query 795 AGAGGTGTCAGAACGAATGAAGATTGTGGATGTAATAGGAGAGAAGATCTATAAGGATGGAGAACGCATAATCA 868
||||.||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||.|||||.||.||||||.
Sbjct 789 AGAGATGTCAGAACGAATGAAGATTGTGGATGTGATCGGGGAAAAGATCTATAAGGACGGAGAGCGAATAATCG 862
Query 869 CTC------------------------------------------------------------------AGACT 876
|.| ||||.
Sbjct 863 CACAGGGTGAAAAGGCCGACAGCTTCTATATCATAGAGTCTGGGGAAGTGAGCATCTTGATTAGAAGCAAGACC 936
Query 877 AAATCAAACAAGGATGGTGGGAACCAGGAGGTCGAGATTGCCCGCTGCCATAAGGGGCAGTACTTTGGAGAGCT 950
||.|||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 937 AAGTCAAACAAGAATGGAGGGAACCAGGAGGTCGAGATTGCCCATTGCCATAAGGGGCAGTACTTCGGAGAACT 1010
Query 951 TGCCCTGGTCACCAACAAACCCAGAGCTGCCTCAGCTTATGCAGTTGGAGATGTCAAATGCTTAGTTATGGATG 1024
||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1011 TGCCCTGGTCACCAACAAACCCAGAGCTGCTTCCGCTTACGCGGTTGGAGATGTCAAATGCTTAGTTATGGATG 1084
Query 1025 TACAAGCATTCGAGAGGCTTCTGGGGCCCTGCATGGACATCATGAAGAGGAACATCTCACACTATGAGGAACAG 1098
|.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||
Sbjct 1085 TTCAAGCATTTGAGAGGCTTCTGGGCCCCTGCATGGACATCATGAAGAGGAACATCTCACATTACGAAGAACAG 1158
Query 1099 CTGGTGAAGATGTTTGGCTCCAGCGTGGATCTG--GGCAACCTCGGGCAG 1146
||||||||||||||||||||||.|.|||||||| || |||.|||||||
Sbjct 1159 CTGGTGAAGATGTTTGGCTCCAACTTGGATCTGATGG--ACCCCGGGCAG 1206