Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14786
• Subject: XM_011533943.2
• Aligned Length: 1182
• Identities: 979
• Gaps: 171

Alignment

Query    1  ATGAGCCACATCCAGATCCCGCCGGGGCTCACGGAGCTGCTGCAGGGCTACACGGTGGAGGTGCTGCGACAGCA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGCCACATCCAGATCCCGCCGGGGCTCACGGAGCTGCTGCAGGGCTACACGGTGGAGGTGCTGCGACAGCA  74

Query   75  GCCGCCTGACCTCGTCGAATTCGCAGTGGAGTACTTCACCCGCCTGCGCGAGGCCCGCGCCCCAGCCTCAGTCC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCCGCCTGACCTCGTCGAATTCGCAGTGGAGTACTTCACCCGCCTGCGCGAGGCCCGCGCCCCAGCCTCAGTCC  148

Query  149  TGCCCGCCGCCACCCCACGCCAGAGCCTGGGCCACCCCCCGCCAGAACCCGGCCCGGACCGTGTCGCCGACGCC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGCCCGCCGCCACCCCACGCCAGAGCCTGGGCCACCCCCCGCCAGAACCCGGCCCGGACCGTGTCGCCGACGCC  222

Query  223  AAAGGGGACAGCGAGTCGGAGGAGGACGAGGACTTGGAAGTTCCAGTTCCTAGCAGATTTAATAGACGAGTATC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAAGGGGACAGCGAGTCGGAGGAGGACGAGGACTTGGAAGTTCCAGTTCCTAGCAGATTTAATAGACGAGTATC  296

Query  297  AGTCTGTGCTGAGACCTATAACCCTGATGAGGAAGAGGAAGATACAGATCCAAGGGTGATTCATCCTAAAACTG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGTCTGTGCTGAGACCTATAACCCTGATGAGGAAGAGGAAGATACAGATCCAAGGGTGATTCATCCTAAAACTG  370

Query  371  ATGAACAGAGATGCAGACTTCAGGAAGCTTGCAAAGATATTCTCCTTTTCAAAAATCTTGATCAGGAACAGCTT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATGAACAGAGATGCAGACTTCAGGAAGCTTGCAAAGATATTCTCCTTTTCAAAAATCTTGATCAGGAACAGCTT  444

Query  445  TCTCAAGTTCTCGATGCCATGTTTGAAAGGATAGTCAAAGCTGATGAGCATGTCATTGACCAAGGAGATGATGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TCTCAAGTTCTCGATGCCATGTTTGAAAGGATAGTCAAAGCTGATGAGCATGTCATTGACCAAGGAGATGATGG  518

Query  519  AGACAACTTTTATGTCATAGAACGGGGAACTTATGACATTTTAGTAACAAAAGATAATCAAACCCGCTCTGTTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGACAACTTTTATGTCATAGAACGGGGAACTTATGACATTTTAGTAACAAAAGATAATCAAACCCGCTCTGTTG  592

Query  593  GTCAATATGACAACCGTGGCAGTTTTGGAGAACTAGCTCTGATGTACAACACCCCGAGAGCTGCTACCATTGTT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GTCAATATGACAACCGTGGCAGTTTTGGAGAACTAGCTCTGATGTACAACACCCCGAGAGCTGCTACCATTGTT  666

Query  667  GCTACCTCAGAAGGCTCCCTTTGGGGACTGGACCGGGTGACTTTTAGAAGAATCATAGTGAAAAATAATGCAAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GCTACCTCAGAAGGCTCCCTTTGGGGACTGGACCGGGTGACTTTTAGAAGAATCATAGTGAAAAATAATGCAAA  740

Query  741  GAAGAGGAAGATGTTTGAATCATTTATTGAGTCTGTGCCCCTCCTTAAATCACTAGAGGTGTCAGAACGAATGA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GAAGAGGAAGATGTTTGAATCATTTATTGAGTCTGTGCCCCTCCTTAAATCACTAGAGGTGTCAGAACGAATGA  814

Query  815  AGATTGTGGATGTAATAGGAGAGAAGATCTATAAGGATGGAGAACGCATAATCACTCAGACTAAATCAAACAAG  888
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|.||      |||
Sbjct  815  AGATTGTGGATGTAATAGGAGAGAAGATCTATAAGGATGGAGAACGCATAATCACTCAGGGTGAA------AAG  882

Query  889  GATGGTGG-------------GAACCAG--GAGGTCGAG---ATTGCCCGCTGCCATAAGGGGCAGTACTTTGG  944
            |.||.|.|             ||..|.|  ||.|| |||   .|||         ||.||..|||       ||
Sbjct  883  GCTGATAGCTTTTACATCATAGAGTCTGGCGAAGT-GAGCATCTTG---------ATTAGAAGCA-------GG  939

Query  945  AGAG-CTTGCC-----CTGGTCACCA------ACAAACCCAGAGCTGCCTCAGCTTATGCAGTTGGAGATGTCA  1006
            ..|| ||||.|     |||    |||      ||        .||||.||..||.||.|||||           
Sbjct  940  CAAGCCTTGACATATTCTG----CCATCTTTTAC--------TGCTGTCTAGGCCTAGGCAGT-----------  990

Query 1007  AATGCTTAGTTATGGATGTACAAGCATTCGAGAGGCTTCTGGGGCCCTGCATGGA------CATCATGAAGAGG  1074
                     |||||  ||..|||.||   ||||      |||    .||.|||||      ||.||        
Sbjct  991  ---------TTATG--TGACCAACCA---GAGA------TGG----ATGAATGGATGCTTTCAGCA--------  1032

Query 1075  AACATCTCACACTATGAGGAACAGCTGGTGAAGATGTTTGGCTCCAGCGTGGATCTGGGCAACCTCGGGCAG  1146
            |||||.||      ||||.|.                                                   
Sbjct 1033  AACATTTC------TGAGTAC---------------------------------------------------  1047