Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14796
• Subject: NM_008860.3
• Aligned Length: 1776
• Identities: 1578
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGCCCAGCAGGACCGGCCCCAAGATGGAAGGGAGCGGCGGCCGCGTCCGCCTCAAGGCGCATTACGGGGGGGA  74
            ||||||||||||||.|.||||||||||||..|||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||
Sbjct    1  ATGCCCAGCAGGACGGACCCCAAGATGGACCGGAGCGGCGGCCGCGTCCGTCTGAAGGCGCACTACGGCGGGGA  74

Query   75  CATCTTCATCACCAGCGTGGACGCCGCCACGACCTTCGAGGAGCTCTGTGAGGAAGTGAGAGACATGTGTCGTC  148
            ||||.|.||.|||||||||||.|||...||.||.|||.||||.|||||||||||||||.|||||||||||.|.|
Sbjct   75  CATCCTGATTACCAGCGTGGATGCCATGACAACATTCAAGGACCTCTGTGAGGAAGTGCGAGACATGTGTGGCC  148

Query  149  TGCACCAGCAGCACCCGCTCACCCTCAAGTGGGTGGACAGCGAAGGTGACCCTTGCACGGTGTCCTCCCAGATG  222
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||
Sbjct  149  TGCACCAGCAGCACCCACTCACCCTCAAGTGGGTGGACAGTGAAGGTGACCCTTGTACTGTGTCCTCACAGATG  222

Query  223  GAGCTGGAAGAGGCTTTCCGCCTGGCCCGTCAGTGCAGGGATGAAGGCCTCATCATTCATGTTTTCCCGAGCAC  296
            ||||||||.|||||.||||||||||.|.|||||.|||||||.||||..||||||||||||||||||||.||||.
Sbjct  223  GAGCTGGAGGAGGCCTTCCGCCTGGTCTGTCAGGGCAGGGACGAAGTGCTCATCATTCATGTTTTCCCAAGCAT  296

Query  297  CCCTGAGCAGCCTGGCCTGCCATGTCCGGGAGAAGACAAATCTATCTACCGCCGGGGAGCCAGAAGATGGAGGA  370
            |||.||||||||.|||.||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCCAGAGCAGCCGGGCATGCCTTGTCCTGGAGAAGACAAGTCCATCTACCGCCGTGGAGCCAGAAGATGGAGGA  370

Query  371  AGCTGTACCGTGCCAACGGCCACCTCTTCCAAGCCAAGCGCTTTAACAGGAGAGCGTACTGCGGTCAGTGCAGC  444
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||
Sbjct  371  AGCTGTACCGAGCCAACGGCCACCTCTTCCAAGCCAAGCGCTTTAACAGGGGAGCGTACTGCGGCCAGTGCAGC  444

Query  445  GAGAGGATATGGGGCCTCGCGAGGCAAGGCTACAGGTGCATCAACTGCAAACTGCTGGTCCATAAGCGCTGCCA  518
            ||.|||||||||||.|||.|||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct  445  GAAAGGATATGGGGTCTCTCGAGGCAGGGCTACAGGTGCATCAACTGCAAGCTGCTGGTCCATAAACGCTGCCA  518

Query  519  CGGCCTCGTCCCGCTGACCTGCAGGAAGCATATGGATTCTGTCATGCCTTCCCAAGAGCCTCCAGTAGACGACA  592
            ||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  519  CGTCCTCGTCCCGCTGACCTGCAGGAGGCATATGGATTCTGTCATGCCTTCCCAAGAGCCTCCAGTAGATGACA  592

Query  593  AGAACGAGGACGCCGACCTTCCTTCCGAGGAGACAGATGGAATTGCTTACATTTCCTCATCCCGGAAGCATGAC  666
            |||||||.|..|..|||||||||||.||.||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.
Sbjct  593  AGAACGATGGTGTAGACCTTCCTTCAGAAGAAACTGATGGAATTGCTTATATTTCTTCATCTCGGAAACATGAT  666

Query  667  AGCATTAAAGACGACTCGGAGGACCTTAAGCCAGTTATCGATGGGATGGATGGAATCAAAATCTCTCAGGGGCT  740
            |..||.|||||.||.||.||||||||||||||.||.|||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AATATCAAAGATGATTCTGAGGACCTTAAGCCTGTCATCGATGGGGTGGATGGGATCAAAATCTCTCAGGGGCT  740

Query  741  TGGGCTGCAGGACTTTGACCTAATCAGAGTCATCGGGCGCGGGAGCTACGCCAAGGTTCTCCTGGTGCGGTTGA  814
            .||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  741  GGGGCTGCAAGACTTCGACCTCATCAGAGTCATCGGGCGTGGAAGCTATGCCAAGGTCCTCCTGGTGCGGTTGA  814

Query  815  AGAAGAATGACCAAATTTACGCCATGAAAGTGGTGAAGAAAGAGCTGGTGCATGATGACGAGGATATTGACTGG  888
            ||||.||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||.||.||.|||||||||||.||||||
Sbjct  815  AGAAAAACGACCAGATTTACGCCATGAAGGTGGTAAAGAAGGAGCTTGTCCACGACGACGAGGATATCGACTGG  888

