Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_14796
- Subject:
- NM_001242874.2
- Aligned Length:
- 1776
- Identities:
- 1460
- Gaps:
- 312
Alignment
Query 1 ATGCCCAGCAGGACCGGCCCCAAGATGGAAGGGAGCGGCGGCCGCGTCCGCCTCAAGGCGCATTACGGGGGGGA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CATCTTCATCACCAGCGTGGACGCCGCCACGACCTTCGAGGAGCTCTGTGAGGAAGTGAGAGACATGTGTCGTC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 TGCACCAGCAGCACCCGCTCACCCTCAAGTGGGTGGACAGCGAAGGTGACCCTTGCACGGTGTCCTCCCAGATG 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 GAGCTGGAAGAGGCTTTCCGCCTGGCCCGTCAGTGCAGGGATGAAGGCCTCATCATTCATGTTTTCCCGAGCAC 296
|||.| |||
Sbjct 1 ----------------------------------------------------------ATGCT--------CAC 8
Query 297 CCCTGAGCAGCCTGGCCTGCCATGTCCGGGAGAAGACAAATCTATCTACCGCCGGGGAGCCAGAAGATGGAGGA 370
||| |||.| || ||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 9 CCC-GAGGA-----------------CG------GATGAATCTATCTACCGCCGGGGAGCCAGAAGATGGAGGA 58
Query 371 AGCTGTACCGTGCCAACGGCCACCTCTTCCAAGCCAAGCGCTTTAACAGGAGAGCGTACTGCGGTCAGTGCAGC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 59 AGCTGTACCGTGCCAACGGCCACCTCTTCCAAGCCAAGCGCTTTAACAGGAGAGCGTACTGCGGTCAGTGCAGC 132
Query 445 GAGAGGATATGGGGCCTCGCGAGGCAAGGCTACAGGTGCATCAACTGCAAACTGCTGGTCCATAAGCGCTGCCA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 133 GAGAGGATATGGGGCCTCGCGAGGCAAGGCTACAGGTGCATCAACTGCAAACTGCTGGTCCATAAGCGCTGCCA 206
Query 519 CGGCCTCGTCCCGCTGACCTGCAGGAAGCATATGGATTCTGTCATGCCTTCCCAAGAGCCTCCAGTAGACGACA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 207 CGGCCTCGTCCCGCTGACCTGCAGGAAGCATATGGATTCTGTCATGCCTTCCCAAGAGCCTCCAGTAGACGACA 280
Query 593 AGAACGAGGACGCCGACCTTCCTTCCGAGGAGACAGATGGAATTGCTTACATTTCCTCATCCCGGAAGCATGAC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 281 AGAACGAGGACGCCGACCTTCCTTCCGAGGAGACAGATGGAATTGCTTACATTTCCTCATCCCGGAAGCATGAC 354
Query 667 AGCATTAAAGACGACTCGGAGGACCTTAAGCCAGTTATCGATGGGATGGATGGAATCAAAATCTCTCAGGGGCT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 355 AGCATTAAAGACGACTCGGAGGACCTTAAGCCAGTTATCGATGGGATGGATGGAATCAAAATCTCTCAGGGGCT 428
Query 741 TGGGCTGCAGGACTTTGACCTAATCAGAGTCATCGGGCGCGGGAGCTACGCCAAGGTTCTCCTGGTGCGGTTGA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 429 TGGGCTGCAGGACTTTGACCTAATCAGAGTCATCGGGCGCGGGAGCTACGCCAAGGTTCTCCTGGTGCGGTTGA 502
Query 815 AGAAGAATGACCAAATTTACGCCATGAAAGTGGTGAAGAAAGAGCTGGTGCATGATGACGAGGATATTGACTGG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 503 AGAAGAATGACCAAATTTACGCCATGAAAGTGGTGAAGAAAGAGCTGGTGCATGATGACGAGGATATTGACTGG 576
