Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14796
• Subject: XM_006538655.3
• Aligned Length: 1778
• Identities: 1294
• Gaps: 328

Alignment

Query    1  ATGCCCAGCAGGACCGGCCCCAAGATGGAAGGGAGCGGCGGCCGCGTCCGCCTCAAGGCGCATTACGGGGGGGA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CATCTTCATCACCAGCGTGGACGCCGCCACGACCTTCGAGGAGCTCTGTGAGGAAGTGAGAGACATGTGTCGTC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TGCACCAGCAGCACCCGCTCACCCTCAAGTGGGTGGACAGCGAAGGTGACCCTTGCACGGTGTCCTCCCAGATG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GAGCTGGAAGAGGCTTTCCGCCTGGCCCGTCAGTGCAGGGATGAAGGCCTCATCATTCATGTTTTCCCGAGCAC  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  CCCTGAGCAGCCTGGCCTGCCATGTCCG--GGAGAAGACAAATCTATCTACCGCCGGGGAGCCAGAAGATGGAG  368
                                 |||   |  ||||      |.||.|||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct    1  ---------------------ATG---GTTGGAG------AGTCCATCTACCGCCGTGGAGCCAGAAGATGGAG  44

Query  369  GAAGCTGTACCGTGCCAACGGCCACCTCTTCCAAGCCAAGCGCTTTAACAGGAGAGCGTACTGCGGTCAGTGCA  442
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||
Sbjct   45  GAAGCTGTACCGAGCCAACGGCCACCTCTTCCAAGCCAAGCGCTTTAACAGGGGAGCGTACTGCGGCCAGTGCA  118

Query  443  GCGAGAGGATATGGGGCCTCGCGAGGCAAGGCTACAGGTGCATCAACTGCAAACTGCTGGTCCATAAGCGCTGC  516
            ||||.|||||||||||.|||.|||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct  119  GCGAAAGGATATGGGGTCTCTCGAGGCAGGGCTACAGGTGCATCAACTGCAAGCTGCTGGTCCATAAACGCTGC  192

Query  517  CACGGCCTCGTCCCGCTGACCTGCAGGAAGCATATGGATTCTGTCATGCCTTCCCAAGAGCCTCCAGTAGACGA  590
            ||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  193  CACGTCCTCGTCCCGCTGACCTGCAGGAGGCATATGGATTCTGTCATGCCTTCCCAAGAGCCTCCAGTAGATGA  266

Query  591  CAAGAACGAGGACGCCGACCTTCCTTCCGAGGAGACAGATGGAATTGCTTACATTTCCTCATCCCGGAAGCATG  664
            |||||||||.|..|..|||||||||||.||.||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||
Sbjct  267  CAAGAACGATGGTGTAGACCTTCCTTCAGAAGAAACTGATGGAATTGCTTATATTTCTTCATCTCGGAAACATG  340

Query  665  ACAGCATTAAAGACGACTCGGAGGACCTTAAGCCAGTTATCGATGGGATGGATGGAATCAAAATCTCTCAGGGG  738
            |.|..||.|||||.||.||.||||||||||||||.||.|||||||||.|||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  341  ATAATATCAAAGATGATTCTGAGGACCTTAAGCCTGTCATCGATGGGGTGGATGGGATCAAAATCTCTCAGGGG  414

Query  739  CTTGGGCTGCAGGACTTTGACCTAATCAGAGTCATCGGGCGCGGGAGCTACGCCAAGGTTCTCCTGGTGCGGTT  812
            ||.||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct  415  CTGGGGCTGCAAGACTTCGACCTCATCAGAGTCATCGGGCGTGGAAGCTATGCCAAGGTCCTCCTGGTGCGGTT  488

Query  813  GAAGAAGAATGACCAAATTTACGCCATGAAAGTGGTGAAGAAAGAGCTGGTGCATGATGACGAGGATATTGACT  886
            ||||||.||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||.||.||.|||||||||||.||||
Sbjct  489  GAAGAAAAACGACCAGATTTACGCCATGAAGGTGGTAAAGAAGGAGCTTGTCCACGACGACGAGGATATCGACT  562

Query  887  GGGTACAGACAGAGAAGCACGTGTTTGAGCAGGCATCCAGCAACCCCTTCCTGGTCGGATTACACTCCTGCTTC  960
            ||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct  563  GGGTGCAGACAGAGAAACATGTGTTTGAGCAGGCGTCCAGCAACCCCTTCCTGGTTGGCTTACACTCCTGCTTC  636

