Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14786
• Subject: XM_005265315.4
• Aligned Length: 1155
• Identities: 971
• Gaps: 174

Alignment

Query    1  ATGAGCCACATCCAGATCCCGCCGGGGCTCACGGAGCTGCTGCAGGGCTACACGGTGGAGGTGCTGCGACAGCA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGCCACATCCAGATCCCGCCGGGGCTCACGGAGCTGCTGCAGGGCTACACGGTGGAGGTGCTGCGACAGCA  74

Query   75  GCCGCCTGACCTCGTCGAATTCGCAGTGGAGTACTTCACCCGCCTGCGCGAGGCCCGCGCCCCAGCCTCAGTCC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCCGCCTGACCTCGTCGAATTCGCAGTGGAGTACTTCACCCGCCTGCGCGAGGCCCGCGCCCCAGCCTCAGTCC  148

Query  149  TGCCCGCCGCCACCCCACGCCAGAGCCTGGGCCACCCCCCGCCAGAACCCGGCCCGGACCGTGTCGCCGACGCC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGCCCGCCGCCACCCCACGCCAGAGCCTGGGCCACCCCCCGCCAGAACCCGGCCCGGACCGTGTCGCCGACGCC  222

Query  223  AAAGGGGACAGCGAGTCGGAGGAGGACGAGGACTTGGAAGTTCCAGTTCCTAGCAGATTTAATAGACGAGTATC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAAGGGGACAGCGAGTCGGAGGAGGACGAGGACTTGGAAGTTCCAGTTCCTAGCAGATTTAATAGACGAGTATC  296

Query  297  AGTCTGTGCTGAGACCTATAACCCTGATGAGGAAGAGGAAGATACAGATCCAAGGGTGATTCATCCTAAAACTG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGTCTGTGCTGAGACCTATAACCCTGATGAGGAAGAGGAAGATACAGATCCAAGGGTGATTCATCCTAAAACTG  370

Query  371  ATGAACAGAGATGCAGACTTCAGGAAGCTTGCAAAGATATTCTCCTTTTCAAAAATCTTGATCAGGAACAGCTT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATGAACAGAGATGCAGACTTCAGGAAGCTTGCAAAGATATTCTCCTTTTCAAAAATCTTGATCAGGAACAGCTT  444

Query  445  TCTCAAGTTCTCGATGCCATGTTTGAAAGGATAGTCAAAGCTGATGAGCATGTCATTGACCAAGGAGATGATGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TCTCAAGTTCTCGATGCCATGTTTGAAAGGATAGTCAAAGCTGATGAGCATGTCATTGACCAAGGAGATGATGG  518

Query  519  AGACAACTTTTATGTCATAGAACGGGGAACTTATGACATTTTAGTAACAAAAGATAATCAAACCCGCTCTGTTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGACAACTTTTATGTCATAGAACGGGGAACTTATGACATTTTAGTAACAAAAGATAATCAAACCCGCTCTGTTG  592

Query  593  GTCAATATGACAACCGTGGCAGTTTTGGAGAACTAGCTCTGATGTACAACACCCCGAGAGCTGCTACCATTGTT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GTCAATATGACAACCGTGGCAGTTTTGGAGAACTAGCTCTGATGTACAACACCCCGAGAGCTGCTACCATTGTT  666

Query  667  GCTACCTCAGAAGGCTCCCTTTGGGGACTGGACCGGGTGACTTTTAGAAGAATCATAGTGAAAAATAATGCAAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GCTACCTCAGAAGGCTCCCTTTGGGGACTGGACCGGGTGACTTTTAGAAGAATCATAGTGAAAAATAATGCAAA  740

Query  741  GAAGAGGAAGATGTTTGAATCATTTATTGAGTCTGTGCCCCTCCTTAAATCACTAGAGGTGTCAGAACGAATGA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GAAGAGGAAGATGTTTGAATCATTTATTGAGTCTGTGCCCCTCCTTAAATCACTAGAGGTGTCAGAACGAATGA  814

Query  815  AGATTGTGGATGTAATAGGAGAGAAGATCTATAAGGATGGAGAACGCATAATCACTCAGACTAAATCAAACAAG  888
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               
Sbjct  815  AGATTGTGGATGTAATAGGAGAGAAGATCTATAAGGATGGAGAACGCATAATCACTCAG---------------  873

Query  889  GATGGTGGGAACCAGGAGGTCGAGATTGCCCGCTGCCATAAGGGGCAGTACTTTGGAGAGCTTGCCCTGGTCAC  962
               ||||                              |.||||       ||   ||.|||||       |.||
Sbjct  874  ---GGTG------------------------------AAAAGG-------CT---GATAGCTT-------TTAC  897

Query  963  CAACAAACCCAGAG-CTGCCTCAGCTTATGCAGTTGGAG-ATGTCAAATGCTTA-------GTTATGGATGTAC  1027
                 |.|..|||| |||.|         |.|||  ||| ||.|    ||.|||       |||||||||||||
Sbjct  898  -----ATCATAGAGTCTGGC---------GAAGT--GAGCATCT----TGATTAGAAGCAGGTTATGGATGTAC  951

Query 1028  AAGCATTCGAGAGGCTTCTGGGGCCCTGCATGGACATCATGAAGAGGAACATCTCACACTATGAGGAACAGCTG  1101
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                   
Sbjct  952  AAGCATTCGAGAGGCTTCTGGGGCCCTGCATGGACATCA-----------------------------------  990

Query 1102  GTGAAGATGTTTGGCTCCAGCGTGGATCTGGGCAACCTCGGGCAG  1146
                                                         
Sbjct  991  ---------------------------------------------  990