Query 889 GTACAGACAGAGAAGCACGTGTTTGAGCAGGCATCCAGCAACCCCTTCCTGGTCGGATTACACTCCTGCTTCCA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 577 GTACAGACAGAGAAGCACGTGTTTGAGCAGGCATCCAGCAACCCCTTCCTGGTCGGATTACACTCCTGCTTCCA 650
Query 963 GACGACAAGTCGGTTGTTCCTGGTCATTGAGTACGTCAACGGCGGGGACCTGATGTTCCACATGCAGAGGCAGA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 651 GACGACAAGTCGGTTGTTCCTGGTCATTGAGTACGTCAACGGCGGGGACCTGATGTTCCACATGCAGAGGCAGA 724
Query 1037 GGAAGCTCCCTGAGGAGCACGCCAGGTTCTACGCGGCCGAGATCTGCATCGCCCTCAACTTCCTGCACGAGAGG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 725 GGAAGCTCCCTGAGGAGCACGCCAGGTTCTACGCGGCCGAGATCTGCATCGCCCTCAACTTCCTGCACGAGAGG 798
Query 1111 GGGATCATCTACAGGGACCTGAAGCTGGACAACGTCCTCCTGGATGCGGACGGGCACATCAAGCTCACAGACTA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 799 GGGATCATCTACAGGGACCTGAAGCTGGACAACGTCCTCCTGGATGCGGACGGGCACATCAAGCTCACAGACTA 872
Query 1185 CGGCATGTGCAAGGAAGGCCTGGGCCCTGGTGACACAACGAGCACTTTCTGCGGAACCCCGAATTACATCGCCC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 873 CGGCATGTGCAAGGAAGGCCTGGGCCCTGGTGACACAACGAGCACTTTCTGCGGAACCCCGAATTACATCGCCC 946
Query 1259 CCGAAATCCTGCGGGGAGAGGAGTACGGGTTCAGCGTGGACTGGTGGGCGCTGGGAGTCCTCATGTTTGAGATG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 947 CCGAAATCCTGCGGGGAGAGGAGTACGGGTTCAGCGTGGACTGGTGGGCGCTGGGAGTCCTCATGTTTGAGATG 1020
Query 1333 ATGGCCGGGCGCTCCCCGTTCGACATCATCACCGACAACCCGGACATGAACACAGAGGACTACCTTTTCCAAGT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021 ATGGCCGGGCGCTCCCCGTTCGACATCATCACCGACAACCCGGACATGAACACAGAGGACTACCTTTTCCAAGT 1094
Query 1407 GATCCTGGAGAAGCCCATCCGGATCCCCCGGTTCCTGTCCGTCAAAGCCTCCCATGTTTTAAAAGGATTTTTAA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1095 GATCCTGGAGAAGCCCATCCGGATCCCCCGGTTCCTGTCCGTCAAAGCCTCCCATGTTTTAAAAGGATTTTTAA 1168
Query 1481 ATAAGGACCCCAAAGAGAGGCTCGGCTGCCGGCCACAGACTGGATTTTCTGACATCAAGTCCCACGCGTTCTTC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1169 ATAAGGACCCCAAAGAGAGGCTCGGCTGCCGGCCACAGACTGGATTTTCTGACATCAAGTCCCACGCGTTCTTC 1242
Query 1555 CGCAGCATAGACTGGGACTTGCTGGAGAAGAAGCAGGCGCTCCCTCCATTCCAGCCACAGATCACAGACGACTA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1243 CGCAGCATAGACTGGGACTTGCTGGAGAAGAAGCAGGCGCTCCCTCCATTCCAGCCACAGATCACAGACGACTA 1316
Query 1629 CGGTCTGGACAACTTTGACACACAGTTCACCAGCGAGCCCGTGCAGCTGACCCCAGACGATGAGGATGCCATAA 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1317 CGGTCTGGACAACTTTGACACACAGTTCACCAGCGAGCCCGTGCAGCTGACCCCAGACGATGAGGATGCCATAA 1390
Query 1703 AGAGGATCGACCAGTCAGAGTTCGAAGGCTTTGAGTATATCAACCCATTATTGCTGTCCACCGAGGAGTCGGTG 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1391 AGAGGATCGACCAGTCAGAGTTCGAAGGCTTTGAGTATATCAACCCATTATTGCTGTCCACCGAGGAGTCGGTG 1464