Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14805
• Subject: XM_011249450.3
• Aligned Length: 1170
• Identities: 869
• Gaps: 213

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGAACACCTGGAGTGCTGCGTACGACGCTGTCCTTGACAGAAATGTGGCCATTAAGAAGCTCAGCAGACCCTT  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CCAGAACCAAACTCACGCCAAGAGGGCTTACCGGGAGCTGGTCCTCATGAAGTGTGTGAACCATAAAAACATTA  148

Query    1  -----------------------------------------------------------------ATGGAACTG  9
                                                                             |||||||||
Sbjct  149  TTAGCTTATTAAATGTTTTTACACCCCAGAAAACACTGGAGGAGTTCCAAGATGTCTACTTAGTGATGGAACTG  222

Query   10  ATGGATGCCAACTTATGTCAAGTGATTCAGATGGAATTAGACCATGAGCGAATGTCTTACCTGCTGTACCAAAT  83
            |||||.||||||.|.|||||.||||||||||||||..|.|||||.|||||.|||||||||.||||||||||.||
Sbjct  223  ATGGACGCCAACCTGTGTCAGGTGATTCAGATGGAGCTGGACCACGAGCGGATGTCTTACTTGCTGTACCAGAT  296

Query   84  GTTGTGTGGCATTAAGCACCTCCATTCTGCTGGAATTATTCACAGGGATTTAAAACCAAGTAACATTGTAGTCA  157
            |.||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  297  GCTGTGTGGCATCAAGCACCTCCACTCCGCTGGGATCATCCACAGGGACTTAAAACCCAGTAACATTGTAGTCA  370

Query  158  AGTCTGATTGCACATTGAAAATCCTGGACTTTGGACTGGCCAGGACAGCAGGCACAAGCTTCATGATGACTCCA  231
            ||||||||||||||.||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.
Sbjct  371  AGTCTGATTGCACACTGAAAATCCTCGACTTCGGACTGGCCAGGACAGCGGGTACAAGCTTCATGATGACTCCG  444

Query  232  TATGTGGTGACACGTTATTACAGAGCCCCTGAGGTCATCCTGGGGATGGGCTACAAGGAGAACGTGGATATATG  305
            |||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  445  TATGTGGTGACGCGATATTACAGAGCCCCTGAGGTCATCCTGGGCATGGGCTACAAGGAGAACGTGGACATATG  518

Query  306  GTCTGTGGGATGCATTATGGGAGAAATGGTTCGCCACAAAATCCTCTTTCCAGGAAGGGACTATATTGACCAGT  379
            |||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GTCTGTGGGATGCATCATGGGAGAAATGGTTCGCCACAAAATCCTCTTTCCCGGAAGGGACTATATTGACCAGT  592

Query  380  GGAATAAGGTAATTGAACAACTAGGAACACCATGTCCAGAATTCATGAAGAAATTGCAACCCACAGTAAGAAAC  453
            ||||.||.||.||.||.||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct  593  GGAACAAAGTCATCGAGCAGCTAGGAACTCCGTGTCCAGAGTTCATGAAGAAATTGCAGCCCACAGTCAGAAAC  666

Query  454  TATGTGGAGAATCGGCCCAAGTATGCGGGACTCACCTTCCCCAAACTCTTCCCAGATTCCCTCTTCCCAGCGGA  527
            ||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TACGTGGAGAATCGGCCCAAGTACGCAGGACTCACCTTCCCCAAGCTCTTTCCAGATTCCCTCTTCCCAGCGGA  740

Query  528  CTCCGAGCACAATAAACTCAAAGCCAGCCAAGCCAGGGACTTGTTGTCAAAGATGCTAGTGATTGACCCAGCAA  601
            .||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||.||||||||||||||||.|
Sbjct  741  TTCTGAGCACAATAAACTTAAAGCCAGCCAAGCCAGGGATTTGTTGTCTAAGATGTTAGTGATTGACCCAGCGA  814

Query  602  AAAGAATATCAGTGGACGACGCCTTACAGCATCCCTACATCAACGTCTGGTATGACCCAGCCGAAGTGGAGGCG  675
            |.||.|||||.|||||||||||..|.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||
Sbjct  815  AGAGGATATCGGTGGACGACGCACTGCAGCATCCGTACATCAACGTTTGGTACGACCCGGCTGAAGTGGAGGCG  888

Query  676  CCTCCACCTCAGATATATGACAAGCAGTTGGATGAAAGAGAACACACAATTGAAGAATGGAAAGAACTTATCTA  749
            |||||.||||||||||||||.||||||.||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CCTCCGCCTCAGATATATGATAAGCAGCTGGATGAAAGGGAGCACACCATCGAAGAATGGAAAGAACTTATCTA  962

Query  750  CAAGGAAGTAATGAATTCAGAAGAAAAGACTAAAAATGGTGTAGTAAAAGGACAGCCTTCTCCTTCAGGTGCAG  823
            ||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||
Sbjct  963  CAAGGAGGTAATGAACTCAGAAGAGAAGACTAAGAATGGCGTAGTCAAAGGCCAGCCCTCGCCTTCAGGTGCAG  1036

Query  824  CAGTGAACAGCAGTGAGAGTCTCCCTCCATCCTCGTCTGTCAATGACATCTCCTCCATGTCCACCGACCAGACC  897
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CAGTGAACAGCAGTGAGAGTCTCCCTCCATCCTCGTCTGTCAACGACATCTCCTCCATGTCCACCGACCAGACC  1110

Query  898  CTGGCATCTGACACTGACAGCAGCCTGGAAGCCTCGGCAGGACCCCTGGGTTGTTGCAGG  957
            ||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||..||||||||||||||
Sbjct 1111  CTCGCATCTGACACTGACAGCAGCCTGGAGGCCTCGGCGGGACCGTTGGGTTGTTGCAGG  1170