Query  889  GTACAGACAGAGAAGCACGTGTTTGAGCAGGCATCCAGCAACCCCTTCCTGGTCGGATTACACTCCTGCTTCCA  962
            ||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct  889  GTGCAGACAGAGAAACATGTGTTTGAGCAGGCGTCCAGCAACCCCTTCCTGGTTGGCTTACACTCCTGCTTCCA  962

Query  963  GACGACAAGTCGGTTGTTCCTGGTCATTGAGTACGTCAACGGCGGGGACCTGATGTTCCACATGCAGAGGCAGA  1036
            |||.||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GACAACGAGCCGGTTGTTCCTGGTCATCGAGTATGTCAATGGCGGGGACCTCATGTTCCACATGCAGAGGCAGA  1036

Query 1037  GGAAGCTCCCTGAGGAGCACGCCAGGTTCTACGCGGCCGAGATCTGCATCGCCCTCAACTTCCTGCACGAGAGG  1110
            |.||.||.||.||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||.|||||.|||||||||.||||.||||||
Sbjct 1037  GAAAACTTCCAGAGGAGCATGCCAGGTTCTATGCTGCTGAGATCTGTATCGCTCTCAACTTCTTGCATGAGAGG  1110

Query 1111  GGGATCATCTACAGGGACCTGAAGCTGGACAACGTCCTCCTGGATGCGGACGGGCACATCAAGCTCACAGACTA  1184
            ||||||||||||.|||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.||.|||||
Sbjct 1111  GGGATCATCTACCGGGACCTAAAACTGGACAACGTCCTCCTTGATGCCGACGGACACATTAAGCTGACGGACTA  1184

Query 1185  CGGCATGTGCAAGGAAGGCCTGGGCCCTGGTGACACAACGAGCACTTTCTGCGGAACCCCGAATTACATCGCCC  1258
            ||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||
Sbjct 1185  CGGCATGTGCAAGGAAGGTCTAGGCCCCGGTGATACAACAAGCACTTTTTGTGGAACCCCGAACTATATCGCCC  1258

Query 1259  CCGAAATCCTGCGGGGAGAGGAGTACGGGTTCAGCGTGGACTGGTGGGCGCTGGGAGTCCTCATGTTTGAGATG  1332
            |||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 1259  CCGAAATCCTGCGAGGAGAAGAGTACGGGTTCAGCGTGGACTGGTGGGCACTGGGTGTCCTTATGTTTGAGATG  1332

Query 1333  ATGGCCGGGCGCTCCCCGTTCGACATCATCACCGACAACCCGGACATGAACACAGAGGACTACCTTTTCCAAGT  1406
            |||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 1333  ATGGCTGGGCGCTCCCCCTTTGACATCATCACGGACAACCCTGACATGAACACTGAAGACTACCTTTTCCAAGT  1406

Query 1407  GATCCTGGAGAAGCCCATCCGGATCCCCCGGTTCCTGTCCGTCAAAGCCTCCCATGTTTTAAAAGGATTTTTAA  1480
            .||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||.||.||.||||||||||||||||
Sbjct 1407  TATCCTGGAAAAGCCAATCCGGATTCCCCGTTTCCTGTCTGTCAAGGCCTCACACGTCTTAAAAGGATTTTTAA  1480

Query 1481  ATAAGGACCCCAAAGAGAGGCTCGGCTGCCGGCCACAGACTGGATTTTCTGACATCAAGTCCCACGCGTTCTTC  1554
            |||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.||||||
Sbjct 1481  ATAAGGATCCCAAAGAGAGGCTTGGCTGCCGGCCACAGACTGGGTTTTCCGACATCAAGTCTCATGCTTTCTTC  1554

Query 1555  CGCAGCATAGACTGGGACTTGCTGGAGAAGAAGCAGGCGCTCCCTCCATTCCAGCCACAGATCACAGACGACTA  1628
            ||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||.|.||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1555  CGCAGCATAGACTGGGACCTGCTGGAAAAGAAGCAGACCCTGCCTCCCTTCCAGCCCCAGATCACAGATGACTA  1628

Query 1629  CGGTCTGGACAACTTTGACACACAGTTCACCAGCGAGCCCGTGCAGCTGACCCCAGACGATGAGGATGCCATAA  1702
            .||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|.|||||
Sbjct 1629  TGGCCTGGACAACTTTGACACGCAGTTCACCAGCGAGCCTGTGCAGCTGACCCCAGATGATGAGGACGTCATAA  1702

Query 1703  AGAGGATCGACCAGTCAGAGTTCGAAGGCTTTGAGTATATCAACCCATTATTGCTGTCCACCGAGGAGTCGGTG  1776
            ||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||.|..|||||||..|.||||||||.|||
Sbjct 1703  AGAGGATCGACCAGTCCGAATTTGAAGGCTTTGAGTACATCAACCCACTTCTGCTGTCTGCTGAGGAGTCCGTG  1776