Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14790
- Subject:
- XM_005264431.4
- Aligned Length:
- 2226
- Identities:
- 1460
- Gaps:
- 752
Alignment
Query 1 ATGGTAGTGTTCAATGGCCTTCTTAAGATCAAAATCTGCGAGGCCGTGAGCTTGAAGCCCACAGCCTGGTCGCT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGTAGTGTTCAATGGCCTTCTTAAGATCAAAATCTGCGAGGCCGTGAGCTTGAAGCCCACAGCCTGGTCGCT 74
Query 75 GCGCCATGCGGTGGGACCCCGGCCGCAGACTTTCCTTCTCGACCCCTACATTGCCCTCAATGTGGACGACTCGC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GCGCCATGCGGTGGGACCCCGGCCGCAGACTTTCCTTCTCGACCCCTACATTGCCCTCAATGTGGACGACTCGC 148
Query 149 GCATCGGCCAAACGGCCACCAAGCAGAAGACCAACAGCCCGGCCTGGCACGACGAGTTCGTCACCGATGTGTGC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GCATCGGCCAAACGGCCACCAAGCAGAAGACCAACAGCCCGGCCTGGCACGACGAGTTCGTCACCGATGTGTGC 222
Query 223 AACGGACGCAAGATCGAGCTGGCTGTCTTTCACGATGCCCCCATAGGCTACGACGACTTCGTGGCCAACTGCAC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AACGGACGCAAGATCGAGCTGGCTGTCTTTCACGATGCCCCCATAGGCTACGACGACTTCGTGGCCAACTGCAC 296
Query 297 CATCCAGTTTGAGGAGCTGCTGCAGAACGGGAGCCGCCACTTCGAGGACTGGATTGATCTGGAGCCAGAAGGAA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CATCCAGTTTGAGGAGCTGCTGCAGAACGGGAGCCGCCACTTCGAGGACTGGATTGATCTGGAGCCAGAAGGAA 370
Query 371 GAGTGTATGTGATCATCGATCTCTCAGGGTCGTCGGGTGAAGCCCCTAAAGACAATGAAGAGCGTGTGTTCAGG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GAGTGTATGTGATCATCGATCTCTCAGGGTCGTCGGGTGAAGCCCCTAAAGACAATGAAGAGCGTGTGTTCAGG 444
Query 445 GAACGCATGCGGCCGAGGAAGCGGCAGGGGGCCGTCAGGCGCAGGGTCCATCAGGTCAACGGCCACAAGTTCAT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GAACGCATGCGGCCGAGGAAGCGGCAGGGGGCCGTCAGGCGCAGGGTCCATCAGGTCAACGGCCACAAGTTCAT 518
Query 519 GGCCACCTATCTTCGGCAGCCCACCTACTGCTCCCATTGCAGAGACTTCATCTGGGGTGTCATAGGAAAGCAGG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GGCCACCTATCTTCGGCAGCCCACCTACTGCTCCCATTGCAGAGACTTCATCTGGGGTGTCATAGGAAAGCAGG 592
Query 593 GATACCAGTGTCAAGTCTGCACCTGCGTGGTCCACAAGCGGTGCCACGAGCTCATAATCACAAAGTGTGCTGGG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GATACCAGTGTCAAGTCTGCACCTGCGTGGTCCACAAGCGGTGCCACGAGCTCATAATCACAAAGTGTGCTGGG 666
Query 667 GTTAAGAAGCAGGAAACCCCCGAACAGGTGGGCTCCCAGCGGTTCAACCGTC-ACATGGCCCCA-AAGTTCGGT 738
.|.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||| |.|||| |||| |||||| |||||||||
Sbjct 667 TTAAAGAAGCAGGAGACCCCCGACCAGGTGGGCTCCCAGCGGTTC-AGCGTCAACAT-GCCCCACAAGTTCGGT 738
Query 739 ATCCACAACTACAAGGTCCCTACCTTCTGCGATCACTGTGGGTCCCTGCTCTGGGGACTCTTGCGGCAGGGTTT 812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 739 ATCCACAACTACAAGGTCCCTACCTTCTGCGATCACTGTGGGTCCCTGCTCTGGGGACTCTTGCGGCAGGGTTT 812
Query 813 GCAGTGTAAAGTCTGCAAAATGAATGTTCACCGTCGATGTGAGACCAACGTGGCTCCCAACTGTGGAGTGGATG 886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 813 GCAGTGTAAAGTCTGCAAAATGAATGTTCACCGTCGATGTGAGACCAACGTGGCTCCCAACTGTGGAGTGGATG 886
Query 887 CCAGAGGAATCGCCAAAGTACTGGCCGACCTGGGCGTTACCCCAGACAAAATCACCAACAGCGGCCAGAGAAGG 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 887 CCAGAGGAATCGCCAAAGTACTGGCCGACCTGGGCGTTACCCCAGACAAAATCACCAACAGCGGCCAGAGAAGG 960
Query 961 AAAAAGCTCATTGCTGGTGCCGAGTCCCCGCAGCCTGCTTCTGGAAGCTCACCATCTGAGGAAGATCGATCCAA 1034
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 AAAAAGCTCATTGCTGGTGCCGAGTCCCCGCAGCCTGCTTCTGGAAGCTCACCATCTGAGGAAGATCGATCCAA 1034
