Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_14807
• Subject: XM_006511196.3
• Aligned Length: 1183
• Identities: 1003
• Gaps: 73

Alignment

Query    1  ATGCCCAAGAAGAAGCCGACGCCCATCCAGCTGAACCCGGCCCCCGACGGCTCTGCAGTTAACGGGACCAGCTC  74
                                                                           ..||  |||| 
Sbjct    1  ---------------------------------------------------------------ATGA--AGCT-  8

Query   75  TGCGGA---GACCAACTTGGAGGCCTTGCAGAAGAAGCTGGAGGAGCTAGAGCTTGATGAGCAGCAGCGAAAGC  145
               |||   |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct    9  ---GGAGAGGACCAACCTGGAGGCCTTGCAGAAGAAGCTGGAGGAGCTGGAGCTTGACGAGCAGCAGCGGAAGC  79

Query  146  GCCTTGAGGCCTTTCTTACCCAGAAGCAGAAGGTGGGAGAACTGAAGGATGACGACTTTGAGAAGATCAGTGAG  219
            |.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.
Sbjct   80  GGCTCGAGGCCTTTCTGACGCAGAAGCAGAAGGTGGGGGAACTGAAGGATGATGACTTTGAGAAGATCAGCGAA  153

Query  220  CTGGGGGCTGGCAATGGCGGTGTGGTGTTCAAGGTCTCCCACAAGCCTTCTGGCCTGGTCATGGCCAGAAAGCT  293
            |||||.||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct  154  CTGGGAGCTGGCAACGGTGGAGTGGTCTTCAAGGTCTCCCACAAGCCATCTGGCCTGGTTATGGCTAGAAAGCT  227

Query  294  AATTCATCTGGAGATCAAACCCGCAATCCGGAACCAGATCATAAGGGAGCTGCAGGTTCTGCATGAGTGCAACT  367
            .||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct  228  GATCCACCTGGAGATCAAACCCGCAATCCGGAACCAGATCATCCGGGAGCTGCAGGTACTGCACGAGTGCAACT  301

Query  368  CTCCGTACATCGTGGGCTTCTATGGTGCGTTCTACAGCGATGGCGAGGATCAGTATCTGCATGGAGCACATGGA  441
            |.||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||| ||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  302  CCCCGTACATCGTGGGCTTCTACGGGGCCTTCTACAGCGACGGCGA-GATCAGCATCTGCATGGAGCACATGGA  374

Query  442  TGGAGGTTCTCTGGATCAAGTCCTGAAGAAAGCTGGAAGAATTCCTGAACAAATTTTAGGAAAAGTTAGCATTG  515
            |||.||.||..||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  375  TGGTGGGTCCTTGGATCAAGTTCTGAAGAAAGCTGGAAGAATTCCTGAGCAAATTTTAGGAAAAGTTAGCATTG  448

Query  516  CTGTAATAAAAGGCCTGACATATCTGAGGGAGAAGCACAAGATCATGCACAGAGATGTCAAGCCCTCCAACATC  589
            ||||.||||||||||||||.|||||..||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct  449  CTGTGATAAAAGGCCTGACCTATCTTCGGGAGAAGCACAAGATTATGCACAGAGATGTCAAGCCATCCAACATT  522

Query  590  CTAGTCAACTCCCGTGGGGAGATCAAGCTCTGTGACTTTGGGGTCAGCGGGCAGCTCATCGACTCCATGGCCAA  663
            |||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||
Sbjct  523  CTAGTGAACTCACGTGGGGAGATCAAACTCTGTGATTTTGGGGTCAGCGGGCAGCTAATTGACTCTATGGCCAA  596

Query  664  CTCCTTCGTGGGCACAAGGTCCTACATGTCGCCAGAAAGACTCCAGGGGACTCATTACTCTGTGCAGTCAGACA  737
            |||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct  597  CTCCTTCGTGGGCACGAGATCCTACATGTCGCCTGAGAGACTCCAGGGGACTCACTACTCTGTGCAGTCGGACA  670

Query  738  TCTGGAGCATGGGACTGTCTCTGGTAGAGATGGCGGTTGGGAGGTATCCCATCCCTCCTCCAGATGCCAAGGAG  811
            |||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct  671  TCTGGAGCATGGGGCTCTCTCTGGTGGAGATGGCAGTTGGGAGATACCCCATTCCTCCTCCTGATGCCAAGGAG  744

Query  812  CTGGAGCTGATGTTTGGGTGCCAGGTGGAAGGAGATGCGGCTGAGACCCCACCCAGGCCAAGGACCCCCGGGAG  885
            ||||||||..|||||||.|||||.|||||||||||.||.||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  745  CTGGAGCTACTGTTTGGATGCCATGTGGAAGGAGACGCAGCCGAAACACCACCCAGGCCAAGGACCCCTGGGAG  818

Query  886  GCCCCTTAGCTCATACGGAATGGACAGCCGACCTCCCATGGCAATTTTTGAGTTGTTGGATTACATAGTCAACG  959
            |||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct  819  GCCTCTCAGCTCATATGGAATGGACAGCCGACCTCCCATGGCAATTTTTGAGTTGTTGGATTACATTGTCAATG  892

Query  960  AGCCTCCTCCAAAACTGCCCAGTGGAGTGTTCAGTCTGGAATTTCAAGATTTTGTGAATAAATGCTTAATAAAA  1033
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  893  AGCCTCCTCCAAAACTGCCCAGTGGAGTATTCAGTCTGGAGTTTCAGGATTTTGTGAATAAATGCTTAATAAAG  966

Query 1034  AACCCCGCAGAGAGAGCAGATTTGAAGCAACTCATGGTTCATGCTTTTATCAAGAGATCTGATGCTGAGGAAGT  1107
            |||||.|||||||||||||||.|||||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.||
Sbjct  967  AACCCTGCAGAGAGAGCAGATCTGAAGCAGCTCATGGTACATGCTTTCATCAAAAGATCTGACGCCGAGGAGGT  1040

Query 1108  GGATTTTGCAGGTTGGCTCTGCTCCACCATCGGCCTTAACCAGCCCAGCACACCAACCCATGCTGCTGGCGTC  1180
            .||.||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||..||.||
Sbjct 1041  AGACTTCGCAGGCTGGCTCTGCTCCACCATTGGGCTTAACCAGCCCAGCACACCAACCCACGCTGCCAGCATC  1113