Query  961  CAGACGACAAGTCGGTTGTTCCTGGTCATTGAGTACGTCAACGGCGGGGACCTGATGTTCCACATGCAGAGGCA  1034
            |||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  637  CAGACAACGAGCCGGTTGTTCCTGGTCATCGAGTATGTCAATGGCGGGGACCTCATGTTCCACATGCAGAGGCA  710

Query 1035  GAGGAAGCTCCCTGAGGAGCACGCCAGGTTCTACGCGGCCGAGATCTGCATCGCCCTCAACTTCCTGCACGAGA  1108
            |||.||.||.||.||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||.|||||.|||||||||.||||.||||
Sbjct  711  GAGAAAACTTCCAGAGGAGCATGCCAGGTTCTATGCTGCTGAGATCTGTATCGCTCTCAACTTCTTGCATGAGA  784

Query 1109  GGGGGATCATCTACAGGGACCTGAAGCTGGACAACGTCCTCCTGGATGCGGACGGGCACATCAAGCTCACAGAC  1182
            ||||||||||||||.|||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.||.|||
Sbjct  785  GGGGGATCATCTACCGGGACCTAAAACTGGACAACGTCCTCCTTGATGCCGACGGACACATTAAGCTGACGGAC  858

Query 1183  TACGGCATGTGCAAGGAAGGCCTGGGCCCTGGTGACACAACGAGCACTTTCTGCGGAACCCCGAATTACATCGC  1256
            ||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||.||.|||||
Sbjct  859  TACGGCATGTGCAAGGAAGGTCTAGGCCCCGGTGATACAACAAGCACTTTTTGTGGAACCCCGAACTATATCGC  932

Query 1257  CCCCGAAATCCTGCGGGGAGAGGAGTACGGGTTCAGCGTGGACTGGTGGGCGCTGGGAGTCCTCATGTTTGAGA  1330
            |||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||
Sbjct  933  CCCCGAAATCCTGCGAGGAGAAGAGTACGGGTTCAGCGTGGACTGGTGGGCACTGGGTGTCCTTATGTTTGAGA  1006

Query 1331  TGATGGCCGGGCGCTCCCCGTTCGACATCATCACCGACAACCCGGACATGAACACAGAGGACTACCTTTTCCAA  1404
            |||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 1007  TGATGGCTGGGCGCTCCCCCTTTGACATCATCACGGACAACCCTGACATGAACACTGAAGACTACCTTTTCCAA  1080

Query 1405  GTGATCCTGGAGAAGCCCATCCGGATCCCCCGGTTCCTGTCCGTCAAAGCCTCCCATGTTTTAAAAGGATTTTT  1478
            ||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||.||.||.||||||||||||||
Sbjct 1081  GTTATCCTGGAAAAGCCAATCCGGATTCCCCGTTTCCTGTCTGTCAAGGCCTCACACGTCTTAAAAGGATTTTT  1154

Query 1479  AAATAAGGACCCCAAAGAGAGGCTCGGCTGCCGGCCACAGACTGGATTTTCTGACATCAAGTCCCACGCGTTCT  1552
            |||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.||||
Sbjct 1155  AAATAAGGATCCCAAAGAGAGGCTTGGCTGCCGGCCACAGACTGGGTTTTCCGACATCAAGTCTCATGCTTTCT  1228

Query 1553  TCCGCAGCATAGACTGGGACTTGCTGGAGAAGAAGCAGGCGCTCCCTCCATTCCAGCCACAGATCACAGACGAC  1626
            ||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||.|.||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct 1229  TCCGCAGCATAGACTGGGACCTGCTGGAAAAGAAGCAGACCCTGCCTCCCTTCCAGCCCCAGATCACAGATGAC  1302

Query 1627  TACGGTCTGGACAACTTTGACACACAGTTCACCAGCGAGCCCGTGCAGCTGACCCCAGACGATGAGGATGCCAT  1700
            ||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|.|||
Sbjct 1303  TATGGCCTGGACAACTTTGACACGCAGTTCACCAGCGAGCCTGTGCAGCTGACCCCAGATGATGAGGACGTCAT  1376

Query 1701  AAAGAGGATCGACCAGTCAGAGTTCGAAGGCTTTGAGTATATCAACCCATTATTGCTGTCCACCGAGGAGTCGG  1774
            ||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||.|..|||||||..|.||||||||.|
Sbjct 1377  AAAGAGGATCGACCAGTCCGAATTTGAAGGCTTTGAGTACATCAACCCACTTCTGCTGTCTGCTGAGGAGTCCG  1450

Query 1775  TG  1776
            ||
Sbjct 1451  TG  1452