Query 1035 GTCAGCACCCACCTCCCCTTGTGACCAGGAAATAAAAGAACTTGAGAACAACATTCGGAAAGCCTTGTCATTTG 1108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1035 GTCAGCACCCACCTCCCCTTGTGACCAGGAAATAAAAGAACTTGAGAACAACATTCGGAAAGCCTTGTCATTTG 1108
Query 1109 ACAACCGAGGAGAGGAGCACCGGGCAGCATCGTCTCCTGATGGCCAGCTGATGAGCCCCGGTGAGAATGGCGAA 1182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1109 ACAACCGAGGAGAGGAGCACCGGGCAGCATCGTCTCCTGATGGCCAGCTGATGAGCCCCGGTGAGAATGGCGAA 1182
Query 1183 GTCCGGCAAGGCCAGGCCAAGCGCCTGGGCCTGGATGAGTTCAACTTCATCAAGGTGTTGGGCAAAGGCAGCTT 1256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1183 GTCCGGCAAGGCCAGGCCAAGCGCCTGGGCCTGGATGAGTTCAACTTCATCAAGGTGTTGGGCAAAGGCAGCTT 1256
Query 1257 TGGCAAGGTCATGTTGGCAGAACTCAAGGGCAAAGATGAAGTATATGCTGTGAAGGTCTTAAAGAAGGACGTCA 1330
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1257 TGGCAAGGTCATGTTGGCAGAACTCAAGGGCAAAGATGAAGTATATGCTGTGAAGGTCTTAAAGAAGGACGTCA 1330
Query 1331 TCCTTCAGGATGATGACGTGGACTGCACAATGACAGAGAAGAGGATTTTGGCTCTGGCACGGAAACACCCGTAC 1404
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1331 TCCTTCAGGATGATGACGTGGACTGCACAATGACAGAGAAGAGGATTTTGGCTCTGGCACGGAAACACCCGTAC 1404
Query 1405 CTTACCCAACTCTACTGCTGCTTCCAGACCAAGG--ACCGCCTCTTTTTCGTCATGGAA--------TATGTAA 1468
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||.| ..||||| |||..|| | |||.|
Sbjct 1405 CTTACCCAACTCTACTGCTGCTTCCAGACCAAGGGCACAG---GATTTTC--CATTCAAGGTTGTGCT-TGTGA 1472
Query 1469 ATGG-TG-GAGACCTCATGTTTCAGATTCAGCGCTCCCGAAAATTCGACGAGCCTCGTTCACGTTTCTATGCTG 1540
|.|| || ||||.||.
Sbjct 1473 AGGGATGAGAGAGCTG---------------------------------------------------------- 1488
Query 1541 CAGAGGTCACATCGGCCCTCATGTTCCTCCACCAGCATGGAGTCATCTACAGGGATTTGAAACTGGACAACATC 1614
Sbjct 1489 -------------------------------------------------------------------------- 1488
Query 1615 CTTTCTGGATGCAGAAGGTCACTGCAAGCTGGCTGACTTCGGGATGTGCAAGGAAGGGATTCTGAATGGTGTGA 1688
Sbjct 1489 -------------------------------------------------------------------------- 1488
Query 1689 CGACCACCACGTTCTGTGGGACTCCTGACTACATAGCTCCTGAGATCCTGCAGGAGTTGGAGTATGGCCCCTCC 1762
Sbjct 1489 -------------------------------------------------------------------------- 1488
Query 1763 GTGGACTGGTGGGCCCTGGGGGTGCTGATGTACGAGATGATGGCTGGACAGCCTCCCTTTGAGGCCGACAATGA 1836
Sbjct 1489 -------------------------------------------------------------------------- 1488
Query 1837 GGACGACCTATTTGAGTCCATCCTCCATGACGACGTGCTGTACCCAGTCTGGCTCAGCAAGGAGGCTGTCAGCA 1910
Sbjct 1489 -------------------------------------------------------------------------- 1488
Query 1911 TCTTGAAAGCTTTCATGACGAAGAATCCCCACAAGCGCCTGGGCTGTGTGGCATCGCAGAATGGCGAGGACGCC 1984
Sbjct 1489 -------------------------------------------------------------------------- 1488
Query 1985 ATCAAGCAGCACCCATTCTTCAAAGAGATTGACTGGGTGCTCCTGGAGCAGAAGAAGATCAAGCCACCCTTCAA 2058
Sbjct 1489 -------------------------------------------------------------------------- 1488
Query 2059 ACCACGCATTAAAACCAAAAGAGACGTCAATAATTTTGACCAAGACTTTACCCGGGAAGAGCCGGTACTCACCC 2132
Sbjct 1489 -------------------------------------------------------------------------- 1488
Query 2133 TTGTGGACGAAGCAATTGTAAAGCAGATCAACCAGGAGGAATTCAAAGGTTTCTCCTACTTTGGTGAAGACCTG 2206
Sbjct 1489 -------------------------------------------------------------------------- 1488
Query 2207 ATGCCC 2212
Sbjct 1489 ------ 1488